Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9CIX9

Protein Details
Accession W9CIX9    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-93FPNWRTKNYIPKNPNKWYEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
311-328RPPPPSRKIIKPVAPSSR
380-386PARRRPA
391-400FNRGPKKPRR
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MGELGAPSLFSTAKAQCIKAAPSLTDIGDFEYMQIRDILKAVKKPEQLHIIEMNSPQIKGEDAELWQAFIAREFPNWRTKNYIPKNPNKWYEVYLKYKSEREVEILRDRENLKNSMNALAQHKQNHLSKFVELRALPKIPREYGMRPNNGGVPLTKGRGLQKSAPNSLTWSGGSRTKMTDGASVLTRARREAKEITQRSKLVTPTSMLSGRLGQVGRAPAGMAQEYKIANQPALKVLARHKTTSRLSGGTSGLSLEDREKKLRAAMVSKKPDPSAPKETYVGSSDDETYGNDADDLFDEPEEARSVPRATRPPPPSRKIIKPVAPSSRLRSSSPPNKPISKPSGVISGIVNNSKSSFSPASSRTSSAPPSRAATPKPMMPARRRPAEVDVFNRGPKKPRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.3
4 0.34
5 0.36
6 0.36
7 0.37
8 0.3
9 0.3
10 0.32
11 0.28
12 0.25
13 0.23
14 0.2
15 0.18
16 0.17
17 0.15
18 0.18
19 0.18
20 0.17
21 0.19
22 0.17
23 0.16
24 0.19
25 0.24
26 0.23
27 0.28
28 0.33
29 0.39
30 0.44
31 0.47
32 0.52
33 0.55
34 0.51
35 0.51
36 0.5
37 0.45
38 0.42
39 0.39
40 0.38
41 0.31
42 0.29
43 0.24
44 0.2
45 0.18
46 0.16
47 0.17
48 0.13
49 0.13
50 0.19
51 0.18
52 0.18
53 0.17
54 0.18
55 0.15
56 0.14
57 0.16
58 0.11
59 0.15
60 0.18
61 0.22
62 0.31
63 0.33
64 0.34
65 0.39
66 0.43
67 0.51
68 0.56
69 0.63
70 0.62
71 0.7
72 0.78
73 0.79
74 0.8
75 0.73
76 0.66
77 0.6
78 0.59
79 0.57
80 0.55
81 0.51
82 0.5
83 0.5
84 0.51
85 0.5
86 0.45
87 0.39
88 0.36
89 0.35
90 0.36
91 0.4
92 0.39
93 0.37
94 0.38
95 0.39
96 0.39
97 0.38
98 0.36
99 0.29
100 0.3
101 0.3
102 0.29
103 0.28
104 0.26
105 0.27
106 0.29
107 0.32
108 0.32
109 0.33
110 0.35
111 0.39
112 0.38
113 0.37
114 0.34
115 0.33
116 0.33
117 0.32
118 0.31
119 0.26
120 0.26
121 0.27
122 0.28
123 0.26
124 0.27
125 0.29
126 0.25
127 0.28
128 0.3
129 0.3
130 0.38
131 0.45
132 0.43
133 0.41
134 0.41
135 0.4
136 0.36
137 0.32
138 0.22
139 0.2
140 0.18
141 0.18
142 0.19
143 0.18
144 0.22
145 0.25
146 0.28
147 0.29
148 0.33
149 0.38
150 0.4
151 0.39
152 0.35
153 0.33
154 0.31
155 0.26
156 0.19
157 0.16
158 0.14
159 0.17
160 0.18
161 0.17
162 0.16
163 0.17
164 0.18
165 0.17
166 0.18
167 0.14
168 0.15
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.18
176 0.17
177 0.2
178 0.23
179 0.29
180 0.38
181 0.42
182 0.45
183 0.45
184 0.45
185 0.43
186 0.42
187 0.37
188 0.28
189 0.24
190 0.2
191 0.16
192 0.18
193 0.17
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.12
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.07
210 0.07
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.14
219 0.13
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.2
224 0.27
225 0.28
226 0.3
227 0.3
228 0.34
229 0.36
230 0.39
231 0.36
232 0.29
233 0.28
234 0.29
235 0.28
236 0.2
237 0.18
238 0.13
239 0.11
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.16
244 0.18
245 0.2
246 0.21
247 0.21
248 0.24
249 0.26
250 0.26
251 0.27
252 0.34
253 0.41
254 0.48
255 0.5
256 0.5
257 0.48
258 0.49
259 0.47
260 0.45
261 0.44
262 0.4
263 0.4
264 0.4
265 0.4
266 0.37
267 0.34
268 0.28
269 0.2
270 0.18
271 0.16
272 0.15
273 0.15
274 0.13
275 0.12
276 0.11
277 0.1
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.11
292 0.13
293 0.15
294 0.22
295 0.27
296 0.3
297 0.39
298 0.46
299 0.54
300 0.62
301 0.64
302 0.67
303 0.68
304 0.74
305 0.73
306 0.74
307 0.71
308 0.7
309 0.73
310 0.73
311 0.71
312 0.65
313 0.64
314 0.63
315 0.59
316 0.53
317 0.51
318 0.53
319 0.58
320 0.64
321 0.65
322 0.63
323 0.67
324 0.68
325 0.7
326 0.68
327 0.62
328 0.55
329 0.48
330 0.49
331 0.42
332 0.4
333 0.33
334 0.3
335 0.28
336 0.29
337 0.27
338 0.21
339 0.21
340 0.22
341 0.21
342 0.22
343 0.21
344 0.2
345 0.26
346 0.28
347 0.34
348 0.35
349 0.37
350 0.34
351 0.37
352 0.42
353 0.42
354 0.43
355 0.4
356 0.41
357 0.45
358 0.48
359 0.46
360 0.48
361 0.46
362 0.46
363 0.51
364 0.54
365 0.57
366 0.6
367 0.67
368 0.68
369 0.72
370 0.71
371 0.67
372 0.68
373 0.69
374 0.67
375 0.62
376 0.62
377 0.57
378 0.6
379 0.6
380 0.56