FuNGI

W9YX29

Protein Details

Accession

W9YX29

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-38	STTGPKPKPRAGVVRKTKAERE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-87	PAGAKPSTTGPKPKPRAGVVRKTKAEREQFAKEEAERQKARLAEEAKNERTRGGARGGRGGAGARGGRGGASAAGPR
291-303	RKRNLKKPRSLSG

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPDAPAATPKPAGAKPSTTGPKPKPRAGVVRKTKAEREQFAKEEAERQKARLAEEAKNERTRGGARGGRGGAGARGGRGGASAAGPRDDRARDGPMGVGGGVFGAGSGLKPGGRPRGMLAEGHSEVLDGQAALKFDESGGGELAGSSGGGGGGGRGAAAGSRKAGDTYEIPSDDDPDEPKRDIERIWISSEEEEEEDQGPVSSKGKQRATPRTFKASLALRPVRAPRMRREDEEENANTVSGKKRGTLKKNEESVDAHELPEDGDAMDVDVDVGVDDPVFVKEQPSSPEMRKRNLKKPRSLSGRARDLKLAAETIEERAERLRVSDDTHKLRNLFTGHQAGKPDPTSQDADESEEDSGIEDGKLFLFQLPPLTPFLLDEESMNHEPAVKAEPNADTTVPPSGITVSIPSAVKKDPETDAVADPSLPHLLMDGMLTASEPTRLPSGLVGKLRLHKSGKVSLDWGGTDIEVQYGSEVDFLQDVVMVSPGVKAEGQGQENGDADEAGATNKGKVPGTAYALGHVRKKLVLIPDWAKLYD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.32
3	0.41
4	0.48
5	0.47
6	0.55
7	0.59
8	0.66
9	0.7
10	0.74
11	0.72
12	0.72
13	0.77
14	0.77
15	0.79
16	0.78
17	0.81
18	0.82
19	0.8
20	0.8
21	0.78
22	0.77
23	0.74
24	0.7
25	0.68
26	0.64
27	0.61
28	0.58
29	0.5
30	0.5
31	0.48
32	0.51
33	0.44
34	0.43
35	0.44
36	0.43
37	0.44
38	0.42
39	0.41
40	0.38
41	0.46
42	0.54
43	0.56
44	0.58
45	0.57
46	0.49
47	0.48
48	0.44
49	0.38
50	0.38
51	0.34
52	0.31
53	0.38
54	0.38
55	0.34
56	0.32
57	0.29
58	0.21
59	0.22
60	0.2
61	0.13
62	0.13
63	0.13
64	0.12
65	0.11
66	0.11
67	0.07
68	0.08
69	0.1
70	0.11
71	0.13
72	0.14
73	0.15
74	0.19
75	0.2
76	0.22
77	0.23
78	0.26
79	0.25
80	0.25
81	0.25
82	0.21
83	0.2
84	0.17
85	0.13
86	0.08
87	0.06
88	0.05
89	0.04
90	0.03
91	0.03
92	0.03
93	0.03
94	0.04
95	0.05
96	0.05
97	0.07
98	0.11
99	0.2
100	0.21
101	0.22
102	0.23
103	0.29
104	0.3
105	0.3
106	0.28
107	0.27
108	0.27
109	0.27
110	0.24
111	0.17
112	0.16
113	0.15
114	0.12
115	0.05
116	0.05
117	0.06
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.09
124	0.09
125	0.08
126	0.08
127	0.08
128	0.08
129	0.07
130	0.08
131	0.05
132	0.04
133	0.03
134	0.03
135	0.02
136	0.03
137	0.03
138	0.02
139	0.03
140	0.03
141	0.02
142	0.02
143	0.02
144	0.04
145	0.05
146	0.06
147	0.07
148	0.08
149	0.08
150	0.09
151	0.09
152	0.11
153	0.11
154	0.13
155	0.16
156	0.16
157	0.17
158	0.17
159	0.19
160	0.17
161	0.17
162	0.17
163	0.17
164	0.19
165	0.19
166	0.2
167	0.2
168	0.2
169	0.2
170	0.24
171	0.26
172	0.25
173	0.27
174	0.26
175	0.26
176	0.25
177	0.25
178	0.19
179	0.14
180	0.12
181	0.11
182	0.1
183	0.09
184	0.09
185	0.08
186	0.08
187	0.08
188	0.09
189	0.13
190	0.17
191	0.24
192	0.28
193	0.34
194	0.41
195	0.52
196	0.57
197	0.61
198	0.61
199	0.62
200	0.59
201	0.54
202	0.51
203	0.44
204	0.41
205	0.41
206	0.39
207	0.32
208	0.33
209	0.36
210	0.38
211	0.39
212	0.39
213	0.38
214	0.46
215	0.48
216	0.48
217	0.52
218	0.49
219	0.47
220	0.49
221	0.41
222	0.33
223	0.3
224	0.27
225	0.2
226	0.17
227	0.17
228	0.14
229	0.13
230	0.14
231	0.23
232	0.31
233	0.39
234	0.48
235	0.54
236	0.59
237	0.64
238	0.63
239	0.56
240	0.5
241	0.45
242	0.42
243	0.33
244	0.25
245	0.19
246	0.18
247	0.16
248	0.14
249	0.11
250	0.04
251	0.04
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.02
258	0.02
259	0.02
260	0.02
261	0.02
262	0.02
263	0.02
264	0.03
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.05
269	0.06
270	0.08
271	0.11
272	0.12
273	0.15
274	0.18
275	0.27
276	0.3
277	0.36
278	0.43
279	0.48
280	0.57
281	0.64
282	0.68
283	0.68
284	0.72
285	0.75
286	0.74
287	0.75
288	0.73
289	0.71
290	0.74
291	0.68
292	0.62
293	0.54
294	0.46
295	0.39
296	0.31
297	0.23
298	0.13
299	0.11
300	0.1
301	0.1
302	0.11
303	0.1
304	0.09
305	0.1
306	0.11
307	0.09
308	0.1
309	0.11
310	0.1
311	0.14
312	0.21
313	0.27
314	0.31
315	0.34
316	0.36
317	0.34
318	0.33
319	0.34
320	0.29
321	0.25
322	0.24
323	0.29
324	0.28
325	0.3
326	0.31
327	0.28
328	0.28
329	0.27
330	0.25
331	0.18
332	0.2
333	0.2
334	0.19
335	0.22
336	0.19
337	0.21
338	0.19
339	0.19
340	0.16
341	0.13
342	0.13
343	0.1
344	0.09
345	0.06
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.1
356	0.1
357	0.12
358	0.13
359	0.14
360	0.13
361	0.12
362	0.15
363	0.13
364	0.13
365	0.11
366	0.12
367	0.17
368	0.18
369	0.18
370	0.15
371	0.15
372	0.15
373	0.16
374	0.19
375	0.14
376	0.13
377	0.15
378	0.17
379	0.18
380	0.2
381	0.19
382	0.14
383	0.15
384	0.17
385	0.15
386	0.13
387	0.11
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.1
392	0.09
393	0.11
394	0.12
395	0.12
396	0.14
397	0.15
398	0.17
399	0.17
400	0.2
401	0.19
402	0.22
403	0.24
404	0.24
405	0.25
406	0.24
407	0.23
408	0.2
409	0.18
410	0.16
411	0.14
412	0.11
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.1
428	0.1
429	0.11
430	0.14
431	0.19
432	0.23
433	0.26
434	0.28
435	0.3
436	0.38
437	0.4
438	0.43
439	0.41
440	0.4
441	0.43
442	0.48
443	0.47
444	0.42
445	0.41
446	0.38
447	0.37
448	0.32
449	0.28
450	0.2
451	0.16
452	0.15
453	0.12
454	0.1
455	0.08
456	0.07
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.06
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.13
478	0.19
479	0.21
480	0.23
481	0.24
482	0.25
483	0.25
484	0.25
485	0.2
486	0.13
487	0.12
488	0.1
489	0.09
490	0.08
491	0.1
492	0.1
493	0.11
494	0.15
495	0.18
496	0.18
497	0.19
498	0.22
499	0.25
500	0.3
501	0.34
502	0.31
503	0.32
504	0.36
505	0.4
506	0.4
507	0.37
508	0.33
509	0.29
510	0.3
511	0.31
512	0.33
513	0.34
514	0.38
515	0.4
516	0.44

W9YX29

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer