Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A017SMH6

Protein Details
Accession A0A017SMH6    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
171-194EKIEKEGEEKKKKKKEEEESGDTEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
172-187KIEKEGEEKKKKKKEE
197-208GSKSAAKKRKRA
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036882  Alba-like_dom_sf  
IPR014612  Pop7/Rpp20  
IPR020241  RNase_P/MRP_Pop7_fungi  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF12328  Rpp20  
Amino Acid Sequences MAKRPLTRDLQFEKKNQDMVKLPKYARIQKRPIPHPPIASPYAGPSTPKTVYISSSTPFMSAVKRVQKLLHQTEKRAMASVHLSLSNKTKTDRQKLAQMAEGHEKMRKEAGQEEIFIKATGRAMEKAMRVGKWFGEREREYVTRVKTGSVIVVDDVVEDEEGRKKVVEEGEKIEKEGEEKKKKKKEEEESGDTESAGSKSAAKKRKRAAAAETEELPESRTRWVNVVEIAVTYK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.64
3 0.56
4 0.54
5 0.52
6 0.55
7 0.56
8 0.55
9 0.52
10 0.53
11 0.6
12 0.64
13 0.66
14 0.67
15 0.69
16 0.68
17 0.77
18 0.78
19 0.8
20 0.78
21 0.73
22 0.68
23 0.63
24 0.63
25 0.55
26 0.49
27 0.39
28 0.34
29 0.32
30 0.27
31 0.25
32 0.21
33 0.24
34 0.23
35 0.25
36 0.24
37 0.22
38 0.23
39 0.26
40 0.26
41 0.21
42 0.22
43 0.2
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.14
48 0.15
49 0.21
50 0.27
51 0.28
52 0.3
53 0.31
54 0.35
55 0.42
56 0.47
57 0.51
58 0.46
59 0.47
60 0.52
61 0.54
62 0.5
63 0.42
64 0.33
65 0.25
66 0.25
67 0.23
68 0.18
69 0.16
70 0.16
71 0.16
72 0.21
73 0.21
74 0.19
75 0.2
76 0.25
77 0.32
78 0.4
79 0.45
80 0.43
81 0.49
82 0.51
83 0.51
84 0.5
85 0.43
86 0.37
87 0.35
88 0.34
89 0.26
90 0.25
91 0.23
92 0.18
93 0.2
94 0.18
95 0.14
96 0.16
97 0.21
98 0.19
99 0.2
100 0.2
101 0.19
102 0.19
103 0.17
104 0.14
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.13
112 0.13
113 0.17
114 0.18
115 0.17
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.21
120 0.23
121 0.2
122 0.26
123 0.27
124 0.28
125 0.32
126 0.31
127 0.29
128 0.32
129 0.32
130 0.27
131 0.27
132 0.25
133 0.2
134 0.2
135 0.18
136 0.14
137 0.12
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.05
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.15
153 0.2
154 0.24
155 0.23
156 0.28
157 0.36
158 0.36
159 0.36
160 0.33
161 0.28
162 0.26
163 0.32
164 0.36
165 0.39
166 0.47
167 0.57
168 0.65
169 0.72
170 0.79
171 0.82
172 0.82
173 0.82
174 0.83
175 0.8
176 0.76
177 0.73
178 0.63
179 0.52
180 0.42
181 0.32
182 0.23
183 0.17
184 0.12
185 0.12
186 0.19
187 0.28
188 0.37
189 0.42
190 0.51
191 0.58
192 0.67
193 0.7
194 0.68
195 0.68
196 0.7
197 0.7
198 0.65
199 0.58
200 0.5
201 0.45
202 0.39
203 0.33
204 0.24
205 0.19
206 0.21
207 0.23
208 0.23
209 0.26
210 0.28
211 0.3
212 0.29
213 0.3
214 0.25