Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9C173

Protein Details
Accession W9C173    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-28RDEHGGRSTKRKLQRHHARSYTASBasic
51-77RQKTTKTEELIRVRRKQKKPYSAVTVAHydrophilic
111-130ASRAIRKKLKYGNVHRQIRAHydrophilic
268-300ILSSSTRKSKKDKEKDKKKKKHKPFNLEAEKETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-291RKSKKDKEKDKKKKKHKP
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR004152  GAT_dom  
IPR044103  GAT_LSB5  
IPR038425  GAT_sf  
IPR045007  LSB5  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50909  GAT  
PS50179  VHS  
CDD cd14232  GAT_LSB5  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MSSYRDEHGGRSTKRKLQRHHARSYTASYISSEPQSDSFHRGHVGNLLFGRQKTTKTEELIRVRRKQKKPYSAVTVAIERLTSEQYEDDDFGGIPELVEVIKIQSTGPTEASRAIRKKLKYGNVHRQIRALEILDGLIQNAGGRFQRTFADEALLERLRICGTSDLSDPAVKAKCKELFKNWSAEYAEVSGMEEVRALYKQLPRTKKVVTQDRSKVLRETEENPFHDDELEESPSSPGPSTPGPSQAGSSHSRQSSLTTSTRDRASSILSSSTRKSKKDKEKDKKKKKHKPFNLEAEKETMKAAIAESAVASTNLLNALRHINREKERISENKTALQHFDSCKLLRRKILRYIQHVEAEEWLGGLLHANDELVNALMTFEQLDRSIDADSDSDDDMAEQAHLYKMAERSNADRRNSDATTQQLAGLSIGTKSPLSPTRTSHRPAPPTPQRSARPPAPESEDEEEDEDDPFADRNALD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.76
3 0.76
4 0.78
5 0.84
6 0.84
7 0.86
8 0.84
9 0.81
10 0.76
11 0.73
12 0.68
13 0.59
14 0.5
15 0.42
16 0.37
17 0.34
18 0.32
19 0.27
20 0.23
21 0.23
22 0.27
23 0.28
24 0.3
25 0.27
26 0.27
27 0.29
28 0.27
29 0.26
30 0.28
31 0.26
32 0.25
33 0.25
34 0.27
35 0.28
36 0.27
37 0.33
38 0.28
39 0.3
40 0.32
41 0.38
42 0.39
43 0.4
44 0.48
45 0.51
46 0.59
47 0.66
48 0.69
49 0.72
50 0.77
51 0.82
52 0.83
53 0.85
54 0.85
55 0.86
56 0.85
57 0.84
58 0.83
59 0.77
60 0.72
61 0.65
62 0.57
63 0.47
64 0.39
65 0.3
66 0.21
67 0.19
68 0.16
69 0.13
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.14
74 0.15
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.09
92 0.12
93 0.13
94 0.15
95 0.15
96 0.16
97 0.2
98 0.24
99 0.3
100 0.31
101 0.36
102 0.41
103 0.42
104 0.5
105 0.53
106 0.58
107 0.61
108 0.67
109 0.72
110 0.75
111 0.81
112 0.73
113 0.69
114 0.6
115 0.52
116 0.44
117 0.34
118 0.24
119 0.17
120 0.16
121 0.13
122 0.12
123 0.1
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.1
133 0.12
134 0.14
135 0.15
136 0.14
137 0.15
138 0.14
139 0.15
140 0.19
141 0.18
142 0.15
143 0.14
144 0.14
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.1
149 0.11
150 0.13
151 0.14
152 0.14
153 0.15
154 0.16
155 0.14
156 0.17
157 0.19
158 0.18
159 0.18
160 0.23
161 0.28
162 0.32
163 0.36
164 0.4
165 0.44
166 0.46
167 0.51
168 0.46
169 0.44
170 0.4
171 0.36
172 0.29
173 0.22
174 0.19
175 0.12
176 0.13
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.09
186 0.13
187 0.2
188 0.28
189 0.34
190 0.36
191 0.4
192 0.42
193 0.44
194 0.49
195 0.52
196 0.49
197 0.53
198 0.56
199 0.59
200 0.59
201 0.55
202 0.49
203 0.4
204 0.38
205 0.32
206 0.3
207 0.31
208 0.33
209 0.33
210 0.33
211 0.32
212 0.29
213 0.26
214 0.22
215 0.15
216 0.12
217 0.13
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.11
228 0.11
229 0.15
230 0.16
231 0.16
232 0.17
233 0.16
234 0.19
235 0.19
236 0.21
237 0.21
238 0.2
239 0.21
240 0.2
241 0.21
242 0.2
243 0.22
244 0.22
245 0.21
246 0.23
247 0.25
248 0.27
249 0.25
250 0.23
251 0.19
252 0.18
253 0.16
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.18
258 0.19
259 0.28
260 0.29
261 0.32
262 0.38
263 0.44
264 0.54
265 0.63
266 0.72
267 0.75
268 0.82
269 0.9
270 0.94
271 0.95
272 0.95
273 0.95
274 0.95
275 0.95
276 0.94
277 0.93
278 0.91
279 0.92
280 0.9
281 0.82
282 0.72
283 0.66
284 0.56
285 0.45
286 0.36
287 0.25
288 0.15
289 0.12
290 0.11
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.04
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.13
306 0.14
307 0.19
308 0.21
309 0.28
310 0.32
311 0.37
312 0.38
313 0.35
314 0.4
315 0.42
316 0.47
317 0.47
318 0.45
319 0.46
320 0.47
321 0.45
322 0.42
323 0.37
324 0.35
325 0.29
326 0.3
327 0.28
328 0.26
329 0.33
330 0.38
331 0.39
332 0.41
333 0.46
334 0.49
335 0.55
336 0.63
337 0.61
338 0.63
339 0.65
340 0.63
341 0.6
342 0.55
343 0.46
344 0.39
345 0.32
346 0.24
347 0.18
348 0.13
349 0.08
350 0.07
351 0.07
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.05
367 0.06
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.09
374 0.1
375 0.09
376 0.1
377 0.11
378 0.1
379 0.1
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.05
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.12
391 0.15
392 0.19
393 0.22
394 0.23
395 0.29
396 0.38
397 0.45
398 0.44
399 0.43
400 0.44
401 0.48
402 0.47
403 0.43
404 0.39
405 0.36
406 0.37
407 0.35
408 0.33
409 0.26
410 0.25
411 0.22
412 0.18
413 0.13
414 0.1
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.15
420 0.21
421 0.26
422 0.29
423 0.35
424 0.42
425 0.49
426 0.54
427 0.57
428 0.6
429 0.62
430 0.63
431 0.69
432 0.71
433 0.71
434 0.73
435 0.73
436 0.69
437 0.69
438 0.73
439 0.69
440 0.67
441 0.63
442 0.62
443 0.61
444 0.57
445 0.56
446 0.54
447 0.49
448 0.42
449 0.41
450 0.36
451 0.29
452 0.27
453 0.2
454 0.14
455 0.13
456 0.11
457 0.1