Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9CTD8

Protein Details
Accession W9CTD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
172-199IEDEKEREERRKKRRELAERKKEEKEKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-199EKEREERRKKRRELAERKKEEKEKE
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MASKKGAYETNASDTDFRKKYDREGNVAKAREQEAKEKEEGRLRYEAKLAGKKYYAPLTGDETLTSARASRLDVSANIGKTILMPAGAAMGKRGKGAGFYCKDCDLTFKDSLQWVEHENSMQHLRAIGQTGEVQRASAEDVRRRIDEIWERLEREKNQEVVSLGERLEGRRIEDEKEREERRKKRRELAERKKEEKEKEVAVKKEYGEDVRVDGEHDEDDMMASMGIVGFGSSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.39
3 0.36
4 0.34
5 0.36
6 0.36
7 0.44
8 0.5
9 0.54
10 0.53
11 0.58
12 0.65
13 0.66
14 0.66
15 0.59
16 0.54
17 0.51
18 0.5
19 0.44
20 0.44
21 0.41
22 0.44
23 0.46
24 0.44
25 0.45
26 0.46
27 0.45
28 0.4
29 0.43
30 0.4
31 0.38
32 0.38
33 0.38
34 0.38
35 0.43
36 0.4
37 0.36
38 0.36
39 0.35
40 0.37
41 0.37
42 0.32
43 0.27
44 0.27
45 0.29
46 0.3
47 0.28
48 0.24
49 0.2
50 0.18
51 0.17
52 0.14
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.17
62 0.2
63 0.19
64 0.18
65 0.16
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.09
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.08
82 0.1
83 0.12
84 0.19
85 0.2
86 0.22
87 0.24
88 0.24
89 0.25
90 0.23
91 0.24
92 0.19
93 0.21
94 0.21
95 0.19
96 0.2
97 0.2
98 0.21
99 0.19
100 0.16
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.11
106 0.12
107 0.13
108 0.12
109 0.1
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.08
115 0.08
116 0.1
117 0.11
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.15
126 0.17
127 0.21
128 0.23
129 0.24
130 0.25
131 0.24
132 0.27
133 0.3
134 0.3
135 0.33
136 0.33
137 0.35
138 0.36
139 0.42
140 0.37
141 0.37
142 0.38
143 0.34
144 0.32
145 0.32
146 0.3
147 0.26
148 0.26
149 0.2
150 0.16
151 0.16
152 0.15
153 0.14
154 0.18
155 0.16
156 0.16
157 0.2
158 0.22
159 0.23
160 0.3
161 0.33
162 0.34
163 0.42
164 0.46
165 0.5
166 0.59
167 0.65
168 0.69
169 0.75
170 0.78
171 0.79
172 0.84
173 0.86
174 0.88
175 0.89
176 0.89
177 0.89
178 0.87
179 0.87
180 0.84
181 0.78
182 0.73
183 0.67
184 0.64
185 0.64
186 0.66
187 0.61
188 0.57
189 0.55
190 0.49
191 0.48
192 0.44
193 0.36
194 0.3
195 0.27
196 0.26
197 0.24
198 0.23
199 0.19
200 0.17
201 0.15
202 0.13
203 0.12
204 0.11
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.04