Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9CQE5

Protein Details
Accession W9CQE5    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-124KAVEQAPEKKERKKRQHDPNAPKRPLTBasic
259-280TPAPKTPKAKGRKAKGKSDVAEHydrophilic
291-317VPPQKEASPARKRKRVAKKGADEPVATHydrophilic
323-343ATIETPKSAPKSRKKKTKTDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-117EKKERKKRQHDPN
261-276APKTPKAKGRKAKGKS
295-310KEASPARKRKRVAKKG
330-340SAPKSRKKKTK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, nucl 13, cyto 12.5, mito_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MARPKKTEEKPKEGGDGATLQIDVASFVRTRDTFIGGLATLQEAIQSVSSAYIKHTNAVLGEHGAGYDIDTALSKLGENPLLGSLGALQRAASPVVIKAVEQAPEKKERKKRQHDPNAPKRPLTPFFLYMQTARPIIAKDLGDVPKGEVSSEGTKRWTDMALKDKALWQDAYKDNLRLYNARMHSYRRGNLTAKEMGDDAAAAYADENNIGADASADAQLVGEATAGVPAAVEEEEDAEGEPEPEVEAEAEAEVEKSPTPAPKTPKAKGRKAKGKSDVAEEIPPPSSASIVPPQKEASPARKRKRVAKKGADEPVATTEQEEATIETPKSAPKSRKKKTKTDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.48
3 0.41
4 0.32
5 0.26
6 0.21
7 0.15
8 0.13
9 0.12
10 0.1
11 0.08
12 0.09
13 0.08
14 0.09
15 0.15
16 0.15
17 0.19
18 0.19
19 0.22
20 0.2
21 0.2
22 0.22
23 0.16
24 0.17
25 0.13
26 0.12
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.06
31 0.07
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.12
39 0.18
40 0.18
41 0.2
42 0.2
43 0.19
44 0.19
45 0.2
46 0.18
47 0.13
48 0.13
49 0.11
50 0.1
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.06
60 0.07
61 0.06
62 0.07
63 0.09
64 0.11
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.1
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.1
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.11
86 0.12
87 0.16
88 0.18
89 0.21
90 0.23
91 0.33
92 0.37
93 0.44
94 0.52
95 0.59
96 0.68
97 0.75
98 0.82
99 0.83
100 0.9
101 0.92
102 0.93
103 0.93
104 0.93
105 0.85
106 0.76
107 0.67
108 0.63
109 0.55
110 0.5
111 0.43
112 0.34
113 0.34
114 0.35
115 0.33
116 0.27
117 0.26
118 0.22
119 0.18
120 0.16
121 0.15
122 0.13
123 0.13
124 0.15
125 0.13
126 0.12
127 0.18
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.17
132 0.15
133 0.15
134 0.14
135 0.09
136 0.11
137 0.16
138 0.17
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.18
143 0.18
144 0.17
145 0.14
146 0.17
147 0.23
148 0.24
149 0.24
150 0.24
151 0.26
152 0.26
153 0.25
154 0.21
155 0.14
156 0.18
157 0.19
158 0.23
159 0.21
160 0.21
161 0.2
162 0.21
163 0.22
164 0.18
165 0.18
166 0.21
167 0.21
168 0.23
169 0.24
170 0.25
171 0.31
172 0.35
173 0.36
174 0.33
175 0.36
176 0.35
177 0.36
178 0.37
179 0.33
180 0.28
181 0.26
182 0.22
183 0.18
184 0.15
185 0.13
186 0.08
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.02
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.09
245 0.13
246 0.18
247 0.24
248 0.3
249 0.39
250 0.47
251 0.52
252 0.6
253 0.65
254 0.7
255 0.74
256 0.78
257 0.79
258 0.78
259 0.82
260 0.82
261 0.81
262 0.73
263 0.7
264 0.64
265 0.56
266 0.53
267 0.43
268 0.37
269 0.29
270 0.27
271 0.21
272 0.16
273 0.14
274 0.11
275 0.15
276 0.21
277 0.26
278 0.27
279 0.29
280 0.3
281 0.31
282 0.37
283 0.38
284 0.4
285 0.45
286 0.55
287 0.62
288 0.69
289 0.74
290 0.78
291 0.84
292 0.84
293 0.84
294 0.84
295 0.84
296 0.85
297 0.88
298 0.82
299 0.71
300 0.62
301 0.56
302 0.47
303 0.38
304 0.29
305 0.22
306 0.17
307 0.17
308 0.15
309 0.12
310 0.11
311 0.16
312 0.16
313 0.16
314 0.17
315 0.21
316 0.27
317 0.34
318 0.42
319 0.48
320 0.6
321 0.69
322 0.79
323 0.82