Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9C4R5

Protein Details
Accession W9C4R5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-85SSQSKPTKAGRAPKPTKKLTESRKRVKEEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-81SKPTKAGRAPKPTKKLTESRKRV
105-146PAKKKVKISLKPKTPSLASIPGLPKAPLAIKAKIKGKPPKRP
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.333, mito 4.5, cyto_mito 4.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MSGPIKLKLKTNGGMNLPSGPSTPTPNTPTVLTPGGSKPKLKFSRPATSPPLPSASSQSKPTKAGRAPKPTKKLTESRKRVKEEDDSGEETISVIPRKPNFHDEPAKKKVKISLKPKTPSLASIPGLPKAPLAIKAKIKGKPPKRPLGEGYDSEASDTEKDPSIEESFIFRMIPGDDCDYLRTCIHDKKMGINPRNGGANVQMKFFQAEGRRAAITIRGNVYAATLVDLPCIIEGMKSWDKRGWWKSADICQMLWIYQKVEREDDAKISPLPAIIDPQTFQYPHGLTAPMHLARKRRFRTRISRTAIEAVEEAVEKLLEDDRKAVSSQYKVISPEREQSNQVFSPGSYGEDGEDQYSEDEDAEGEADDGGYFAHMNGHDHASGDEMNGDLEADLAAEMEAELEAGAGFEDFADTPMSMSGIAATPSMLQSETPAANEEEDSGDESIEDGESIDEGSEPDEISDDEKARLAQLQEAKEDIVDLEKQIEGLQAQLAAQNNPILRRRIEDKSRKLKAELEIKKSSIGEAEDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.46
3 0.43
4 0.37
5 0.33
6 0.27
7 0.23
8 0.21
9 0.25
10 0.27
11 0.3
12 0.34
13 0.35
14 0.36
15 0.36
16 0.36
17 0.34
18 0.33
19 0.27
20 0.25
21 0.3
22 0.38
23 0.39
24 0.42
25 0.4
26 0.49
27 0.56
28 0.57
29 0.59
30 0.58
31 0.65
32 0.65
33 0.69
34 0.67
35 0.66
36 0.65
37 0.59
38 0.56
39 0.46
40 0.43
41 0.43
42 0.41
43 0.38
44 0.43
45 0.46
46 0.46
47 0.5
48 0.53
49 0.55
50 0.55
51 0.62
52 0.63
53 0.67
54 0.73
55 0.78
56 0.82
57 0.8
58 0.81
59 0.79
60 0.79
61 0.78
62 0.8
63 0.8
64 0.82
65 0.84
66 0.83
67 0.79
68 0.76
69 0.74
70 0.69
71 0.66
72 0.61
73 0.55
74 0.49
75 0.45
76 0.38
77 0.3
78 0.24
79 0.19
80 0.15
81 0.14
82 0.19
83 0.23
84 0.28
85 0.32
86 0.39
87 0.42
88 0.49
89 0.58
90 0.6
91 0.66
92 0.71
93 0.74
94 0.66
95 0.64
96 0.63
97 0.62
98 0.64
99 0.65
100 0.66
101 0.68
102 0.72
103 0.72
104 0.68
105 0.59
106 0.53
107 0.49
108 0.45
109 0.36
110 0.38
111 0.37
112 0.34
113 0.34
114 0.3
115 0.24
116 0.2
117 0.2
118 0.2
119 0.23
120 0.27
121 0.3
122 0.37
123 0.44
124 0.46
125 0.54
126 0.57
127 0.62
128 0.67
129 0.71
130 0.75
131 0.73
132 0.74
133 0.7
134 0.68
135 0.64
136 0.55
137 0.51
138 0.44
139 0.39
140 0.33
141 0.29
142 0.21
143 0.17
144 0.16
145 0.12
146 0.11
147 0.12
148 0.12
149 0.15
150 0.16
151 0.15
152 0.14
153 0.15
154 0.14
155 0.14
156 0.13
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.16
166 0.16
167 0.17
168 0.16
169 0.16
170 0.17
171 0.21
172 0.24
173 0.28
174 0.27
175 0.32
176 0.4
177 0.47
178 0.48
179 0.47
180 0.45
181 0.42
182 0.44
183 0.36
184 0.29
185 0.25
186 0.27
187 0.23
188 0.23
189 0.22
190 0.19
191 0.2
192 0.19
193 0.19
194 0.16
195 0.18
196 0.19
197 0.2
198 0.2
199 0.19
200 0.2
201 0.2
202 0.18
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.15
209 0.11
210 0.09
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.11
223 0.16
224 0.17
225 0.18
226 0.2
227 0.22
228 0.3
229 0.34
230 0.33
231 0.3
232 0.33
233 0.36
234 0.41
235 0.45
236 0.37
237 0.33
238 0.28
239 0.27
240 0.23
241 0.2
242 0.14
243 0.1
244 0.12
245 0.15
246 0.14
247 0.15
248 0.15
249 0.16
250 0.16
251 0.17
252 0.15
253 0.14
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.09
258 0.09
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.13
269 0.12
270 0.13
271 0.14
272 0.13
273 0.12
274 0.13
275 0.16
276 0.15
277 0.17
278 0.19
279 0.25
280 0.3
281 0.4
282 0.44
283 0.5
284 0.55
285 0.61
286 0.7
287 0.72
288 0.76
289 0.73
290 0.7
291 0.63
292 0.6
293 0.51
294 0.41
295 0.32
296 0.22
297 0.15
298 0.13
299 0.1
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.05
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.1
308 0.1
309 0.12
310 0.12
311 0.13
312 0.14
313 0.16
314 0.19
315 0.19
316 0.21
317 0.22
318 0.25
319 0.28
320 0.27
321 0.32
322 0.32
323 0.33
324 0.33
325 0.32
326 0.35
327 0.31
328 0.29
329 0.23
330 0.18
331 0.18
332 0.16
333 0.15
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.06
361 0.06
362 0.09
363 0.1
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.12
369 0.12
370 0.1
371 0.09
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.07
415 0.06
416 0.08
417 0.12
418 0.12
419 0.12
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.15
424 0.14
425 0.11
426 0.11
427 0.13
428 0.11
429 0.1
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.07
434 0.07
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.09
449 0.12
450 0.13
451 0.13
452 0.15
453 0.15
454 0.15
455 0.19
456 0.18
457 0.21
458 0.26
459 0.28
460 0.28
461 0.29
462 0.28
463 0.24
464 0.24
465 0.17
466 0.14
467 0.12
468 0.11
469 0.12
470 0.12
471 0.12
472 0.12
473 0.13
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.09
478 0.09
479 0.12
480 0.14
481 0.13
482 0.14
483 0.17
484 0.19
485 0.24
486 0.29
487 0.3
488 0.29
489 0.34
490 0.39
491 0.46
492 0.55
493 0.6
494 0.66
495 0.72
496 0.79
497 0.78
498 0.75
499 0.72
500 0.69
501 0.69
502 0.68
503 0.65
504 0.62
505 0.59
506 0.59
507 0.53
508 0.46
509 0.38