Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9CHK8

Protein Details
Accession W9CHK8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-35PSPIPGPSRPPRTRIRRPRRGGHQNAGPAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-27PSRPPRTRIRRPRRGG
85-103GGQGRRGGFGRGGRRGGPR
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
cd16492  RING-CH-C4HC3_NFX1-like  
Amino Acid Sequences MATAEPSPIPGPSRPPRTRIRRPRRGGHQNAGPAPADINANATPNPAAQVPNGSLALRPASIVPLSISDAPTPSNPRNPIANNRGGQGRRGGFGRGGRRGGPRGQPMANGRVFGGQLTSNPHIGSTSDAGSLAGDAPSFVPGQPLATRAGPSRAPRARRMSKSQAPDLATRTHEDITNGQYECVICTNEVLPNSKIWTCKTCWSVLHISCVKKWSKNEVSTLQQRAVENGELPPPRQWRCPGCNLPKEDVALSYTCWCEKEVEPRSEAGLPPHSCGQSCSKKRVGHCPHPCDLICHAGPCPPCAHMGPSLPCFCGKETVSRRCLDTKYESGWGCGQICNDVLPCGEHNCERSCHEGMCGSCEVLIESTCYCGKVEKTLPCSERGEERESQAPASALDDESSATRTWVGSFDCGSECRRPYDCGRPEHYCESRCHSQDLLPAHCPFSPDVVTTCPCGKTSISTLLENPRTDCKQHIPHCREKCELPLKCGHTCQGICHEGECRPCFQSVSITCQCGRTTSDTMCHQGTDQKPQCPRVCRSTLNCGRHECGERCCSGEKKASERQAAKRKYRNLNVPATEESIEAEHICLKVCGRPLKCGNHACAELCHKGPCRSCLEAIFEEISCACGRTVMHPPIPCGTKPPECRFDCTRQRTCGHPQTKHHCHLDGEPCPKCPFLVEKPCICGKRTLKNIPCWFTEVRCGLPCGRKLKCGIHSCQSLCHRPGQCEDATTPCHQPCGRQKTVCDHTCIDACHAPYPCKENAPCQGKTFITCECQNQKQAVKCLASKSSEGNSKKTLDCNDECLKLQRNAKLAAALNIDPSTHMDDHIPYSQQTLDMVKDMLKFCQTYEREFRVFAADSSEKRLRFKPMQPHQRAFVHSLAEDYGLDSESQDPEPHRHVSIFKTPRFVSAPLKTLAQCIKVKPVPIAEVAPSSKGLVATTQPFNALLLSNPRFGLTIEDIHAELSPEFANAGLDFDVSFLPSGEVALRGKPSENWHTKVESALNATQHSISKKVKALELASTVILCSVDSSLNVVRREDDHLGGGWSQVAKGASGSKAPVRPDIGVKSSFTVLGNRSLMKKKKVEQDAVDDWEKEVEAWDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.55
3 0.64
4 0.71
5 0.79
6 0.81
7 0.83
8 0.83
9 0.88
10 0.92
11 0.92
12 0.93
13 0.91
14 0.89
15 0.86
16 0.84
17 0.78
18 0.71
19 0.6
20 0.49
21 0.4
22 0.32
23 0.25
24 0.17
25 0.17
26 0.15
27 0.17
28 0.16
29 0.17
30 0.16
31 0.15
32 0.17
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.19
37 0.19
38 0.22
39 0.22
40 0.21
41 0.19
42 0.2
43 0.21
44 0.16
45 0.15
46 0.12
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.16
53 0.18
54 0.18
55 0.16
56 0.17
57 0.18
58 0.22
59 0.27
60 0.29
61 0.35
62 0.37
63 0.39
64 0.46
65 0.5
66 0.56
67 0.57
68 0.61
69 0.54
70 0.54
71 0.59
72 0.52
73 0.49
74 0.47
75 0.41
76 0.35
77 0.35
78 0.35
79 0.31
80 0.37
81 0.43
82 0.42
83 0.42
84 0.44
85 0.49
86 0.51
87 0.54
88 0.55
89 0.53
90 0.53
91 0.51
92 0.53
93 0.52
94 0.55
95 0.49
96 0.42
97 0.35
98 0.31
99 0.3
100 0.23
101 0.2
102 0.13
103 0.14
104 0.19
105 0.21
106 0.2
107 0.2
108 0.2
109 0.18
110 0.18
111 0.2
112 0.15
113 0.15
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.1
120 0.08
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.12
130 0.12
131 0.14
132 0.15
133 0.16
134 0.18
135 0.19
136 0.23
137 0.25
138 0.28
139 0.37
140 0.41
141 0.45
142 0.52
143 0.6
144 0.65
145 0.68
146 0.74
147 0.73
148 0.74
149 0.76
150 0.74
151 0.7
152 0.64
153 0.6
154 0.54
155 0.48
156 0.42
157 0.37
158 0.34
159 0.29
160 0.27
161 0.25
162 0.25
163 0.24
164 0.28
165 0.26
166 0.23
167 0.23
168 0.21
169 0.21
170 0.2
171 0.17
172 0.11
173 0.12
174 0.14
175 0.15
176 0.17
177 0.19
178 0.18
179 0.19
180 0.23
181 0.24
182 0.25
183 0.26
184 0.29
185 0.28
186 0.35
187 0.36
188 0.37
189 0.35
190 0.39
191 0.44
192 0.41
193 0.47
194 0.45
195 0.44
196 0.43
197 0.48
198 0.46
199 0.43
200 0.46
201 0.47
202 0.51
203 0.53
204 0.57
205 0.56
206 0.6
207 0.62
208 0.62
209 0.54
210 0.49
211 0.44
212 0.39
213 0.37
214 0.29
215 0.23
216 0.2
217 0.24
218 0.21
219 0.22
220 0.27
221 0.31
222 0.33
223 0.37
224 0.42
225 0.44
226 0.5
227 0.58
228 0.62
229 0.65
230 0.7
231 0.7
232 0.67
233 0.61
234 0.56
235 0.46
236 0.37
237 0.29
238 0.22
239 0.19
240 0.17
241 0.16
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.18
247 0.28
248 0.33
249 0.36
250 0.36
251 0.36
252 0.38
253 0.37
254 0.35
255 0.29
256 0.29
257 0.26
258 0.27
259 0.3
260 0.29
261 0.26
262 0.28
263 0.33
264 0.35
265 0.39
266 0.44
267 0.47
268 0.52
269 0.55
270 0.64
271 0.64
272 0.65
273 0.7
274 0.7
275 0.65
276 0.66
277 0.63
278 0.55
279 0.48
280 0.43
281 0.34
282 0.28
283 0.25
284 0.24
285 0.24
286 0.22
287 0.21
288 0.15
289 0.17
290 0.16
291 0.18
292 0.18
293 0.23
294 0.25
295 0.29
296 0.29
297 0.28
298 0.28
299 0.27
300 0.24
301 0.24
302 0.21
303 0.27
304 0.34
305 0.42
306 0.45
307 0.45
308 0.47
309 0.47
310 0.48
311 0.43
312 0.4
313 0.36
314 0.34
315 0.39
316 0.36
317 0.33
318 0.34
319 0.31
320 0.26
321 0.23
322 0.2
323 0.15
324 0.15
325 0.14
326 0.12
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.11
332 0.12
333 0.13
334 0.16
335 0.17
336 0.19
337 0.2
338 0.24
339 0.24
340 0.22
341 0.22
342 0.23
343 0.2
344 0.22
345 0.21
346 0.16
347 0.14
348 0.14
349 0.13
350 0.1
351 0.1
352 0.07
353 0.07
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.11
359 0.11
360 0.16
361 0.23
362 0.26
363 0.31
364 0.38
365 0.39
366 0.4
367 0.42
368 0.37
369 0.38
370 0.36
371 0.36
372 0.3
373 0.32
374 0.33
375 0.31
376 0.3
377 0.24
378 0.2
379 0.15
380 0.15
381 0.13
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.09
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.09
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.12
399 0.13
400 0.16
401 0.18
402 0.19
403 0.21
404 0.23
405 0.25
406 0.29
407 0.38
408 0.42
409 0.44
410 0.48
411 0.49
412 0.52
413 0.56
414 0.55
415 0.48
416 0.44
417 0.45
418 0.46
419 0.43
420 0.4
421 0.34
422 0.31
423 0.32
424 0.34
425 0.3
426 0.26
427 0.26
428 0.25
429 0.25
430 0.24
431 0.2
432 0.18
433 0.15
434 0.12
435 0.13
436 0.14
437 0.14
438 0.15
439 0.17
440 0.15
441 0.14
442 0.15
443 0.14
444 0.14
445 0.16
446 0.22
447 0.23
448 0.23
449 0.24
450 0.3
451 0.33
452 0.31
453 0.3
454 0.27
455 0.26
456 0.26
457 0.27
458 0.27
459 0.33
460 0.4
461 0.49
462 0.51
463 0.59
464 0.65
465 0.66
466 0.62
467 0.54
468 0.54
469 0.54
470 0.48
471 0.42
472 0.42
473 0.42
474 0.42
475 0.41
476 0.34
477 0.29
478 0.28
479 0.26
480 0.25
481 0.23
482 0.21
483 0.21
484 0.22
485 0.19
486 0.24
487 0.23
488 0.19
489 0.18
490 0.19
491 0.18
492 0.17
493 0.21
494 0.18
495 0.25
496 0.25
497 0.26
498 0.26
499 0.27
500 0.27
501 0.21
502 0.21
503 0.18
504 0.18
505 0.18
506 0.21
507 0.21
508 0.24
509 0.23
510 0.21
511 0.17
512 0.2
513 0.21
514 0.28
515 0.3
516 0.32
517 0.35
518 0.42
519 0.46
520 0.46
521 0.47
522 0.44
523 0.45
524 0.45
525 0.46
526 0.5
527 0.54
528 0.53
529 0.53
530 0.48
531 0.44
532 0.43
533 0.44
534 0.35
535 0.31
536 0.28
537 0.26
538 0.25
539 0.27
540 0.25
541 0.23
542 0.27
543 0.25
544 0.29
545 0.34
546 0.38
547 0.42
548 0.46
549 0.51
550 0.55
551 0.61
552 0.63
553 0.64
554 0.67
555 0.69
556 0.7
557 0.7
558 0.66
559 0.65
560 0.59
561 0.55
562 0.48
563 0.41
564 0.35
565 0.26
566 0.2
567 0.13
568 0.12
569 0.08
570 0.07
571 0.07
572 0.06
573 0.06
574 0.06
575 0.06
576 0.08
577 0.13
578 0.19
579 0.19
580 0.25
581 0.31
582 0.36
583 0.43
584 0.44
585 0.42
586 0.39
587 0.39
588 0.33
589 0.29
590 0.29
591 0.24
592 0.21
593 0.23
594 0.21
595 0.26
596 0.27
597 0.29
598 0.29
599 0.29
600 0.29
601 0.28
602 0.3
603 0.26
604 0.25
605 0.22
606 0.17
607 0.15
608 0.14
609 0.13
610 0.08
611 0.08
612 0.06
613 0.07
614 0.07
615 0.1
616 0.18
617 0.2
618 0.24
619 0.24
620 0.26
621 0.28
622 0.3
623 0.27
624 0.24
625 0.25
626 0.3
627 0.36
628 0.41
629 0.46
630 0.46
631 0.51
632 0.53
633 0.57
634 0.59
635 0.61
636 0.61
637 0.57
638 0.58
639 0.58
640 0.61
641 0.61
642 0.59
643 0.57
644 0.59
645 0.64
646 0.7
647 0.7
648 0.64
649 0.56
650 0.5
651 0.5
652 0.49
653 0.46
654 0.46
655 0.41
656 0.41
657 0.4
658 0.38
659 0.32
660 0.25
661 0.24
662 0.26
663 0.34
664 0.37
665 0.37
666 0.41
667 0.46
668 0.46
669 0.41
670 0.41
671 0.37
672 0.41
673 0.48
674 0.54
675 0.55
676 0.63
677 0.68
678 0.63
679 0.58
680 0.54
681 0.47
682 0.38
683 0.38
684 0.3
685 0.26
686 0.24
687 0.24
688 0.24
689 0.28
690 0.32
691 0.33
692 0.33
693 0.34
694 0.37
695 0.42
696 0.47
697 0.48
698 0.47
699 0.47
700 0.51
701 0.48
702 0.51
703 0.49
704 0.47
705 0.42
706 0.46
707 0.41
708 0.37
709 0.4
710 0.37
711 0.33
712 0.29
713 0.28
714 0.24
715 0.25
716 0.26
717 0.27
718 0.23
719 0.27
720 0.25
721 0.31
722 0.37
723 0.43
724 0.47
725 0.46
726 0.48
727 0.53
728 0.62
729 0.57
730 0.52
731 0.44
732 0.4
733 0.39
734 0.38
735 0.32
736 0.25
737 0.24
738 0.24
739 0.24
740 0.23
741 0.23
742 0.27
743 0.25
744 0.28
745 0.28
746 0.3
747 0.37
748 0.42
749 0.42
750 0.39
751 0.42
752 0.37
753 0.38
754 0.34
755 0.27
756 0.26
757 0.26
758 0.3
759 0.32
760 0.36
761 0.37
762 0.4
763 0.43
764 0.43
765 0.47
766 0.46
767 0.43
768 0.41
769 0.41
770 0.41
771 0.37
772 0.33
773 0.31
774 0.31
775 0.36
776 0.36
777 0.36
778 0.36
779 0.38
780 0.38
781 0.39
782 0.38
783 0.37
784 0.36
785 0.39
786 0.39
787 0.38
788 0.37
789 0.37
790 0.38
791 0.37
792 0.41
793 0.38
794 0.38
795 0.38
796 0.37
797 0.37
798 0.33
799 0.31
800 0.29
801 0.24
802 0.22
803 0.2
804 0.19
805 0.15
806 0.15
807 0.16
808 0.13
809 0.14
810 0.13
811 0.14
812 0.18
813 0.2
814 0.19
815 0.15
816 0.16
817 0.16
818 0.15
819 0.15
820 0.14
821 0.12
822 0.12
823 0.12
824 0.13
825 0.17
826 0.17
827 0.18
828 0.18
829 0.18
830 0.17
831 0.26
832 0.26
833 0.28
834 0.36
835 0.4
836 0.39
837 0.39
838 0.39
839 0.34
840 0.33
841 0.27
842 0.26
843 0.24
844 0.24
845 0.31
846 0.35
847 0.32
848 0.35
849 0.38
850 0.39
851 0.43
852 0.5
853 0.54
854 0.59
855 0.69
856 0.74
857 0.74
858 0.72
859 0.69
860 0.65
861 0.58
862 0.5
863 0.41
864 0.33
865 0.3
866 0.24
867 0.2
868 0.16
869 0.13
870 0.1
871 0.08
872 0.08
873 0.08
874 0.09
875 0.1
876 0.11
877 0.13
878 0.15
879 0.18
880 0.22
881 0.24
882 0.24
883 0.24
884 0.26
885 0.3
886 0.38
887 0.43
888 0.41
889 0.46
890 0.45
891 0.47
892 0.48
893 0.46
894 0.44
895 0.4
896 0.42
897 0.37
898 0.4
899 0.35
900 0.37
901 0.37
902 0.35
903 0.33
904 0.31
905 0.39
906 0.38
907 0.39
908 0.37
909 0.37
910 0.33
911 0.31
912 0.31
913 0.23
914 0.25
915 0.25
916 0.23
917 0.2
918 0.18
919 0.17
920 0.16
921 0.14
922 0.12
923 0.14
924 0.19
925 0.21
926 0.2
927 0.2
928 0.2
929 0.2
930 0.18
931 0.15
932 0.12
933 0.19
934 0.21
935 0.22
936 0.22
937 0.22
938 0.22
939 0.21
940 0.25
941 0.19
942 0.19
943 0.19
944 0.2
945 0.2
946 0.2
947 0.2
948 0.15
949 0.12
950 0.11
951 0.09
952 0.08
953 0.08
954 0.08
955 0.08
956 0.07
957 0.09
958 0.07
959 0.07
960 0.07
961 0.08
962 0.08
963 0.08
964 0.08
965 0.06
966 0.07
967 0.07
968 0.07
969 0.07
970 0.1
971 0.1
972 0.13
973 0.15
974 0.16
975 0.17
976 0.21
977 0.27
978 0.35
979 0.41
980 0.43
981 0.44
982 0.46
983 0.45
984 0.46
985 0.42
986 0.35
987 0.33
988 0.32
989 0.31
990 0.29
991 0.3
992 0.28
993 0.28
994 0.27
995 0.29
996 0.3
997 0.33
998 0.38
999 0.4
1000 0.41
1001 0.42
1002 0.42
1003 0.4
1004 0.39
1005 0.35
1006 0.3
1007 0.26
1008 0.23
1009 0.18
1010 0.16
1011 0.1
1012 0.08
1013 0.08
1014 0.08
1015 0.08
1016 0.12
1017 0.16
1018 0.22
1019 0.24
1020 0.24
1021 0.24
1022 0.26
1023 0.32
1024 0.32
1025 0.29
1026 0.25
1027 0.24
1028 0.25
1029 0.24
1030 0.22
1031 0.18
1032 0.15
1033 0.13
1034 0.14
1035 0.13
1036 0.11
1037 0.13
1038 0.16
1039 0.15
1040 0.17
1041 0.2
1042 0.24
1043 0.28
1044 0.3
1045 0.34
1046 0.34
1047 0.35
1048 0.39
1049 0.42
1050 0.41
1051 0.39
1052 0.38
1053 0.35
1054 0.33
1055 0.32
1056 0.27
1057 0.26
1058 0.23
1059 0.28
1060 0.29
1061 0.29
1062 0.35
1063 0.42
1064 0.49
1065 0.53
1066 0.59
1067 0.61
1068 0.68
1069 0.74
1070 0.76
1071 0.72
1072 0.73
1073 0.71
1074 0.7
1075 0.65
1076 0.55
1077 0.46
1078 0.39
1079 0.33
1080 0.24