Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SRN3

Protein Details
Accession A0A017SRN3    Localization Confidence Low Confidence Score 5.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-42SPAASTAGSKRKRNNPGKYYAVKKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 9, cyto_nucl 7, nucl 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009027  Ribosomal_L9/RNase_H1_N  
IPR017067  RNase_H1_euk  
IPR011320  RNase_H1_N  
IPR037056  RNase_H1_N_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0000287  F:magnesium ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01693  Cauli_VI  
Amino Acid Sequences MGTSTTTPSPSPAPAIKPSPAASTAGSKRKRNNPGKYYAVKKGYQPGVYFEWNDCLTQVTGYKGAIFQAFSTIEEANSFLRGTKAPLGGVTHSESVHNRFYGIQRGRVPGVYTDWAQAQEQIRGFQRPSYKKFSTRAEAEEFVKMGQQSGASFASDSTKTQKLSGAPGMMDEIPKDEHGVPYEAADGPLGLDAEDGFDPNVLLDPKTGKAVYKLPEQKTVTKVQAKGPPGMLRIYTDGSSLANGQAVASAGVGVYFGPGDSRFVSASLIPLFQLCLFTDTDYH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.39
3 0.38
4 0.4
5 0.4
6 0.38
7 0.35
8 0.32
9 0.27
10 0.31
11 0.37
12 0.42
13 0.48
14 0.51
15 0.58
16 0.66
17 0.76
18 0.77
19 0.8
20 0.79
21 0.79
22 0.82
23 0.81
24 0.78
25 0.76
26 0.72
27 0.63
28 0.59
29 0.6
30 0.57
31 0.53
32 0.47
33 0.43
34 0.42
35 0.42
36 0.4
37 0.31
38 0.3
39 0.26
40 0.25
41 0.21
42 0.18
43 0.15
44 0.15
45 0.15
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.12
51 0.13
52 0.12
53 0.11
54 0.09
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.14
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.09
64 0.1
65 0.09
66 0.07
67 0.09
68 0.09
69 0.12
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.16
74 0.17
75 0.17
76 0.18
77 0.18
78 0.15
79 0.14
80 0.16
81 0.16
82 0.18
83 0.2
84 0.17
85 0.16
86 0.16
87 0.18
88 0.26
89 0.26
90 0.29
91 0.29
92 0.32
93 0.32
94 0.31
95 0.3
96 0.22
97 0.22
98 0.18
99 0.16
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.14
106 0.16
107 0.15
108 0.17
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.19
113 0.26
114 0.29
115 0.34
116 0.4
117 0.42
118 0.45
119 0.5
120 0.51
121 0.48
122 0.44
123 0.43
124 0.39
125 0.37
126 0.33
127 0.29
128 0.24
129 0.18
130 0.17
131 0.13
132 0.09
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.12
145 0.15
146 0.16
147 0.16
148 0.19
149 0.17
150 0.21
151 0.22
152 0.19
153 0.16
154 0.15
155 0.16
156 0.14
157 0.13
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.1
163 0.09
164 0.1
165 0.12
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.08
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.1
192 0.11
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.16
197 0.21
198 0.24
199 0.32
200 0.39
201 0.39
202 0.48
203 0.51
204 0.53
205 0.51
206 0.54
207 0.52
208 0.5
209 0.5
210 0.48
211 0.52
212 0.49
213 0.48
214 0.47
215 0.43
216 0.38
217 0.37
218 0.3
219 0.25
220 0.26
221 0.25
222 0.2
223 0.17
224 0.16
225 0.15
226 0.15
227 0.13
228 0.11
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.05
245 0.06
246 0.09
247 0.1
248 0.12
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.17
254 0.16
255 0.15
256 0.13
257 0.13
258 0.14
259 0.13
260 0.15
261 0.12
262 0.12
263 0.13