FuNGI

W9CB80

Protein Details

Accession

W9CB80

Localization Confidence

High

Confidence Score

26.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
95-135	AKTLKASKRKRAEGEGKKPKEGKRDKKKRPRRDSDEDPDGM	Basic
137-171	IDGKRVRKPKRVEGERKERDRTKERRKPTPEPEND	Basic
188-210	MDAALKNPNKRRRKKDEVDLEEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
99-126	KASKRKRAEGEGKKPKEGKRDKKKRPRR
139-165	GKRVRKPKRVEGERKERDRTKERRKPT
179-202	RRRRALDKAMDAALKNPNKRRRKK
473-475	KKR

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035441 TFIIS/LEDGF_dom_sf IPR017923 TFIIS_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08711 Med26
PROSITE	View protein in PROSITE PS51319 TFIIS_N

Amino Acid Sequences

MSDSDLDSRPTTPLPEAGNEAGDTNRPTSQERDAPEPPMANSDLDMDDVDNAVAGADSDNESDLSDVDEANFDDFDASKVALDERPMVGIDEEVAKTLKASKRKRAEGEGKKPKEGKRDKKKRPRRDSDEDPDGMEIDGKRVRKPKRVEGERKERDRTKERRKPTPEPENDENLTPDERRRRALDKAMDAALKNPNKRRRKKDEVDLEEAFDDEIAALKLRMEEACQADNAARDANSPATRKLEMLPEVVALLNRNTIQHSIVDPDTNFLQSVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDLFQALARLPIEKEALLSSGIGKVVLYYTKSKRPEIGIKRIAERLLGEWSRPILKRSDDYKKRKVATKEFDHQYVSPNTTHDVPTNVLLRAAQLAIRPTGSQSSQIPSSQRIPLTARDLERQRLLAPKIVSNRARMETSNTSYSVAPRSNFDPSRGLDPSTRPIGAGGVEAFRKMTAKQGKKRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.26
3	0.29
4	0.28
5	0.28
6	0.25
7	0.24
8	0.21
9	0.21
10	0.2
11	0.18
12	0.19
13	0.2
14	0.23
15	0.26
16	0.32
17	0.35
18	0.37
19	0.42
20	0.42
21	0.44
22	0.45
23	0.42
24	0.36
25	0.34
26	0.32
27	0.24
28	0.22
29	0.21
30	0.18
31	0.16
32	0.16
33	0.12
34	0.11
35	0.11
36	0.1
37	0.07
38	0.06
39	0.05
40	0.05
41	0.04
42	0.04
43	0.05
44	0.06
45	0.07
46	0.07
47	0.08
48	0.08
49	0.08
50	0.08
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.09
56	0.09
57	0.1
58	0.1
59	0.08
60	0.08
61	0.08
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.08
66	0.09
67	0.11
68	0.11
69	0.12
70	0.14
71	0.13
72	0.14
73	0.14
74	0.14
75	0.12
76	0.11
77	0.1
78	0.11
79	0.1
80	0.11
81	0.11
82	0.1
83	0.1
84	0.17
85	0.21
86	0.28
87	0.36
88	0.45
89	0.55
90	0.63
91	0.68
92	0.71
93	0.77
94	0.78
95	0.82
96	0.83
97	0.77
98	0.76
99	0.77
100	0.72
101	0.72
102	0.72
103	0.72
104	0.72
105	0.79
106	0.84
107	0.89
108	0.95
109	0.95
110	0.95
111	0.95
112	0.93
113	0.92
114	0.91
115	0.88
116	0.85
117	0.74
118	0.64
119	0.53
120	0.44
121	0.34
122	0.26
123	0.17
124	0.13
125	0.16
126	0.16
127	0.21
128	0.28
129	0.35
130	0.41
131	0.48
132	0.54
133	0.62
134	0.72
135	0.78
136	0.8
137	0.85
138	0.86
139	0.86
140	0.84
141	0.79
142	0.76
143	0.76
144	0.76
145	0.76
146	0.76
147	0.76
148	0.79
149	0.81
150	0.82
151	0.82
152	0.83
153	0.79
154	0.78
155	0.75
156	0.71
157	0.63
158	0.54
159	0.45
160	0.36
161	0.3
162	0.23
163	0.23
164	0.26
165	0.27
166	0.29
167	0.32
168	0.34
169	0.38
170	0.45
171	0.46
172	0.41
173	0.42
174	0.4
175	0.38
176	0.34
177	0.31
178	0.3
179	0.28
180	0.3
181	0.36
182	0.43
183	0.52
184	0.62
185	0.69
186	0.72
187	0.78
188	0.81
189	0.83
190	0.84
191	0.8
192	0.77
193	0.68
194	0.58
195	0.48
196	0.4
197	0.29
198	0.18
199	0.11
200	0.04
201	0.04
202	0.03
203	0.04
204	0.03
205	0.04
206	0.04
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.09
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.11
215	0.11
216	0.12
217	0.11
218	0.09
219	0.07
220	0.07
221	0.08
222	0.11
223	0.13
224	0.14
225	0.15
226	0.17
227	0.17
228	0.17
229	0.18
230	0.19
231	0.17
232	0.17
233	0.15
234	0.13
235	0.13
236	0.12
237	0.11
238	0.07
239	0.06
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.08
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.1
248	0.11
249	0.12
250	0.13
251	0.12
252	0.12
253	0.12
254	0.11
255	0.11
256	0.08
257	0.08
258	0.07
259	0.08
260	0.09
261	0.08
262	0.08
263	0.09
264	0.1
265	0.11
266	0.13
267	0.15
268	0.13
269	0.13
270	0.13
271	0.13
272	0.12
273	0.12
274	0.12
275	0.09
276	0.1
277	0.1
278	0.11
279	0.11
280	0.11
281	0.1
282	0.09
283	0.1
284	0.1
285	0.12
286	0.12
287	0.12
288	0.11
289	0.12
290	0.13
291	0.11
292	0.11
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.08
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.07
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.08
305	0.09
306	0.14
307	0.19
308	0.26
309	0.3
310	0.32
311	0.34
312	0.39
313	0.47
314	0.49
315	0.55
316	0.55
317	0.54
318	0.56
319	0.55
320	0.5
321	0.4
322	0.33
323	0.24
324	0.24
325	0.22
326	0.19
327	0.18
328	0.19
329	0.24
330	0.24
331	0.24
332	0.21
333	0.24
334	0.3
335	0.36
336	0.46
337	0.5
338	0.59
339	0.66
340	0.7
341	0.72
342	0.74
343	0.75
344	0.74
345	0.74
346	0.73
347	0.74
348	0.69
349	0.67
350	0.62
351	0.54
352	0.49
353	0.44
354	0.37
355	0.29
356	0.26
357	0.25
358	0.24
359	0.25
360	0.21
361	0.19
362	0.18
363	0.21
364	0.22
365	0.2
366	0.19
367	0.17
368	0.16
369	0.15
370	0.14
371	0.12
372	0.11
373	0.13
374	0.13
375	0.14
376	0.14
377	0.14
378	0.17
379	0.17
380	0.19
381	0.19
382	0.22
383	0.24
384	0.27
385	0.27
386	0.28
387	0.31
388	0.33
389	0.31
390	0.31
391	0.31
392	0.33
393	0.37
394	0.39
395	0.37
396	0.4
397	0.44
398	0.46
399	0.46
400	0.42
401	0.39
402	0.41
403	0.4
404	0.38
405	0.36
406	0.37
407	0.41
408	0.48
409	0.49
410	0.46
411	0.5
412	0.47
413	0.48
414	0.43
415	0.43
416	0.42
417	0.45
418	0.43
419	0.38
420	0.36
421	0.35
422	0.36
423	0.35
424	0.32
425	0.27
426	0.27
427	0.3
428	0.37
429	0.38
430	0.39
431	0.38
432	0.36
433	0.42
434	0.41
435	0.4
436	0.36
437	0.38
438	0.42
439	0.41
440	0.39
441	0.31
442	0.3
443	0.28
444	0.24
445	0.22
446	0.17
447	0.16
448	0.16
449	0.16
450	0.16
451	0.16
452	0.17
453	0.15
454	0.23
455	0.3
456	0.4

W9CB80

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer