Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9Y0Y5

Protein Details
Accession W9Y0Y5    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
407-428SEPQSSRRRPVKPQPNNKPKLGHydrophilic
667-695ELQNGGPKKKTPREIRKERERQETEDQKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
413-435RRRPVKPQPNNKPKLGGLRKKKQ
673-687PKKKTPREIRKERER
712-717VKRRRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MGAFNDEGWQELQLPSRRQCPKLFYSLSTESDSITLLLTDLICIWECSLDRYDIVAEASCQHTSIDPSASSDQFDVLLSKIGKSLKDGQNVLVRTNERDGYVLRLKTSVDLPKPLRPLEWTFKLTPQPSSELAERILRPSLHEVAVSQEKISTLLRIIREKDHVISRLLDRIGSSAVDLSLIFPGITGVASRKGGHISVTEAKKHVPGMASFDEKSWTKQFANDDGYEGADRTGLGNLVRGCEKCFVHTRAQHEDWIAGLPSMDKLNGDGDKNRQFSPPTRKAAPRQHKSDDESTASGSDDDFERQPTPHRLKSKAPETSKPAKAASVDDGDAEEETVPSKEALKSAPEIGGLGRRNATKAFGTSATRRSSSSSAERPTPLLRRGSDASTATATPTASEDNDDDNDSEPQSSRRRPVKPQPNNKPKLGGLRKKKQATPSPSPTPTPSPAPSPAQASRQQGAPSARGSRNSTSARSKNQVSPTPKDNSNNADETTSTASESDFEIDARARPELDSKPQQPRKSKPEPEPEPDAKPKPNQSQESSANTPRRRLGRIGRKQPDQPTDLQTSPTPRSSKKATDKATSRQGNTHGTRTRDRRGNENDDSDRTGSATSTPSPSPSPSPTASQATSKPKIASHPRKSPSNSAPSRSNENGKRSLESTEPEHEPELQNGGPKKKTPREIRKERERQETEDQKADRRRMELELALAAPSPVKRRRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.45
4 0.52
5 0.55
6 0.6
7 0.6
8 0.59
9 0.63
10 0.63
11 0.56
12 0.57
13 0.57
14 0.55
15 0.51
16 0.44
17 0.35
18 0.31
19 0.28
20 0.2
21 0.15
22 0.11
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.07
27 0.07
28 0.08
29 0.08
30 0.09
31 0.09
32 0.11
33 0.11
34 0.15
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.18
39 0.18
40 0.16
41 0.17
42 0.14
43 0.12
44 0.14
45 0.16
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.17
51 0.19
52 0.19
53 0.17
54 0.21
55 0.26
56 0.26
57 0.26
58 0.23
59 0.2
60 0.17
61 0.18
62 0.14
63 0.1
64 0.16
65 0.14
66 0.14
67 0.18
68 0.2
69 0.2
70 0.24
71 0.33
72 0.35
73 0.41
74 0.42
75 0.43
76 0.48
77 0.48
78 0.45
79 0.41
80 0.36
81 0.32
82 0.35
83 0.32
84 0.25
85 0.26
86 0.25
87 0.27
88 0.32
89 0.3
90 0.27
91 0.26
92 0.26
93 0.27
94 0.31
95 0.32
96 0.28
97 0.35
98 0.38
99 0.44
100 0.48
101 0.47
102 0.42
103 0.39
104 0.43
105 0.44
106 0.47
107 0.46
108 0.43
109 0.47
110 0.53
111 0.5
112 0.47
113 0.41
114 0.38
115 0.35
116 0.37
117 0.34
118 0.28
119 0.29
120 0.3
121 0.28
122 0.26
123 0.28
124 0.24
125 0.24
126 0.28
127 0.29
128 0.24
129 0.23
130 0.21
131 0.23
132 0.28
133 0.26
134 0.21
135 0.18
136 0.18
137 0.19
138 0.2
139 0.15
140 0.12
141 0.16
142 0.2
143 0.24
144 0.27
145 0.29
146 0.32
147 0.34
148 0.35
149 0.36
150 0.35
151 0.32
152 0.32
153 0.3
154 0.31
155 0.29
156 0.25
157 0.2
158 0.19
159 0.18
160 0.14
161 0.13
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.12
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.14
184 0.16
185 0.23
186 0.26
187 0.26
188 0.26
189 0.27
190 0.27
191 0.27
192 0.24
193 0.18
194 0.16
195 0.2
196 0.23
197 0.25
198 0.24
199 0.23
200 0.25
201 0.23
202 0.27
203 0.23
204 0.24
205 0.21
206 0.25
207 0.27
208 0.3
209 0.34
210 0.3
211 0.29
212 0.26
213 0.26
214 0.22
215 0.19
216 0.13
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.14
227 0.14
228 0.15
229 0.19
230 0.19
231 0.19
232 0.26
233 0.28
234 0.34
235 0.38
236 0.41
237 0.45
238 0.46
239 0.44
240 0.38
241 0.34
242 0.27
243 0.24
244 0.18
245 0.1
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.05
252 0.06
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.14
257 0.2
258 0.27
259 0.29
260 0.3
261 0.29
262 0.3
263 0.36
264 0.44
265 0.46
266 0.45
267 0.48
268 0.52
269 0.59
270 0.67
271 0.7
272 0.68
273 0.66
274 0.66
275 0.66
276 0.66
277 0.62
278 0.54
279 0.46
280 0.39
281 0.32
282 0.27
283 0.22
284 0.17
285 0.12
286 0.09
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.15
294 0.23
295 0.29
296 0.33
297 0.38
298 0.41
299 0.46
300 0.54
301 0.58
302 0.58
303 0.56
304 0.55
305 0.58
306 0.62
307 0.59
308 0.53
309 0.45
310 0.38
311 0.34
312 0.31
313 0.26
314 0.19
315 0.15
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.1
320 0.09
321 0.06
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.13
339 0.13
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.14
344 0.14
345 0.15
346 0.11
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.15
351 0.17
352 0.22
353 0.22
354 0.23
355 0.22
356 0.23
357 0.23
358 0.24
359 0.27
360 0.27
361 0.28
362 0.29
363 0.29
364 0.28
365 0.3
366 0.31
367 0.28
368 0.27
369 0.25
370 0.26
371 0.28
372 0.27
373 0.27
374 0.23
375 0.21
376 0.18
377 0.17
378 0.14
379 0.13
380 0.11
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.1
395 0.09
396 0.13
397 0.18
398 0.21
399 0.28
400 0.35
401 0.4
402 0.48
403 0.58
404 0.64
405 0.69
406 0.77
407 0.81
408 0.84
409 0.84
410 0.77
411 0.7
412 0.61
413 0.61
414 0.6
415 0.58
416 0.57
417 0.62
418 0.69
419 0.7
420 0.72
421 0.7
422 0.69
423 0.69
424 0.68
425 0.66
426 0.65
427 0.62
428 0.6
429 0.55
430 0.5
431 0.44
432 0.39
433 0.33
434 0.29
435 0.3
436 0.31
437 0.29
438 0.3
439 0.3
440 0.31
441 0.35
442 0.35
443 0.33
444 0.32
445 0.32
446 0.31
447 0.31
448 0.28
449 0.25
450 0.28
451 0.28
452 0.29
453 0.33
454 0.3
455 0.36
456 0.36
457 0.38
458 0.4
459 0.44
460 0.46
461 0.46
462 0.48
463 0.47
464 0.51
465 0.54
466 0.52
467 0.51
468 0.51
469 0.52
470 0.52
471 0.49
472 0.45
473 0.42
474 0.4
475 0.38
476 0.33
477 0.28
478 0.24
479 0.23
480 0.23
481 0.18
482 0.14
483 0.12
484 0.11
485 0.11
486 0.11
487 0.11
488 0.08
489 0.08
490 0.09
491 0.09
492 0.11
493 0.12
494 0.12
495 0.1
496 0.11
497 0.16
498 0.18
499 0.25
500 0.32
501 0.37
502 0.48
503 0.55
504 0.62
505 0.66
506 0.72
507 0.73
508 0.76
509 0.78
510 0.76
511 0.8
512 0.79
513 0.76
514 0.76
515 0.71
516 0.67
517 0.66
518 0.62
519 0.56
520 0.55
521 0.58
522 0.58
523 0.63
524 0.62
525 0.59
526 0.61
527 0.62
528 0.63
529 0.6
530 0.59
531 0.59
532 0.55
533 0.54
534 0.52
535 0.51
536 0.47
537 0.49
538 0.52
539 0.55
540 0.63
541 0.7
542 0.72
543 0.73
544 0.77
545 0.78
546 0.74
547 0.66
548 0.6
549 0.55
550 0.52
551 0.47
552 0.43
553 0.37
554 0.36
555 0.36
556 0.38
557 0.37
558 0.33
559 0.38
560 0.42
561 0.49
562 0.54
563 0.6
564 0.59
565 0.64
566 0.69
567 0.71
568 0.75
569 0.71
570 0.63
571 0.58
572 0.57
573 0.57
574 0.54
575 0.56
576 0.51
577 0.5
578 0.56
579 0.59
580 0.63
581 0.61
582 0.6
583 0.6
584 0.64
585 0.67
586 0.65
587 0.66
588 0.61
589 0.57
590 0.59
591 0.5
592 0.41
593 0.33
594 0.27
595 0.19
596 0.17
597 0.16
598 0.15
599 0.17
600 0.18
601 0.2
602 0.22
603 0.24
604 0.27
605 0.28
606 0.31
607 0.3
608 0.34
609 0.36
610 0.39
611 0.38
612 0.38
613 0.41
614 0.45
615 0.47
616 0.46
617 0.43
618 0.4
619 0.48
620 0.55
621 0.58
622 0.59
623 0.65
624 0.68
625 0.74
626 0.78
627 0.78
628 0.76
629 0.75
630 0.72
631 0.67
632 0.68
633 0.64
634 0.67
635 0.63
636 0.64
637 0.6
638 0.61
639 0.64
640 0.59
641 0.58
642 0.51
643 0.49
644 0.43
645 0.39
646 0.38
647 0.36
648 0.36
649 0.34
650 0.34
651 0.34
652 0.32
653 0.3
654 0.3
655 0.24
656 0.28
657 0.32
658 0.37
659 0.38
660 0.43
661 0.51
662 0.56
663 0.65
664 0.7
665 0.75
666 0.79
667 0.86
668 0.91
669 0.92
670 0.93
671 0.91
672 0.91
673 0.85
674 0.81
675 0.81
676 0.8
677 0.75
678 0.73
679 0.67
680 0.65
681 0.68
682 0.68
683 0.62
684 0.55
685 0.53
686 0.49
687 0.51
688 0.45
689 0.39
690 0.35
691 0.31
692 0.28
693 0.24
694 0.2
695 0.17
696 0.17
697 0.23
698 0.29