Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9CHA8

Protein Details
Accession W9CHA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-297HQAGVNKKTKKKTKSLEKAVDKVRRKEKKSKQPHPLNFSALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-288GVNKKTKKKTKSLEKAVDKVRRKEKKSKQ
673-695REGKGERSEHKSTKALRRAKKDS
Subcellular Location(s) nucl 22, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027312  Sda1  
IPR007949  SDA1_C  
IPR012977  SDA1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08158  NUC130_3NT  
PF05285  SDA1  
Amino Acid Sequences MGKKRVGALEKVDADLPNLQYKIRRDPKSYAEDFLNQYGQYQSQRDIFMSSPSTATSGGIVSFHDLIDFVAHCSDCFPEDTAEFPEDLKRILTLHHAELESELREKIVGSLVLLRRKEVIDSADLLNTLFPILVATPSKTLRTLLFQKILSDLRTSNSKAINHRLNRTMQTALFNLLTSDRTSSKGIWAVKITRELWKRQIWTDAKTVEIMKEASLSDNEKVVGGGVRFFLGGDKEREDMEDESSDDEAIDIGKLKHQAGVNKKTKKKTKSLEKAVDKVRRKEKKSKQPHPLNFSALHLLHDPQGFAETLFSKHLQNSKSKLNLEQKLIVLSLVSRLVGLHKLTVIALYSYFTKYLTPRQPSVTSFLASLAQATHNLVPPDALEPLVQKIANEFVSEASASEVAASGLNAIREICVRQPLAMNDTLLQDLIMYRKSKDKGTMMAAKGLLSLYREVGADMLKKRDRGKTASMGLKAGSIKERRFGEEEVGGIEGIELLEQWKEDERKRKRVEQGLPEELGTDEEEEDDEQDWNAWDVESDASSDAGDWINVESDAEIEISDSEDDKPAAKKAKLDIKATEKSAEDTEKEKSDEVLEQKISTYATTKILTPADLTKLQELRLEASVNKAMGGRTQSQRMKDAAARHADDALTADQIEGFSRLQKNTREEKIAMAREGKGERSEHKSTKALRRAKKDSEGKSSTNQEKSRNKNFMMTLGKAKRHIDVGRLYNIQLFTQSPHGFPVSNMTVSDDGAAQKPAKREQKAIIDPCDTIPRYDEESQTSETGPQKRKIKLEDEDDQEHKTKCLKLGLKEDSHTGSYQTPTFRSQEISERFSGWHPTVYQHPPETKPQVCSQKTDINPYLLCSNHGHDGVSLARHLPMPQISQNSTTSKPDQRTIARFPRLDRFLQMRMTLPSMRRTMLEIEHHNQIYKDNTDYTPDFNRIFRSPSWSSVSETEDETKSADIAAPAPPPPTPPPPPQLLNAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.3
4 0.27
5 0.26
6 0.26
7 0.3
8 0.35
9 0.44
10 0.49
11 0.53
12 0.53
13 0.6
14 0.67
15 0.71
16 0.69
17 0.62
18 0.56
19 0.55
20 0.53
21 0.5
22 0.44
23 0.33
24 0.32
25 0.3
26 0.29
27 0.28
28 0.27
29 0.26
30 0.28
31 0.3
32 0.29
33 0.3
34 0.27
35 0.27
36 0.28
37 0.25
38 0.22
39 0.21
40 0.21
41 0.19
42 0.18
43 0.14
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.1
52 0.09
53 0.09
54 0.11
55 0.11
56 0.09
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.13
61 0.14
62 0.13
63 0.14
64 0.15
65 0.14
66 0.15
67 0.17
68 0.2
69 0.2
70 0.19
71 0.18
72 0.2
73 0.19
74 0.19
75 0.17
76 0.14
77 0.13
78 0.15
79 0.21
80 0.21
81 0.23
82 0.28
83 0.27
84 0.27
85 0.28
86 0.29
87 0.24
88 0.21
89 0.18
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.11
97 0.19
98 0.24
99 0.31
100 0.31
101 0.31
102 0.3
103 0.3
104 0.31
105 0.26
106 0.24
107 0.2
108 0.23
109 0.23
110 0.22
111 0.21
112 0.19
113 0.16
114 0.13
115 0.11
116 0.07
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.08
121 0.1
122 0.11
123 0.15
124 0.17
125 0.19
126 0.19
127 0.21
128 0.2
129 0.26
130 0.32
131 0.35
132 0.39
133 0.38
134 0.38
135 0.41
136 0.42
137 0.35
138 0.31
139 0.25
140 0.22
141 0.27
142 0.29
143 0.29
144 0.32
145 0.35
146 0.38
147 0.46
148 0.53
149 0.54
150 0.57
151 0.58
152 0.58
153 0.57
154 0.54
155 0.49
156 0.41
157 0.38
158 0.33
159 0.3
160 0.25
161 0.22
162 0.19
163 0.16
164 0.15
165 0.13
166 0.15
167 0.13
168 0.16
169 0.18
170 0.18
171 0.21
172 0.26
173 0.27
174 0.27
175 0.3
176 0.32
177 0.33
178 0.38
179 0.35
180 0.38
181 0.41
182 0.43
183 0.46
184 0.49
185 0.49
186 0.46
187 0.54
188 0.49
189 0.48
190 0.5
191 0.43
192 0.37
193 0.36
194 0.35
195 0.25
196 0.24
197 0.2
198 0.14
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.15
204 0.14
205 0.15
206 0.15
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.13
220 0.15
221 0.16
222 0.17
223 0.17
224 0.18
225 0.2
226 0.18
227 0.18
228 0.16
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.14
233 0.11
234 0.1
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.1
241 0.12
242 0.12
243 0.16
244 0.19
245 0.25
246 0.33
247 0.43
248 0.5
249 0.57
250 0.64
251 0.7
252 0.76
253 0.77
254 0.78
255 0.78
256 0.8
257 0.81
258 0.85
259 0.85
260 0.83
261 0.83
262 0.82
263 0.81
264 0.77
265 0.75
266 0.75
267 0.74
268 0.74
269 0.77
270 0.79
271 0.81
272 0.85
273 0.86
274 0.87
275 0.88
276 0.9
277 0.87
278 0.8
279 0.73
280 0.63
281 0.55
282 0.49
283 0.38
284 0.31
285 0.24
286 0.2
287 0.19
288 0.18
289 0.16
290 0.11
291 0.12
292 0.11
293 0.1
294 0.11
295 0.09
296 0.1
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.16
301 0.21
302 0.22
303 0.28
304 0.31
305 0.36
306 0.4
307 0.41
308 0.46
309 0.5
310 0.52
311 0.5
312 0.49
313 0.42
314 0.37
315 0.35
316 0.27
317 0.18
318 0.13
319 0.1
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.1
341 0.11
342 0.2
343 0.27
344 0.31
345 0.32
346 0.37
347 0.39
348 0.39
349 0.42
350 0.35
351 0.27
352 0.23
353 0.21
354 0.18
355 0.15
356 0.13
357 0.09
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.11
368 0.1
369 0.09
370 0.07
371 0.07
372 0.09
373 0.1
374 0.1
375 0.08
376 0.09
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.1
403 0.1
404 0.11
405 0.14
406 0.14
407 0.17
408 0.17
409 0.16
410 0.13
411 0.14
412 0.13
413 0.11
414 0.1
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.09
419 0.09
420 0.1
421 0.16
422 0.18
423 0.2
424 0.24
425 0.25
426 0.26
427 0.31
428 0.37
429 0.32
430 0.33
431 0.31
432 0.26
433 0.24
434 0.21
435 0.15
436 0.09
437 0.09
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.1
445 0.11
446 0.17
447 0.18
448 0.21
449 0.25
450 0.29
451 0.32
452 0.33
453 0.36
454 0.37
455 0.41
456 0.43
457 0.4
458 0.35
459 0.31
460 0.29
461 0.24
462 0.19
463 0.18
464 0.17
465 0.17
466 0.22
467 0.23
468 0.23
469 0.26
470 0.25
471 0.23
472 0.19
473 0.19
474 0.14
475 0.13
476 0.11
477 0.08
478 0.07
479 0.04
480 0.03
481 0.03
482 0.02
483 0.02
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.07
488 0.1
489 0.15
490 0.25
491 0.32
492 0.42
493 0.47
494 0.54
495 0.58
496 0.64
497 0.67
498 0.67
499 0.67
500 0.6
501 0.56
502 0.48
503 0.41
504 0.32
505 0.25
506 0.16
507 0.09
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.05
521 0.04
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.05
536 0.05
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.03
544 0.04
545 0.04
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.07
551 0.08
552 0.09
553 0.12
554 0.18
555 0.18
556 0.2
557 0.25
558 0.34
559 0.37
560 0.39
561 0.41
562 0.42
563 0.45
564 0.43
565 0.4
566 0.31
567 0.28
568 0.28
569 0.24
570 0.18
571 0.17
572 0.19
573 0.18
574 0.19
575 0.18
576 0.16
577 0.16
578 0.18
579 0.18
580 0.2
581 0.18
582 0.17
583 0.17
584 0.17
585 0.16
586 0.12
587 0.12
588 0.1
589 0.12
590 0.13
591 0.13
592 0.15
593 0.15
594 0.15
595 0.15
596 0.15
597 0.16
598 0.17
599 0.17
600 0.18
601 0.19
602 0.19
603 0.2
604 0.19
605 0.17
606 0.17
607 0.17
608 0.13
609 0.15
610 0.16
611 0.14
612 0.14
613 0.13
614 0.12
615 0.13
616 0.16
617 0.18
618 0.19
619 0.27
620 0.3
621 0.32
622 0.35
623 0.33
624 0.33
625 0.32
626 0.34
627 0.32
628 0.34
629 0.33
630 0.3
631 0.3
632 0.27
633 0.23
634 0.2
635 0.15
636 0.1
637 0.08
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.07
642 0.07
643 0.06
644 0.11
645 0.14
646 0.16
647 0.2
648 0.26
649 0.32
650 0.39
651 0.43
652 0.43
653 0.4
654 0.44
655 0.47
656 0.45
657 0.4
658 0.35
659 0.32
660 0.31
661 0.32
662 0.28
663 0.23
664 0.22
665 0.24
666 0.29
667 0.35
668 0.34
669 0.37
670 0.42
671 0.46
672 0.54
673 0.59
674 0.61
675 0.62
676 0.68
677 0.72
678 0.72
679 0.75
680 0.74
681 0.7
682 0.71
683 0.68
684 0.62
685 0.6
686 0.61
687 0.59
688 0.58
689 0.56
690 0.55
691 0.59
692 0.65
693 0.69
694 0.68
695 0.62
696 0.59
697 0.56
698 0.54
699 0.51
700 0.45
701 0.45
702 0.44
703 0.46
704 0.44
705 0.44
706 0.38
707 0.38
708 0.37
709 0.33
710 0.34
711 0.36
712 0.37
713 0.37
714 0.36
715 0.33
716 0.32
717 0.26
718 0.21
719 0.17
720 0.14
721 0.2
722 0.21
723 0.18
724 0.19
725 0.2
726 0.19
727 0.19
728 0.24
729 0.19
730 0.19
731 0.18
732 0.19
733 0.18
734 0.18
735 0.18
736 0.13
737 0.11
738 0.12
739 0.14
740 0.13
741 0.16
742 0.2
743 0.28
744 0.36
745 0.38
746 0.41
747 0.46
748 0.54
749 0.6
750 0.62
751 0.58
752 0.52
753 0.49
754 0.47
755 0.47
756 0.38
757 0.29
758 0.25
759 0.24
760 0.27
761 0.3
762 0.3
763 0.26
764 0.29
765 0.31
766 0.3
767 0.27
768 0.26
769 0.29
770 0.36
771 0.39
772 0.43
773 0.48
774 0.53
775 0.59
776 0.6
777 0.62
778 0.6
779 0.61
780 0.61
781 0.6
782 0.6
783 0.56
784 0.53
785 0.49
786 0.43
787 0.38
788 0.35
789 0.31
790 0.29
791 0.36
792 0.38
793 0.41
794 0.5
795 0.56
796 0.55
797 0.53
798 0.52
799 0.47
800 0.43
801 0.36
802 0.29
803 0.24
804 0.23
805 0.25
806 0.24
807 0.24
808 0.25
809 0.27
810 0.26
811 0.27
812 0.27
813 0.33
814 0.36
815 0.38
816 0.36
817 0.35
818 0.35
819 0.34
820 0.37
821 0.28
822 0.27
823 0.23
824 0.24
825 0.3
826 0.35
827 0.38
828 0.38
829 0.42
830 0.42
831 0.5
832 0.56
833 0.52
834 0.5
835 0.53
836 0.58
837 0.55
838 0.57
839 0.55
840 0.55
841 0.54
842 0.59
843 0.54
844 0.48
845 0.46
846 0.43
847 0.42
848 0.33
849 0.33
850 0.27
851 0.27
852 0.26
853 0.26
854 0.24
855 0.2
856 0.22
857 0.21
858 0.2
859 0.18
860 0.14
861 0.15
862 0.15
863 0.16
864 0.17
865 0.18
866 0.21
867 0.26
868 0.31
869 0.32
870 0.34
871 0.38
872 0.38
873 0.38
874 0.39
875 0.41
876 0.43
877 0.45
878 0.46
879 0.5
880 0.53
881 0.57
882 0.61
883 0.65
884 0.65
885 0.64
886 0.64
887 0.66
888 0.62
889 0.57
890 0.54
891 0.5
892 0.47
893 0.48
894 0.46
895 0.39
896 0.38
897 0.4
898 0.39
899 0.36
900 0.38
901 0.36
902 0.35
903 0.33
904 0.33
905 0.33
906 0.33
907 0.38
908 0.38
909 0.39
910 0.45
911 0.45
912 0.44
913 0.4
914 0.38
915 0.35
916 0.31
917 0.31
918 0.27
919 0.27
920 0.32
921 0.33
922 0.35
923 0.35
924 0.37
925 0.36
926 0.34
927 0.38
928 0.34
929 0.37
930 0.34
931 0.37
932 0.35
933 0.39
934 0.43
935 0.4
936 0.41
937 0.4
938 0.42
939 0.36
940 0.36
941 0.35
942 0.29
943 0.28
944 0.25
945 0.22
946 0.18
947 0.17
948 0.15
949 0.12
950 0.12
951 0.15
952 0.16
953 0.17
954 0.18
955 0.18
956 0.21
957 0.26
958 0.33
959 0.36
960 0.41
961 0.46
962 0.52
963 0.54