Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9YM66

Protein Details
Accession W9YM66    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-65DAAYKGKVRQRNLKKLRAKNYDGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
314-339RTRALGSKRAAKQKSPSPLPPPRKLP
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MAASSWVIRLEADKGNPPILVKVSRKEGGHDLDLDLLATDGDAAYKGKVRQRNLKKLRAKNYDGSDKDWIAVVSHVLLRTAAHQLDDAQKQNLHVTCSVSGKDPNGTLSIAFLNKVEDITQRLGNIELPQTEDTDDIDLFGWTLQAVKKRDELDEAVQALTWELKSKDAALKTLQKQIDELVEAKSEHEKQLLSKFSVLLNEKKLKIRNMQRVLSTAKTDATKLKELQSVIKKEGSASGGRGNKRRAEEAPKDDETDESEAFDTMQVDGNTNVRQHVPRDGDSPTSRETTPARSEDEDEDDDLGAPEPTAYRPRTRALGSKRAAKQKSPSPLPPPRKLPFQKKTGGQNDETSATQKEQKSKLTAPPADADEDETASEDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.32
4 0.31
5 0.3
6 0.29
7 0.34
8 0.32
9 0.35
10 0.41
11 0.45
12 0.45
13 0.46
14 0.48
15 0.45
16 0.44
17 0.4
18 0.33
19 0.3
20 0.3
21 0.25
22 0.18
23 0.12
24 0.09
25 0.07
26 0.06
27 0.04
28 0.04
29 0.05
30 0.05
31 0.07
32 0.12
33 0.17
34 0.24
35 0.31
36 0.38
37 0.48
38 0.58
39 0.68
40 0.73
41 0.79
42 0.82
43 0.85
44 0.89
45 0.88
46 0.83
47 0.8
48 0.78
49 0.78
50 0.7
51 0.65
52 0.6
53 0.51
54 0.45
55 0.38
56 0.3
57 0.2
58 0.18
59 0.14
60 0.1
61 0.12
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.15
68 0.14
69 0.12
70 0.12
71 0.15
72 0.22
73 0.26
74 0.26
75 0.24
76 0.25
77 0.25
78 0.31
79 0.3
80 0.26
81 0.23
82 0.23
83 0.23
84 0.24
85 0.24
86 0.21
87 0.22
88 0.2
89 0.21
90 0.19
91 0.18
92 0.17
93 0.16
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.12
98 0.11
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.12
106 0.14
107 0.15
108 0.14
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.16
113 0.14
114 0.12
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.04
130 0.06
131 0.07
132 0.13
133 0.16
134 0.17
135 0.21
136 0.23
137 0.24
138 0.26
139 0.27
140 0.23
141 0.24
142 0.23
143 0.19
144 0.17
145 0.16
146 0.13
147 0.11
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.1
154 0.14
155 0.14
156 0.16
157 0.17
158 0.25
159 0.27
160 0.34
161 0.33
162 0.29
163 0.29
164 0.28
165 0.25
166 0.18
167 0.17
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.13
173 0.13
174 0.12
175 0.13
176 0.12
177 0.13
178 0.19
179 0.2
180 0.18
181 0.18
182 0.18
183 0.17
184 0.22
185 0.22
186 0.2
187 0.23
188 0.27
189 0.28
190 0.32
191 0.35
192 0.34
193 0.4
194 0.46
195 0.5
196 0.53
197 0.53
198 0.5
199 0.5
200 0.49
201 0.42
202 0.35
203 0.25
204 0.2
205 0.18
206 0.19
207 0.19
208 0.2
209 0.23
210 0.23
211 0.25
212 0.26
213 0.26
214 0.33
215 0.36
216 0.35
217 0.34
218 0.34
219 0.3
220 0.28
221 0.29
222 0.24
223 0.18
224 0.16
225 0.2
226 0.24
227 0.28
228 0.33
229 0.34
230 0.37
231 0.38
232 0.4
233 0.39
234 0.42
235 0.47
236 0.48
237 0.51
238 0.48
239 0.47
240 0.44
241 0.39
242 0.33
243 0.28
244 0.22
245 0.16
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.13
250 0.1
251 0.07
252 0.11
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.14
257 0.15
258 0.15
259 0.16
260 0.15
261 0.17
262 0.18
263 0.24
264 0.27
265 0.27
266 0.29
267 0.3
268 0.33
269 0.33
270 0.34
271 0.29
272 0.28
273 0.26
274 0.27
275 0.27
276 0.27
277 0.31
278 0.31
279 0.32
280 0.31
281 0.34
282 0.34
283 0.37
284 0.32
285 0.27
286 0.25
287 0.21
288 0.19
289 0.17
290 0.14
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.09
296 0.15
297 0.18
298 0.23
299 0.26
300 0.3
301 0.34
302 0.37
303 0.44
304 0.46
305 0.54
306 0.53
307 0.6
308 0.64
309 0.69
310 0.69
311 0.66
312 0.65
313 0.63
314 0.69
315 0.67
316 0.67
317 0.67
318 0.73
319 0.77
320 0.77
321 0.78
322 0.72
323 0.76
324 0.78
325 0.79
326 0.77
327 0.76
328 0.76
329 0.74
330 0.79
331 0.78
332 0.75
333 0.67
334 0.63
335 0.58
336 0.53
337 0.47
338 0.39
339 0.32
340 0.29
341 0.33
342 0.33
343 0.38
344 0.41
345 0.46
346 0.51
347 0.54
348 0.6
349 0.63
350 0.62
351 0.57
352 0.56
353 0.52
354 0.48
355 0.42
356 0.37
357 0.29
358 0.26
359 0.22
360 0.19
361 0.17