Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9CHK6

Protein Details
Accession W9CHK6    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-46GDVLTKKKLDPHRNQCRGATHydrophilic
79-100YRGEGKGKKGKQQNNQQQKNGSHydrophilic
241-273KEHDGKSSKKDKKDEKKKDKKRKRLHVDTHDLSBasic
319-345KETPSAKPKKTKESKRASRPRTRTDTFHydrophilic
354-386TTRQHSREHSEDRPKKRKHKHRTKSSERPKMLEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
240-264TKEHDGKSSKKDKKDEKKKDKKRKR
324-339AKPKKTKESKRASRPR
366-383RPKKRKHKHRTKSSERPK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 13, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MSIGTPMPTPASTFTPKPTTTSIMNCGDVLTKKKLDPHRNQCRGATYTCLDCMVHFQGLEYRSHTSCMSEAQKYQGALYRGEGKGKKGKQQNNQQQKNGSQNNSQSAPAHKAYVEDAQDEYDNSQLVTAPSIPKAPSPSAAVNVFDFLVDATPNASKLELPASDEVMNDSEPERYQVRDEPMSDNADVSEAEKPSTDLVRVTSEENNQTITNLVEWGSGPVPTTGPFETPVPKAIEWKPTKEHDGKSSKKDKKDEKKKDKKRKRLHVDTHDLSPREGDVLMDDAPPVLHSGLTGGLGKLLSRPAVFPPSPDYSGADAEKETPSAKPKKTKESKRASRPRTRTDTFGSNLMSLITTRQHSREHSEDRPKKRKHKHRTKSSERPKMLEYKPINGADDSSPGENQMIVYKPRAELLMSMVNKGPSSEKGVSMNKALKRYHRERTAAGLALGKGDEEKELWRSLRMKKNDRGEIVLFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.38
3 0.38
4 0.41
5 0.42
6 0.4
7 0.4
8 0.43
9 0.43
10 0.4
11 0.41
12 0.37
13 0.33
14 0.33
15 0.33
16 0.33
17 0.33
18 0.32
19 0.33
20 0.41
21 0.51
22 0.57
23 0.64
24 0.7
25 0.75
26 0.8
27 0.82
28 0.77
29 0.74
30 0.68
31 0.59
32 0.54
33 0.46
34 0.4
35 0.36
36 0.34
37 0.27
38 0.23
39 0.25
40 0.23
41 0.21
42 0.18
43 0.17
44 0.21
45 0.23
46 0.24
47 0.22
48 0.22
49 0.22
50 0.24
51 0.23
52 0.2
53 0.19
54 0.25
55 0.27
56 0.27
57 0.28
58 0.31
59 0.34
60 0.32
61 0.33
62 0.31
63 0.28
64 0.25
65 0.26
66 0.29
67 0.27
68 0.34
69 0.34
70 0.35
71 0.43
72 0.47
73 0.52
74 0.54
75 0.62
76 0.64
77 0.74
78 0.79
79 0.81
80 0.85
81 0.82
82 0.78
83 0.74
84 0.75
85 0.71
86 0.65
87 0.6
88 0.56
89 0.56
90 0.51
91 0.47
92 0.39
93 0.35
94 0.36
95 0.31
96 0.27
97 0.22
98 0.21
99 0.22
100 0.25
101 0.23
102 0.19
103 0.18
104 0.18
105 0.18
106 0.17
107 0.16
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.14
119 0.14
120 0.15
121 0.19
122 0.19
123 0.19
124 0.22
125 0.22
126 0.23
127 0.24
128 0.23
129 0.19
130 0.19
131 0.17
132 0.12
133 0.11
134 0.07
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.11
146 0.1
147 0.12
148 0.12
149 0.14
150 0.15
151 0.15
152 0.15
153 0.12
154 0.12
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.13
163 0.17
164 0.21
165 0.22
166 0.24
167 0.24
168 0.26
169 0.28
170 0.25
171 0.21
172 0.17
173 0.14
174 0.13
175 0.11
176 0.12
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.08
185 0.09
186 0.11
187 0.12
188 0.14
189 0.15
190 0.17
191 0.19
192 0.19
193 0.19
194 0.16
195 0.15
196 0.14
197 0.11
198 0.09
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.13
216 0.13
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.2
221 0.21
222 0.29
223 0.29
224 0.31
225 0.32
226 0.32
227 0.38
228 0.39
229 0.39
230 0.38
231 0.45
232 0.47
233 0.51
234 0.6
235 0.6
236 0.61
237 0.67
238 0.69
239 0.71
240 0.78
241 0.81
242 0.82
243 0.87
244 0.91
245 0.95
246 0.95
247 0.95
248 0.94
249 0.94
250 0.93
251 0.93
252 0.92
253 0.9
254 0.88
255 0.79
256 0.74
257 0.67
258 0.57
259 0.46
260 0.36
261 0.26
262 0.18
263 0.16
264 0.1
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.09
290 0.1
291 0.17
292 0.17
293 0.17
294 0.22
295 0.25
296 0.26
297 0.26
298 0.25
299 0.21
300 0.24
301 0.23
302 0.19
303 0.14
304 0.15
305 0.15
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.19
310 0.27
311 0.32
312 0.4
313 0.45
314 0.55
315 0.65
316 0.74
317 0.76
318 0.79
319 0.84
320 0.86
321 0.91
322 0.9
323 0.9
324 0.88
325 0.87
326 0.85
327 0.77
328 0.71
329 0.66
330 0.63
331 0.54
332 0.49
333 0.4
334 0.32
335 0.29
336 0.24
337 0.19
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.12
342 0.14
343 0.17
344 0.2
345 0.23
346 0.3
347 0.36
348 0.41
349 0.48
350 0.57
351 0.63
352 0.7
353 0.78
354 0.8
355 0.83
356 0.87
357 0.89
358 0.89
359 0.91
360 0.92
361 0.93
362 0.95
363 0.95
364 0.95
365 0.95
366 0.95
367 0.87
368 0.8
369 0.73
370 0.72
371 0.63
372 0.62
373 0.54
374 0.48
375 0.51
376 0.49
377 0.46
378 0.36
379 0.37
380 0.28
381 0.28
382 0.24
383 0.19
384 0.17
385 0.16
386 0.16
387 0.14
388 0.13
389 0.14
390 0.16
391 0.17
392 0.2
393 0.21
394 0.22
395 0.23
396 0.23
397 0.19
398 0.16
399 0.2
400 0.25
401 0.23
402 0.25
403 0.26
404 0.26
405 0.25
406 0.25
407 0.23
408 0.17
409 0.24
410 0.24
411 0.25
412 0.31
413 0.36
414 0.37
415 0.41
416 0.46
417 0.43
418 0.48
419 0.49
420 0.51
421 0.57
422 0.62
423 0.66
424 0.68
425 0.68
426 0.64
427 0.68
428 0.65
429 0.57
430 0.51
431 0.44
432 0.35
433 0.32
434 0.29
435 0.21
436 0.15
437 0.13
438 0.13
439 0.1
440 0.13
441 0.15
442 0.2
443 0.21
444 0.27
445 0.33
446 0.42
447 0.51
448 0.58
449 0.64
450 0.68
451 0.77
452 0.8
453 0.77
454 0.74