Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9CDB3

Protein Details
Accession W9CDB3    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-106TSTSAPKSTRGSKKKKPPIHTPAPRQVHGHydrophilic
515-537DEDAYTRKKKTWRRVQDDMDDNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-95TRGSKKKKPP
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 7, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSLAQLQRLLPLPEEDLKQALDYANTLSKQAAAEHFNNLLGESPGSIEFISSFNSRRQDPTAKPTPQTQTQTSAQASTSTSAPKSTRGSKKKKPPIHTPAPRQVHGIYGGQGTAYKKKDEDDYVSRRSTPQPSTSKSSSTANALALDTGSSAIQSPTPRPPPSAAGTLISDFNRKPKSTSSSRAVSQNPSRNASPAPKPKPATTKINITGGNAMHGASTALSDLDAAIRTLEISTNSSLSTDPSKRKCNCIATRHPLLAAAPNCLSCGKVICVKEGFGPCTFCGSAILGRDEVQSMIRTLKEERGAEKMRLDASSHRRADISRTTPAPFSAPKNLDMTPAEQKAKEHRDTLLGFQAQNAKRTTVKDEAADFDTGLAASVAAGVGGGSGMGGMWASPAERAKELKRQQKVLAEQEWNARPEYEKRRQVVSVDLVGGKIVKRMARIERPTFESEGEGEEETVDEVENTNMRGNNGGGGTFSRNPLLGGLIKPIWKAAKGKEVEGAVAGSGEGSVANDEDAYTRKKKTWRRVQDDMDDNEDIILNGGAFGGNQGMENRREGVEEHAVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.25
4 0.24
5 0.23
6 0.22
7 0.19
8 0.15
9 0.14
10 0.16
11 0.2
12 0.2
13 0.2
14 0.19
15 0.19
16 0.19
17 0.22
18 0.23
19 0.23
20 0.25
21 0.28
22 0.28
23 0.28
24 0.27
25 0.24
26 0.2
27 0.15
28 0.14
29 0.1
30 0.11
31 0.1
32 0.11
33 0.11
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.13
38 0.13
39 0.15
40 0.2
41 0.24
42 0.26
43 0.3
44 0.36
45 0.41
46 0.45
47 0.52
48 0.57
49 0.58
50 0.58
51 0.62
52 0.62
53 0.62
54 0.62
55 0.56
56 0.53
57 0.5
58 0.54
59 0.48
60 0.42
61 0.34
62 0.3
63 0.27
64 0.23
65 0.22
66 0.19
67 0.18
68 0.21
69 0.22
70 0.25
71 0.3
72 0.38
73 0.47
74 0.54
75 0.64
76 0.69
77 0.8
78 0.85
79 0.88
80 0.86
81 0.87
82 0.86
83 0.87
84 0.88
85 0.86
86 0.86
87 0.83
88 0.76
89 0.68
90 0.59
91 0.5
92 0.43
93 0.35
94 0.26
95 0.2
96 0.19
97 0.15
98 0.18
99 0.17
100 0.21
101 0.22
102 0.22
103 0.22
104 0.24
105 0.3
106 0.32
107 0.36
108 0.39
109 0.44
110 0.48
111 0.49
112 0.48
113 0.45
114 0.46
115 0.46
116 0.41
117 0.43
118 0.45
119 0.48
120 0.55
121 0.55
122 0.52
123 0.47
124 0.46
125 0.38
126 0.34
127 0.31
128 0.25
129 0.23
130 0.21
131 0.18
132 0.15
133 0.13
134 0.09
135 0.07
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.08
141 0.1
142 0.13
143 0.2
144 0.27
145 0.29
146 0.31
147 0.33
148 0.35
149 0.37
150 0.37
151 0.3
152 0.26
153 0.26
154 0.24
155 0.24
156 0.21
157 0.2
158 0.16
159 0.22
160 0.26
161 0.25
162 0.26
163 0.3
164 0.37
165 0.41
166 0.49
167 0.47
168 0.47
169 0.49
170 0.53
171 0.49
172 0.49
173 0.5
174 0.51
175 0.48
176 0.48
177 0.45
178 0.41
179 0.41
180 0.4
181 0.41
182 0.42
183 0.45
184 0.48
185 0.51
186 0.54
187 0.59
188 0.59
189 0.58
190 0.51
191 0.54
192 0.5
193 0.53
194 0.48
195 0.41
196 0.39
197 0.3
198 0.28
199 0.19
200 0.16
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.14
228 0.18
229 0.24
230 0.29
231 0.38
232 0.4
233 0.45
234 0.5
235 0.55
236 0.58
237 0.6
238 0.64
239 0.62
240 0.64
241 0.58
242 0.52
243 0.42
244 0.34
245 0.31
246 0.23
247 0.18
248 0.15
249 0.14
250 0.15
251 0.14
252 0.14
253 0.08
254 0.09
255 0.08
256 0.13
257 0.13
258 0.15
259 0.15
260 0.15
261 0.19
262 0.2
263 0.2
264 0.16
265 0.17
266 0.15
267 0.17
268 0.17
269 0.13
270 0.12
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.13
288 0.17
289 0.17
290 0.18
291 0.24
292 0.27
293 0.27
294 0.26
295 0.25
296 0.21
297 0.21
298 0.21
299 0.21
300 0.25
301 0.33
302 0.33
303 0.32
304 0.31
305 0.31
306 0.35
307 0.35
308 0.32
309 0.27
310 0.28
311 0.29
312 0.29
313 0.29
314 0.26
315 0.21
316 0.21
317 0.25
318 0.24
319 0.25
320 0.27
321 0.27
322 0.27
323 0.25
324 0.25
325 0.23
326 0.26
327 0.25
328 0.23
329 0.24
330 0.3
331 0.36
332 0.35
333 0.31
334 0.28
335 0.32
336 0.33
337 0.34
338 0.32
339 0.26
340 0.23
341 0.24
342 0.31
343 0.27
344 0.3
345 0.29
346 0.25
347 0.26
348 0.28
349 0.31
350 0.28
351 0.28
352 0.26
353 0.27
354 0.28
355 0.28
356 0.26
357 0.2
358 0.15
359 0.13
360 0.11
361 0.09
362 0.06
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.02
368 0.02
369 0.02
370 0.02
371 0.02
372 0.02
373 0.02
374 0.02
375 0.02
376 0.02
377 0.02
378 0.02
379 0.02
380 0.02
381 0.03
382 0.05
383 0.07
384 0.09
385 0.11
386 0.15
387 0.19
388 0.29
389 0.37
390 0.44
391 0.49
392 0.52
393 0.54
394 0.59
395 0.62
396 0.59
397 0.57
398 0.51
399 0.47
400 0.5
401 0.49
402 0.42
403 0.36
404 0.3
405 0.26
406 0.32
407 0.39
408 0.42
409 0.46
410 0.47
411 0.5
412 0.52
413 0.51
414 0.48
415 0.42
416 0.35
417 0.3
418 0.27
419 0.23
420 0.22
421 0.21
422 0.15
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.14
427 0.2
428 0.28
429 0.37
430 0.45
431 0.49
432 0.51
433 0.55
434 0.56
435 0.52
436 0.45
437 0.37
438 0.3
439 0.25
440 0.23
441 0.17
442 0.14
443 0.12
444 0.11
445 0.1
446 0.09
447 0.07
448 0.05
449 0.05
450 0.07
451 0.08
452 0.09
453 0.12
454 0.13
455 0.13
456 0.15
457 0.15
458 0.16
459 0.16
460 0.15
461 0.12
462 0.13
463 0.18
464 0.18
465 0.19
466 0.17
467 0.17
468 0.17
469 0.17
470 0.18
471 0.15
472 0.15
473 0.18
474 0.19
475 0.21
476 0.21
477 0.24
478 0.23
479 0.23
480 0.27
481 0.28
482 0.35
483 0.35
484 0.37
485 0.38
486 0.37
487 0.34
488 0.3
489 0.25
490 0.15
491 0.13
492 0.11
493 0.06
494 0.05
495 0.05
496 0.04
497 0.04
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.06
503 0.07
504 0.11
505 0.16
506 0.2
507 0.23
508 0.3
509 0.39
510 0.49
511 0.58
512 0.66
513 0.72
514 0.76
515 0.83
516 0.86
517 0.86
518 0.85
519 0.78
520 0.72
521 0.61
522 0.52
523 0.43
524 0.35
525 0.24
526 0.17
527 0.13
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.06
535 0.06
536 0.07
537 0.1
538 0.15
539 0.17
540 0.19
541 0.21
542 0.21
543 0.22
544 0.22
545 0.26