Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9CTK2

Protein Details
Accession W9CTK2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-116TGVWVIRKQTRRKRAPEDDEIHydrophilic
295-322KGEKSPRTPGTGKPKRRKSKVMNGGVSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
290-314QKKGSKGEKSPRTPGTGKPKRRKSK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.833, cyto 9, cyto_mito 5.833, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MASQDPPLDEIQWRDPQWLAANGGIHENTILHYFAQSPFFDRTSNNSIVTTQATFNNNLWYLLGTRGAFEGRLKTMSGLEFIIAQEPAAMGPGTGTGVWVIRKQTRRKRAPEDDEIIIHSSYFVVGENIYMAPTVADVLGSRMLSIFTSLTNAISKVSELPNFSPSLGHTYMPPVPPRTKAVTSTFSQTEENTPMPDSLATEAKNPSVSTSTNVLAHHLLEETLNITLKYGDEYMDENPITGTPGDFHFSTTGRKEKERLMVPPTSKPAGFGLSGKPAAPTPLKTDLGIQKKGSKGEKSPRTPGTGKPKRRKSKVMNGGVSPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.34
4 0.36
5 0.35
6 0.3
7 0.25
8 0.27
9 0.25
10 0.27
11 0.24
12 0.19
13 0.16
14 0.14
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.09
19 0.1
20 0.12
21 0.14
22 0.18
23 0.17
24 0.19
25 0.22
26 0.23
27 0.23
28 0.23
29 0.27
30 0.3
31 0.33
32 0.31
33 0.28
34 0.27
35 0.28
36 0.29
37 0.23
38 0.18
39 0.2
40 0.21
41 0.23
42 0.23
43 0.27
44 0.25
45 0.23
46 0.22
47 0.18
48 0.17
49 0.16
50 0.18
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.13
56 0.14
57 0.16
58 0.14
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.17
63 0.16
64 0.16
65 0.13
66 0.11
67 0.11
68 0.1
69 0.11
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.04
84 0.06
85 0.07
86 0.09
87 0.13
88 0.19
89 0.27
90 0.37
91 0.47
92 0.56
93 0.64
94 0.71
95 0.78
96 0.82
97 0.82
98 0.8
99 0.74
100 0.65
101 0.57
102 0.5
103 0.41
104 0.3
105 0.22
106 0.14
107 0.09
108 0.07
109 0.07
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.04
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.12
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.14
151 0.12
152 0.11
153 0.15
154 0.14
155 0.13
156 0.12
157 0.14
158 0.17
159 0.19
160 0.21
161 0.19
162 0.2
163 0.22
164 0.25
165 0.27
166 0.26
167 0.28
168 0.31
169 0.31
170 0.3
171 0.32
172 0.29
173 0.26
174 0.25
175 0.22
176 0.2
177 0.19
178 0.18
179 0.15
180 0.15
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.1
185 0.09
186 0.11
187 0.11
188 0.13
189 0.13
190 0.14
191 0.15
192 0.14
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.16
198 0.16
199 0.18
200 0.18
201 0.18
202 0.16
203 0.16
204 0.14
205 0.11
206 0.1
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.1
221 0.11
222 0.14
223 0.14
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.1
229 0.1
230 0.07
231 0.09
232 0.11
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.14
237 0.19
238 0.23
239 0.29
240 0.3
241 0.33
242 0.35
243 0.39
244 0.46
245 0.47
246 0.46
247 0.45
248 0.49
249 0.49
250 0.52
251 0.51
252 0.46
253 0.4
254 0.37
255 0.33
256 0.28
257 0.27
258 0.22
259 0.21
260 0.24
261 0.25
262 0.23
263 0.22
264 0.2
265 0.24
266 0.24
267 0.23
268 0.23
269 0.3
270 0.31
271 0.3
272 0.37
273 0.41
274 0.46
275 0.49
276 0.46
277 0.45
278 0.48
279 0.54
280 0.54
281 0.51
282 0.53
283 0.59
284 0.66
285 0.67
286 0.72
287 0.7
288 0.71
289 0.67
290 0.67
291 0.68
292 0.68
293 0.72
294 0.74
295 0.8
296 0.84
297 0.9
298 0.92
299 0.9
300 0.91
301 0.91
302 0.91
303 0.86