Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9CS98

Protein Details
Accession W9CS98    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-89SSSTRRKRGRADGSDKTSKGHydrophilic
453-483LPPVSHKKGGRPPNPRKGKSGKNQYTKDKDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-307RSRKAKRGRSGSENKSEGPKR
349-389GVKKIRGAAAKNHREKELREERERSRVEAATKRKGRAERRR
458-474HKKGGRPPNPRKGKSGK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
Amino Acid Sequences MDTTRRSSRAARGSQPSQSTSHHSSASSNSSGRAERSTRSNNKVEPARKSTPSASLSSDSPDDATTAEDSSSTRRKRGRADGSDKTSKGQSVEEDTLIGVDGAGDDDEAVRCICGHDENPGPPSLEGEDNKNNTKDGIDEPVITAAEFTEDLAGFFLQCDVCKVWQHGVCVGIINDDASPDEYFCEQCRKELHRIRTAPNGQRYSLYLPLHPSLSRTTSRAGSFSKDGTRSPKDGRSRPTSSSTSAKRRSTMNSRDAAYDAAAEAEQIRQAIAASVAENNTESVDGRSRKAKRGRSGSENKSEGPKRQRTDSASSTPEDDEKPQQTTQRSVSQAVSEDSATLTNGRNGGVKKIRGAAAKNHREKELREERERSRVEAATKRKGRAERRRIEGQYTPIHNDVAITHSHPDSEPIEETPPAIKPSNNKTPEVAAQPPDPPPVPQTIAPDTPPPVLPPVSHKKGGRPPNPRKGKSGKNQYTKDKDDSGVGSPNRSQSRDILRIDDNVQATISKGSNNESKSSKAKASVGSKISMAEMRKRAASILDFISRTQVELASDPFMLPSGSGAEKFMRELVEETLPLIQVNGAHGAERTKVAAGESDSAKEFKDLTCLEMMDILTRQLVKWQKEYDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.68
3 0.61
4 0.55
5 0.51
6 0.5
7 0.47
8 0.46
9 0.4
10 0.36
11 0.36
12 0.37
13 0.4
14 0.36
15 0.31
16 0.29
17 0.31
18 0.33
19 0.32
20 0.34
21 0.31
22 0.3
23 0.39
24 0.47
25 0.52
26 0.57
27 0.63
28 0.6
29 0.66
30 0.71
31 0.7
32 0.68
33 0.67
34 0.67
35 0.63
36 0.64
37 0.59
38 0.58
39 0.54
40 0.48
41 0.44
42 0.39
43 0.37
44 0.35
45 0.33
46 0.25
47 0.22
48 0.19
49 0.15
50 0.13
51 0.14
52 0.11
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.17
58 0.26
59 0.28
60 0.34
61 0.39
62 0.45
63 0.54
64 0.63
65 0.67
66 0.69
67 0.75
68 0.77
69 0.79
70 0.82
71 0.73
72 0.65
73 0.57
74 0.49
75 0.41
76 0.34
77 0.29
78 0.28
79 0.3
80 0.27
81 0.25
82 0.23
83 0.21
84 0.19
85 0.15
86 0.07
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.08
101 0.1
102 0.11
103 0.15
104 0.2
105 0.22
106 0.25
107 0.25
108 0.26
109 0.22
110 0.23
111 0.21
112 0.22
113 0.21
114 0.25
115 0.31
116 0.33
117 0.38
118 0.37
119 0.34
120 0.29
121 0.29
122 0.25
123 0.2
124 0.22
125 0.19
126 0.19
127 0.19
128 0.2
129 0.2
130 0.17
131 0.15
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.06
142 0.07
143 0.08
144 0.06
145 0.07
146 0.09
147 0.1
148 0.12
149 0.15
150 0.17
151 0.23
152 0.25
153 0.27
154 0.26
155 0.25
156 0.23
157 0.22
158 0.2
159 0.14
160 0.11
161 0.1
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.12
172 0.19
173 0.18
174 0.21
175 0.28
176 0.32
177 0.42
178 0.49
179 0.56
180 0.57
181 0.61
182 0.62
183 0.65
184 0.68
185 0.65
186 0.66
187 0.61
188 0.52
189 0.48
190 0.47
191 0.41
192 0.39
193 0.32
194 0.25
195 0.25
196 0.26
197 0.26
198 0.24
199 0.21
200 0.18
201 0.21
202 0.21
203 0.2
204 0.21
205 0.23
206 0.24
207 0.25
208 0.24
209 0.23
210 0.23
211 0.25
212 0.27
213 0.24
214 0.26
215 0.3
216 0.33
217 0.33
218 0.36
219 0.41
220 0.44
221 0.49
222 0.53
223 0.54
224 0.55
225 0.54
226 0.56
227 0.5
228 0.46
229 0.48
230 0.48
231 0.5
232 0.53
233 0.51
234 0.48
235 0.48
236 0.51
237 0.53
238 0.54
239 0.51
240 0.47
241 0.46
242 0.45
243 0.42
244 0.36
245 0.26
246 0.18
247 0.11
248 0.08
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.22
275 0.25
276 0.33
277 0.41
278 0.47
279 0.5
280 0.58
281 0.61
282 0.63
283 0.7
284 0.68
285 0.68
286 0.62
287 0.55
288 0.53
289 0.5
290 0.47
291 0.47
292 0.48
293 0.42
294 0.44
295 0.48
296 0.46
297 0.5
298 0.48
299 0.43
300 0.38
301 0.37
302 0.34
303 0.29
304 0.26
305 0.21
306 0.18
307 0.17
308 0.17
309 0.2
310 0.2
311 0.23
312 0.24
313 0.26
314 0.28
315 0.3
316 0.29
317 0.29
318 0.28
319 0.25
320 0.24
321 0.21
322 0.18
323 0.12
324 0.1
325 0.09
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.11
334 0.12
335 0.18
336 0.21
337 0.22
338 0.22
339 0.24
340 0.27
341 0.27
342 0.28
343 0.31
344 0.37
345 0.46
346 0.51
347 0.5
348 0.5
349 0.5
350 0.49
351 0.5
352 0.5
353 0.48
354 0.47
355 0.51
356 0.51
357 0.58
358 0.58
359 0.5
360 0.43
361 0.38
362 0.38
363 0.39
364 0.43
365 0.44
366 0.47
367 0.47
368 0.49
369 0.54
370 0.6
371 0.63
372 0.67
373 0.65
374 0.68
375 0.74
376 0.71
377 0.68
378 0.61
379 0.55
380 0.51
381 0.46
382 0.42
383 0.34
384 0.32
385 0.27
386 0.23
387 0.18
388 0.13
389 0.11
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.11
395 0.13
396 0.12
397 0.13
398 0.13
399 0.13
400 0.15
401 0.14
402 0.15
403 0.14
404 0.14
405 0.15
406 0.15
407 0.16
408 0.2
409 0.28
410 0.37
411 0.39
412 0.39
413 0.37
414 0.39
415 0.41
416 0.4
417 0.35
418 0.28
419 0.27
420 0.28
421 0.28
422 0.28
423 0.24
424 0.21
425 0.19
426 0.2
427 0.21
428 0.21
429 0.24
430 0.26
431 0.27
432 0.27
433 0.28
434 0.26
435 0.25
436 0.23
437 0.19
438 0.18
439 0.17
440 0.16
441 0.22
442 0.3
443 0.33
444 0.38
445 0.39
446 0.44
447 0.52
448 0.62
449 0.63
450 0.65
451 0.7
452 0.75
453 0.85
454 0.8
455 0.79
456 0.77
457 0.78
458 0.77
459 0.78
460 0.77
461 0.77
462 0.81
463 0.83
464 0.83
465 0.78
466 0.73
467 0.65
468 0.56
469 0.49
470 0.44
471 0.37
472 0.36
473 0.31
474 0.29
475 0.27
476 0.34
477 0.34
478 0.34
479 0.32
480 0.31
481 0.4
482 0.44
483 0.44
484 0.42
485 0.4
486 0.41
487 0.41
488 0.39
489 0.31
490 0.24
491 0.22
492 0.18
493 0.17
494 0.17
495 0.15
496 0.12
497 0.13
498 0.16
499 0.22
500 0.24
501 0.28
502 0.27
503 0.32
504 0.35
505 0.38
506 0.37
507 0.36
508 0.38
509 0.41
510 0.44
511 0.47
512 0.45
513 0.42
514 0.39
515 0.35
516 0.33
517 0.3
518 0.27
519 0.27
520 0.29
521 0.3
522 0.3
523 0.3
524 0.29
525 0.29
526 0.28
527 0.23
528 0.23
529 0.26
530 0.25
531 0.25
532 0.29
533 0.25
534 0.24
535 0.21
536 0.18
537 0.15
538 0.16
539 0.18
540 0.15
541 0.15
542 0.14
543 0.13
544 0.13
545 0.11
546 0.09
547 0.08
548 0.09
549 0.1
550 0.11
551 0.13
552 0.14
553 0.15
554 0.16
555 0.18
556 0.15
557 0.15
558 0.16
559 0.18
560 0.18
561 0.18
562 0.18
563 0.17
564 0.17
565 0.15
566 0.13
567 0.11
568 0.09
569 0.1
570 0.13
571 0.11
572 0.12
573 0.13
574 0.14
575 0.15
576 0.16
577 0.16
578 0.13
579 0.14
580 0.14
581 0.17
582 0.18
583 0.21
584 0.22
585 0.23
586 0.24
587 0.24
588 0.24
589 0.21
590 0.2
591 0.15
592 0.22
593 0.2
594 0.21
595 0.23
596 0.23
597 0.22
598 0.24
599 0.23
600 0.18
601 0.18
602 0.16
603 0.15
604 0.15
605 0.15
606 0.2
607 0.28
608 0.3
609 0.37