Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

J3KFW6

Protein Details
Accession J3KFW6    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-64EDNLKREIKKLQRFRDQIKTWHydrophilic
416-435TTTQKQQQPQQQPQPQPRPSHydrophilic
562-581ALKNQSWRFHKQYQTWFQRHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR012270  CCR4-NOT_su3/5  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
IPR007207  Not_N  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG cim:CIMG_05581  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
PF04065  Not3  
Amino Acid Sequences MTSRKTQQEIDRTFKKVAEGIQSFEGIYEKIKTTTNLAQRDKLEDNLKREIKKLQRFRDQIKTWASGNEVKDKGPLLEQRRAIETCMEQFKAVEKEMKTKAYSKEGLSAAARLDPKEKERVETCEFLSSMVDILQQKIEAMEAEEEMLQATMKKGKKDASKATRLADISRISERHKWHVAKLELLLRSLQNGNVETGQVIDIKEAIKYYAEDGHNADFCGEDETIYDDIELGDDEAQFGMGLDNDRVSSQDTQSIQEDDQSEVRRGKADTGPPRRSSTQTKSPLSALATLNLNGQSSTPAPTMKPAPPPTRLPGETLKYASAAAAAAASDKNGVGIAPLPPPPGASPAISNAQPVSKPPSSASPQVAPAQPVQRLISNAANSDDLSNQSKSPTLSSVAASRPGTVPPTPAITKAETTTQKQQQPQQQPQPQPRPSKDRPIANGEKKEESNAEESVYHLPPGLQDLIHSFEATKSRATAPQSGSTQRLLVASHNTCPEPSDAEKPRHYKPQTPYNTPLYYPQDVLPIFDDPRLYENGRIETDTLFYLFYYRQATYQQYLAAKALKNQSWRFHKQYQTWFQRHEEPKTITEEFEQGTYRFFDYESTWMNRRKADFKFVYKFLEDDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.51
3 0.44
4 0.41
5 0.42
6 0.37
7 0.36
8 0.36
9 0.35
10 0.32
11 0.29
12 0.25
13 0.15
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.19
19 0.2
20 0.25
21 0.32
22 0.39
23 0.45
24 0.48
25 0.52
26 0.52
27 0.57
28 0.54
29 0.52
30 0.53
31 0.49
32 0.5
33 0.54
34 0.59
35 0.54
36 0.55
37 0.58
38 0.59
39 0.63
40 0.68
41 0.68
42 0.72
43 0.77
44 0.82
45 0.83
46 0.77
47 0.74
48 0.7
49 0.64
50 0.55
51 0.5
52 0.47
53 0.42
54 0.41
55 0.42
56 0.37
57 0.34
58 0.35
59 0.34
60 0.3
61 0.31
62 0.35
63 0.33
64 0.39
65 0.42
66 0.43
67 0.47
68 0.46
69 0.41
70 0.38
71 0.34
72 0.33
73 0.35
74 0.33
75 0.28
76 0.27
77 0.31
78 0.31
79 0.3
80 0.3
81 0.26
82 0.33
83 0.38
84 0.42
85 0.39
86 0.42
87 0.45
88 0.46
89 0.49
90 0.42
91 0.45
92 0.41
93 0.41
94 0.36
95 0.32
96 0.25
97 0.25
98 0.25
99 0.19
100 0.23
101 0.23
102 0.26
103 0.33
104 0.34
105 0.34
106 0.37
107 0.43
108 0.44
109 0.43
110 0.41
111 0.37
112 0.36
113 0.31
114 0.28
115 0.21
116 0.16
117 0.13
118 0.15
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.13
139 0.16
140 0.18
141 0.21
142 0.28
143 0.36
144 0.44
145 0.53
146 0.56
147 0.62
148 0.64
149 0.62
150 0.61
151 0.54
152 0.47
153 0.42
154 0.34
155 0.29
156 0.29
157 0.29
158 0.28
159 0.33
160 0.35
161 0.37
162 0.43
163 0.42
164 0.42
165 0.5
166 0.48
167 0.45
168 0.44
169 0.43
170 0.35
171 0.34
172 0.31
173 0.22
174 0.22
175 0.2
176 0.18
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.09
196 0.15
197 0.15
198 0.16
199 0.18
200 0.2
201 0.19
202 0.19
203 0.17
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.1
208 0.07
209 0.07
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.15
238 0.15
239 0.17
240 0.18
241 0.19
242 0.17
243 0.18
244 0.18
245 0.15
246 0.18
247 0.18
248 0.19
249 0.18
250 0.19
251 0.18
252 0.18
253 0.2
254 0.21
255 0.27
256 0.35
257 0.43
258 0.48
259 0.49
260 0.53
261 0.51
262 0.51
263 0.51
264 0.49
265 0.49
266 0.52
267 0.51
268 0.48
269 0.46
270 0.44
271 0.37
272 0.34
273 0.24
274 0.17
275 0.16
276 0.15
277 0.15
278 0.14
279 0.12
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.11
289 0.15
290 0.17
291 0.23
292 0.27
293 0.31
294 0.34
295 0.37
296 0.38
297 0.4
298 0.37
299 0.34
300 0.32
301 0.31
302 0.29
303 0.27
304 0.25
305 0.19
306 0.18
307 0.15
308 0.1
309 0.07
310 0.05
311 0.04
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.03
322 0.04
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.12
331 0.12
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.15
336 0.14
337 0.14
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.12
342 0.17
343 0.15
344 0.16
345 0.16
346 0.22
347 0.24
348 0.28
349 0.3
350 0.24
351 0.26
352 0.29
353 0.29
354 0.24
355 0.23
356 0.23
357 0.21
358 0.21
359 0.2
360 0.18
361 0.18
362 0.19
363 0.2
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.16
368 0.15
369 0.15
370 0.12
371 0.11
372 0.14
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.15
377 0.14
378 0.15
379 0.14
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.17
384 0.17
385 0.21
386 0.2
387 0.19
388 0.18
389 0.17
390 0.19
391 0.16
392 0.17
393 0.13
394 0.18
395 0.17
396 0.18
397 0.2
398 0.18
399 0.19
400 0.19
401 0.25
402 0.24
403 0.27
404 0.35
405 0.4
406 0.43
407 0.47
408 0.53
409 0.55
410 0.61
411 0.67
412 0.68
413 0.69
414 0.72
415 0.77
416 0.81
417 0.79
418 0.78
419 0.75
420 0.74
421 0.71
422 0.74
423 0.7
424 0.68
425 0.65
426 0.65
427 0.69
428 0.67
429 0.69
430 0.62
431 0.6
432 0.53
433 0.51
434 0.43
435 0.35
436 0.3
437 0.23
438 0.21
439 0.16
440 0.18
441 0.2
442 0.19
443 0.16
444 0.13
445 0.13
446 0.11
447 0.15
448 0.14
449 0.09
450 0.09
451 0.11
452 0.15
453 0.15
454 0.15
455 0.12
456 0.14
457 0.18
458 0.18
459 0.17
460 0.15
461 0.17
462 0.22
463 0.25
464 0.29
465 0.3
466 0.35
467 0.38
468 0.39
469 0.39
470 0.36
471 0.33
472 0.27
473 0.24
474 0.18
475 0.17
476 0.22
477 0.21
478 0.23
479 0.26
480 0.25
481 0.24
482 0.25
483 0.24
484 0.21
485 0.22
486 0.28
487 0.32
488 0.38
489 0.46
490 0.49
491 0.53
492 0.59
493 0.59
494 0.59
495 0.6
496 0.64
497 0.65
498 0.68
499 0.69
500 0.67
501 0.65
502 0.57
503 0.57
504 0.53
505 0.47
506 0.4
507 0.35
508 0.34
509 0.31
510 0.32
511 0.26
512 0.23
513 0.21
514 0.21
515 0.21
516 0.15
517 0.18
518 0.21
519 0.21
520 0.22
521 0.25
522 0.28
523 0.29
524 0.29
525 0.27
526 0.24
527 0.24
528 0.2
529 0.16
530 0.12
531 0.1
532 0.12
533 0.11
534 0.14
535 0.16
536 0.15
537 0.17
538 0.21
539 0.25
540 0.25
541 0.27
542 0.29
543 0.27
544 0.28
545 0.28
546 0.3
547 0.27
548 0.3
549 0.36
550 0.36
551 0.43
552 0.47
553 0.54
554 0.57
555 0.65
556 0.67
557 0.68
558 0.72
559 0.72
560 0.78
561 0.79
562 0.81
563 0.79
564 0.76
565 0.72
566 0.73
567 0.72
568 0.68
569 0.66
570 0.6
571 0.57
572 0.59
573 0.56
574 0.47
575 0.42
576 0.39
577 0.31
578 0.28
579 0.27
580 0.21
581 0.22
582 0.22
583 0.21
584 0.17
585 0.16
586 0.16
587 0.16
588 0.22
589 0.26
590 0.29
591 0.35
592 0.42
593 0.46
594 0.49
595 0.52
596 0.55
597 0.54
598 0.59
599 0.6
600 0.63
601 0.67
602 0.65
603 0.65
604 0.58