Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

J3KHZ4

Protein Details
Accession J3KHZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
336-355KPLTPPKAVGPPRRRPPPNPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
341-363PKAVGPPRRRPPPNPLLIPKRRA
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG cim:CIMG_00886  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MVVPSLLHMARRACVKQAKAIDDVGDAPYGLVRPILLKVENPRQLHALETNSPQLKEYTGEIWIEFIKRDIPFWRDVKLPENPESWFNFYRSLRQQALRELELQAERIKQAMNGLRSEKAKHSPKVVNARKLGLPQEKPTSLQKYANYDRQMGGLQPVFVRARTQNDKGLTPYSQTSRWTFEKPKLPTTTKPKKSTLPVAKRNKRLCIPTHQLNKRASAIKKAPISFVEDYKYEQRLAQRNTDRKVPAARASPPKRIKESSTSSQRPASSLTRPNSSGLGRPQTITAKPPGLPLTEPKLTLSGVPQPRPATAKPPRLETPKQNASSSTATPQPDAKPLTPPKAVGPPRRRPPPNPLLIPKRRAGPLPAQMLTGPARQSASSKRLLDSGLAGSDAVPERSRVKKQRIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.42
3 0.46
4 0.52
5 0.52
6 0.48
7 0.48
8 0.41
9 0.35
10 0.34
11 0.27
12 0.2
13 0.15
14 0.12
15 0.12
16 0.11
17 0.09
18 0.08
19 0.07
20 0.08
21 0.1
22 0.14
23 0.14
24 0.18
25 0.26
26 0.36
27 0.43
28 0.43
29 0.43
30 0.42
31 0.41
32 0.41
33 0.37
34 0.32
35 0.29
36 0.31
37 0.36
38 0.37
39 0.37
40 0.34
41 0.31
42 0.27
43 0.24
44 0.23
45 0.18
46 0.17
47 0.17
48 0.16
49 0.17
50 0.17
51 0.17
52 0.14
53 0.13
54 0.16
55 0.15
56 0.18
57 0.21
58 0.23
59 0.29
60 0.31
61 0.33
62 0.32
63 0.34
64 0.38
65 0.4
66 0.42
67 0.39
68 0.39
69 0.38
70 0.38
71 0.39
72 0.4
73 0.34
74 0.31
75 0.34
76 0.32
77 0.39
78 0.41
79 0.44
80 0.43
81 0.45
82 0.47
83 0.47
84 0.52
85 0.45
86 0.41
87 0.35
88 0.33
89 0.29
90 0.27
91 0.22
92 0.18
93 0.17
94 0.16
95 0.16
96 0.12
97 0.18
98 0.22
99 0.22
100 0.24
101 0.26
102 0.3
103 0.31
104 0.34
105 0.32
106 0.36
107 0.41
108 0.41
109 0.46
110 0.47
111 0.53
112 0.62
113 0.65
114 0.64
115 0.58
116 0.58
117 0.53
118 0.5
119 0.5
120 0.46
121 0.42
122 0.38
123 0.42
124 0.39
125 0.4
126 0.43
127 0.42
128 0.37
129 0.39
130 0.37
131 0.4
132 0.45
133 0.49
134 0.45
135 0.41
136 0.38
137 0.35
138 0.32
139 0.24
140 0.22
141 0.15
142 0.14
143 0.12
144 0.15
145 0.14
146 0.13
147 0.15
148 0.14
149 0.21
150 0.26
151 0.28
152 0.3
153 0.32
154 0.33
155 0.32
156 0.33
157 0.26
158 0.22
159 0.22
160 0.19
161 0.19
162 0.21
163 0.21
164 0.23
165 0.26
166 0.3
167 0.31
168 0.35
169 0.42
170 0.42
171 0.47
172 0.49
173 0.49
174 0.51
175 0.58
176 0.62
177 0.63
178 0.65
179 0.62
180 0.6
181 0.61
182 0.64
183 0.64
184 0.63
185 0.64
186 0.7
187 0.74
188 0.78
189 0.78
190 0.72
191 0.66
192 0.61
193 0.55
194 0.53
195 0.52
196 0.51
197 0.57
198 0.56
199 0.59
200 0.55
201 0.53
202 0.48
203 0.48
204 0.41
205 0.38
206 0.38
207 0.37
208 0.4
209 0.38
210 0.36
211 0.3
212 0.35
213 0.29
214 0.26
215 0.23
216 0.18
217 0.2
218 0.23
219 0.23
220 0.18
221 0.18
222 0.23
223 0.3
224 0.32
225 0.39
226 0.43
227 0.49
228 0.5
229 0.55
230 0.49
231 0.44
232 0.46
233 0.4
234 0.37
235 0.35
236 0.39
237 0.43
238 0.48
239 0.54
240 0.57
241 0.59
242 0.59
243 0.58
244 0.55
245 0.53
246 0.55
247 0.54
248 0.57
249 0.56
250 0.53
251 0.55
252 0.51
253 0.44
254 0.41
255 0.35
256 0.32
257 0.36
258 0.37
259 0.36
260 0.37
261 0.37
262 0.36
263 0.33
264 0.31
265 0.28
266 0.31
267 0.28
268 0.27
269 0.29
270 0.3
271 0.3
272 0.28
273 0.27
274 0.24
275 0.24
276 0.27
277 0.26
278 0.23
279 0.23
280 0.24
281 0.27
282 0.26
283 0.26
284 0.24
285 0.23
286 0.22
287 0.21
288 0.19
289 0.22
290 0.26
291 0.27
292 0.31
293 0.31
294 0.33
295 0.37
296 0.36
297 0.37
298 0.4
299 0.48
300 0.46
301 0.51
302 0.55
303 0.59
304 0.64
305 0.64
306 0.64
307 0.64
308 0.65
309 0.6
310 0.55
311 0.52
312 0.49
313 0.42
314 0.35
315 0.31
316 0.29
317 0.29
318 0.32
319 0.29
320 0.31
321 0.34
322 0.31
323 0.36
324 0.41
325 0.46
326 0.44
327 0.43
328 0.41
329 0.47
330 0.54
331 0.55
332 0.59
333 0.63
334 0.7
335 0.8
336 0.82
337 0.78
338 0.8
339 0.8
340 0.79
341 0.78
342 0.77
343 0.78
344 0.8
345 0.8
346 0.73
347 0.69
348 0.62
349 0.56
350 0.52
351 0.5
352 0.5
353 0.52
354 0.49
355 0.44
356 0.41
357 0.41
358 0.38
359 0.33
360 0.25
361 0.19
362 0.2
363 0.2
364 0.24
365 0.29
366 0.32
367 0.36
368 0.38
369 0.37
370 0.38
371 0.39
372 0.36
373 0.31
374 0.28
375 0.21
376 0.18
377 0.17
378 0.14
379 0.18
380 0.18
381 0.17
382 0.15
383 0.17
384 0.23
385 0.31
386 0.41
387 0.46