Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

J3K4R0

Protein Details
Accession J3K4R0    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
156-178AAQLRWESRNKKKDGKQLPPAEGHydrophilic
790-815STTEASPSKKRKRGETKESKIRQPNSHydrophilic
945-976GSESKAESRTKHRRSRNPRRWWHTFKYREILGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
798-809KKRKRGETKESK
953-963RTKHRRSRNPR
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 5, cyto 4, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011659  PD40  
IPR046351  UTP4  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG cim:CIMG_08063  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07676  PD40  
Amino Acid Sequences MKVKKNSIWCLHRLVLTPPVFSQLSMDIHRCRFVPYNPQAINALAFSHPPSTELQGRGVPTLRLAIGRANGDIELWNPSKGTWFQETILRGGKDRSIEGLAWTVDPSEKDSEGNDLPGKLRLFSIGYSSVVTEWDLEKGRPARHSSGNYGEIWCLAAQLRWESRNKKKDGKQLPPAEGEYMGQHLAVGCADGAIVILSTADGDLKYLRTMRPSTKKSRVLNITFQNRNTIVAAYADSSIRIFDIRSGKLLRTVTLGKGPNKAVKELLVWSVKCLPDGTIVSGDSAGEVRFWDSKNYSLIQRIQSHQADVLDIAVSADGESVVSAGADQRTAVYRRKAPEKGAKTRRWVEVMHRRYHTHDVKALAVYETKDISVFVSGGLDTVPVVVPLRSIGKELHRKLPSLPQSPPLSSSPSSRLLMGWWDREVNIWRVSQPSKSLESQQHRLVAKVLFQGEENLTSAALSSDGKLLVAASVSQIKAFCLSPREDGDKPGLQVNKLEIPFEISKCGAKEIAISPDGKWLCFVRSDNVICMARIDIDPEIPGRPQILPGISKLRRAQRNVQRGKLHHGSLGAYDRTIRCIAFSSDSNIVACGDLAGFVDAWVLENKSNLLTNGQIPEKAADSELSDDDSSDEEAGSTNTYGQRWIVPRFDSPIPRLKSGVLLMTFRPSYGSQSKHLTNGVTSNSSPSHNLSTGDDRLVVLTTEHHISEFNVLEGKLTGWSRRNPKSYLPKDFTIVKDRAMGALWDKKGTSERLWLYGPSWLWMFDLAQDFPAPAEPDNEEKAVAALNNDSTTEASPSKKRKRGETKESKIRQPNSGAGDRVPYWQDNIGLGRKMRKVIGDDGETAQWIPIDLKKPADPAQMGDEAADHYEEPSKSILAEFRREPQGDGPGSEEENGEWQQQQQLDEGTSAIRPQSSSNLPNEASEANDHDVEGTTADLQVQEVPGSESKAESRTKHRRSRNPRRWWHTFKYREILGIVPLGQGFTAGDAVGASWANEGMGGLEVAVVERPMWDVALPGRYVRDYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.47
3 0.42
4 0.4
5 0.33
6 0.34
7 0.3
8 0.28
9 0.26
10 0.22
11 0.25
12 0.26
13 0.31
14 0.32
15 0.34
16 0.37
17 0.35
18 0.35
19 0.37
20 0.38
21 0.44
22 0.45
23 0.53
24 0.51
25 0.53
26 0.49
27 0.44
28 0.4
29 0.3
30 0.25
31 0.15
32 0.16
33 0.15
34 0.17
35 0.16
36 0.16
37 0.18
38 0.21
39 0.27
40 0.28
41 0.29
42 0.3
43 0.32
44 0.34
45 0.33
46 0.28
47 0.23
48 0.24
49 0.21
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.2
54 0.21
55 0.21
56 0.19
57 0.18
58 0.17
59 0.17
60 0.14
61 0.17
62 0.17
63 0.17
64 0.16
65 0.16
66 0.21
67 0.22
68 0.26
69 0.25
70 0.26
71 0.27
72 0.33
73 0.35
74 0.34
75 0.39
76 0.34
77 0.31
78 0.3
79 0.32
80 0.29
81 0.28
82 0.27
83 0.23
84 0.22
85 0.22
86 0.24
87 0.21
88 0.19
89 0.18
90 0.16
91 0.15
92 0.15
93 0.17
94 0.17
95 0.17
96 0.17
97 0.17
98 0.22
99 0.21
100 0.25
101 0.23
102 0.21
103 0.22
104 0.27
105 0.27
106 0.22
107 0.21
108 0.19
109 0.18
110 0.17
111 0.21
112 0.17
113 0.17
114 0.17
115 0.17
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.11
120 0.1
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.22
125 0.26
126 0.3
127 0.34
128 0.39
129 0.41
130 0.47
131 0.52
132 0.51
133 0.52
134 0.51
135 0.47
136 0.43
137 0.37
138 0.29
139 0.26
140 0.19
141 0.14
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.16
146 0.2
147 0.24
148 0.32
149 0.4
150 0.5
151 0.58
152 0.64
153 0.68
154 0.72
155 0.78
156 0.81
157 0.82
158 0.82
159 0.81
160 0.78
161 0.72
162 0.66
163 0.57
164 0.47
165 0.37
166 0.28
167 0.21
168 0.17
169 0.12
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.09
193 0.12
194 0.14
195 0.19
196 0.23
197 0.32
198 0.42
199 0.49
200 0.56
201 0.64
202 0.71
203 0.7
204 0.75
205 0.75
206 0.7
207 0.71
208 0.71
209 0.7
210 0.66
211 0.62
212 0.58
213 0.49
214 0.45
215 0.37
216 0.29
217 0.2
218 0.16
219 0.16
220 0.11
221 0.12
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.11
230 0.17
231 0.18
232 0.22
233 0.24
234 0.24
235 0.3
236 0.3
237 0.25
238 0.24
239 0.25
240 0.23
241 0.28
242 0.33
243 0.3
244 0.35
245 0.37
246 0.38
247 0.37
248 0.37
249 0.31
250 0.27
251 0.26
252 0.23
253 0.25
254 0.25
255 0.23
256 0.24
257 0.29
258 0.27
259 0.26
260 0.24
261 0.2
262 0.19
263 0.2
264 0.2
265 0.16
266 0.16
267 0.16
268 0.15
269 0.14
270 0.1
271 0.09
272 0.07
273 0.05
274 0.05
275 0.07
276 0.1
277 0.11
278 0.15
279 0.16
280 0.18
281 0.21
282 0.23
283 0.23
284 0.25
285 0.3
286 0.32
287 0.35
288 0.35
289 0.39
290 0.38
291 0.37
292 0.34
293 0.29
294 0.23
295 0.19
296 0.16
297 0.09
298 0.08
299 0.07
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.1
317 0.13
318 0.18
319 0.22
320 0.27
321 0.32
322 0.4
323 0.43
324 0.47
325 0.54
326 0.58
327 0.63
328 0.68
329 0.69
330 0.69
331 0.71
332 0.68
333 0.61
334 0.54
335 0.53
336 0.54
337 0.55
338 0.54
339 0.51
340 0.49
341 0.5
342 0.58
343 0.53
344 0.46
345 0.43
346 0.38
347 0.37
348 0.36
349 0.32
350 0.23
351 0.19
352 0.16
353 0.14
354 0.12
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.11
379 0.19
380 0.28
381 0.31
382 0.39
383 0.38
384 0.39
385 0.4
386 0.47
387 0.47
388 0.43
389 0.41
390 0.39
391 0.4
392 0.4
393 0.41
394 0.33
395 0.3
396 0.26
397 0.27
398 0.25
399 0.26
400 0.26
401 0.23
402 0.22
403 0.18
404 0.22
405 0.22
406 0.19
407 0.16
408 0.16
409 0.16
410 0.18
411 0.2
412 0.18
413 0.18
414 0.17
415 0.16
416 0.2
417 0.21
418 0.21
419 0.21
420 0.21
421 0.22
422 0.23
423 0.28
424 0.32
425 0.36
426 0.39
427 0.39
428 0.42
429 0.39
430 0.38
431 0.35
432 0.27
433 0.24
434 0.22
435 0.2
436 0.14
437 0.14
438 0.15
439 0.13
440 0.13
441 0.11
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.04
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.06
460 0.06
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.11
468 0.12
469 0.14
470 0.17
471 0.22
472 0.21
473 0.22
474 0.25
475 0.23
476 0.23
477 0.24
478 0.22
479 0.18
480 0.18
481 0.18
482 0.19
483 0.18
484 0.17
485 0.13
486 0.17
487 0.18
488 0.18
489 0.17
490 0.12
491 0.14
492 0.14
493 0.14
494 0.1
495 0.08
496 0.1
497 0.1
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.12
502 0.18
503 0.18
504 0.16
505 0.15
506 0.13
507 0.13
508 0.15
509 0.15
510 0.11
511 0.17
512 0.17
513 0.17
514 0.2
515 0.2
516 0.17
517 0.17
518 0.15
519 0.11
520 0.1
521 0.11
522 0.07
523 0.06
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.08
532 0.09
533 0.1
534 0.1
535 0.12
536 0.2
537 0.2
538 0.24
539 0.28
540 0.35
541 0.39
542 0.43
543 0.51
544 0.51
545 0.61
546 0.63
547 0.65
548 0.63
549 0.59
550 0.62
551 0.57
552 0.48
553 0.38
554 0.33
555 0.27
556 0.23
557 0.25
558 0.18
559 0.13
560 0.15
561 0.13
562 0.15
563 0.15
564 0.13
565 0.1
566 0.12
567 0.13
568 0.13
569 0.14
570 0.15
571 0.16
572 0.16
573 0.16
574 0.14
575 0.13
576 0.1
577 0.09
578 0.06
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.03
584 0.03
585 0.04
586 0.03
587 0.04
588 0.05
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.07
593 0.07
594 0.08
595 0.07
596 0.08
597 0.08
598 0.1
599 0.13
600 0.13
601 0.13
602 0.13
603 0.13
604 0.13
605 0.12
606 0.11
607 0.08
608 0.08
609 0.1
610 0.1
611 0.11
612 0.09
613 0.09
614 0.09
615 0.09
616 0.09
617 0.07
618 0.07
619 0.05
620 0.06
621 0.06
622 0.06
623 0.05
624 0.07
625 0.08
626 0.09
627 0.09
628 0.09
629 0.13
630 0.16
631 0.19
632 0.2
633 0.21
634 0.22
635 0.26
636 0.3
637 0.29
638 0.29
639 0.35
640 0.35
641 0.34
642 0.34
643 0.3
644 0.28
645 0.26
646 0.26
647 0.18
648 0.17
649 0.16
650 0.18
651 0.18
652 0.15
653 0.16
654 0.13
655 0.18
656 0.22
657 0.25
658 0.25
659 0.3
660 0.31
661 0.31
662 0.32
663 0.27
664 0.22
665 0.22
666 0.21
667 0.19
668 0.17
669 0.18
670 0.17
671 0.18
672 0.18
673 0.17
674 0.18
675 0.17
676 0.18
677 0.18
678 0.22
679 0.22
680 0.21
681 0.2
682 0.16
683 0.16
684 0.15
685 0.12
686 0.07
687 0.07
688 0.08
689 0.09
690 0.09
691 0.09
692 0.09
693 0.09
694 0.13
695 0.12
696 0.1
697 0.11
698 0.11
699 0.11
700 0.11
701 0.11
702 0.11
703 0.11
704 0.15
705 0.18
706 0.25
707 0.33
708 0.4
709 0.45
710 0.44
711 0.53
712 0.6
713 0.64
714 0.67
715 0.64
716 0.58
717 0.56
718 0.58
719 0.53
720 0.49
721 0.42
722 0.33
723 0.31
724 0.3
725 0.27
726 0.23
727 0.2
728 0.17
729 0.23
730 0.23
731 0.2
732 0.2
733 0.21
734 0.24
735 0.27
736 0.24
737 0.25
738 0.26
739 0.28
740 0.29
741 0.28
742 0.25
743 0.26
744 0.24
745 0.17
746 0.16
747 0.13
748 0.12
749 0.12
750 0.12
751 0.11
752 0.13
753 0.12
754 0.12
755 0.12
756 0.12
757 0.11
758 0.13
759 0.11
760 0.09
761 0.11
762 0.12
763 0.16
764 0.18
765 0.18
766 0.16
767 0.15
768 0.14
769 0.13
770 0.12
771 0.09
772 0.08
773 0.09
774 0.09
775 0.09
776 0.1
777 0.1
778 0.1
779 0.12
780 0.14
781 0.17
782 0.24
783 0.34
784 0.44
785 0.5
786 0.54
787 0.61
788 0.71
789 0.77
790 0.81
791 0.82
792 0.82
793 0.86
794 0.89
795 0.87
796 0.85
797 0.78
798 0.73
799 0.66
800 0.61
801 0.57
802 0.55
803 0.47
804 0.38
805 0.38
806 0.33
807 0.32
808 0.28
809 0.22
810 0.2
811 0.21
812 0.21
813 0.19
814 0.22
815 0.23
816 0.24
817 0.26
818 0.3
819 0.31
820 0.33
821 0.32
822 0.32
823 0.32
824 0.35
825 0.39
826 0.35
827 0.35
828 0.34
829 0.33
830 0.3
831 0.26
832 0.19
833 0.13
834 0.1
835 0.1
836 0.12
837 0.16
838 0.18
839 0.21
840 0.22
841 0.27
842 0.3
843 0.35
844 0.31
845 0.29
846 0.32
847 0.31
848 0.29
849 0.25
850 0.21
851 0.15
852 0.15
853 0.14
854 0.09
855 0.08
856 0.13
857 0.13
858 0.14
859 0.15
860 0.14
861 0.14
862 0.16
863 0.2
864 0.19
865 0.25
866 0.26
867 0.31
868 0.38
869 0.39
870 0.39
871 0.38
872 0.42
873 0.37
874 0.36
875 0.33
876 0.28
877 0.28
878 0.26
879 0.23
880 0.15
881 0.17
882 0.18
883 0.16
884 0.15
885 0.15
886 0.19
887 0.21
888 0.21
889 0.19
890 0.19
891 0.19
892 0.18
893 0.18
894 0.14
895 0.13
896 0.13
897 0.12
898 0.11
899 0.11
900 0.12
901 0.18
902 0.24
903 0.28
904 0.31
905 0.35
906 0.35
907 0.34
908 0.35
909 0.29
910 0.24
911 0.22
912 0.22
913 0.19
914 0.19
915 0.18
916 0.16
917 0.16
918 0.15
919 0.13
920 0.1
921 0.08
922 0.08
923 0.08
924 0.08
925 0.07
926 0.09
927 0.09
928 0.08
929 0.08
930 0.11
931 0.12
932 0.14
933 0.14
934 0.14
935 0.16
936 0.22
937 0.27
938 0.29
939 0.38
940 0.47
941 0.57
942 0.66
943 0.74
944 0.79
945 0.85
946 0.92
947 0.92
948 0.92
949 0.93
950 0.92
951 0.92
952 0.91
953 0.9
954 0.89
955 0.87
956 0.84
957 0.81
958 0.73
959 0.65
960 0.58
961 0.49
962 0.4
963 0.34
964 0.26
965 0.19
966 0.18
967 0.15
968 0.13
969 0.11
970 0.09
971 0.07
972 0.07
973 0.06
974 0.06
975 0.05
976 0.06
977 0.07
978 0.07
979 0.06
980 0.06
981 0.06
982 0.06
983 0.06
984 0.06
985 0.05
986 0.06
987 0.06
988 0.05
989 0.05
990 0.05
991 0.06
992 0.06
993 0.06
994 0.05
995 0.06
996 0.07
997 0.08
998 0.08
999 0.08
1000 0.1
1001 0.14
1002 0.18
1003 0.19
1004 0.18
1005 0.21