Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9YDX1

Protein Details
Accession W9YDX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
216-238QDERPDQRSYRQRSPPRGRHGPGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-265DRRGPPPRGWSPRGYRERSPGRR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 10, cyto_nucl 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MADVSSTRLYLGNLPRNSMHTPQSSVPVWVIPVSTNCTSGGSIPLETWTRCIDFPGCAITKQDIQDHFGTHGTGSIKEIKLMNGFGFIEYEDPMDARDVVPDGTEFKGERLTVQFARGPRRKDEFNGPSDRNIPRPRRTIYRMQVTGLQPDTSWQDLKDFARNSGQLDVVYSETGRERDGKGFVEFETAADLKTAVEKLDGQTFKDAVVHCIADIQDERPDQRSYRQRSPPRGRHGPGDDYHDRRGPPPRGWSPRGYRERSPGRRPPTDDYYDRSYDRGYARRTPPRDYPPPPPRRYDADPYDSRGLPPPPPVRGYPDPYARNGDPYVRPRSPPRGYGYGGGYGGGYDDRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.44
4 0.47
5 0.44
6 0.41
7 0.35
8 0.39
9 0.38
10 0.42
11 0.38
12 0.35
13 0.32
14 0.26
15 0.23
16 0.19
17 0.18
18 0.14
19 0.15
20 0.19
21 0.19
22 0.19
23 0.19
24 0.2
25 0.2
26 0.19
27 0.21
28 0.17
29 0.16
30 0.15
31 0.18
32 0.2
33 0.2
34 0.21
35 0.19
36 0.2
37 0.19
38 0.22
39 0.2
40 0.18
41 0.19
42 0.24
43 0.22
44 0.21
45 0.23
46 0.23
47 0.26
48 0.27
49 0.31
50 0.26
51 0.29
52 0.3
53 0.29
54 0.28
55 0.24
56 0.23
57 0.16
58 0.19
59 0.16
60 0.14
61 0.15
62 0.21
63 0.2
64 0.22
65 0.23
66 0.21
67 0.22
68 0.23
69 0.2
70 0.16
71 0.16
72 0.14
73 0.13
74 0.11
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.14
98 0.18
99 0.18
100 0.2
101 0.22
102 0.23
103 0.33
104 0.37
105 0.38
106 0.39
107 0.43
108 0.43
109 0.44
110 0.51
111 0.47
112 0.49
113 0.53
114 0.49
115 0.46
116 0.49
117 0.46
118 0.44
119 0.46
120 0.47
121 0.46
122 0.51
123 0.52
124 0.55
125 0.59
126 0.61
127 0.6
128 0.62
129 0.56
130 0.51
131 0.54
132 0.46
133 0.45
134 0.35
135 0.28
136 0.18
137 0.18
138 0.19
139 0.14
140 0.14
141 0.1
142 0.1
143 0.13
144 0.15
145 0.2
146 0.18
147 0.18
148 0.21
149 0.22
150 0.22
151 0.2
152 0.19
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.09
157 0.09
158 0.07
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.11
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.11
174 0.12
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.18
193 0.18
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.12
204 0.13
205 0.14
206 0.16
207 0.18
208 0.17
209 0.25
210 0.33
211 0.38
212 0.47
213 0.56
214 0.61
215 0.7
216 0.8
217 0.81
218 0.81
219 0.83
220 0.75
221 0.73
222 0.7
223 0.65
224 0.56
225 0.55
226 0.52
227 0.47
228 0.48
229 0.44
230 0.39
231 0.37
232 0.44
233 0.41
234 0.39
235 0.44
236 0.51
237 0.56
238 0.59
239 0.63
240 0.62
241 0.67
242 0.72
243 0.68
244 0.63
245 0.64
246 0.71
247 0.72
248 0.74
249 0.72
250 0.71
251 0.73
252 0.74
253 0.72
254 0.68
255 0.66
256 0.6
257 0.56
258 0.55
259 0.51
260 0.47
261 0.41
262 0.33
263 0.32
264 0.34
265 0.36
266 0.35
267 0.4
268 0.48
269 0.57
270 0.6
271 0.61
272 0.64
273 0.66
274 0.71
275 0.67
276 0.69
277 0.71
278 0.77
279 0.76
280 0.72
281 0.68
282 0.66
283 0.67
284 0.66
285 0.63
286 0.61
287 0.6
288 0.6
289 0.61
290 0.54
291 0.48
292 0.44
293 0.39
294 0.34
295 0.4
296 0.39
297 0.38
298 0.41
299 0.42
300 0.45
301 0.49
302 0.52
303 0.51
304 0.54
305 0.53
306 0.53
307 0.58
308 0.5
309 0.48
310 0.44
311 0.43
312 0.42
313 0.46
314 0.51
315 0.48
316 0.52
317 0.55
318 0.63
319 0.62
320 0.61
321 0.61
322 0.59
323 0.58
324 0.58
325 0.53
326 0.48
327 0.42
328 0.35
329 0.27
330 0.2
331 0.19
332 0.16