Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

J3KDH0

Protein Details
Accession J3KDH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-55AGEATEGKRRKRQPQSAEELKRELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
572-598QRGGSQRGGGGQQRGGPQQRGRGQPAP
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 10.5, nucl 8.5, cysk 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
KEGG cim:CIMG_04434  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MASDLASAMQQVQINAQALDVDAELDAWIDGAGEATEGKRRKRQPQSAEELKRELEEEFLAPSPRFNTQWLNRLQKRWEAPVDYADLFELAPTQTRTVIRFTREGLEGRVTRYREVTVPAGSATAKNSTSLRRRPAGRAEFVRGAAGFYPFEPGGLEAVEAISVLESEAQAEELRASAAAGKSSLDRIIKFGVEGGLLEVAPGLSRGLDFKKEKAAEAERDADDVQDALQRDDSQLDREVGEAGHEVDGGPKKEEPDEGLASDEEEDIDSLLPVEYPALEPRGELLAASAKKAGREWAHVVDVNKEITNFYDLVPDMAREYPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFDDVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTPKRPVPLEHFLWAGKSMHKIVDAEKRFIESGWKQADDILSGRDKIRAQKEAEAKANQRGGFVDRGRGQSQRGAQRGAQRGGSQRGGGGQQRGGPQQRGRGQPAPRGIGNIARTGRGGGRTTAAQDRNIWVHLVLHLKKESMLPACIFVFSKKRCEENADSLSNQDFCVASEKSSIHMLIEKSLARLKVEDRRLPQIRRVRELLSRGIGVHHGGLLPIIKEIVEILFARGLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGRQFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGSVIIATSGRDEAPPIWALKKMILGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHQKQVQISEATLEKITREPCAICDIDLETCHRASVEFGRLTVRLHTLLLASPVGRRLFATKRVVVYRKNGVRTVGMLAKEGVSGGAAPSLQVFEFGPQSLVRHPSDILPYLPMFRHYFVPLPRLASDMHLKTCKVPLMDLECVTSAVVKFGGPPYALNNKKEGLKIANKELIPLASSWEKAEWDELDWGRMKELQVIEVLNERQKQLEIAQSCQCFQCPQFLKHFEMQHDEWQVKENISQLKQLMSDQNLQLLPDYEQRLQVLKDLGFVDEACRVQLKGKVACEIHSADELVLTELILENVLAEYEPEEIVALLSAFVFEEKTENAPTLTPRLEKGKEAIIDISNRVNDLQVKHQVILSSEDAGDFESKPRFNLVEVVYEWARGMSFNRITDLTDVMEGTIVRVITRLDETCREVKSAAKLVGDPSLYTKMQTAQEMIKRDVIFAASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.17
4 0.14
5 0.13
6 0.13
7 0.12
8 0.08
9 0.06
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.05
15 0.05
16 0.04
17 0.04
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.06
22 0.07
23 0.15
24 0.2
25 0.26
26 0.35
27 0.44
28 0.54
29 0.65
30 0.74
31 0.77
32 0.82
33 0.86
34 0.88
35 0.89
36 0.83
37 0.75
38 0.66
39 0.57
40 0.47
41 0.38
42 0.29
43 0.22
44 0.18
45 0.17
46 0.18
47 0.2
48 0.19
49 0.2
50 0.21
51 0.23
52 0.24
53 0.24
54 0.32
55 0.35
56 0.44
57 0.51
58 0.6
59 0.62
60 0.67
61 0.69
62 0.67
63 0.66
64 0.66
65 0.64
66 0.57
67 0.54
68 0.51
69 0.51
70 0.43
71 0.37
72 0.29
73 0.22
74 0.18
75 0.15
76 0.12
77 0.08
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.17
82 0.2
83 0.22
84 0.28
85 0.33
86 0.33
87 0.35
88 0.37
89 0.37
90 0.39
91 0.39
92 0.35
93 0.38
94 0.35
95 0.37
96 0.41
97 0.38
98 0.36
99 0.36
100 0.35
101 0.3
102 0.32
103 0.31
104 0.26
105 0.26
106 0.24
107 0.23
108 0.21
109 0.2
110 0.17
111 0.18
112 0.16
113 0.17
114 0.2
115 0.28
116 0.36
117 0.43
118 0.48
119 0.52
120 0.56
121 0.61
122 0.69
123 0.68
124 0.68
125 0.66
126 0.65
127 0.61
128 0.57
129 0.52
130 0.41
131 0.35
132 0.27
133 0.23
134 0.17
135 0.13
136 0.17
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.06
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.14
171 0.18
172 0.17
173 0.17
174 0.19
175 0.22
176 0.21
177 0.2
178 0.19
179 0.16
180 0.13
181 0.13
182 0.11
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.05
189 0.06
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.08
194 0.11
195 0.19
196 0.22
197 0.24
198 0.33
199 0.34
200 0.35
201 0.39
202 0.43
203 0.4
204 0.43
205 0.46
206 0.37
207 0.38
208 0.36
209 0.29
210 0.23
211 0.17
212 0.14
213 0.11
214 0.12
215 0.11
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.19
223 0.19
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.14
228 0.14
229 0.12
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.12
235 0.17
236 0.18
237 0.19
238 0.19
239 0.21
240 0.22
241 0.23
242 0.21
243 0.23
244 0.23
245 0.21
246 0.22
247 0.2
248 0.19
249 0.19
250 0.15
251 0.1
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.08
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.13
270 0.12
271 0.1
272 0.1
273 0.15
274 0.15
275 0.17
276 0.19
277 0.17
278 0.19
279 0.2
280 0.24
281 0.2
282 0.25
283 0.29
284 0.29
285 0.32
286 0.34
287 0.34
288 0.31
289 0.31
290 0.27
291 0.23
292 0.19
293 0.16
294 0.15
295 0.16
296 0.14
297 0.12
298 0.14
299 0.13
300 0.15
301 0.15
302 0.14
303 0.13
304 0.15
305 0.14
306 0.11
307 0.13
308 0.13
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.14
313 0.16
314 0.18
315 0.16
316 0.16
317 0.15
318 0.16
319 0.18
320 0.18
321 0.17
322 0.15
323 0.15
324 0.14
325 0.14
326 0.13
327 0.1
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.08
356 0.1
357 0.11
358 0.18
359 0.19
360 0.21
361 0.23
362 0.26
363 0.26
364 0.3
365 0.37
366 0.38
367 0.46
368 0.47
369 0.52
370 0.54
371 0.55
372 0.61
373 0.53
374 0.48
375 0.45
376 0.46
377 0.4
378 0.35
379 0.33
380 0.22
381 0.21
382 0.17
383 0.1
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.11
408 0.1
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.09
422 0.07
423 0.06
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.09
429 0.07
430 0.09
431 0.09
432 0.07
433 0.07
434 0.08
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.04
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.09
465 0.1
466 0.1
467 0.16
468 0.22
469 0.26
470 0.29
471 0.34
472 0.37
473 0.39
474 0.45
475 0.41
476 0.41
477 0.45
478 0.52
479 0.51
480 0.51
481 0.49
482 0.45
483 0.46
484 0.4
485 0.34
486 0.32
487 0.35
488 0.32
489 0.32
490 0.31
491 0.28
492 0.28
493 0.26
494 0.2
495 0.14
496 0.14
497 0.14
498 0.13
499 0.14
500 0.14
501 0.17
502 0.25
503 0.26
504 0.26
505 0.25
506 0.26
507 0.25
508 0.24
509 0.26
510 0.18
511 0.23
512 0.24
513 0.24
514 0.22
515 0.24
516 0.24
517 0.19
518 0.18
519 0.13
520 0.11
521 0.12
522 0.13
523 0.15
524 0.16
525 0.21
526 0.25
527 0.28
528 0.29
529 0.35
530 0.41
531 0.43
532 0.46
533 0.44
534 0.41
535 0.41
536 0.43
537 0.36
538 0.3
539 0.26
540 0.24
541 0.25
542 0.23
543 0.23
544 0.22
545 0.26
546 0.27
547 0.27
548 0.26
549 0.25
550 0.3
551 0.32
552 0.31
553 0.3
554 0.31
555 0.38
556 0.42
557 0.4
558 0.35
559 0.3
560 0.32
561 0.34
562 0.32
563 0.24
564 0.18
565 0.18
566 0.19
567 0.19
568 0.16
569 0.14
570 0.16
571 0.18
572 0.22
573 0.23
574 0.24
575 0.24
576 0.3
577 0.35
578 0.36
579 0.39
580 0.42
581 0.42
582 0.44
583 0.46
584 0.41
585 0.35
586 0.33
587 0.28
588 0.26
589 0.24
590 0.23
591 0.2
592 0.17
593 0.17
594 0.16
595 0.17
596 0.15
597 0.15
598 0.11
599 0.12
600 0.12
601 0.14
602 0.19
603 0.19
604 0.18
605 0.17
606 0.18
607 0.18
608 0.18
609 0.16
610 0.1
611 0.09
612 0.11
613 0.16
614 0.16
615 0.17
616 0.17
617 0.17
618 0.18
619 0.18
620 0.18
621 0.13
622 0.14
623 0.12
624 0.13
625 0.13
626 0.13
627 0.12
628 0.11
629 0.17
630 0.17
631 0.23
632 0.24
633 0.26
634 0.27
635 0.33
636 0.35
637 0.36
638 0.4
639 0.35
640 0.33
641 0.32
642 0.31
643 0.25
644 0.21
645 0.14
646 0.08
647 0.07
648 0.11
649 0.1
650 0.1
651 0.12
652 0.12
653 0.12
654 0.13
655 0.13
656 0.09
657 0.12
658 0.12
659 0.1
660 0.12
661 0.12
662 0.12
663 0.14
664 0.15
665 0.12
666 0.13
667 0.15
668 0.2
669 0.26
670 0.29
671 0.3
672 0.38
673 0.44
674 0.45
675 0.49
676 0.49
677 0.47
678 0.47
679 0.47
680 0.41
681 0.38
682 0.4
683 0.35
684 0.29
685 0.25
686 0.21
687 0.19
688 0.17
689 0.13
690 0.1
691 0.07
692 0.06
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.05
697 0.04
698 0.04
699 0.04
700 0.04
701 0.04
702 0.04
703 0.05
704 0.05
705 0.05
706 0.05
707 0.06
708 0.06
709 0.06
710 0.06
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.04
715 0.05
716 0.05
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.06
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.07
725 0.07
726 0.07
727 0.07
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.07
732 0.08
733 0.1
734 0.12
735 0.18
736 0.19
737 0.24
738 0.25
739 0.26
740 0.32
741 0.38
742 0.41
743 0.42
744 0.44
745 0.4
746 0.45
747 0.44
748 0.39
749 0.33
750 0.28
751 0.22
752 0.19
753 0.18
754 0.11
755 0.11
756 0.1
757 0.08
758 0.09
759 0.11
760 0.11
761 0.12
762 0.12
763 0.12
764 0.12
765 0.12
766 0.11
767 0.09
768 0.09
769 0.08
770 0.07
771 0.06
772 0.06
773 0.05
774 0.04
775 0.04
776 0.05
777 0.05
778 0.05
779 0.06
780 0.06
781 0.08
782 0.1
783 0.1
784 0.11
785 0.12
786 0.13
787 0.13
788 0.16
789 0.14
790 0.15
791 0.19
792 0.19
793 0.2
794 0.24
795 0.26
796 0.26
797 0.28
798 0.27
799 0.26
800 0.3
801 0.34
802 0.33
803 0.37
804 0.36
805 0.38
806 0.38
807 0.36
808 0.32
809 0.25
810 0.22
811 0.15
812 0.13
813 0.09
814 0.07
815 0.06
816 0.05
817 0.06
818 0.06
819 0.07
820 0.09
821 0.11
822 0.13
823 0.14
824 0.14
825 0.15
826 0.16
827 0.18
828 0.17
829 0.2
830 0.2
831 0.2
832 0.21
833 0.2
834 0.19
835 0.18
836 0.19
837 0.17
838 0.18
839 0.18
840 0.19
841 0.2
842 0.2
843 0.2
844 0.22
845 0.2
846 0.16
847 0.16
848 0.15
849 0.15
850 0.15
851 0.13
852 0.1
853 0.13
854 0.14
855 0.13
856 0.14
857 0.13
858 0.14
859 0.18
860 0.18
861 0.14
862 0.15
863 0.15
864 0.14
865 0.14
866 0.16
867 0.13
868 0.13
869 0.12
870 0.11
871 0.1
872 0.11
873 0.15
874 0.19
875 0.18
876 0.18
877 0.2
878 0.21
879 0.21
880 0.21
881 0.19
882 0.13
883 0.13
884 0.13
885 0.11
886 0.11
887 0.12
888 0.11
889 0.09
890 0.09
891 0.13
892 0.13
893 0.12
894 0.12
895 0.16
896 0.2
897 0.27
898 0.33
899 0.32
900 0.36
901 0.42
902 0.46
903 0.45
904 0.46
905 0.48
906 0.49
907 0.5
908 0.47
909 0.42
910 0.38
911 0.36
912 0.34
913 0.29
914 0.23
915 0.2
916 0.18
917 0.17
918 0.16
919 0.14
920 0.1
921 0.06
922 0.05
923 0.04
924 0.05
925 0.04
926 0.04
927 0.05
928 0.05
929 0.05
930 0.06
931 0.06
932 0.07
933 0.08
934 0.08
935 0.09
936 0.09
937 0.11
938 0.13
939 0.18
940 0.17
941 0.17
942 0.18
943 0.19
944 0.22
945 0.23
946 0.2
947 0.18
948 0.18
949 0.19
950 0.19
951 0.2
952 0.19
953 0.18
954 0.2
955 0.2
956 0.24
957 0.24
958 0.28
959 0.26
960 0.27
961 0.26
962 0.24
963 0.23
964 0.21
965 0.26
966 0.25
967 0.28
968 0.28
969 0.28
970 0.28
971 0.31
972 0.31
973 0.24
974 0.22
975 0.22
976 0.26
977 0.28
978 0.27
979 0.25
980 0.22
981 0.21
982 0.21
983 0.17
984 0.11
985 0.09
986 0.09
987 0.07
988 0.08
989 0.09
990 0.12
991 0.11
992 0.11
993 0.16
994 0.26
995 0.3
996 0.31
997 0.32
998 0.33
999 0.36
1000 0.37
1001 0.35
1002 0.32
1003 0.36
1004 0.39
1005 0.42
1006 0.46
1007 0.42
1008 0.42
1009 0.39
1010 0.32
1011 0.25
1012 0.21
1013 0.18
1014 0.15
1015 0.15
1016 0.15
1017 0.15
1018 0.15
1019 0.15
1020 0.17
1021 0.14
1022 0.13
1023 0.19
1024 0.18
1025 0.21
1026 0.23
1027 0.23
1028 0.22
1029 0.23
1030 0.22
1031 0.21
1032 0.21
1033 0.19
1034 0.18
1035 0.18
1036 0.18
1037 0.2
1038 0.22
1039 0.21
1040 0.22
1041 0.21
1042 0.21
1043 0.21
1044 0.21
1045 0.19
1046 0.25
1047 0.22
1048 0.25
1049 0.31
1050 0.31
1051 0.32
1052 0.31
1053 0.3
1054 0.24
1055 0.23
1056 0.29
1057 0.28
1058 0.31
1059 0.39
1060 0.42
1061 0.47
1062 0.5
1063 0.54
1064 0.47
1065 0.48
1066 0.47
1067 0.44
1068 0.45
1069 0.4
1070 0.34
1071 0.34
1072 0.33
1073 0.27
1074 0.26
1075 0.24
1076 0.27
1077 0.28
1078 0.31
1079 0.27
1080 0.28
1081 0.28
1082 0.3
1083 0.3
1084 0.26
1085 0.3
1086 0.27
1087 0.31
1088 0.29
1089 0.28
1090 0.26
1091 0.22
1092 0.21
1093 0.21
1094 0.25
1095 0.21
1096 0.23
1097 0.24
1098 0.26
1099 0.25
1100 0.26
1101 0.25
1102 0.2
1103 0.23
1104 0.21
1105 0.21
1106 0.19
1107 0.18
1108 0.16
1109 0.16
1110 0.16
1111 0.13
1112 0.14
1113 0.14
1114 0.16
1115 0.21
1116 0.25
1117 0.27
1118 0.29
1119 0.35
1120 0.34
1121 0.35
1122 0.36
1123 0.34
1124 0.3
1125 0.26
1126 0.24
1127 0.17
1128 0.17
1129 0.16
1130 0.13
1131 0.11
1132 0.09
1133 0.07
1134 0.07
1135 0.07
1136 0.06
1137 0.05
1138 0.04
1139 0.04
1140 0.05
1141 0.04
1142 0.04
1143 0.05
1144 0.06
1145 0.06
1146 0.06
1147 0.06
1148 0.06
1149 0.06
1150 0.06
1151 0.06
1152 0.04
1153 0.04
1154 0.05
1155 0.04
1156 0.05
1157 0.05
1158 0.05
1159 0.07
1160 0.08
1161 0.12
1162 0.13
1163 0.14
1164 0.14
1165 0.16
1166 0.19
1167 0.22
1168 0.25
1169 0.24
1170 0.26
1171 0.33
1172 0.34
1173 0.35
1174 0.35
1175 0.37
1176 0.35
1177 0.35
1178 0.35
1179 0.31
1180 0.31
1181 0.31
1182 0.32
1183 0.25
1184 0.25
1185 0.23
1186 0.22
1187 0.23
1188 0.23
1189 0.29
1190 0.33
1191 0.35
1192 0.35
1193 0.37
1194 0.35
1195 0.33
1196 0.34
1197 0.28
1198 0.22
1199 0.19
1200 0.18
1201 0.17
1202 0.17
1203 0.17
1204 0.13
1205 0.16
1206 0.19
1207 0.2
1208 0.21
1209 0.24
1210 0.24
1211 0.23
1212 0.29
1213 0.27
1214 0.27
1215 0.27
1216 0.32
1217 0.28
1218 0.28
1219 0.27
1220 0.2
1221 0.18
1222 0.13
1223 0.14
1224 0.18
1225 0.22
1226 0.23
1227 0.26
1228 0.26
1229 0.28
1230 0.28
1231 0.28
1232 0.21
1233 0.17
1234 0.16
1235 0.13
1236 0.14
1237 0.12
1238 0.11
1239 0.12
1240 0.1
1241 0.09
1242 0.1
1243 0.1
1244 0.11
1245 0.16
1246 0.17
1247 0.19
1248 0.24
1249 0.29
1250 0.34
1251 0.35
1252 0.35
1253 0.31
1254 0.34
1255 0.37
1256 0.4
1257 0.38
1258 0.35
1259 0.35
1260 0.34
1261 0.39
1262 0.35
1263 0.28
1264 0.25
1265 0.28
1266 0.26
1267 0.25
1268 0.25
1269 0.26
1270 0.28
1271 0.3
1272 0.29
1273 0.31
1274 0.37
1275 0.42
1276 0.42
1277 0.43
1278 0.4
1279 0.38
1280 0.36
1281 0.29
1282 0.24