FuNGI

W9CPI0

Protein Details

Accession

W9CPI0

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-55	QFTRRLKAADPLRPRKKPIRRPNVPSKPAGA	Hydrophilic
536-560	ESSGNESTRKKHKKKHIGSSQPTGT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
29-51	RLKAADPLRPRKKPIRRPNVPSK
435-449	KKKLGKGVRKALTKR
483-534	KKKDEEAKAKLKAEAKPSGTTSKGNNTPSGRPKHTDPMKKSKSLKRPGSPNL
539-551	GNESTRKKHKKKH

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPSGMSNGRTPTPTPNSGGAPQFTRRLKAADPLRPRKKPIRRPNVPSKPAGANLNGLTPARPNGPTSLNSFSGPRAPGPRGPIPNNGNVAPRQTYDGWTHPPKGEVTDYPLFTTRRALRDGMRYHAMRFAGKKEVDPTNQDEFTRPIALHRRDPRQPPSGKAFKDEDTVMEDSVDSKERERQEILKAEKEAQKASDRAQIAPTGNNATALAARKAQSFRNEKTTQVHRLDKTAEQKKESDLRYEEALPWHLEDADNKNIWVGNYESALSEVNVMFFTEGSSFKMIPVEKWYKFTSKNKFNTLTIDEAEAMLNKKTKESRWAMKTHEKNEATRANQENIRGLNKLYTVKTESTSFKGSSKNETRDIDELDFDADDLFQDDDELATVEPDRDEDTKDAQERIKQDQRGANLFGEADEESVEKDFLQEEQETEAKKKLGKGVRKALTKREKNFIYDSDSSNPYASSDSEDDTSDEEKQKEIDKKKDEEAKAKLKAEAKPSGTTSKGNNTPSGRPKHTDPMKKSKSLKRPGSPNLSESSGNESTRKKHKKKHIGSSQPTGTSTPIPGSRPMSPTPSSQPPPGQAQRKSSIVKISVNPSELSRISSMPPNPQGATSDGEATGGEMSDGAGGKKKKITIRMGGSPTASQPGSPAPGRSNGSRGGSPAQAAETAAPSGSGTIQPKEIIAALPSTGISIGQLLGHFRGRVGDAEGQTTKTEFMAMIKRNSKYGTDKLLRPKF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.41
3	0.43
4	0.42
5	0.42
6	0.43
7	0.46
8	0.48
9	0.42
10	0.39
11	0.39
12	0.44
13	0.43
14	0.42
15	0.39
16	0.39
17	0.38
18	0.43
19	0.48
20	0.49
21	0.57
22	0.64
23	0.73
24	0.75
25	0.81
26	0.82
27	0.84
28	0.85
29	0.86
30	0.86
31	0.86
32	0.89
33	0.93
34	0.93
35	0.88
36	0.81
37	0.75
38	0.69
39	0.63
40	0.57
41	0.48
42	0.41
43	0.36
44	0.34
45	0.31
46	0.26
47	0.22
48	0.2
49	0.21
50	0.2
51	0.2
52	0.2
53	0.22
54	0.26
55	0.27
56	0.31
57	0.33
58	0.31
59	0.31
60	0.31
61	0.28
62	0.3
63	0.29
64	0.28
65	0.29
66	0.31
67	0.33
68	0.39
69	0.46
70	0.48
71	0.5
72	0.55
73	0.54
74	0.56
75	0.56
76	0.51
77	0.47
78	0.4
79	0.41
80	0.34
81	0.31
82	0.29
83	0.27
84	0.28
85	0.29
86	0.32
87	0.36
88	0.39
89	0.42
90	0.39
91	0.4
92	0.37
93	0.37
94	0.36
95	0.29
96	0.31
97	0.33
98	0.32
99	0.32
100	0.36
101	0.33
102	0.3
103	0.36
104	0.34
105	0.33
106	0.35
107	0.36
108	0.36
109	0.44
110	0.47
111	0.44
112	0.46
113	0.43
114	0.41
115	0.43
116	0.39
117	0.34
118	0.34
119	0.32
120	0.33
121	0.33
122	0.34
123	0.34
124	0.4
125	0.39
126	0.4
127	0.43
128	0.41
129	0.42
130	0.4
131	0.37
132	0.32
133	0.32
134	0.3
135	0.24
136	0.24
137	0.32
138	0.36
139	0.43
140	0.48
141	0.54
142	0.59
143	0.67
144	0.68
145	0.67
146	0.67
147	0.63
148	0.65
149	0.65
150	0.59
151	0.56
152	0.53
153	0.45
154	0.44
155	0.39
156	0.31
157	0.27
158	0.27
159	0.21
160	0.18
161	0.16
162	0.13
163	0.15
164	0.17
165	0.12
166	0.13
167	0.19
168	0.22
169	0.26
170	0.28
171	0.29
172	0.33
173	0.41
174	0.44
175	0.43
176	0.43
177	0.45
178	0.47
179	0.46
180	0.4
181	0.35
182	0.35
183	0.31
184	0.32
185	0.33
186	0.29
187	0.28
188	0.28
189	0.29
190	0.25
191	0.25
192	0.24
193	0.21
194	0.19
195	0.18
196	0.17
197	0.13
198	0.15
199	0.15
200	0.15
201	0.14
202	0.15
203	0.18
204	0.2
205	0.24
206	0.3
207	0.35
208	0.37
209	0.44
210	0.44
211	0.43
212	0.48
213	0.51
214	0.51
215	0.5
216	0.54
217	0.46
218	0.48
219	0.49
220	0.47
221	0.5
222	0.5
223	0.48
224	0.43
225	0.43
226	0.45
227	0.49
228	0.45
229	0.41
230	0.35
231	0.33
232	0.33
233	0.33
234	0.3
235	0.24
236	0.25
237	0.19
238	0.17
239	0.15
240	0.13
241	0.12
242	0.13
243	0.16
244	0.19
245	0.19
246	0.18
247	0.18
248	0.19
249	0.18
250	0.17
251	0.14
252	0.1
253	0.1
254	0.11
255	0.1
256	0.1
257	0.1
258	0.08
259	0.08
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.06
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.08
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.14
274	0.13
275	0.13
276	0.2
277	0.26
278	0.25
279	0.29
280	0.31
281	0.32
282	0.39
283	0.46
284	0.49
285	0.51
286	0.56
287	0.59
288	0.6
289	0.56
290	0.54
291	0.48
292	0.41
293	0.32
294	0.27
295	0.2
296	0.17
297	0.16
298	0.13
299	0.11
300	0.09
301	0.11
302	0.1
303	0.13
304	0.16
305	0.17
306	0.25
307	0.3
308	0.37
309	0.4
310	0.45
311	0.48
312	0.55
313	0.6
314	0.55
315	0.58
316	0.51
317	0.46
318	0.49
319	0.48
320	0.4
321	0.41
322	0.4
323	0.34
324	0.34
325	0.34
326	0.3
327	0.26
328	0.26
329	0.2
330	0.17
331	0.15
332	0.16
333	0.18
334	0.15
335	0.16
336	0.17
337	0.17
338	0.18
339	0.2
340	0.2
341	0.2
342	0.22
343	0.21
344	0.21
345	0.25
346	0.24
347	0.3
348	0.35
349	0.35
350	0.38
351	0.38
352	0.38
353	0.35
354	0.36
355	0.28
356	0.22
357	0.18
358	0.13
359	0.12
360	0.09
361	0.07
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.03
367	0.04
368	0.04
369	0.03
370	0.04
371	0.04
372	0.03
373	0.03
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.06
379	0.07
380	0.08
381	0.09
382	0.12
383	0.15
384	0.17
385	0.19
386	0.18
387	0.21
388	0.23
389	0.29
390	0.33
391	0.31
392	0.34
393	0.35
394	0.37
395	0.37
396	0.36
397	0.28
398	0.22
399	0.2
400	0.16
401	0.14
402	0.1
403	0.07
404	0.06
405	0.06
406	0.05
407	0.06
408	0.06
409	0.04
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.08
414	0.07
415	0.08
416	0.1
417	0.13
418	0.13
419	0.15
420	0.17
421	0.16
422	0.17
423	0.19
424	0.24
425	0.29
426	0.36
427	0.42
428	0.5
429	0.55
430	0.61
431	0.62
432	0.65
433	0.68
434	0.69
435	0.65
436	0.63
437	0.58
438	0.54
439	0.55
440	0.47
441	0.43
442	0.38
443	0.37
444	0.32
445	0.32
446	0.29
447	0.26
448	0.23
449	0.17
450	0.15
451	0.13
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.13
456	0.13
457	0.13
458	0.14
459	0.15
460	0.14
461	0.17
462	0.16
463	0.15
464	0.16
465	0.22
466	0.29
467	0.35
468	0.41
469	0.44
470	0.47
471	0.54
472	0.61
473	0.59
474	0.58
475	0.59
476	0.59
477	0.58
478	0.56
479	0.54
480	0.5
481	0.5
482	0.49
483	0.48
484	0.42
485	0.39
486	0.4
487	0.39
488	0.36
489	0.34
490	0.31
491	0.32
492	0.35
493	0.34
494	0.37
495	0.37
496	0.43
497	0.49
498	0.54
499	0.5
500	0.47
501	0.49
502	0.54
503	0.59
504	0.62
505	0.61
506	0.64
507	0.66
508	0.71
509	0.75
510	0.75
511	0.76
512	0.77
513	0.79
514	0.75
515	0.78
516	0.78
517	0.8
518	0.73
519	0.65
520	0.57
521	0.5
522	0.43
523	0.35
524	0.35
525	0.28
526	0.27
527	0.28
528	0.28
529	0.32
530	0.42
531	0.52
532	0.53
533	0.59
534	0.69
535	0.76
536	0.84
537	0.88
538	0.89
539	0.89
540	0.87
541	0.86
542	0.8
543	0.7
544	0.62
545	0.51
546	0.42
547	0.32
548	0.27
549	0.22
550	0.2
551	0.2
552	0.22
553	0.25
554	0.27
555	0.3
556	0.31
557	0.33
558	0.32
559	0.34
560	0.37
561	0.42
562	0.41
563	0.41
564	0.42
565	0.4
566	0.47
567	0.52
568	0.54
569	0.51
570	0.54
571	0.54
572	0.57
573	0.56
574	0.5
575	0.49
576	0.44
577	0.44
578	0.41
579	0.43
580	0.4
581	0.39
582	0.37
583	0.31
584	0.32
585	0.27
586	0.26
587	0.21
588	0.19
589	0.2
590	0.26
591	0.27
592	0.3
593	0.33
594	0.34
595	0.33
596	0.32
597	0.32
598	0.28
599	0.28
600	0.22
601	0.2
602	0.16
603	0.16
604	0.15
605	0.13
606	0.11
607	0.08
608	0.06
609	0.04
610	0.05
611	0.06
612	0.07
613	0.07
614	0.13
615	0.14
616	0.18
617	0.22
618	0.27
619	0.31
620	0.4
621	0.47
622	0.5
623	0.56
624	0.62
625	0.62
626	0.59
627	0.55
628	0.48
629	0.42
630	0.37
631	0.29
632	0.2
633	0.18
634	0.18
635	0.22
636	0.22
637	0.23
638	0.21
639	0.28
640	0.32
641	0.32
642	0.33
643	0.33
644	0.36
645	0.34
646	0.34
647	0.32
648	0.3
649	0.28
650	0.25
651	0.21
652	0.18
653	0.17
654	0.15
655	0.13
656	0.12
657	0.11
658	0.1
659	0.08
660	0.09
661	0.09
662	0.13
663	0.15
664	0.16
665	0.18
666	0.18
667	0.19
668	0.19
669	0.19
670	0.15
671	0.13
672	0.12
673	0.11
674	0.11
675	0.11
676	0.1
677	0.09
678	0.08
679	0.07
680	0.06
681	0.07
682	0.07
683	0.08
684	0.1
685	0.12
686	0.15
687	0.15
688	0.15
689	0.17
690	0.17
691	0.18
692	0.21
693	0.25
694	0.23
695	0.29
696	0.31
697	0.3
698	0.29
699	0.28
700	0.24
701	0.18
702	0.17
703	0.12
704	0.16
705	0.23
706	0.27
707	0.36
708	0.42
709	0.43
710	0.47
711	0.49
712	0.49
713	0.48
714	0.5
715	0.52
716	0.52
717	0.58

W9CPI0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer