Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9CHM9

Protein Details
Accession W9CHM9    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAEQPRRRKRPDSSKMWEESEHydrophilic
30-85EEKNDRGDRRDDRNRNHERSRRDRSRSPRDSKDNIRSSYRDREREQRNRGGRRDDRBasic
256-281DIDSGNKKKKSQPKKKIKEEEEDDDIAcidic
313-333ISAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-107RRRKRPDSSKMWEESENRGPGRDREEKNDRGDRRDDRNRNHERSRRDRSRSPRDSKDNIRSSYRDREREQRNRGGRRDDRDGRGNDRNRDHRDKNDGRSGRR
262-273KKKKSQPKKKIK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MAEQPRRRKRPDSSKMWEESENRGPGRDREEKNDRGDRRDDRNRNHERSRRDRSRSPRDSKDNIRSSYRDREREQRNRGGRRDDRDGRGNDRNRDHRDKNDGRSGRRDSHRADVPDRTRGEFMPYALSQTVFTLRGRPNIGKDDVQEPRVKDENENDRKGMFSPDSEQDETLVLAIRTLSNSHKDNERSSGEKSNERVRSRSPRRNDERDYRKDKSSEGTSRSGEYTDDRNVTPQPVSFSIGASHTAIGHDHDRMDIDSGNKKKKSQPKKKIKEEEEDDDIVIEDDGMAAMQAMMGFGGFATTQNKQIPGNNISAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPSRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.82
3 0.77
4 0.73
5 0.65
6 0.62
7 0.6
8 0.57
9 0.48
10 0.46
11 0.45
12 0.43
13 0.48
14 0.5
15 0.45
16 0.48
17 0.57
18 0.6
19 0.65
20 0.71
21 0.66
22 0.63
23 0.67
24 0.66
25 0.67
26 0.72
27 0.72
28 0.72
29 0.79
30 0.83
31 0.83
32 0.86
33 0.83
34 0.82
35 0.83
36 0.85
37 0.84
38 0.82
39 0.83
40 0.83
41 0.87
42 0.88
43 0.86
44 0.85
45 0.84
46 0.84
47 0.84
48 0.84
49 0.81
50 0.75
51 0.72
52 0.66
53 0.63
54 0.65
55 0.64
56 0.61
57 0.57
58 0.63
59 0.68
60 0.74
61 0.76
62 0.75
63 0.76
64 0.78
65 0.8
66 0.8
67 0.77
68 0.73
69 0.75
70 0.72
71 0.69
72 0.68
73 0.66
74 0.63
75 0.65
76 0.65
77 0.63
78 0.63
79 0.66
80 0.66
81 0.71
82 0.69
83 0.66
84 0.7
85 0.7
86 0.68
87 0.69
88 0.67
89 0.61
90 0.65
91 0.64
92 0.62
93 0.6
94 0.59
95 0.52
96 0.53
97 0.56
98 0.52
99 0.49
100 0.49
101 0.47
102 0.49
103 0.47
104 0.41
105 0.37
106 0.33
107 0.34
108 0.27
109 0.24
110 0.22
111 0.2
112 0.2
113 0.19
114 0.19
115 0.13
116 0.13
117 0.14
118 0.11
119 0.11
120 0.16
121 0.17
122 0.21
123 0.24
124 0.25
125 0.26
126 0.3
127 0.32
128 0.27
129 0.27
130 0.29
131 0.29
132 0.3
133 0.3
134 0.25
135 0.27
136 0.3
137 0.29
138 0.24
139 0.29
140 0.38
141 0.42
142 0.43
143 0.39
144 0.35
145 0.34
146 0.33
147 0.29
148 0.19
149 0.12
150 0.14
151 0.16
152 0.21
153 0.2
154 0.19
155 0.17
156 0.17
157 0.15
158 0.12
159 0.1
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.08
167 0.11
168 0.13
169 0.14
170 0.2
171 0.22
172 0.23
173 0.27
174 0.28
175 0.26
176 0.28
177 0.34
178 0.31
179 0.33
180 0.34
181 0.38
182 0.43
183 0.42
184 0.41
185 0.41
186 0.49
187 0.55
188 0.62
189 0.61
190 0.64
191 0.71
192 0.77
193 0.77
194 0.77
195 0.77
196 0.77
197 0.78
198 0.71
199 0.67
200 0.6
201 0.54
202 0.49
203 0.48
204 0.45
205 0.41
206 0.41
207 0.38
208 0.38
209 0.37
210 0.32
211 0.24
212 0.2
213 0.19
214 0.19
215 0.2
216 0.18
217 0.2
218 0.2
219 0.21
220 0.2
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.19
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.16
230 0.13
231 0.12
232 0.09
233 0.1
234 0.09
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.12
244 0.14
245 0.21
246 0.28
247 0.36
248 0.38
249 0.41
250 0.48
251 0.56
252 0.65
253 0.68
254 0.72
255 0.75
256 0.84
257 0.92
258 0.94
259 0.9
260 0.89
261 0.85
262 0.8
263 0.74
264 0.64
265 0.53
266 0.42
267 0.36
268 0.26
269 0.18
270 0.12
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.05
288 0.09
289 0.1
290 0.16
291 0.18
292 0.21
293 0.22
294 0.28
295 0.33
296 0.34
297 0.36
298 0.35
299 0.37
300 0.38
301 0.42
302 0.45
303 0.45
304 0.46
305 0.47
306 0.53
307 0.59
308 0.67
309 0.71
310 0.73
311 0.76
312 0.8
313 0.84
314 0.83
315 0.79
316 0.73
317 0.65
318 0.58
319 0.55
320 0.51
321 0.46
322 0.42
323 0.39