FuNGI

W9CHV3

Protein Details

Accession

W9CHV3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
123-145	STGRARFKPKNIRRDQADRERLE	Hydrophilic
421-441	PQQSKIQRPSRKKDKMPVIQT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-20	SRGRPRGRGR
110-141	RGRGGASTRARGESTGRARFKPKNIRRDQADR
160-175	EKEARRAQRGRGQVGR

Subcellular Location(s)

mito 20, cyto 5.5, cyto_nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAERGATSRGRPRGRGRGIAIEAVETPELIGVLEQSTQPTQSTQSPAPVEPVAPVAPMTQSAGIITPKVEPNDDAFDPNTSPATMPAETPATTPAKPPPRTESAIIRGRGGASTRARGESTGRARFKPKNIRRDQADRERLEQEERDRKSANQAQAEKEARRAQRGRGQVGRGRGDAMGQNRGAGRGDPISSATGIFSVAPAAMDRKGGMGGFAIATARGSGGGGGGGSGGFGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGSGSGIGGGGGVNVLSAENSATFDPEYPDEGDGQVRKVNIEMINLVEDDDDDDMVGSGRGGKVGFKSRSLAPIRIKREEHKERSNMMVSDPDLAEVVKKQAGKAEGNQAGEDVEMTVDGVTSTGSSDEPRAKGEPGLESPTLSKFPEFKAPSSPEEKKPPKTEPVSPQQSKIQRPSRKKDKMPVIQTEEDKFEYERYLEDVDILAEELRLLRGTVDTTPNDKGKGKAIDADGDVGMDGEKEEESQPEANHADGRIYIFQFPPVLPRLFNPQVEDQEDAIVTQSSEQIDLTDDKDKTIKKESEEVIIKAEPNPTPENEELISEQGYIGKLVVRKSGKVELDWGGTSMAVGRGVPAAFLSQIVLAEDPKGEAPEGVATGLGKVMGKFIVTPDWEKIF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.73
3	0.75
4	0.75
5	0.73
6	0.69
7	0.69
8	0.66
9	0.62
10	0.53
11	0.44
12	0.37
13	0.31
14	0.26
15	0.16
16	0.13
17	0.09
18	0.09
19	0.07
20	0.07
21	0.05
22	0.06
23	0.07
24	0.08
25	0.1
26	0.12
27	0.13
28	0.14
29	0.14
30	0.17
31	0.21
32	0.27
33	0.26
34	0.32
35	0.34
36	0.34
37	0.36
38	0.34
39	0.29
40	0.24
41	0.25
42	0.18
43	0.15
44	0.15
45	0.12
46	0.12
47	0.12
48	0.13
49	0.11
50	0.1
51	0.1
52	0.13
53	0.13
54	0.13
55	0.13
56	0.15
57	0.18
58	0.19
59	0.2
60	0.19
61	0.22
62	0.28
63	0.28
64	0.27
65	0.24
66	0.24
67	0.24
68	0.24
69	0.21
70	0.15
71	0.15
72	0.14
73	0.18
74	0.16
75	0.15
76	0.17
77	0.18
78	0.18
79	0.19
80	0.22
81	0.21
82	0.2
83	0.23
84	0.29
85	0.36
86	0.39
87	0.43
88	0.45
89	0.49
90	0.53
91	0.54
92	0.53
93	0.52
94	0.56
95	0.53
96	0.47
97	0.41
98	0.37
99	0.35
100	0.28
101	0.27
102	0.23
103	0.28
104	0.29
105	0.3
106	0.3
107	0.29
108	0.31
109	0.33
110	0.38
111	0.42
112	0.43
113	0.44
114	0.51
115	0.57
116	0.63
117	0.65
118	0.66
119	0.67
120	0.72
121	0.77
122	0.78
123	0.81
124	0.81
125	0.8
126	0.81
127	0.72
128	0.68
129	0.63
130	0.57
131	0.52
132	0.46
133	0.44
134	0.44
135	0.44
136	0.44
137	0.43
138	0.42
139	0.48
140	0.51
141	0.48
142	0.48
143	0.49
144	0.48
145	0.54
146	0.58
147	0.49
148	0.48
149	0.49
150	0.43
151	0.48
152	0.47
153	0.45
154	0.48
155	0.54
156	0.55
157	0.53
158	0.57
159	0.52
160	0.56
161	0.53
162	0.46
163	0.4
164	0.33
165	0.29
166	0.27
167	0.26
168	0.23
169	0.2
170	0.21
171	0.19
172	0.2
173	0.19
174	0.15
175	0.15
176	0.12
177	0.13
178	0.12
179	0.13
180	0.13
181	0.12
182	0.12
183	0.1
184	0.08
185	0.07
186	0.07
187	0.05
188	0.05
189	0.04
190	0.04
191	0.05
192	0.06
193	0.06
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.04
206	0.05
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.02
220	0.02
221	0.02
222	0.02
223	0.02
224	0.02
225	0.02
226	0.02
227	0.02
228	0.02
229	0.02
230	0.02
231	0.01
232	0.01
233	0.01
234	0.01
235	0.01
236	0.01
237	0.01
238	0.01
239	0.01
240	0.01
241	0.01
242	0.01
243	0.01
244	0.01
245	0.01
246	0.02
247	0.02
248	0.02
249	0.02
250	0.02
251	0.02
252	0.02
253	0.02
254	0.02
255	0.02
256	0.02
257	0.02
258	0.03
259	0.03
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.05
264	0.06
265	0.07
266	0.08
267	0.1
268	0.09
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.12
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.13
280	0.12
281	0.12
282	0.11
283	0.1
284	0.11
285	0.11
286	0.1
287	0.06
288	0.06
289	0.05
290	0.05
291	0.04
292	0.04
293	0.03
294	0.03
295	0.04
296	0.04
297	0.03
298	0.03
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.05
303	0.08
304	0.16
305	0.17
306	0.17
307	0.2
308	0.2
309	0.28
310	0.3
311	0.33
312	0.32
313	0.39
314	0.43
315	0.46
316	0.47
317	0.44
318	0.52
319	0.56
320	0.56
321	0.55
322	0.54
323	0.51
324	0.53
325	0.51
326	0.41
327	0.32
328	0.27
329	0.2
330	0.18
331	0.16
332	0.12
333	0.09
334	0.09
335	0.08
336	0.07
337	0.08
338	0.08
339	0.09
340	0.09
341	0.12
342	0.15
343	0.16
344	0.18
345	0.25
346	0.26
347	0.26
348	0.26
349	0.23
350	0.2
351	0.18
352	0.16
353	0.07
354	0.04
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.04
365	0.04
366	0.05
367	0.07
368	0.11
369	0.12
370	0.14
371	0.15
372	0.15
373	0.16
374	0.17
375	0.18
376	0.16
377	0.2
378	0.18
379	0.17
380	0.17
381	0.18
382	0.18
383	0.16
384	0.15
385	0.12
386	0.14
387	0.23
388	0.24
389	0.23
390	0.3
391	0.33
392	0.35
393	0.41
394	0.45
395	0.41
396	0.49
397	0.55
398	0.54
399	0.56
400	0.57
401	0.58
402	0.58
403	0.6
404	0.57
405	0.61
406	0.64
407	0.6
408	0.58
409	0.57
410	0.59
411	0.57
412	0.59
413	0.58
414	0.57
415	0.65
416	0.73
417	0.76
418	0.79
419	0.8
420	0.8
421	0.81
422	0.81
423	0.79
424	0.77
425	0.73
426	0.68
427	0.64
428	0.57
429	0.49
430	0.4
431	0.34
432	0.26
433	0.2
434	0.16
435	0.14
436	0.13
437	0.12
438	0.13
439	0.12
440	0.11
441	0.11
442	0.09
443	0.09
444	0.09
445	0.06
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.07
455	0.1
456	0.14
457	0.16
458	0.19
459	0.23
460	0.24
461	0.27
462	0.27
463	0.26
464	0.29
465	0.31
466	0.29
467	0.29
468	0.29
469	0.29
470	0.28
471	0.28
472	0.21
473	0.17
474	0.15
475	0.11
476	0.09
477	0.06
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.06
482	0.06
483	0.07
484	0.1
485	0.13
486	0.13
487	0.16
488	0.17
489	0.16
490	0.18
491	0.17
492	0.15
493	0.13
494	0.16
495	0.15
496	0.16
497	0.17
498	0.16
499	0.17
500	0.18
501	0.17
502	0.19
503	0.2
504	0.2
505	0.18
506	0.2
507	0.28
508	0.31
509	0.32
510	0.32
511	0.33
512	0.36
513	0.38
514	0.39
515	0.3
516	0.27
517	0.25
518	0.21
519	0.16
520	0.12
521	0.1
522	0.08
523	0.1
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.09
528	0.11
529	0.12
530	0.14
531	0.19
532	0.19
533	0.2
534	0.25
535	0.27
536	0.3
537	0.38
538	0.39
539	0.36
540	0.44
541	0.45
542	0.49
543	0.51
544	0.47
545	0.42
546	0.4
547	0.37
548	0.31
549	0.33
550	0.25
551	0.26
552	0.28
553	0.25
554	0.3
555	0.3
556	0.31
557	0.27
558	0.27
559	0.24
560	0.23
561	0.22
562	0.15
563	0.15
564	0.13
565	0.13
566	0.11
567	0.1
568	0.12
569	0.14
570	0.15
571	0.23
572	0.24
573	0.26
574	0.31
575	0.38
576	0.37
577	0.36
578	0.39
579	0.34
580	0.35
581	0.33
582	0.29
583	0.21
584	0.18
585	0.17
586	0.14
587	0.12
588	0.09
589	0.08
590	0.08
591	0.1
592	0.1
593	0.1
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.09
598	0.09
599	0.08
600	0.08
601	0.09
602	0.09
603	0.09
604	0.1
605	0.1
606	0.11
607	0.11
608	0.12
609	0.11
610	0.1
611	0.11
612	0.13
613	0.13
614	0.12
615	0.11
616	0.1
617	0.1
618	0.1
619	0.1
620	0.09
621	0.08
622	0.1
623	0.1
624	0.1
625	0.1
626	0.12
627	0.17
628	0.2
629	0.23

W9CHV3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer