Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C8VRX7

Protein Details
Accession C8VRX7    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-165GGDGKKSKGKGKKGARRDSDATBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
147-160GKKSKGKGKKGARR
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_mito 10.333, mito_nucl 7.333, mito 7, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG ani:AN1353.2  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MAEPRARAARHKGQMNFPSECWFFLSSLRLLLLAYGDPAPHPSFPSEPLPETVRVLDEIVTDFVLEMCHGAAQHANYSRRQKIKVDDFRFALRRDPNKLGRVQELLRMERELKEARKQFDQNDDQVGNLKDAAGKRGLDDIGDGGDGKKSKGKGKKGARRDSDATEDTSMAKKRKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.68
3 0.62
4 0.53
5 0.52
6 0.44
7 0.4
8 0.33
9 0.27
10 0.22
11 0.21
12 0.24
13 0.18
14 0.18
15 0.17
16 0.14
17 0.13
18 0.12
19 0.11
20 0.07
21 0.08
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.11
26 0.12
27 0.12
28 0.13
29 0.14
30 0.15
31 0.19
32 0.24
33 0.23
34 0.23
35 0.26
36 0.27
37 0.26
38 0.25
39 0.23
40 0.18
41 0.16
42 0.14
43 0.12
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.05
53 0.04
54 0.03
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.05
59 0.06
60 0.09
61 0.15
62 0.17
63 0.21
64 0.27
65 0.33
66 0.36
67 0.38
68 0.38
69 0.41
70 0.49
71 0.55
72 0.53
73 0.5
74 0.48
75 0.49
76 0.49
77 0.41
78 0.36
79 0.32
80 0.32
81 0.34
82 0.39
83 0.41
84 0.42
85 0.44
86 0.41
87 0.37
88 0.37
89 0.32
90 0.31
91 0.3
92 0.27
93 0.25
94 0.24
95 0.22
96 0.2
97 0.23
98 0.23
99 0.22
100 0.29
101 0.33
102 0.35
103 0.41
104 0.42
105 0.42
106 0.46
107 0.48
108 0.41
109 0.42
110 0.39
111 0.32
112 0.34
113 0.31
114 0.22
115 0.18
116 0.16
117 0.14
118 0.14
119 0.16
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.17
124 0.17
125 0.14
126 0.14
127 0.12
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.07
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.15
136 0.18
137 0.27
138 0.35
139 0.44
140 0.51
141 0.62
142 0.71
143 0.77
144 0.85
145 0.83
146 0.82
147 0.78
148 0.73
149 0.7
150 0.62
151 0.55
152 0.46
153 0.4
154 0.34
155 0.35
156 0.36