FuNGI

W9CSN4

Protein Details

Accession

W9CSN4

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
106-132	DAKAWLMKQKKRQKEIEKARKKEQERA	Basic
281-306	NISDIKVRKSKKKKAKSTRQRTTDED	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
68-90	KKKREAKAEAIKKARDTAKRFAK
113-128	KQKKRQKEIEKARKKE
286-298	KVRKSKKKKAKST
364-372	LKKRQKIRP

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MADAISIEETNRIRVSLGMKPLAVPGAAGPVFKEVPSAPAEDLGSTLESRQAEGYDNYRKLQEGEETKKKREAKAEAIKKARDTAKRFAKLEGKGLGEADDDGDLDAKAWLMKQKKRQKEIEKARKKEQERAEAEAAAAAEYTAKDLAGVRVGHELDTFVEGEDQVLTLKDTTIDENEEEGDELENLDLREREKLSDKLELKKKKPTYNPNDDDDESGDRKILAHYDEDIDGKKGNRFTLDGMGSTTETASADTAPHMKAKAKIFSLDILKDDEPKSDYLNISDIKVRKSKKKKAKSTRQRTTDEDDVFLEPEPAVSNGDVADAMDVDGVSRPVTVKKRTFEDTSFVDDDDLQALLATQRRNALKKRQKIRPGEFAQRLRKEASAIPAADDEEGNDSGLVIDETSEFVANLQKPVAPEPKQRSVSRPADAVTSMDADSDDDGDGDVQMSESYANIEDDEDRLSRIKREEANEDIENNGLEKEATLDNVGLGSMLNILRGRGILKTSESGDVATIFREKQMFLAEKQRREAEAERRAKSQRERDRTTGRLDRMSAREKEEHARQQNTMRDQQESRQLADHFNREYKPNVELKYIDEHGRNMNRKEAFKHLSHQFHGKGSGKQKTEKLLKKIEDEKRREAQSSLDGSQIGGMTGAAAQQLKKNRQAGVRLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.24
3	0.25
4	0.31
5	0.31
6	0.3
7	0.31
8	0.32
9	0.3
10	0.25
11	0.18
12	0.12
13	0.16
14	0.17
15	0.16
16	0.15
17	0.18
18	0.19
19	0.18
20	0.2
21	0.13
22	0.16
23	0.18
24	0.2
25	0.16
26	0.18
27	0.19
28	0.17
29	0.17
30	0.15
31	0.15
32	0.12
33	0.12
34	0.14
35	0.14
36	0.15
37	0.15
38	0.15
39	0.17
40	0.19
41	0.26
42	0.3
43	0.33
44	0.33
45	0.34
46	0.34
47	0.32
48	0.32
49	0.34
50	0.34
51	0.42
52	0.51
53	0.55
54	0.59
55	0.65
56	0.68
57	0.65
58	0.65
59	0.63
60	0.63
61	0.68
62	0.74
63	0.75
64	0.77
65	0.75
66	0.67
67	0.67
68	0.64
69	0.62
70	0.58
71	0.59
72	0.62
73	0.67
74	0.66
75	0.66
76	0.66
77	0.6
78	0.6
79	0.54
80	0.46
81	0.39
82	0.38
83	0.31
84	0.24
85	0.21
86	0.15
87	0.1
88	0.08
89	0.07
90	0.08
91	0.07
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.06
96	0.08
97	0.14
98	0.22
99	0.29
100	0.39
101	0.49
102	0.59
103	0.67
104	0.76
105	0.8
106	0.83
107	0.88
108	0.89
109	0.89
110	0.86
111	0.87
112	0.86
113	0.8
114	0.78
115	0.76
116	0.75
117	0.68
118	0.68
119	0.61
120	0.52
121	0.47
122	0.4
123	0.31
124	0.2
125	0.16
126	0.08
127	0.06
128	0.06
129	0.07
130	0.06
131	0.05
132	0.06
133	0.07
134	0.08
135	0.12
136	0.12
137	0.12
138	0.16
139	0.17
140	0.16
141	0.16
142	0.15
143	0.11
144	0.13
145	0.12
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.07
151	0.07
152	0.05
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.08
159	0.09
160	0.1
161	0.12
162	0.12
163	0.12
164	0.13
165	0.12
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.07
170	0.07
171	0.06
172	0.07
173	0.07
174	0.08
175	0.09
176	0.09
177	0.13
178	0.14
179	0.16
180	0.2
181	0.24
182	0.26
183	0.34
184	0.37
185	0.42
186	0.5
187	0.57
188	0.55
189	0.62
190	0.66
191	0.66
192	0.72
193	0.74
194	0.75
195	0.77
196	0.78
197	0.72
198	0.7
199	0.62
200	0.54
201	0.45
202	0.39
203	0.29
204	0.25
205	0.2
206	0.15
207	0.14
208	0.13
209	0.13
210	0.1
211	0.1
212	0.11
213	0.13
214	0.13
215	0.14
216	0.14
217	0.13
218	0.14
219	0.14
220	0.16
221	0.16
222	0.16
223	0.17
224	0.17
225	0.18
226	0.22
227	0.21
228	0.19
229	0.17
230	0.17
231	0.16
232	0.15
233	0.13
234	0.07
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.08
242	0.09
243	0.1
244	0.11
245	0.13
246	0.18
247	0.22
248	0.26
249	0.25
250	0.25
251	0.25
252	0.28
253	0.28
254	0.24
255	0.21
256	0.2
257	0.19
258	0.21
259	0.2
260	0.18
261	0.17
262	0.16
263	0.17
264	0.16
265	0.16
266	0.14
267	0.17
268	0.16
269	0.16
270	0.19
271	0.19
272	0.2
273	0.26
274	0.29
275	0.35
276	0.45
277	0.54
278	0.61
279	0.7
280	0.77
281	0.83
282	0.9
283	0.92
284	0.93
285	0.92
286	0.89
287	0.83
288	0.77
289	0.72
290	0.68
291	0.57
292	0.47
293	0.38
294	0.31
295	0.27
296	0.22
297	0.16
298	0.08
299	0.08
300	0.07
301	0.06
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.04
309	0.04
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.04
319	0.04
320	0.09
321	0.14
322	0.2
323	0.24
324	0.27
325	0.31
326	0.34
327	0.37
328	0.34
329	0.33
330	0.29
331	0.3
332	0.28
333	0.24
334	0.2
335	0.17
336	0.16
337	0.13
338	0.1
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.13
347	0.16
348	0.2
349	0.25
350	0.35
351	0.42
352	0.5
353	0.59
354	0.64
355	0.7
356	0.75
357	0.76
358	0.75
359	0.72
360	0.72
361	0.7
362	0.69
363	0.69
364	0.62
365	0.58
366	0.5
367	0.44
368	0.37
369	0.32
370	0.28
371	0.23
372	0.21
373	0.19
374	0.18
375	0.18
376	0.16
377	0.14
378	0.1
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.07
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.05
395	0.09
396	0.1
397	0.1
398	0.1
399	0.11
400	0.12
401	0.16
402	0.23
403	0.23
404	0.3
405	0.37
406	0.45
407	0.5
408	0.51
409	0.51
410	0.53
411	0.55
412	0.49
413	0.44
414	0.35
415	0.31
416	0.3
417	0.26
418	0.17
419	0.13
420	0.11
421	0.09
422	0.09
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.05
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.06
443	0.07
444	0.07
445	0.09
446	0.09
447	0.09
448	0.12
449	0.13
450	0.15
451	0.18
452	0.23
453	0.26
454	0.3
455	0.34
456	0.35
457	0.4
458	0.38
459	0.36
460	0.3
461	0.26
462	0.22
463	0.17
464	0.13
465	0.07
466	0.06
467	0.05
468	0.07
469	0.07
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.05
477	0.04
478	0.04
479	0.06
480	0.05
481	0.07
482	0.07
483	0.07
484	0.08
485	0.09
486	0.09
487	0.09
488	0.1
489	0.1
490	0.12
491	0.14
492	0.16
493	0.17
494	0.17
495	0.16
496	0.15
497	0.15
498	0.13
499	0.12
500	0.12
501	0.1
502	0.12
503	0.12
504	0.12
505	0.12
506	0.18
507	0.2
508	0.21
509	0.32
510	0.37
511	0.4
512	0.44
513	0.46
514	0.4
515	0.43
516	0.47
517	0.46
518	0.5
519	0.54
520	0.53
521	0.56
522	0.59
523	0.6
524	0.63
525	0.63
526	0.64
527	0.65
528	0.69
529	0.72
530	0.76
531	0.73
532	0.73
533	0.71
534	0.64
535	0.59
536	0.54
537	0.53
538	0.51
539	0.55
540	0.49
541	0.47
542	0.47
543	0.45
544	0.5
545	0.52
546	0.55
547	0.56
548	0.56
549	0.54
550	0.57
551	0.61
552	0.61
553	0.6
554	0.52
555	0.49
556	0.48
557	0.49
558	0.52
559	0.47
560	0.42
561	0.4
562	0.39
563	0.41
564	0.44
565	0.45
566	0.39
567	0.42
568	0.42
569	0.4
570	0.43
571	0.38
572	0.39
573	0.4
574	0.38
575	0.36
576	0.35
577	0.36
578	0.38
579	0.39
580	0.37
581	0.32
582	0.32
583	0.37
584	0.45
585	0.49
586	0.45
587	0.5
588	0.51
589	0.53
590	0.55
591	0.55
592	0.52
593	0.48
594	0.54
595	0.55
596	0.56
597	0.56
598	0.6
599	0.53
600	0.5
601	0.55
602	0.51
603	0.5
604	0.52
605	0.57
606	0.54
607	0.58
608	0.59
609	0.61
610	0.67
611	0.68
612	0.68
613	0.69
614	0.69
615	0.7
616	0.76
617	0.76
618	0.76
619	0.75
620	0.75
621	0.73
622	0.73
623	0.67
624	0.58
625	0.53
626	0.51
627	0.5
628	0.43
629	0.37
630	0.32
631	0.3
632	0.3
633	0.25
634	0.17
635	0.1
636	0.09
637	0.07
638	0.07
639	0.07
640	0.08
641	0.09
642	0.1
643	0.16
644	0.26
645	0.32
646	0.4
647	0.44
648	0.48
649	0.53

W9CSN4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer