FuNGI

W9YNM9

Protein Details

Accession

W9YNM9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
436-459	NPGGGKRRGAKGKRGKNGNEKIGL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
437-453	PGGGKRRGAKGKRGKNG

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MFLTLAQQWSNTDKDRSDKNNAQTFHLLYRPQADPALHDENAGERALYPVSGPTSSSQEVGTKKGLHLNDLENELDFESVRENEGEAAQYGVYFDDTSYDYMQHLRDIGEGGGESHFIEAMPVKVQGKGKAKAKTMKLEDALREVSLDDEQSVAGTDMLSTFTTSTKDRTYEKQQNVPDEIAGFQPDMDPRLREVLEALEDDAYVDDSDADDIFGALAKDGRNGELELEEFEENFFDGDDDEGWESDATEKAPTQPSELKLSSTAPMTEGGDRNDHTLDAETASAEDGDWLRDFAKFKRDNARKPPPKAAESIIAASAIQDKTPSLYTLNGTPLRQKKRKGALTNPSSYSMTSSSLARTSGQQLLDARFDKVEQMYALEEADEFDDMDAGMSLASGMTGRSKMSQLSTTSFADVGAVREDFGSMMDGFLGDWNKANPGGGKRRGAKGKRGKNGNEKIGLQQLDEVRAELGPARVYRRPTKT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.44
3	0.49
4	0.55
5	0.58
6	0.63
7	0.67
8	0.65
9	0.64
10	0.6
11	0.56
12	0.51
13	0.48
14	0.4
15	0.34
16	0.38
17	0.34
18	0.31
19	0.32
20	0.27
21	0.25
22	0.31
23	0.35
24	0.29
25	0.28
26	0.26
27	0.24
28	0.26
29	0.23
30	0.16
31	0.1
32	0.12
33	0.12
34	0.11
35	0.09
36	0.1
37	0.13
38	0.13
39	0.14
40	0.14
41	0.2
42	0.21
43	0.21
44	0.2
45	0.23
46	0.24
47	0.27
48	0.3
49	0.26
50	0.26
51	0.32
52	0.31
53	0.29
54	0.31
55	0.31
56	0.3
57	0.31
58	0.29
59	0.23
60	0.23
61	0.2
62	0.17
63	0.13
64	0.1
65	0.1
66	0.1
67	0.1
68	0.1
69	0.1
70	0.11
71	0.11
72	0.12
73	0.1
74	0.1
75	0.09
76	0.08
77	0.08
78	0.07
79	0.07
80	0.06
81	0.06
82	0.07
83	0.09
84	0.11
85	0.11
86	0.12
87	0.12
88	0.14
89	0.15
90	0.14
91	0.14
92	0.12
93	0.12
94	0.13
95	0.12
96	0.1
97	0.09
98	0.09
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.06
103	0.06
104	0.05
105	0.06
106	0.06
107	0.07
108	0.08
109	0.1
110	0.1
111	0.15
112	0.18
113	0.25
114	0.31
115	0.37
116	0.43
117	0.47
118	0.53
119	0.56
120	0.59
121	0.61
122	0.58
123	0.57
124	0.54
125	0.52
126	0.46
127	0.43
128	0.38
129	0.29
130	0.25
131	0.19
132	0.16
133	0.12
134	0.11
135	0.07
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.05
141	0.05
142	0.04
143	0.04
144	0.04
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.07
150	0.09
151	0.1
152	0.13
153	0.14
154	0.17
155	0.2
156	0.25
157	0.35
158	0.42
159	0.47
160	0.51
161	0.52
162	0.54
163	0.54
164	0.48
165	0.38
166	0.29
167	0.25
168	0.18
169	0.15
170	0.1
171	0.07
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.14
179	0.14
180	0.12
181	0.13
182	0.12
183	0.12
184	0.11
185	0.11
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.06
191	0.05
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.04
202	0.04
203	0.03
204	0.05
205	0.05
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.08
214	0.07
215	0.09
216	0.08
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.06
221	0.06
222	0.05
223	0.03
224	0.03
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.05
236	0.06
237	0.06
238	0.09
239	0.12
240	0.13
241	0.15
242	0.19
243	0.2
244	0.25
245	0.26
246	0.24
247	0.21
248	0.22
249	0.2
250	0.17
251	0.15
252	0.1
253	0.1
254	0.11
255	0.12
256	0.13
257	0.13
258	0.14
259	0.14
260	0.15
261	0.15
262	0.13
263	0.11
264	0.11
265	0.1
266	0.08
267	0.08
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.04
273	0.05
274	0.05
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.07
279	0.09
280	0.11
281	0.12
282	0.22
283	0.24
284	0.28
285	0.38
286	0.46
287	0.52
288	0.61
289	0.7
290	0.69
291	0.72
292	0.78
293	0.73
294	0.67
295	0.62
296	0.54
297	0.47
298	0.4
299	0.35
300	0.26
301	0.2
302	0.17
303	0.14
304	0.16
305	0.11
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.1
310	0.11
311	0.12
312	0.09
313	0.1
314	0.12
315	0.14
316	0.2
317	0.21
318	0.21
319	0.28
320	0.36
321	0.44
322	0.5
323	0.53
324	0.56
325	0.63
326	0.72
327	0.72
328	0.73
329	0.74
330	0.75
331	0.76
332	0.69
333	0.62
334	0.53
335	0.45
336	0.38
337	0.28
338	0.23
339	0.18
340	0.17
341	0.15
342	0.15
343	0.16
344	0.14
345	0.15
346	0.17
347	0.2
348	0.19
349	0.21
350	0.22
351	0.24
352	0.28
353	0.27
354	0.24
355	0.2
356	0.2
357	0.2
358	0.18
359	0.17
360	0.12
361	0.12
362	0.12
363	0.12
364	0.12
365	0.1
366	0.09
367	0.08
368	0.08
369	0.07
370	0.06
371	0.05
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.03
383	0.03
384	0.06
385	0.07
386	0.08
387	0.1
388	0.11
389	0.14
390	0.17
391	0.21
392	0.22
393	0.25
394	0.28
395	0.28
396	0.28
397	0.26
398	0.22
399	0.19
400	0.17
401	0.15
402	0.13
403	0.12
404	0.11
405	0.11
406	0.11
407	0.1
408	0.09
409	0.1
410	0.08
411	0.08
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.1
416	0.11
417	0.09
418	0.11
419	0.11
420	0.14
421	0.14
422	0.15
423	0.18
424	0.25
425	0.35
426	0.4
427	0.48
428	0.52
429	0.61
430	0.7
431	0.71
432	0.73
433	0.74
434	0.77
435	0.78
436	0.82
437	0.83
438	0.83
439	0.87
440	0.84
441	0.8
442	0.72
443	0.67
444	0.65
445	0.56
446	0.46
447	0.41
448	0.35
449	0.33
450	0.31
451	0.27
452	0.2
453	0.19
454	0.19
455	0.16
456	0.16
457	0.16
458	0.19
459	0.24
460	0.28
461	0.35

W9YNM9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer