Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9CKM5

Protein Details
Accession W9CKM5    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-57PSRTPSPAPRGRSRARSRSRTPYSSASRYSRSPRRSISPRSRSRSAGRSRSRSRGSHydrophilic
76-98RSLSPRGRSKSRSRSRERSESAGHydrophilic
242-290YRPGERDRERSRSPRRHRTRSRSLSSRSRSRSPRRDRGRDRRDGFRGRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-94APRGRSRARSRSRTPYSSASRYSRSPRRSISPRSRSRSAGRSRSRSRGSAAGAGRAGGARFKSESRGRSLSPRGRSKSRSRSRERS
237-237R
241-308TYRPGERDRERSRSPRRHRTRSRSLSSRSRSRSPRRDRGRDRRDGFRGRGGRGGRDRDGSRDGRRKRS
320-341RSRSRSRGRGGGGGGGGGRGRR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034201  RNPS1_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12365  RRM_RNPS1  
Amino Acid Sequences MPSRTPSPAPRGRSRARSRSRTPYSSASRYSRSPRRSISPRSRSRSAGRSRSRSRGSAAGAGRAGGARFKSESRGRSLSPRGRSKSRSRSRERSESAGAGARSTKVVIEKLTKNVTEDHLREIFGSYGEIKDLDMPMNRSFNTNRGTAYILYVSASSAESAIAHMHESQLDGAMINVSIVLPRRKFSPQPPMARRGVNIDPRIPLGSGRSSRGGFDSRGGGGGMGGGGRMMDRERERGGDTYRPGERDRERSRSPRRHRTRSRSLSSRSRSRSPRRDRGRDRRDGFRGRGGRGGRDRDGSRDGRRKRSPSYSSYSSFDDRSRSRSRGRGGGGGGGGGRGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.81
3 0.83
4 0.85
5 0.84
6 0.86
7 0.86
8 0.81
9 0.76
10 0.75
11 0.73
12 0.7
13 0.7
14 0.64
15 0.6
16 0.61
17 0.65
18 0.65
19 0.63
20 0.64
21 0.63
22 0.67
23 0.71
24 0.75
25 0.77
26 0.78
27 0.81
28 0.82
29 0.81
30 0.77
31 0.75
32 0.74
33 0.73
34 0.73
35 0.73
36 0.75
37 0.77
38 0.8
39 0.78
40 0.71
41 0.65
42 0.61
43 0.54
44 0.52
45 0.46
46 0.4
47 0.35
48 0.32
49 0.28
50 0.23
51 0.19
52 0.14
53 0.14
54 0.12
55 0.14
56 0.14
57 0.22
58 0.27
59 0.3
60 0.35
61 0.38
62 0.38
63 0.44
64 0.53
65 0.53
66 0.57
67 0.63
68 0.62
69 0.66
70 0.71
71 0.73
72 0.74
73 0.77
74 0.78
75 0.78
76 0.82
77 0.83
78 0.86
79 0.8
80 0.75
81 0.68
82 0.59
83 0.51
84 0.45
85 0.37
86 0.27
87 0.24
88 0.18
89 0.15
90 0.14
91 0.13
92 0.1
93 0.12
94 0.14
95 0.19
96 0.22
97 0.26
98 0.3
99 0.29
100 0.28
101 0.29
102 0.3
103 0.3
104 0.28
105 0.28
106 0.25
107 0.25
108 0.24
109 0.23
110 0.2
111 0.13
112 0.13
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.13
123 0.14
124 0.16
125 0.17
126 0.18
127 0.18
128 0.22
129 0.22
130 0.2
131 0.19
132 0.18
133 0.2
134 0.17
135 0.18
136 0.13
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.02
165 0.03
166 0.06
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.14
171 0.17
172 0.21
173 0.27
174 0.36
175 0.4
176 0.5
177 0.54
178 0.57
179 0.57
180 0.54
181 0.49
182 0.43
183 0.41
184 0.38
185 0.36
186 0.32
187 0.3
188 0.3
189 0.3
190 0.24
191 0.18
192 0.14
193 0.17
194 0.17
195 0.19
196 0.21
197 0.2
198 0.21
199 0.23
200 0.23
201 0.18
202 0.18
203 0.18
204 0.15
205 0.15
206 0.14
207 0.11
208 0.08
209 0.08
210 0.06
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.09
219 0.11
220 0.14
221 0.16
222 0.18
223 0.2
224 0.23
225 0.26
226 0.27
227 0.28
228 0.3
229 0.32
230 0.33
231 0.32
232 0.36
233 0.38
234 0.43
235 0.48
236 0.5
237 0.55
238 0.62
239 0.72
240 0.75
241 0.8
242 0.81
243 0.84
244 0.87
245 0.91
246 0.91
247 0.92
248 0.91
249 0.9
250 0.87
251 0.85
252 0.84
253 0.81
254 0.81
255 0.76
256 0.75
257 0.76
258 0.78
259 0.81
260 0.81
261 0.84
262 0.85
263 0.89
264 0.91
265 0.93
266 0.92
267 0.92
268 0.86
269 0.85
270 0.84
271 0.81
272 0.74
273 0.73
274 0.68
275 0.6
276 0.62
277 0.54
278 0.54
279 0.53
280 0.55
281 0.49
282 0.51
283 0.5
284 0.48
285 0.53
286 0.51
287 0.53
288 0.57
289 0.61
290 0.64
291 0.72
292 0.73
293 0.74
294 0.78
295 0.75
296 0.72
297 0.73
298 0.7
299 0.65
300 0.62
301 0.59
302 0.51
303 0.48
304 0.43
305 0.42
306 0.38
307 0.42
308 0.46
309 0.47
310 0.51
311 0.56
312 0.6
313 0.6
314 0.61
315 0.6
316 0.54
317 0.53
318 0.45
319 0.39
320 0.32
321 0.25