FuNGI

W9CQN6

Protein Details

Accession

W9CQN6

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-28	MGSSKPTSSEQKKKTKSSSKSSSKATTK	Hydrophilic
357-386	DADKSSKKKHKDAGDKKKKHKSSSTPTSSE	Basic
487-516	AATTKDEARREKKAQKEAKKRRLESRTDNF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
343-377	KSGTTKKSRKESEEDADKSSKKKHKDAGDKKKKHK
494-508	ARREKKAQKEAKKRR

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MGSSKPTSSEQKKKTKSSSKSSSKATTKTPVAKTPSNFKSSEFVGESDNENDEPTGTNSSSDSDNESMLSNPAVKSTSKPNSKPKGKAAESSDSSEAVSDAESESGSESDDEEEEEEEENETNVNGNKSVVPPSKKDAKTVSMKVAPFKAPLGFEKNSSKNSSKASQLFNNSNLEGKEIWYITAPASVPIASVKEMSLLDAKLGKAVFSQDGNDYGFVLDPLEDKTYTKMLLPSSSKDGYSIEKKPVDQIYHMQQVVNLSQQNDQATVPAKRPVRQQPKGLKARFQPVGFASAPGIIGSDDESDSEEVGRPPKFQKIVMSEDEASDVEMEDAPPASTPANKSKSGTTKKSRKESEEDADKSSKKKHKDAGDKKKKHKSSSTPTSSEIQELRILNEQTAIELVNRSIPLRLQARSLSDLDPEITTNTRASQASILPASKALKPSSNSDTTISQSHPTTSTVTTKISSLNSGSTKKKATGAVSTEGPGAATTKDEARREKKAQKEAKKRRLESRTDNF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.87
3	0.86
4	0.86
5	0.87
6	0.86
7	0.85
8	0.83
9	0.82
10	0.79
11	0.75
12	0.71
13	0.69
14	0.67
15	0.69
16	0.67
17	0.65
18	0.64
19	0.66
20	0.64
21	0.66
22	0.64
23	0.6
24	0.55
25	0.49
26	0.47
27	0.41
28	0.44
29	0.35
30	0.29
31	0.27
32	0.28
33	0.28
34	0.26
35	0.26
36	0.2
37	0.18
38	0.17
39	0.15
40	0.15
41	0.15
42	0.17
43	0.15
44	0.16
45	0.15
46	0.17
47	0.18
48	0.17
49	0.2
50	0.17
51	0.17
52	0.17
53	0.17
54	0.16
55	0.15
56	0.15
57	0.13
58	0.12
59	0.13
60	0.14
61	0.14
62	0.16
63	0.25
64	0.34
65	0.41
66	0.48
67	0.57
68	0.67
69	0.75
70	0.79
71	0.78
72	0.79
73	0.74
74	0.73
75	0.69
76	0.67
77	0.62
78	0.59
79	0.51
80	0.41
81	0.37
82	0.3
83	0.24
84	0.14
85	0.11
86	0.07
87	0.06
88	0.06
89	0.06
90	0.06
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.07
96	0.08
97	0.08
98	0.09
99	0.08
100	0.09
101	0.09
102	0.1
103	0.09
104	0.09
105	0.09
106	0.08
107	0.08
108	0.07
109	0.08
110	0.1
111	0.11
112	0.1
113	0.11
114	0.12
115	0.14
116	0.22
117	0.27
118	0.28
119	0.3
120	0.36
121	0.45
122	0.44
123	0.47
124	0.44
125	0.45
126	0.49
127	0.5
128	0.51
129	0.47
130	0.47
131	0.46
132	0.46
133	0.4
134	0.33
135	0.3
136	0.25
137	0.21
138	0.24
139	0.27
140	0.24
141	0.26
142	0.32
143	0.35
144	0.37
145	0.41
146	0.39
147	0.37
148	0.4
149	0.4
150	0.39
151	0.4
152	0.41
153	0.41
154	0.45
155	0.44
156	0.43
157	0.42
158	0.36
159	0.33
160	0.28
161	0.24
162	0.19
163	0.16
164	0.16
165	0.13
166	0.13
167	0.11
168	0.11
169	0.1
170	0.12
171	0.11
172	0.08
173	0.09
174	0.08
175	0.08
176	0.08
177	0.09
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.08
182	0.08
183	0.09
184	0.1
185	0.09
186	0.1
187	0.12
188	0.11
189	0.11
190	0.11
191	0.1
192	0.09
193	0.1
194	0.11
195	0.09
196	0.11
197	0.09
198	0.11
199	0.12
200	0.11
201	0.1
202	0.09
203	0.08
204	0.07
205	0.06
206	0.05
207	0.05
208	0.06
209	0.07
210	0.08
211	0.08
212	0.1
213	0.1
214	0.11
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.16
219	0.18
220	0.18
221	0.22
222	0.23
223	0.22
224	0.2
225	0.2
226	0.19
227	0.23
228	0.24
229	0.24
230	0.25
231	0.25
232	0.29
233	0.31
234	0.28
235	0.24
236	0.25
237	0.25
238	0.29
239	0.29
240	0.24
241	0.22
242	0.22
243	0.2
244	0.19
245	0.15
246	0.11
247	0.13
248	0.14
249	0.14
250	0.14
251	0.13
252	0.12
253	0.13
254	0.14
255	0.14
256	0.18
257	0.19
258	0.21
259	0.28
260	0.37
261	0.45
262	0.49
263	0.57
264	0.6
265	0.68
266	0.75
267	0.7
268	0.65
269	0.58
270	0.6
271	0.55
272	0.46
273	0.38
274	0.3
275	0.33
276	0.27
277	0.24
278	0.17
279	0.13
280	0.13
281	0.1
282	0.1
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.08
295	0.12
296	0.12
297	0.13
298	0.15
299	0.21
300	0.22
301	0.22
302	0.27
303	0.28
304	0.33
305	0.33
306	0.35
307	0.3
308	0.28
309	0.28
310	0.22
311	0.17
312	0.12
313	0.1
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.06
323	0.08
324	0.11
325	0.19
326	0.24
327	0.25
328	0.26
329	0.32
330	0.42
331	0.48
332	0.54
333	0.56
334	0.61
335	0.68
336	0.77
337	0.76
338	0.72
339	0.7
340	0.68
341	0.67
342	0.67
343	0.61
344	0.56
345	0.55
346	0.51
347	0.47
348	0.49
349	0.47
350	0.44
351	0.49
352	0.52
353	0.57
354	0.66
355	0.75
356	0.77
357	0.82
358	0.85
359	0.88
360	0.91
361	0.88
362	0.84
363	0.83
364	0.81
365	0.81
366	0.82
367	0.8
368	0.73
369	0.69
370	0.65
371	0.56
372	0.49
373	0.39
374	0.3
375	0.27
376	0.24
377	0.23
378	0.26
379	0.25
380	0.21
381	0.23
382	0.21
383	0.16
384	0.16
385	0.14
386	0.09
387	0.1
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.11
392	0.12
393	0.12
394	0.18
395	0.21
396	0.22
397	0.22
398	0.24
399	0.28
400	0.3
401	0.32
402	0.27
403	0.24
404	0.24
405	0.22
406	0.2
407	0.16
408	0.15
409	0.14
410	0.14
411	0.14
412	0.14
413	0.16
414	0.16
415	0.17
416	0.18
417	0.18
418	0.21
419	0.23
420	0.22
421	0.19
422	0.22
423	0.23
424	0.23
425	0.26
426	0.24
427	0.27
428	0.29
429	0.34
430	0.38
431	0.4
432	0.39
433	0.38
434	0.38
435	0.34
436	0.35
437	0.31
438	0.28
439	0.25
440	0.25
441	0.24
442	0.23
443	0.23
444	0.23
445	0.26
446	0.26
447	0.27
448	0.25
449	0.25
450	0.27
451	0.26
452	0.25
453	0.22
454	0.25
455	0.29
456	0.34
457	0.38
458	0.39
459	0.42
460	0.41
461	0.45
462	0.44
463	0.42
464	0.44
465	0.44
466	0.43
467	0.42
468	0.4
469	0.36
470	0.3
471	0.26
472	0.18
473	0.15
474	0.11
475	0.1
476	0.11
477	0.17
478	0.24
479	0.29
480	0.38
481	0.44
482	0.53
483	0.61
484	0.68
485	0.71
486	0.75
487	0.8
488	0.82
489	0.87
490	0.89
491	0.9
492	0.92
493	0.89
494	0.89
495	0.88
496	0.87

W9CQN6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer