Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9XYP6

Protein Details
Accession W9XYP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPKNKKAKTKHYFSKNSSELHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12, cyto 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
IPR010304  SMN_Tudor  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0097504  C:Gemini of coiled bodies  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06003  SMN  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MPKNKKAKTKHYFSKNSSELSQAEIWDDSALIRSWNDAVAEYEFYHSIHARGEDVEEILRKAEMDELAEAGGPVDAESTNGQDDETTNATKNMKHTKAQPEAVTEEEPNEDAEIEDGEIDDDDHDLHLDLQTAKEALTRQVQGAAVEPEPSPSDLLADTRNETTENQTPLPTSASQPPPSSSMNNHPMIGPSLPPASVQGPSPDQTLENIKMAYYWAGYYSGLYDGQRQGQGQGQTTPSQTDQPQPQQPGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.78
3 0.72
4 0.63
5 0.57
6 0.47
7 0.42
8 0.38
9 0.27
10 0.25
11 0.21
12 0.19
13 0.15
14 0.15
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.11
23 0.11
24 0.1
25 0.12
26 0.13
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.14
31 0.14
32 0.15
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.12
39 0.14
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.09
48 0.09
49 0.11
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.06
58 0.06
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.05
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.09
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.14
76 0.15
77 0.16
78 0.22
79 0.28
80 0.29
81 0.31
82 0.37
83 0.44
84 0.5
85 0.52
86 0.47
87 0.41
88 0.39
89 0.39
90 0.33
91 0.24
92 0.18
93 0.14
94 0.14
95 0.11
96 0.09
97 0.07
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.09
139 0.07
140 0.08
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.16
151 0.2
152 0.22
153 0.21
154 0.21
155 0.21
156 0.21
157 0.23
158 0.19
159 0.16
160 0.21
161 0.26
162 0.28
163 0.29
164 0.3
165 0.31
166 0.32
167 0.32
168 0.28
169 0.31
170 0.35
171 0.36
172 0.34
173 0.31
174 0.3
175 0.3
176 0.27
177 0.19
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.15
187 0.17
188 0.18
189 0.19
190 0.17
191 0.16
192 0.18
193 0.23
194 0.21
195 0.21
196 0.2
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.17
201 0.12
202 0.1
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.16
212 0.17
213 0.21
214 0.24
215 0.23
216 0.23
217 0.27
218 0.3
219 0.28
220 0.3
221 0.29
222 0.29
223 0.3
224 0.31
225 0.27
226 0.29
227 0.29
228 0.33
229 0.39
230 0.45
231 0.52