Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9C8M6

Protein Details
Accession W9C8M6    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-67NRPPIVKTTSFKKKKRPASSRLSFGVHydrophilic
262-287RISLGKKQEREERRRRKKQMADLIQQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-58KKKKRP
204-208KERRA
267-279KKQEREERRRRKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MSAVRKPLKKSNLRRSIAFEDLTQDADDVPQSDTLGDDSPSNRPPIVKTTSFKKKKRPASSRLSFGVGDIISGSDAENLEDDESFIPVKKPLSRKVIEGNVKKTNARLPLPMRARDEDEDGDGDSGMGRPSYSKDYLKELKSSQASAMRDLVEVEIGGGEEPFLDASELEGAMVVDSEGNGDTIGSFGESAAIIPTEAEIREKKERRARMAREKDFISLNDDEPNGGRNMSLLPRQKKPESRLVLDDEEIMEGFEEFVDDGRISLGKKQEREERRRRKKQMADLIQQAEGSSDEESDDSEAERRAAYEVAQTRAGMDGLHKHDDAAAAAAREESQVPARITPIPVLSECLERLQNTLSTMELELSKRKRKMEEGEREKSDIGKREEEVQVLLTQAGMRYSVLKADAATRDVKELELEASDIKGLVNKSSEMGRERERFGDGDRGLESFGNTPVGRGEVVDGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.76
3 0.72
4 0.67
5 0.58
6 0.47
7 0.4
8 0.37
9 0.35
10 0.27
11 0.2
12 0.14
13 0.14
14 0.14
15 0.11
16 0.11
17 0.1
18 0.11
19 0.1
20 0.11
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.13
25 0.14
26 0.19
27 0.22
28 0.24
29 0.24
30 0.24
31 0.26
32 0.31
33 0.37
34 0.38
35 0.4
36 0.47
37 0.58
38 0.66
39 0.7
40 0.74
41 0.77
42 0.8
43 0.87
44 0.87
45 0.86
46 0.86
47 0.87
48 0.83
49 0.76
50 0.69
51 0.57
52 0.48
53 0.43
54 0.31
55 0.23
56 0.16
57 0.13
58 0.09
59 0.1
60 0.09
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.1
73 0.1
74 0.12
75 0.16
76 0.22
77 0.28
78 0.35
79 0.44
80 0.44
81 0.47
82 0.53
83 0.59
84 0.62
85 0.62
86 0.61
87 0.6
88 0.6
89 0.57
90 0.52
91 0.48
92 0.45
93 0.4
94 0.41
95 0.37
96 0.45
97 0.5
98 0.53
99 0.52
100 0.48
101 0.5
102 0.44
103 0.44
104 0.36
105 0.31
106 0.26
107 0.22
108 0.19
109 0.15
110 0.12
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.06
117 0.09
118 0.14
119 0.18
120 0.21
121 0.22
122 0.3
123 0.37
124 0.39
125 0.4
126 0.36
127 0.39
128 0.38
129 0.37
130 0.33
131 0.32
132 0.31
133 0.28
134 0.29
135 0.23
136 0.21
137 0.2
138 0.17
139 0.11
140 0.09
141 0.07
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.07
186 0.08
187 0.12
188 0.22
189 0.25
190 0.32
191 0.39
192 0.45
193 0.51
194 0.6
195 0.64
196 0.66
197 0.74
198 0.71
199 0.67
200 0.63
201 0.55
202 0.47
203 0.39
204 0.32
205 0.23
206 0.19
207 0.18
208 0.17
209 0.15
210 0.13
211 0.14
212 0.1
213 0.08
214 0.07
215 0.05
216 0.07
217 0.09
218 0.14
219 0.2
220 0.24
221 0.29
222 0.34
223 0.39
224 0.43
225 0.46
226 0.5
227 0.48
228 0.47
229 0.46
230 0.45
231 0.41
232 0.35
233 0.31
234 0.21
235 0.16
236 0.13
237 0.1
238 0.06
239 0.04
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.06
251 0.09
252 0.15
253 0.19
254 0.21
255 0.25
256 0.34
257 0.43
258 0.53
259 0.61
260 0.67
261 0.74
262 0.83
263 0.87
264 0.88
265 0.87
266 0.86
267 0.86
268 0.84
269 0.78
270 0.74
271 0.67
272 0.58
273 0.49
274 0.39
275 0.28
276 0.19
277 0.14
278 0.08
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.14
295 0.17
296 0.18
297 0.19
298 0.19
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.11
303 0.09
304 0.14
305 0.17
306 0.2
307 0.19
308 0.19
309 0.19
310 0.2
311 0.19
312 0.14
313 0.11
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.08
321 0.1
322 0.15
323 0.15
324 0.16
325 0.18
326 0.19
327 0.2
328 0.2
329 0.19
330 0.16
331 0.15
332 0.18
333 0.17
334 0.17
335 0.17
336 0.18
337 0.18
338 0.16
339 0.18
340 0.17
341 0.17
342 0.16
343 0.16
344 0.14
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.13
349 0.14
350 0.2
351 0.27
352 0.35
353 0.39
354 0.43
355 0.47
356 0.52
357 0.61
358 0.64
359 0.68
360 0.69
361 0.73
362 0.71
363 0.69
364 0.62
365 0.56
366 0.51
367 0.48
368 0.44
369 0.39
370 0.37
371 0.41
372 0.43
373 0.39
374 0.34
375 0.27
376 0.23
377 0.19
378 0.18
379 0.12
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.09
386 0.1
387 0.11
388 0.12
389 0.12
390 0.12
391 0.17
392 0.19
393 0.2
394 0.23
395 0.22
396 0.23
397 0.23
398 0.23
399 0.18
400 0.17
401 0.16
402 0.13
403 0.13
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.1
408 0.09
409 0.11
410 0.11
411 0.13
412 0.15
413 0.15
414 0.16
415 0.2
416 0.24
417 0.24
418 0.29
419 0.35
420 0.38
421 0.41
422 0.41
423 0.41
424 0.38
425 0.38
426 0.42
427 0.34
428 0.32
429 0.29
430 0.27
431 0.26
432 0.25
433 0.23
434 0.15
435 0.16
436 0.19
437 0.18
438 0.17
439 0.18
440 0.18
441 0.17
442 0.15