Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P28344

Protein Details
Accession P28344    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-57RTFNPTRKALLQRRVDRQAEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) pero 12.5, cyto_pero 10.5, cyto 7.5, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044856  Malate_synth_C_sf  
IPR011076  Malate_synth_sf  
IPR006252  Malate_synthA  
IPR001465  Malate_synthase  
IPR019830  Malate_synthase_CS  
IPR046363  MS_N_TIM-barrel_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0009514  C:glyoxysome  
GO:0005782  C:peroxisomal matrix  
GO:0005777  C:peroxisome  
GO:0004474  F:malate synthase activity  
GO:0045733  P:acetate catabolic process  
GO:0015976  P:carbon utilization  
GO:0009062  P:fatty acid catabolic process  
GO:0006097  P:glyoxylate cycle  
GO:0006099  P:tricarboxylic acid cycle  
KEGG ani:AN6653.2  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01274  Malate_synthase  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00510  MALATE_SYNTHASE  
CDD cd00727  malate_synt_A  
Amino Acid Sequences MSQVDAQLKDVAILGSVSNEARKILTKEACAFLAILHRTFNPTRKALLQRRVDRQAEIDKGHLPDFLPETKHIRDDPSWKGAPPAPGLVDRRVEITGPTDRKMVVNALNSDVWTYMADFEDSSAPTWDNMINGQINLYDAIRRQVDFKQGQKEYKLRTDRTLPTLIARARGWHLDEKHFTVDGEPISGSLFDFGLYFFHNAKELVARGFGPYFYLPKMESHLEARLWNDVFNLAQDYIGMPRGTIRGTVLIETITAAFEMEEIIYELRDHSSGLNCGRWDYIFSFIKKFRQHPNFVLPDRSDVTMTVPFMDAYVKLLIKTCHKRGVHAMGGMAAQIPIKDNAEANDKAMEGVRADKLREVRAGHDGTWVAHPALASIASEVFNKYMPTPNQMHVRREDVNITANDLLNTNVPGKITEDGIRKNLNIGLSYMEGWLRGVGCIPINYLMEDAATAEVSRSQLWQWARHGVTTSEGKKVDKAYALRLLKEQADALAAKGPKGNKFQLAGRYFAGQVTGEDYADFLTSLLYNEISSPGTASKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.1
4 0.1
5 0.11
6 0.12
7 0.12
8 0.13
9 0.18
10 0.21
11 0.28
12 0.32
13 0.36
14 0.4
15 0.42
16 0.41
17 0.36
18 0.33
19 0.26
20 0.29
21 0.26
22 0.22
23 0.21
24 0.21
25 0.27
26 0.31
27 0.37
28 0.36
29 0.36
30 0.39
31 0.45
32 0.55
33 0.58
34 0.63
35 0.67
36 0.69
37 0.75
38 0.8
39 0.75
40 0.66
41 0.62
42 0.61
43 0.56
44 0.49
45 0.43
46 0.38
47 0.38
48 0.37
49 0.32
50 0.24
51 0.22
52 0.24
53 0.25
54 0.24
55 0.25
56 0.3
57 0.31
58 0.35
59 0.33
60 0.34
61 0.36
62 0.4
63 0.43
64 0.45
65 0.45
66 0.41
67 0.44
68 0.42
69 0.41
70 0.37
71 0.33
72 0.28
73 0.31
74 0.35
75 0.34
76 0.33
77 0.29
78 0.28
79 0.26
80 0.24
81 0.19
82 0.2
83 0.25
84 0.26
85 0.27
86 0.26
87 0.26
88 0.26
89 0.27
90 0.27
91 0.23
92 0.25
93 0.26
94 0.27
95 0.27
96 0.26
97 0.25
98 0.21
99 0.16
100 0.11
101 0.1
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.09
107 0.11
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.13
114 0.12
115 0.1
116 0.1
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.16
131 0.19
132 0.28
133 0.32
134 0.37
135 0.43
136 0.46
137 0.5
138 0.53
139 0.56
140 0.52
141 0.56
142 0.58
143 0.51
144 0.51
145 0.55
146 0.54
147 0.53
148 0.51
149 0.42
150 0.36
151 0.4
152 0.36
153 0.32
154 0.27
155 0.24
156 0.23
157 0.24
158 0.25
159 0.25
160 0.27
161 0.3
162 0.33
163 0.33
164 0.33
165 0.31
166 0.28
167 0.23
168 0.22
169 0.16
170 0.14
171 0.11
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.17
209 0.17
210 0.17
211 0.17
212 0.18
213 0.17
214 0.15
215 0.13
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.09
226 0.08
227 0.06
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.07
259 0.09
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.16
269 0.18
270 0.19
271 0.22
272 0.24
273 0.3
274 0.33
275 0.36
276 0.4
277 0.44
278 0.48
279 0.48
280 0.54
281 0.55
282 0.52
283 0.52
284 0.42
285 0.37
286 0.34
287 0.3
288 0.22
289 0.15
290 0.16
291 0.14
292 0.14
293 0.11
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.07
299 0.07
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.1
304 0.12
305 0.2
306 0.27
307 0.28
308 0.35
309 0.35
310 0.37
311 0.41
312 0.46
313 0.41
314 0.35
315 0.32
316 0.24
317 0.24
318 0.21
319 0.16
320 0.09
321 0.06
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.15
330 0.15
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.13
337 0.08
338 0.1
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.16
343 0.19
344 0.2
345 0.24
346 0.22
347 0.21
348 0.27
349 0.28
350 0.25
351 0.25
352 0.23
353 0.21
354 0.21
355 0.2
356 0.13
357 0.12
358 0.12
359 0.09
360 0.09
361 0.08
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.17
373 0.18
374 0.23
375 0.25
376 0.3
377 0.39
378 0.43
379 0.46
380 0.41
381 0.46
382 0.43
383 0.41
384 0.39
385 0.31
386 0.31
387 0.27
388 0.27
389 0.23
390 0.21
391 0.19
392 0.18
393 0.16
394 0.12
395 0.13
396 0.11
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.12
401 0.12
402 0.14
403 0.18
404 0.22
405 0.24
406 0.29
407 0.3
408 0.28
409 0.29
410 0.29
411 0.25
412 0.2
413 0.18
414 0.16
415 0.15
416 0.15
417 0.14
418 0.12
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.09
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.13
430 0.13
431 0.13
432 0.13
433 0.11
434 0.1
435 0.09
436 0.09
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.09
443 0.09
444 0.1
445 0.1
446 0.16
447 0.19
448 0.24
449 0.26
450 0.34
451 0.34
452 0.35
453 0.36
454 0.31
455 0.33
456 0.37
457 0.36
458 0.34
459 0.35
460 0.34
461 0.36
462 0.37
463 0.36
464 0.34
465 0.34
466 0.34
467 0.42
468 0.43
469 0.42
470 0.42
471 0.41
472 0.36
473 0.35
474 0.29
475 0.2
476 0.2
477 0.18
478 0.16
479 0.19
480 0.18
481 0.17
482 0.21
483 0.24
484 0.27
485 0.34
486 0.38
487 0.37
488 0.4
489 0.45
490 0.51
491 0.5
492 0.47
493 0.41
494 0.39
495 0.35
496 0.31
497 0.27
498 0.18
499 0.16
500 0.16
501 0.16
502 0.13
503 0.12
504 0.12
505 0.11
506 0.11
507 0.1
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.12
517 0.12
518 0.11
519 0.12