Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

J3KDV5

Protein Details
Accession J3KDV5    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-66LSMSDVSPAKKRKKGKPEPATDDDPIHydrophilic
77-96LSNGTPKPRHRPRTEFTPGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-57AKKRKKGKP
111-128KPRKKAISTPRVGERRSK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito_nucl 11.333, cyto_nucl 9.833, mito 7.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG cim:CIMG_04618  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MGFLTKTNFRGSLLLTRVEGRSTKRQARYSTGDDDSSSDPLSMSDVSPAKKRKKGKPEPATDDDPISSSNDSDSPSLSNGTPKPRHRPRTEFTPGDLEADLAAIDADATPKPRKKAISTPRVGERRSKRISNVGITAQDANASKDASNEHSPGSRAFGDSLVFFSRVPKKGKTYQRNPFNNVRTPTKTEKKHEFIVPRNGPDIPDTVRTQMPSDNPEFKVPMAIPNDSFSSASFPTDDSSREVPETFVFDDHSGSSSPLSSVAPSNMDLTVDEKRFLDAASGDFVRCQACRELLDPEYLAEFQLEKGVSVRRQMQACQQHKRWTAERDWRQRDYPTIDWEGLEDRIQAYFAELDQILTRKKPSFFRNFLESSNTGNSKKDNFRLTANSQFEMMSSGYYGPRGARLMMDAIITKFAAKLRRLGPSDSLMQAAGASGFVQAVLVPELTVMLVKDDMGVGDETARQIMRESNMIGNLLNDQPDDDVKVDEDGNSRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.3
3 0.32
4 0.31
5 0.32
6 0.33
7 0.31
8 0.38
9 0.45
10 0.53
11 0.58
12 0.65
13 0.67
14 0.71
15 0.72
16 0.68
17 0.66
18 0.6
19 0.53
20 0.46
21 0.44
22 0.38
23 0.32
24 0.26
25 0.19
26 0.16
27 0.14
28 0.16
29 0.13
30 0.11
31 0.16
32 0.19
33 0.21
34 0.29
35 0.38
36 0.45
37 0.52
38 0.61
39 0.65
40 0.72
41 0.81
42 0.85
43 0.86
44 0.88
45 0.89
46 0.87
47 0.83
48 0.73
49 0.64
50 0.53
51 0.44
52 0.34
53 0.27
54 0.21
55 0.15
56 0.14
57 0.14
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.14
62 0.15
63 0.17
64 0.16
65 0.21
66 0.23
67 0.32
68 0.4
69 0.45
70 0.55
71 0.63
72 0.72
73 0.75
74 0.79
75 0.76
76 0.78
77 0.81
78 0.73
79 0.65
80 0.62
81 0.53
82 0.47
83 0.4
84 0.3
85 0.2
86 0.17
87 0.14
88 0.07
89 0.06
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.05
94 0.06
95 0.1
96 0.17
97 0.21
98 0.25
99 0.3
100 0.34
101 0.39
102 0.49
103 0.56
104 0.6
105 0.61
106 0.64
107 0.68
108 0.7
109 0.66
110 0.64
111 0.62
112 0.61
113 0.63
114 0.61
115 0.55
116 0.57
117 0.61
118 0.56
119 0.51
120 0.44
121 0.39
122 0.36
123 0.33
124 0.24
125 0.22
126 0.18
127 0.15
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.14
133 0.16
134 0.19
135 0.18
136 0.19
137 0.2
138 0.21
139 0.2
140 0.22
141 0.17
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.13
146 0.12
147 0.14
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.16
152 0.23
153 0.28
154 0.32
155 0.33
156 0.38
157 0.47
158 0.58
159 0.63
160 0.65
161 0.69
162 0.76
163 0.79
164 0.79
165 0.78
166 0.74
167 0.71
168 0.65
169 0.61
170 0.55
171 0.54
172 0.57
173 0.57
174 0.58
175 0.58
176 0.62
177 0.6
178 0.61
179 0.61
180 0.59
181 0.58
182 0.61
183 0.58
184 0.51
185 0.48
186 0.43
187 0.37
188 0.31
189 0.26
190 0.18
191 0.18
192 0.17
193 0.18
194 0.18
195 0.18
196 0.18
197 0.19
198 0.19
199 0.19
200 0.22
201 0.24
202 0.25
203 0.25
204 0.25
205 0.22
206 0.22
207 0.18
208 0.2
209 0.17
210 0.17
211 0.16
212 0.17
213 0.18
214 0.16
215 0.16
216 0.11
217 0.12
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.13
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.11
265 0.07
266 0.07
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.1
275 0.09
276 0.1
277 0.12
278 0.13
279 0.16
280 0.16
281 0.17
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.09
291 0.08
292 0.07
293 0.09
294 0.13
295 0.14
296 0.17
297 0.22
298 0.23
299 0.24
300 0.26
301 0.33
302 0.39
303 0.46
304 0.51
305 0.52
306 0.56
307 0.61
308 0.64
309 0.62
310 0.57
311 0.58
312 0.6
313 0.65
314 0.67
315 0.68
316 0.67
317 0.64
318 0.61
319 0.58
320 0.54
321 0.47
322 0.42
323 0.38
324 0.35
325 0.31
326 0.3
327 0.26
328 0.21
329 0.18
330 0.12
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.06
338 0.09
339 0.08
340 0.09
341 0.1
342 0.12
343 0.13
344 0.14
345 0.18
346 0.2
347 0.24
348 0.31
349 0.38
350 0.46
351 0.5
352 0.54
353 0.57
354 0.55
355 0.53
356 0.52
357 0.44
358 0.38
359 0.38
360 0.36
361 0.3
362 0.3
363 0.31
364 0.32
365 0.37
366 0.4
367 0.39
368 0.37
369 0.41
370 0.46
371 0.49
372 0.51
373 0.48
374 0.42
375 0.38
376 0.35
377 0.31
378 0.26
379 0.21
380 0.12
381 0.09
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.12
386 0.1
387 0.12
388 0.13
389 0.13
390 0.12
391 0.13
392 0.14
393 0.14
394 0.15
395 0.13
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.11
400 0.11
401 0.14
402 0.2
403 0.2
404 0.26
405 0.29
406 0.38
407 0.41
408 0.42
409 0.43
410 0.4
411 0.43
412 0.37
413 0.34
414 0.25
415 0.22
416 0.18
417 0.15
418 0.1
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.09
443 0.07
444 0.09
445 0.1
446 0.1
447 0.12
448 0.12
449 0.11
450 0.12
451 0.16
452 0.17
453 0.19
454 0.22
455 0.23
456 0.25
457 0.25
458 0.24
459 0.2
460 0.21
461 0.2
462 0.18
463 0.14
464 0.13
465 0.15
466 0.16
467 0.18
468 0.15
469 0.15
470 0.14
471 0.17
472 0.16
473 0.17