Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017S300

Protein Details
Accession A0A017S300    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-71EYQGRKRKDFEDYVRRNRLNHydrophilic
570-589EEAKRRARKVFERAHRVFKEBasic
615-642DIDKIEKQMPRRVKKRRKLDDDRYEEYMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
573-583KRRARKVFERA
624-632PRRVKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 10.5, cyto_mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF13428  TPR_14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MEASRGPPRVKNKAAAPVQISAEQLLREAVDRQEPGVQAPTQRFADLEELHEYQGRKRKDFEDYVRRNRLNLNNWLRYAAWELEQKEFRRARSIFERALDVTPTSVVLWIRYVESEMRNRNINHARNLFDRAVTILPRVDKLWYKYVYMEETLGNIPGTRQVFERWMSWEPDEGAWGAYIKLEKRYNEFERARAIFQRFTIVHPEPRNWIKWARFEEENGTSDLVREVYGAAVEMLGEDFMDEKLFIQYAKFEAKLKEYERARAIYKYALDRLPRSKSMALHKAYTTFEKQFGDREGVEDVILSKRRVQYEEQLKENPRNYDAWFDFARLEETSGDPERVRDTYERAIAQIPPSQEKRHWRRYIYLWIFYAIWEEMEGKDVERARQIYQECLRLIPHRKFTFSKLWLMKAQFEIRQMNLQAARKTLGQAIGMCPKDKLFRGYITLEQQLFEFLRCRTLYEKQIEWNSSNSQSWIKYAELERGLDDAERARAIYELGIDQPTLDMPELVWKSYIDFEEYEGEYDRVRALYERLLAKTDHVKVWINYARFEINVPEEEEEEEEEEEERPISEEAKRRARKVFERAHRVFKEKELKEERVELLNAWRSFEHTHGSGEDIDKIEKQMPRRVKKRRKLDDDRYEEYMDYVFPADDQSAANLSKLLAKAHQWKQGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.66
3 0.6
4 0.55
5 0.52
6 0.47
7 0.41
8 0.32
9 0.29
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.15
17 0.19
18 0.2
19 0.21
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.28
24 0.28
25 0.27
26 0.3
27 0.34
28 0.31
29 0.31
30 0.28
31 0.26
32 0.3
33 0.26
34 0.26
35 0.26
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.29
41 0.36
42 0.39
43 0.37
44 0.41
45 0.45
46 0.5
47 0.59
48 0.62
49 0.65
50 0.69
51 0.76
52 0.81
53 0.77
54 0.7
55 0.69
56 0.68
57 0.64
58 0.65
59 0.64
60 0.61
61 0.61
62 0.61
63 0.52
64 0.46
65 0.42
66 0.34
67 0.28
68 0.27
69 0.28
70 0.34
71 0.4
72 0.39
73 0.44
74 0.46
75 0.43
76 0.47
77 0.45
78 0.45
79 0.49
80 0.54
81 0.49
82 0.47
83 0.49
84 0.42
85 0.43
86 0.37
87 0.28
88 0.21
89 0.17
90 0.16
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.15
101 0.2
102 0.27
103 0.31
104 0.34
105 0.39
106 0.39
107 0.47
108 0.52
109 0.53
110 0.54
111 0.52
112 0.53
113 0.5
114 0.55
115 0.47
116 0.38
117 0.32
118 0.26
119 0.24
120 0.21
121 0.2
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.2
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.31
132 0.33
133 0.35
134 0.34
135 0.3
136 0.27
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.17
141 0.14
142 0.11
143 0.1
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.15
149 0.19
150 0.21
151 0.22
152 0.22
153 0.24
154 0.26
155 0.25
156 0.26
157 0.24
158 0.22
159 0.21
160 0.17
161 0.14
162 0.11
163 0.11
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.1
168 0.17
169 0.21
170 0.22
171 0.27
172 0.36
173 0.39
174 0.46
175 0.47
176 0.43
177 0.46
178 0.47
179 0.44
180 0.42
181 0.41
182 0.33
183 0.31
184 0.35
185 0.28
186 0.28
187 0.32
188 0.29
189 0.33
190 0.34
191 0.35
192 0.35
193 0.38
194 0.39
195 0.35
196 0.39
197 0.36
198 0.41
199 0.44
200 0.43
201 0.4
202 0.39
203 0.41
204 0.38
205 0.35
206 0.28
207 0.24
208 0.19
209 0.18
210 0.17
211 0.12
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.02
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.05
235 0.06
236 0.08
237 0.11
238 0.11
239 0.14
240 0.15
241 0.18
242 0.24
243 0.25
244 0.3
245 0.29
246 0.33
247 0.33
248 0.34
249 0.33
250 0.29
251 0.29
252 0.24
253 0.25
254 0.23
255 0.23
256 0.24
257 0.24
258 0.27
259 0.31
260 0.33
261 0.31
262 0.32
263 0.32
264 0.33
265 0.39
266 0.43
267 0.39
268 0.37
269 0.36
270 0.35
271 0.34
272 0.33
273 0.28
274 0.22
275 0.23
276 0.21
277 0.22
278 0.21
279 0.21
280 0.21
281 0.17
282 0.16
283 0.14
284 0.13
285 0.12
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.14
292 0.17
293 0.19
294 0.22
295 0.23
296 0.28
297 0.37
298 0.41
299 0.41
300 0.42
301 0.43
302 0.46
303 0.47
304 0.4
305 0.31
306 0.28
307 0.26
308 0.27
309 0.25
310 0.23
311 0.2
312 0.2
313 0.18
314 0.17
315 0.18
316 0.11
317 0.12
318 0.08
319 0.09
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.1
324 0.11
325 0.12
326 0.11
327 0.13
328 0.11
329 0.14
330 0.16
331 0.19
332 0.18
333 0.18
334 0.19
335 0.18
336 0.18
337 0.18
338 0.16
339 0.17
340 0.19
341 0.2
342 0.23
343 0.33
344 0.4
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.53
349 0.56
350 0.63
351 0.57
352 0.52
353 0.41
354 0.37
355 0.34
356 0.29
357 0.26
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.14
370 0.15
371 0.14
372 0.2
373 0.2
374 0.24
375 0.26
376 0.29
377 0.27
378 0.26
379 0.27
380 0.28
381 0.35
382 0.33
383 0.39
384 0.36
385 0.4
386 0.41
387 0.45
388 0.48
389 0.43
390 0.47
391 0.4
392 0.42
393 0.43
394 0.42
395 0.39
396 0.34
397 0.34
398 0.27
399 0.29
400 0.27
401 0.24
402 0.26
403 0.24
404 0.23
405 0.25
406 0.26
407 0.23
408 0.23
409 0.23
410 0.2
411 0.21
412 0.2
413 0.17
414 0.14
415 0.14
416 0.16
417 0.21
418 0.22
419 0.21
420 0.19
421 0.19
422 0.21
423 0.22
424 0.22
425 0.18
426 0.19
427 0.23
428 0.25
429 0.28
430 0.28
431 0.31
432 0.28
433 0.25
434 0.23
435 0.21
436 0.19
437 0.16
438 0.14
439 0.1
440 0.15
441 0.15
442 0.17
443 0.19
444 0.24
445 0.31
446 0.33
447 0.35
448 0.36
449 0.41
450 0.42
451 0.39
452 0.37
453 0.33
454 0.31
455 0.3
456 0.26
457 0.24
458 0.21
459 0.21
460 0.21
461 0.17
462 0.19
463 0.19
464 0.23
465 0.22
466 0.22
467 0.22
468 0.2
469 0.2
470 0.16
471 0.15
472 0.11
473 0.1
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.07
490 0.06
491 0.05
492 0.14
493 0.14
494 0.15
495 0.15
496 0.14
497 0.15
498 0.18
499 0.19
500 0.13
501 0.13
502 0.14
503 0.18
504 0.18
505 0.18
506 0.17
507 0.16
508 0.14
509 0.14
510 0.14
511 0.1
512 0.1
513 0.1
514 0.11
515 0.14
516 0.19
517 0.22
518 0.22
519 0.24
520 0.24
521 0.26
522 0.31
523 0.31
524 0.27
525 0.27
526 0.3
527 0.28
528 0.37
529 0.39
530 0.33
531 0.31
532 0.32
533 0.3
534 0.26
535 0.27
536 0.21
537 0.18
538 0.19
539 0.2
540 0.18
541 0.18
542 0.18
543 0.18
544 0.16
545 0.14
546 0.12
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.1
552 0.09
553 0.09
554 0.09
555 0.11
556 0.16
557 0.24
558 0.32
559 0.42
560 0.48
561 0.5
562 0.58
563 0.64
564 0.67
565 0.7
566 0.72
567 0.72
568 0.77
569 0.78
570 0.81
571 0.77
572 0.73
573 0.66
574 0.65
575 0.65
576 0.56
577 0.62
578 0.59
579 0.59
580 0.57
581 0.6
582 0.53
583 0.47
584 0.46
585 0.37
586 0.36
587 0.4
588 0.36
589 0.33
590 0.3
591 0.29
592 0.3
593 0.31
594 0.28
595 0.21
596 0.23
597 0.22
598 0.24
599 0.24
600 0.23
601 0.25
602 0.21
603 0.21
604 0.2
605 0.22
606 0.26
607 0.27
608 0.3
609 0.36
610 0.45
611 0.54
612 0.63
613 0.72
614 0.77
615 0.84
616 0.9
617 0.92
618 0.93
619 0.93
620 0.94
621 0.94
622 0.91
623 0.86
624 0.8
625 0.71
626 0.6
627 0.5
628 0.39
629 0.28
630 0.21
631 0.16
632 0.11
633 0.09
634 0.11
635 0.1
636 0.1
637 0.11
638 0.11
639 0.14
640 0.14
641 0.14
642 0.14
643 0.14
644 0.18
645 0.19
646 0.19
647 0.19
648 0.26
649 0.36
650 0.43