Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9XRB5

Protein Details
Accession W9XRB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
521-540ITRGRSPRGRRGSSKPPEDPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
528-530RGR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11, mito 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001660  SAM  
IPR013761  SAM/pointed_sf  
IPR037635  VTS1_SAM  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0043488  P:regulation of mRNA stability  
Pfam View protein in Pfam  
PF07647  SAM_2  
CDD cd09556  SAM_VTS1_fungal  
Amino Acid Sequences MASNIIGNRNSTPEASKTSLRPPSSRTIGTSGTHTQTVRSSADMSFASPLSARSIRPASEVLYNQQSQQGSLDDSSRLGEQWIQDIEQYETMLEEMAAATLDQDFKDELSAIEQWFRVLSEAERTAATYALIQQTTQMQQRFFAQVLNQMSKSHPISGVLSPANFGEKDAMSSRLNDAMSKLNVDDRRTSLGRPPLSPAGNKRNSGLDQSTIHAMFPDAVAAIQQQKAEYAQQTGNPPPSNRNSTVMGDRSSLIAPTISAPRESKSDVMSWRQGGDHQQPPISRPKSSSGQQQPPAMGHFAQPPLSGGLRSPRPMGGQSGNIQSTTLTATDPVAGDIPLLSPYNVGNQSWASMSNTPMVPNFSQAATHSDMVANATAMKLAALSTVNNRIALDDARKYRRARSIEPQPQSHSAMAPGLTASGIPGINTIMVNDHGQILNAQQVAAIQAQQFAAAQGRRSRPSSPGLSLQTPIGQTSFASPQHNGFLAAYEGAPIMMGAGMAGLIPQLGSLGEGYLSDHSEITRGRSPRGRRGSSKPPEDPTDPSLLQDIPAWLRSLRLHKYTDNLKDLKWDDLVQLDEKGLEARGVNALGARNKMLKVCIWSITFTDTC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.37
4 0.37
5 0.44
6 0.51
7 0.52
8 0.51
9 0.5
10 0.55
11 0.57
12 0.56
13 0.5
14 0.47
15 0.47
16 0.44
17 0.45
18 0.41
19 0.37
20 0.39
21 0.35
22 0.32
23 0.31
24 0.33
25 0.29
26 0.25
27 0.24
28 0.2
29 0.24
30 0.22
31 0.2
32 0.19
33 0.17
34 0.16
35 0.14
36 0.15
37 0.17
38 0.2
39 0.19
40 0.23
41 0.27
42 0.27
43 0.29
44 0.3
45 0.26
46 0.3
47 0.32
48 0.3
49 0.34
50 0.34
51 0.32
52 0.35
53 0.33
54 0.27
55 0.26
56 0.23
57 0.18
58 0.19
59 0.2
60 0.16
61 0.16
62 0.16
63 0.15
64 0.14
65 0.12
66 0.14
67 0.13
68 0.16
69 0.17
70 0.16
71 0.17
72 0.19
73 0.19
74 0.18
75 0.17
76 0.12
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.07
81 0.06
82 0.05
83 0.04
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.05
88 0.07
89 0.06
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.1
97 0.13
98 0.12
99 0.15
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.15
108 0.16
109 0.17
110 0.16
111 0.17
112 0.16
113 0.15
114 0.15
115 0.09
116 0.11
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.14
121 0.17
122 0.21
123 0.26
124 0.26
125 0.22
126 0.23
127 0.27
128 0.28
129 0.25
130 0.23
131 0.18
132 0.22
133 0.27
134 0.29
135 0.27
136 0.25
137 0.26
138 0.29
139 0.3
140 0.25
141 0.21
142 0.19
143 0.21
144 0.21
145 0.25
146 0.2
147 0.19
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.14
152 0.13
153 0.11
154 0.1
155 0.13
156 0.14
157 0.18
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.2
162 0.2
163 0.17
164 0.18
165 0.19
166 0.19
167 0.19
168 0.18
169 0.2
170 0.23
171 0.25
172 0.26
173 0.23
174 0.29
175 0.29
176 0.3
177 0.3
178 0.35
179 0.35
180 0.33
181 0.35
182 0.35
183 0.36
184 0.39
185 0.4
186 0.42
187 0.46
188 0.45
189 0.42
190 0.41
191 0.4
192 0.41
193 0.35
194 0.28
195 0.24
196 0.24
197 0.26
198 0.21
199 0.2
200 0.15
201 0.13
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.16
220 0.19
221 0.21
222 0.26
223 0.26
224 0.26
225 0.28
226 0.32
227 0.35
228 0.34
229 0.34
230 0.32
231 0.32
232 0.36
233 0.33
234 0.29
235 0.24
236 0.22
237 0.2
238 0.17
239 0.15
240 0.1
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.1
245 0.09
246 0.11
247 0.12
248 0.13
249 0.15
250 0.16
251 0.16
252 0.15
253 0.18
254 0.19
255 0.22
256 0.24
257 0.23
258 0.22
259 0.21
260 0.2
261 0.22
262 0.25
263 0.25
264 0.24
265 0.26
266 0.25
267 0.28
268 0.36
269 0.33
270 0.27
271 0.26
272 0.29
273 0.31
274 0.34
275 0.41
276 0.4
277 0.46
278 0.49
279 0.48
280 0.44
281 0.39
282 0.38
283 0.29
284 0.21
285 0.14
286 0.13
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.08
295 0.12
296 0.13
297 0.14
298 0.15
299 0.14
300 0.15
301 0.16
302 0.18
303 0.16
304 0.16
305 0.17
306 0.2
307 0.19
308 0.18
309 0.17
310 0.14
311 0.12
312 0.11
313 0.09
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.1
331 0.11
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.12
338 0.1
339 0.1
340 0.11
341 0.13
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.15
346 0.13
347 0.14
348 0.14
349 0.11
350 0.11
351 0.12
352 0.15
353 0.15
354 0.15
355 0.14
356 0.13
357 0.13
358 0.13
359 0.12
360 0.08
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.04
366 0.03
367 0.03
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.08
372 0.13
373 0.14
374 0.14
375 0.14
376 0.14
377 0.15
378 0.16
379 0.17
380 0.17
381 0.23
382 0.28
383 0.33
384 0.35
385 0.39
386 0.46
387 0.48
388 0.48
389 0.51
390 0.58
391 0.62
392 0.65
393 0.63
394 0.59
395 0.57
396 0.54
397 0.45
398 0.34
399 0.26
400 0.22
401 0.18
402 0.14
403 0.1
404 0.08
405 0.07
406 0.06
407 0.05
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.11
426 0.1
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.1
432 0.1
433 0.07
434 0.08
435 0.08
436 0.09
437 0.09
438 0.08
439 0.12
440 0.12
441 0.15
442 0.21
443 0.26
444 0.3
445 0.32
446 0.34
447 0.33
448 0.39
449 0.4
450 0.37
451 0.39
452 0.4
453 0.39
454 0.38
455 0.35
456 0.31
457 0.26
458 0.23
459 0.16
460 0.12
461 0.11
462 0.13
463 0.17
464 0.17
465 0.2
466 0.2
467 0.21
468 0.24
469 0.24
470 0.22
471 0.17
472 0.15
473 0.13
474 0.13
475 0.11
476 0.09
477 0.08
478 0.07
479 0.07
480 0.05
481 0.04
482 0.04
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.02
490 0.02
491 0.02
492 0.02
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.06
501 0.07
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.12
507 0.13
508 0.17
509 0.23
510 0.24
511 0.29
512 0.37
513 0.44
514 0.51
515 0.61
516 0.63
517 0.63
518 0.7
519 0.76
520 0.78
521 0.8
522 0.76
523 0.72
524 0.71
525 0.67
526 0.63
527 0.57
528 0.54
529 0.45
530 0.39
531 0.36
532 0.29
533 0.26
534 0.23
535 0.22
536 0.17
537 0.18
538 0.19
539 0.16
540 0.19
541 0.23
542 0.29
543 0.33
544 0.36
545 0.39
546 0.4
547 0.48
548 0.54
549 0.57
550 0.58
551 0.53
552 0.48
553 0.53
554 0.52
555 0.48
556 0.41
557 0.34
558 0.28
559 0.29
560 0.31
561 0.25
562 0.24
563 0.2
564 0.18
565 0.17
566 0.16
567 0.13
568 0.12
569 0.1
570 0.1
571 0.13
572 0.13
573 0.13
574 0.14
575 0.18
576 0.2
577 0.22
578 0.24
579 0.25
580 0.26
581 0.28
582 0.28
583 0.27
584 0.3
585 0.31
586 0.34
587 0.32
588 0.33
589 0.32