Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9CXQ1

Protein Details
Accession W9CXQ1    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-52NQQFAFPPHKRQRTSPNPPPSQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
471-480ARIRKRKARE
509-515KKEMKRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQQQQPPYPMPQRPFSPPQPVNSPSTQNQQFAFPPHKRQRTSPNPPPSQPGSPYVTSPYAMSPGASGPASASPSPHFSTVQLPQTAYTTPYSNGLNAQPSPSLNLPQTPGALPPHAQPSPLSFPGQIQQHHQGNLQAAHFNNFNLQMPQQHHPGGIMGPPSRPVDKNKLDGLDPMDVLGGTGVDLAEEEQYTFQQYSSSFNAQVSRSHPGNVSAGHSFTQFPPGHERSFYGSGPANQLGEVPNTKSQEDFEKKAADKAWHDAARDLAVSRQRELNNPFLIVSTVHRRMEKIAHDNGLGLNTDFNQKMGTMKLPEHFPEPNVKVQTAVGPEGAITATTGTFIPADSLLVDQLALMSISTKYRLRGLVEDAIKLSIGRQTGSHAQIRDEWADVAVESRKVSTIVNEGGPRIGWESAVSPLTNSQKRPHSAAGRLPTPVSESAKTPTKSFANEVAVALRKAAGKEQEAEEARIRKRKARESGDGSRAGSINPGTPGSIAPDILDKPPTKKEMKRKAEAKTSEAASHAAANVTTTQFLGGRNVFGKKKQYSWMTSAGGSGSGTSTPGRIMPQGLGASSGSPIANPGPEKFTTDGVRRLGTWREDGGKGRHIQLRDWIMVLEDDGREKKALQKAYALVDGMDPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.61
3 0.63
4 0.64
5 0.62
6 0.64
7 0.61
8 0.62
9 0.63
10 0.62
11 0.59
12 0.56
13 0.56
14 0.49
15 0.55
16 0.54
17 0.49
18 0.47
19 0.45
20 0.43
21 0.43
22 0.48
23 0.44
24 0.5
25 0.57
26 0.65
27 0.65
28 0.69
29 0.74
30 0.76
31 0.81
32 0.8
33 0.8
34 0.79
35 0.78
36 0.78
37 0.73
38 0.68
39 0.61
40 0.56
41 0.51
42 0.45
43 0.44
44 0.41
45 0.37
46 0.31
47 0.29
48 0.24
49 0.21
50 0.2
51 0.18
52 0.14
53 0.13
54 0.15
55 0.14
56 0.12
57 0.1
58 0.13
59 0.16
60 0.16
61 0.17
62 0.16
63 0.22
64 0.24
65 0.24
66 0.23
67 0.21
68 0.27
69 0.31
70 0.36
71 0.33
72 0.32
73 0.3
74 0.31
75 0.31
76 0.27
77 0.22
78 0.17
79 0.16
80 0.19
81 0.19
82 0.18
83 0.2
84 0.2
85 0.23
86 0.21
87 0.23
88 0.21
89 0.21
90 0.24
91 0.23
92 0.23
93 0.2
94 0.22
95 0.22
96 0.22
97 0.24
98 0.2
99 0.22
100 0.21
101 0.21
102 0.2
103 0.2
104 0.26
105 0.25
106 0.25
107 0.22
108 0.26
109 0.31
110 0.32
111 0.31
112 0.24
113 0.26
114 0.31
115 0.35
116 0.3
117 0.28
118 0.35
119 0.37
120 0.38
121 0.38
122 0.35
123 0.34
124 0.36
125 0.31
126 0.26
127 0.23
128 0.24
129 0.23
130 0.2
131 0.19
132 0.17
133 0.17
134 0.16
135 0.16
136 0.19
137 0.23
138 0.26
139 0.28
140 0.27
141 0.26
142 0.24
143 0.24
144 0.19
145 0.17
146 0.18
147 0.15
148 0.15
149 0.18
150 0.2
151 0.22
152 0.24
153 0.28
154 0.34
155 0.38
156 0.42
157 0.43
158 0.42
159 0.4
160 0.4
161 0.37
162 0.3
163 0.24
164 0.19
165 0.16
166 0.13
167 0.12
168 0.09
169 0.06
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.09
185 0.09
186 0.13
187 0.17
188 0.2
189 0.19
190 0.19
191 0.23
192 0.22
193 0.25
194 0.24
195 0.25
196 0.23
197 0.24
198 0.24
199 0.22
200 0.23
201 0.21
202 0.21
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.16
207 0.15
208 0.13
209 0.21
210 0.18
211 0.19
212 0.27
213 0.29
214 0.29
215 0.29
216 0.3
217 0.27
218 0.3
219 0.28
220 0.22
221 0.21
222 0.21
223 0.24
224 0.23
225 0.18
226 0.14
227 0.15
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.15
233 0.17
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.24
238 0.28
239 0.28
240 0.27
241 0.31
242 0.32
243 0.34
244 0.36
245 0.3
246 0.26
247 0.28
248 0.32
249 0.29
250 0.29
251 0.26
252 0.25
253 0.22
254 0.21
255 0.17
256 0.13
257 0.16
258 0.16
259 0.17
260 0.21
261 0.21
262 0.26
263 0.3
264 0.32
265 0.28
266 0.28
267 0.26
268 0.21
269 0.21
270 0.16
271 0.15
272 0.16
273 0.19
274 0.2
275 0.21
276 0.21
277 0.22
278 0.26
279 0.29
280 0.28
281 0.27
282 0.26
283 0.26
284 0.26
285 0.24
286 0.2
287 0.16
288 0.1
289 0.07
290 0.06
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.11
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.15
303 0.15
304 0.17
305 0.17
306 0.16
307 0.21
308 0.22
309 0.24
310 0.24
311 0.23
312 0.21
313 0.21
314 0.22
315 0.16
316 0.15
317 0.1
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.05
323 0.04
324 0.03
325 0.03
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.04
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.02
344 0.03
345 0.04
346 0.05
347 0.07
348 0.08
349 0.09
350 0.12
351 0.14
352 0.15
353 0.16
354 0.2
355 0.24
356 0.24
357 0.24
358 0.22
359 0.2
360 0.18
361 0.16
362 0.12
363 0.08
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.11
368 0.16
369 0.19
370 0.22
371 0.21
372 0.21
373 0.23
374 0.25
375 0.23
376 0.19
377 0.15
378 0.12
379 0.12
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.12
391 0.13
392 0.15
393 0.16
394 0.16
395 0.15
396 0.15
397 0.14
398 0.12
399 0.1
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.1
404 0.11
405 0.1
406 0.09
407 0.13
408 0.21
409 0.24
410 0.25
411 0.29
412 0.35
413 0.37
414 0.41
415 0.44
416 0.42
417 0.44
418 0.48
419 0.48
420 0.43
421 0.41
422 0.37
423 0.31
424 0.28
425 0.26
426 0.23
427 0.18
428 0.18
429 0.21
430 0.29
431 0.3
432 0.28
433 0.29
434 0.28
435 0.29
436 0.31
437 0.32
438 0.28
439 0.28
440 0.28
441 0.26
442 0.26
443 0.24
444 0.21
445 0.17
446 0.14
447 0.14
448 0.17
449 0.17
450 0.17
451 0.2
452 0.21
453 0.27
454 0.27
455 0.29
456 0.31
457 0.34
458 0.37
459 0.41
460 0.42
461 0.41
462 0.48
463 0.55
464 0.6
465 0.61
466 0.66
467 0.67
468 0.74
469 0.73
470 0.68
471 0.59
472 0.51
473 0.44
474 0.34
475 0.28
476 0.2
477 0.16
478 0.14
479 0.14
480 0.12
481 0.12
482 0.12
483 0.14
484 0.14
485 0.12
486 0.1
487 0.13
488 0.14
489 0.15
490 0.2
491 0.18
492 0.21
493 0.27
494 0.33
495 0.38
496 0.44
497 0.54
498 0.6
499 0.68
500 0.74
501 0.75
502 0.77
503 0.8
504 0.76
505 0.69
506 0.63
507 0.57
508 0.48
509 0.42
510 0.35
511 0.26
512 0.23
513 0.19
514 0.14
515 0.11
516 0.1
517 0.11
518 0.11
519 0.1
520 0.09
521 0.1
522 0.1
523 0.11
524 0.15
525 0.14
526 0.16
527 0.19
528 0.25
529 0.27
530 0.31
531 0.39
532 0.38
533 0.42
534 0.47
535 0.51
536 0.51
537 0.53
538 0.55
539 0.49
540 0.45
541 0.41
542 0.34
543 0.27
544 0.21
545 0.16
546 0.1
547 0.08
548 0.09
549 0.08
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.12
554 0.13
555 0.14
556 0.14
557 0.18
558 0.18
559 0.17
560 0.17
561 0.16
562 0.15
563 0.13
564 0.14
565 0.09
566 0.08
567 0.1
568 0.1
569 0.14
570 0.15
571 0.17
572 0.2
573 0.21
574 0.25
575 0.26
576 0.29
577 0.32
578 0.35
579 0.39
580 0.38
581 0.38
582 0.35
583 0.38
584 0.39
585 0.37
586 0.36
587 0.34
588 0.36
589 0.38
590 0.43
591 0.44
592 0.45
593 0.44
594 0.47
595 0.48
596 0.45
597 0.44
598 0.46
599 0.48
600 0.41
601 0.39
602 0.32
603 0.28
604 0.27
605 0.25
606 0.19
607 0.14
608 0.17
609 0.18
610 0.2
611 0.2
612 0.21
613 0.28
614 0.32
615 0.38
616 0.35
617 0.4
618 0.43
619 0.46
620 0.48
621 0.41
622 0.33