FuNGI

W9C201

Protein Details

Accession

W9C201

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
476-497	IEYNRPKRTIKIHNSNYTKRIL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MKGWRAYKPNKYFLLATDDATRVDWIRYIKDKTAVTVVPILIEIIKDIEKEIGEKVTIIRTDNGRSEFGIAFQNKLKKLGIQFEPSPSGKYSINGVAEKHIQDISARSKSLLNQAGMLEDQWELTTRYIIWLCNKAFTKALSFGESGSLSTVITLFGVYYSRLPDFINLQVFSYKVFALNLQFPGKLIKKFESRILKRDNVELLNTTCKHRLRKIFSNQVVQKVKALKVVIIDTENSTLTDDPEVPLEAIELEEAMREDRKQWLKAIKSELTSLQENGTFQIIQGNVPKGKTLITSKLVIKGYLQHAGIDFKETFAGVGRYFTLRTLLAKTTVEDLEIDNMDVDIVFLNEKLTDTKILMEIPQFFEEVFPEIKEMLLKSLQGTKVFLKLKKSLYSLKQTPRIWWLAVKKFLKNIGLTASSADPNLFIGNGVYILLYMDNLLIIGNRTNIDKIKTKISAKWKCKDLGPTRMFLGLQIEYNRPKRTIKIHNSNYTKRIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.46
3	0.4
4	0.36
5	0.32
6	0.29
7	0.28
8	0.27
9	0.19
10	0.19
11	0.2
12	0.18
13	0.24
14	0.31
15	0.35
16	0.38
17	0.43
18	0.43
19	0.42
20	0.46
21	0.4
22	0.35
23	0.34
24	0.3
25	0.23
26	0.23
27	0.2
28	0.14
29	0.13
30	0.11
31	0.09
32	0.09
33	0.09
34	0.1
35	0.12
36	0.12
37	0.13
38	0.14
39	0.14
40	0.14
41	0.14
42	0.15
43	0.18
44	0.2
45	0.2
46	0.23
47	0.25
48	0.29
49	0.34
50	0.35
51	0.31
52	0.3
53	0.31
54	0.27
55	0.25
56	0.29
57	0.24
58	0.24
59	0.28
60	0.34
61	0.32
62	0.34
63	0.34
64	0.3
65	0.34
66	0.4
67	0.41
68	0.41
69	0.42
70	0.43
71	0.48
72	0.44
73	0.42
74	0.35
75	0.32
76	0.26
77	0.24
78	0.24
79	0.23
80	0.27
81	0.26
82	0.25
83	0.26
84	0.29
85	0.29
86	0.27
87	0.22
88	0.18
89	0.17
90	0.21
91	0.25
92	0.25
93	0.25
94	0.24
95	0.26
96	0.28
97	0.36
98	0.36
99	0.29
100	0.27
101	0.27
102	0.27
103	0.25
104	0.23
105	0.15
106	0.09
107	0.09
108	0.07
109	0.08
110	0.08
111	0.09
112	0.09
113	0.08
114	0.12
115	0.13
116	0.15
117	0.18
118	0.24
119	0.24
120	0.3
121	0.31
122	0.29
123	0.3
124	0.29
125	0.28
126	0.26
127	0.27
128	0.23
129	0.22
130	0.2
131	0.21
132	0.2
133	0.16
134	0.12
135	0.11
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.05
140	0.05
141	0.05
142	0.04
143	0.04
144	0.05
145	0.05
146	0.06
147	0.08
148	0.08
149	0.09
150	0.1
151	0.11
152	0.13
153	0.16
154	0.18
155	0.17
156	0.17
157	0.17
158	0.17
159	0.16
160	0.15
161	0.11
162	0.08
163	0.08
164	0.09
165	0.1
166	0.14
167	0.16
168	0.16
169	0.16
170	0.15
171	0.21
172	0.23
173	0.23
174	0.23
175	0.25
176	0.29
177	0.31
178	0.38
179	0.43
180	0.43
181	0.49
182	0.53
183	0.53
184	0.49
185	0.51
186	0.47
187	0.37
188	0.35
189	0.29
190	0.24
191	0.25
192	0.25
193	0.24
194	0.25
195	0.28
196	0.31
197	0.36
198	0.43
199	0.45
200	0.54
201	0.6
202	0.65
203	0.66
204	0.71
205	0.66
206	0.67
207	0.62
208	0.52
209	0.47
210	0.4
211	0.37
212	0.3
213	0.28
214	0.2
215	0.18
216	0.19
217	0.16
218	0.13
219	0.13
220	0.1
221	0.11
222	0.1
223	0.08
224	0.09
225	0.08
226	0.07
227	0.08
228	0.07
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.05
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.04
243	0.04
244	0.05
245	0.06
246	0.13
247	0.17
248	0.19
249	0.23
250	0.29
251	0.32
252	0.36
253	0.41
254	0.36
255	0.34
256	0.34
257	0.31
258	0.28
259	0.26
260	0.22
261	0.17
262	0.15
263	0.14
264	0.13
265	0.12
266	0.09
267	0.07
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.13
272	0.15
273	0.16
274	0.16
275	0.16
276	0.13
277	0.14
278	0.15
279	0.16
280	0.18
281	0.19
282	0.22
283	0.23
284	0.29
285	0.29
286	0.26
287	0.23
288	0.23
289	0.23
290	0.24
291	0.23
292	0.17
293	0.17
294	0.19
295	0.18
296	0.17
297	0.14
298	0.11
299	0.11
300	0.1
301	0.09
302	0.09
303	0.11
304	0.07
305	0.08
306	0.09
307	0.1
308	0.1
309	0.1
310	0.11
311	0.1
312	0.11
313	0.14
314	0.14
315	0.15
316	0.15
317	0.16
318	0.17
319	0.17
320	0.16
321	0.13
322	0.12
323	0.12
324	0.12
325	0.11
326	0.08
327	0.08
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.07
339	0.08
340	0.09
341	0.09
342	0.11
343	0.11
344	0.12
345	0.13
346	0.14
347	0.15
348	0.17
349	0.17
350	0.16
351	0.15
352	0.15
353	0.14
354	0.14
355	0.13
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.11
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.11
365	0.12
366	0.19
367	0.21
368	0.21
369	0.23
370	0.22
371	0.29
372	0.34
373	0.36
374	0.35
375	0.39
376	0.43
377	0.46
378	0.49
379	0.49
380	0.5
381	0.57
382	0.6
383	0.62
384	0.66
385	0.62
386	0.61
387	0.59
388	0.55
389	0.47
390	0.45
391	0.46
392	0.45
393	0.53
394	0.53
395	0.5
396	0.51
397	0.54
398	0.51
399	0.43
400	0.37
401	0.33
402	0.3
403	0.28
404	0.26
405	0.23
406	0.2
407	0.19
408	0.17
409	0.12
410	0.11
411	0.11
412	0.09
413	0.07
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.06
430	0.07
431	0.09
432	0.1
433	0.12
434	0.15
435	0.18
436	0.23
437	0.29
438	0.3
439	0.37
440	0.43
441	0.46
442	0.5
443	0.59
444	0.64
445	0.66
446	0.72
447	0.71
448	0.67
449	0.69
450	0.72
451	0.7
452	0.7
453	0.65
454	0.59
455	0.54
456	0.53
457	0.47
458	0.38
459	0.33
460	0.24
461	0.24
462	0.25
463	0.29
464	0.34
465	0.41
466	0.44
467	0.43
468	0.45
469	0.48
470	0.54
471	0.59
472	0.62
473	0.67
474	0.73
475	0.8
476	0.86
477	0.86

W9C201

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer