Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9C544

Protein Details
Accession W9C544    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-32GDECRRRRACHDRTQTVMKKBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50066  MADS_BOX_2  
Amino Acid Sequences MTKYTRKLTPIVGDECRRRRACHDRTQTVMKKGDELAVLCPGTRVWVIVQSDGQTSIYSSEESSSLPILSTVDNVVTTGPGDYRTHNEVIATGLTPVIQYIPPPSTTQQATSSLPAATSSLTAATSPLPATTSPRLATTSPRLATTSPRPVSSPPPSITSQYAGVTKRTNPALDRGRSFRRIFDLQYSDEEGLERGTKLRKFGNESIHSSSRRNSRIKAELNSRSYMRDIPKFRSSHEITSSGSRAYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.65
3 0.68
4 0.63
5 0.6
6 0.63
7 0.66
8 0.68
9 0.69
10 0.73
11 0.7
12 0.73
13 0.8
14 0.78
15 0.75
16 0.72
17 0.62
18 0.54
19 0.49
20 0.45
21 0.37
22 0.31
23 0.25
24 0.23
25 0.22
26 0.19
27 0.18
28 0.15
29 0.15
30 0.14
31 0.12
32 0.08
33 0.14
34 0.16
35 0.17
36 0.18
37 0.17
38 0.18
39 0.18
40 0.18
41 0.12
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.08
58 0.07
59 0.07
60 0.06
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.07
68 0.08
69 0.1
70 0.14
71 0.17
72 0.18
73 0.17
74 0.17
75 0.15
76 0.15
77 0.14
78 0.1
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.07
88 0.08
89 0.09
90 0.11
91 0.12
92 0.15
93 0.16
94 0.18
95 0.18
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.19
100 0.15
101 0.14
102 0.12
103 0.1
104 0.07
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.1
118 0.11
119 0.13
120 0.13
121 0.14
122 0.16
123 0.16
124 0.19
125 0.21
126 0.25
127 0.24
128 0.24
129 0.24
130 0.23
131 0.27
132 0.3
133 0.34
134 0.29
135 0.3
136 0.3
137 0.31
138 0.38
139 0.39
140 0.38
141 0.3
142 0.33
143 0.33
144 0.35
145 0.34
146 0.29
147 0.25
148 0.2
149 0.23
150 0.2
151 0.21
152 0.21
153 0.21
154 0.23
155 0.24
156 0.24
157 0.21
158 0.29
159 0.35
160 0.37
161 0.39
162 0.41
163 0.45
164 0.5
165 0.5
166 0.44
167 0.42
168 0.41
169 0.39
170 0.41
171 0.39
172 0.34
173 0.35
174 0.36
175 0.29
176 0.26
177 0.24
178 0.17
179 0.14
180 0.14
181 0.11
182 0.11
183 0.17
184 0.18
185 0.22
186 0.27
187 0.31
188 0.38
189 0.43
190 0.5
191 0.5
192 0.54
193 0.58
194 0.59
195 0.56
196 0.51
197 0.51
198 0.5
199 0.52
200 0.52
201 0.49
202 0.51
203 0.58
204 0.63
205 0.65
206 0.65
207 0.67
208 0.66
209 0.65
210 0.58
211 0.51
212 0.47
213 0.45
214 0.42
215 0.42
216 0.43
217 0.46
218 0.53
219 0.52
220 0.52
221 0.56
222 0.54
223 0.52
224 0.52
225 0.48
226 0.43
227 0.48
228 0.47