FuNGI

W9XM43

Protein Details

Accession

W9XM43

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-40	GTIPVVRRKKTQSDPFFKGPRKNP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
421-441	RREAEARKKNFRELRKALERR
513-522	GIKKSSSSKS

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MNPGSVPVGGPANRPPGTIPVVRRKKTQSDPFFKGPRKNPAGITGIKQVNGHATPPVNGQPPPKRIPVPNGPRTASLSQPALPDQERVSGFSDPRLTAEGIPYKDYKLVTSKKDLLNGLRYHLLQLAGEKAIDIRNEAEFPKPARLHRRDPRAPPPGQQHQQQQHKEEDAPPEPKDGLNAAEREEVNKRKEARQKEREANLAQIAPSQGSGRKVNFKKKTQQVFRPDFSAEDKRRIQTNYEEKLPWHLEDFDGKHCLIGHHQMGSMGTTVAFVYEPGTDSPRFRLVPVEKVYQFKPKRELAQQMSIEEVEAAMKKRGTDPEWLIRQREARIAEASRELAARQSRGLFSGAAKTETFAGRTGEDADLDFEDDFADDEEGDLFVDKDEDEKFAEKRIKEDQLQANFLDFKDLKEYDEAEERERREAEARKKNFRELRKALERRERNFNHASDSEYESSTDSEEERERLERERIANLKKEEEDADGKKSALPSSGGNTPSGRKEKHAGTASDREGGIKKSSSSKSLKRPGSPNLSEASGTDASTRKKLKSRHVASTQPTPGQSRPMSPANALDASAALKARRRAAGSGAGSDTDTMLSDRDGGAMSDASRTRRLKLKMSVSPPATGTSTPQPSSRGGSPARSPVQQPMSPTAFPSVQDIKNAIPPHGIAIKDLMKVVAHPKDRRADFVALVREVARMDKERGVLMLK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.31
3	0.31
4	0.36
5	0.39
6	0.42
7	0.45
8	0.55
9	0.58
10	0.63
11	0.65
12	0.7
13	0.74
14	0.77
15	0.77
16	0.76
17	0.8
18	0.82
19	0.84
20	0.82
21	0.81
22	0.78
23	0.78
24	0.75
25	0.72
26	0.65
27	0.62
28	0.61
29	0.55
30	0.51
31	0.49
32	0.45
33	0.42
34	0.4
35	0.34
36	0.34
37	0.32
38	0.29
39	0.24
40	0.23
41	0.23
42	0.27
43	0.31
44	0.28
45	0.3
46	0.38
47	0.42
48	0.48
49	0.52
50	0.54
51	0.55
52	0.56
53	0.62
54	0.64
55	0.66
56	0.67
57	0.69
58	0.65
59	0.61
60	0.62
61	0.56
62	0.49
63	0.43
64	0.37
65	0.32
66	0.32
67	0.31
68	0.29
69	0.27
70	0.27
71	0.23
72	0.27
73	0.25
74	0.25
75	0.27
76	0.26
77	0.26
78	0.28
79	0.31
80	0.25
81	0.26
82	0.27
83	0.25
84	0.22
85	0.28
86	0.3
87	0.27
88	0.3
89	0.29
90	0.28
91	0.3
92	0.29
93	0.26
94	0.28
95	0.34
96	0.36
97	0.43
98	0.49
99	0.49
100	0.53
101	0.54
102	0.5
103	0.51
104	0.47
105	0.43
106	0.39
107	0.36
108	0.32
109	0.31
110	0.26
111	0.18
112	0.18
113	0.17
114	0.14
115	0.14
116	0.12
117	0.11
118	0.13
119	0.13
120	0.13
121	0.12
122	0.13
123	0.15
124	0.16
125	0.18
126	0.19
127	0.22
128	0.29
129	0.31
130	0.36
131	0.45
132	0.51
133	0.58
134	0.63
135	0.72
136	0.72
137	0.77
138	0.8
139	0.78
140	0.74
141	0.7
142	0.7
143	0.7
144	0.67
145	0.65
146	0.65
147	0.65
148	0.73
149	0.72
150	0.67
151	0.61
152	0.59
153	0.56
154	0.5
155	0.47
156	0.44
157	0.42
158	0.38
159	0.36
160	0.34
161	0.31
162	0.28
163	0.22
164	0.18
165	0.18
166	0.18
167	0.18
168	0.21
169	0.21
170	0.23
171	0.29
172	0.32
173	0.31
174	0.36
175	0.38
176	0.42
177	0.5
178	0.58
179	0.62
180	0.66
181	0.72
182	0.75
183	0.77
184	0.75
185	0.68
186	0.61
187	0.53
188	0.44
189	0.34
190	0.26
191	0.22
192	0.15
193	0.14
194	0.12
195	0.12
196	0.15
197	0.18
198	0.2
199	0.29
200	0.36
201	0.46
202	0.53
203	0.58
204	0.64
205	0.7
206	0.78
207	0.77
208	0.79
209	0.79
210	0.78
211	0.73
212	0.66
213	0.57
214	0.48
215	0.45
216	0.46
217	0.38
218	0.37
219	0.39
220	0.38
221	0.42
222	0.42
223	0.39
224	0.39
225	0.46
226	0.43
227	0.44
228	0.43
229	0.38
230	0.43
231	0.42
232	0.33
233	0.25
234	0.21
235	0.18
236	0.22
237	0.24
238	0.2
239	0.21
240	0.2
241	0.18
242	0.18
243	0.18
244	0.15
245	0.19
246	0.17
247	0.16
248	0.16
249	0.16
250	0.16
251	0.16
252	0.14
253	0.08
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.07
264	0.1
265	0.11
266	0.12
267	0.14
268	0.18
269	0.18
270	0.17
271	0.24
272	0.23
273	0.3
274	0.33
275	0.37
276	0.34
277	0.37
278	0.38
279	0.41
280	0.41
281	0.38
282	0.4
283	0.38
284	0.41
285	0.44
286	0.51
287	0.45
288	0.51
289	0.48
290	0.42
291	0.39
292	0.34
293	0.28
294	0.19
295	0.14
296	0.06
297	0.07
298	0.07
299	0.08
300	0.08
301	0.09
302	0.12
303	0.15
304	0.16
305	0.21
306	0.24
307	0.3
308	0.37
309	0.39
310	0.37
311	0.36
312	0.37
313	0.33
314	0.33
315	0.27
316	0.21
317	0.22
318	0.22
319	0.2
320	0.19
321	0.18
322	0.14
323	0.13
324	0.11
325	0.12
326	0.12
327	0.12
328	0.12
329	0.13
330	0.12
331	0.13
332	0.14
333	0.11
334	0.1
335	0.14
336	0.13
337	0.13
338	0.13
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.13
343	0.09
344	0.1
345	0.08
346	0.09
347	0.11
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.08
352	0.07
353	0.08
354	0.07
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.04
361	0.03
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.03
368	0.03
369	0.04
370	0.03
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.07
375	0.09
376	0.1
377	0.15
378	0.2
379	0.19
380	0.22
381	0.26
382	0.3
383	0.3
384	0.38
385	0.39
386	0.38
387	0.4
388	0.36
389	0.32
390	0.28
391	0.26
392	0.24
393	0.17
394	0.14
395	0.17
396	0.17
397	0.16
398	0.17
399	0.18
400	0.15
401	0.21
402	0.21
403	0.2
404	0.24
405	0.24
406	0.26
407	0.25
408	0.25
409	0.25
410	0.32
411	0.38
412	0.44
413	0.49
414	0.56
415	0.58
416	0.65
417	0.66
418	0.66
419	0.66
420	0.61
421	0.64
422	0.65
423	0.69
424	0.68
425	0.71
426	0.71
427	0.65
428	0.71
429	0.64
430	0.6
431	0.59
432	0.52
433	0.48
434	0.41
435	0.39
436	0.32
437	0.34
438	0.28
439	0.23
440	0.23
441	0.18
442	0.17
443	0.15
444	0.13
445	0.09
446	0.1
447	0.11
448	0.11
449	0.12
450	0.14
451	0.15
452	0.18
453	0.21
454	0.22
455	0.23
456	0.3
457	0.34
458	0.37
459	0.42
460	0.41
461	0.41
462	0.38
463	0.38
464	0.32
465	0.29
466	0.31
467	0.26
468	0.27
469	0.25
470	0.24
471	0.23
472	0.23
473	0.2
474	0.16
475	0.15
476	0.13
477	0.15
478	0.2
479	0.2
480	0.2
481	0.21
482	0.22
483	0.27
484	0.32
485	0.3
486	0.28
487	0.33
488	0.35
489	0.42
490	0.45
491	0.41
492	0.41
493	0.47
494	0.45
495	0.43
496	0.4
497	0.33
498	0.29
499	0.29
500	0.25
501	0.19
502	0.19
503	0.24
504	0.27
505	0.32
506	0.37
507	0.43
508	0.51
509	0.59
510	0.63
511	0.62
512	0.66
513	0.67
514	0.7
515	0.64
516	0.56
517	0.48
518	0.43
519	0.37
520	0.31
521	0.28
522	0.19
523	0.17
524	0.18
525	0.2
526	0.21
527	0.27
528	0.31
529	0.3
530	0.36
531	0.43
532	0.51
533	0.58
534	0.63
535	0.66
536	0.7
537	0.73
538	0.7
539	0.73
540	0.67
541	0.58
542	0.54
543	0.48
544	0.42
545	0.42
546	0.38
547	0.32
548	0.33
549	0.35
550	0.34
551	0.31
552	0.32
553	0.29
554	0.28
555	0.25
556	0.19
557	0.15
558	0.14
559	0.14
560	0.14
561	0.11
562	0.15
563	0.18
564	0.23
565	0.26
566	0.28
567	0.28
568	0.31
569	0.38
570	0.35
571	0.35
572	0.31
573	0.28
574	0.26
575	0.24
576	0.2
577	0.12
578	0.1
579	0.08
580	0.07
581	0.07
582	0.08
583	0.08
584	0.08
585	0.08
586	0.08
587	0.09
588	0.09
589	0.09
590	0.13
591	0.16
592	0.18
593	0.26
594	0.27
595	0.3
596	0.38
597	0.42
598	0.46
599	0.53
600	0.59
601	0.6
602	0.65
603	0.69
604	0.63
605	0.6
606	0.53
607	0.46
608	0.39
609	0.31
610	0.29
611	0.28
612	0.32
613	0.31
614	0.32
615	0.32
616	0.32
617	0.37
618	0.36
619	0.35
620	0.32
621	0.36
622	0.39
623	0.45
624	0.46
625	0.44
626	0.43
627	0.44
628	0.49
629	0.46
630	0.45
631	0.44
632	0.45
633	0.42
634	0.42
635	0.38
636	0.31
637	0.3
638	0.32
639	0.32
640	0.29
641	0.31
642	0.32
643	0.29
644	0.34
645	0.35
646	0.29
647	0.24
648	0.23
649	0.25
650	0.27
651	0.25
652	0.2
653	0.24
654	0.27
655	0.26
656	0.26
657	0.23
658	0.18
659	0.21
660	0.28
661	0.31
662	0.35
663	0.38
664	0.45
665	0.54
666	0.55
667	0.59
668	0.56
669	0.52
670	0.48
671	0.5
672	0.5
673	0.41
674	0.4
675	0.35
676	0.3
677	0.27
678	0.26
679	0.24
680	0.22
681	0.25
682	0.28
683	0.29
684	0.29

W9XM43

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer