Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

J3KBD7

Protein Details
Accession J3KBD7    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-48PTPTPIRRPQTKPTTYPKTTHydrophilic
343-365FSHSKDPRRLNNKGKKRKAPETABasic
562-586PSASGAGHKPRKRRKGRMGDVTYLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
349-361PRRLNNKGKKRKA
567-578AGHKPRKRRKGR
678-688SARRRMLKGKH
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 10.833, nucl 6.5, cyto_nucl 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
KEGG cim:CIMG_03448  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MASVRPTRLPPPSRAGVRPVERLASLKNPTPTPIRRPQTKPTTYPKTTTCPNPGCPAPNIVEDDGQKVCSGCGTVISEANIVSEITFGESSSGAAVVQGTFIGADQSHGRSTGPGFQRGGGVESREITEQNGNRYIAQLSRALNIPESASKAAGQVFKLAVGLNFIQGRRTKTVAAICLYVACRRQDGNTIMLIDFADVLMINVFKLGRTYKALLDELRLGGNIFIMNPIDPESLIYRFAKQLEFGSSMMQVASEAVRIVQRMNRDWMITGRRPAGICGAALILAARMNNFRRTVREVVYVVKVTELTIHQRLNEFKATESGDLTVDQFRSVDLETSHDPPSFSHSKDPRRLNNKGKKRKAPETAAEIEDGEEPDQSPPASKRPRRVDADGFAVPDIPIDPAILGLEMQDPLSSTDGNATAESNSGVAGVVEKSTNQRKGSKRARLPEPTEAELASESALEDEMTALLSSGSSLVASAEAPRTASASSSKGQIVPDKRPNKPVPDSEEIDPTEFDSDPEVRYCLLSPAEVEIKERIWVHENKDYLRAQQAKALKRALTAADPSASGAGHKPRKRRKGRMGDVTYLTGEGGDGDRASSRASTPAEATRLMLERRGFSKKINYSLLEKMYEDDDIEVKRRDSEAESARSRSRSQSVARSVRSSSVASDRGFGGLGSIRPSARRRMLKGKHAAGVAARASATPEPSRRPVPTLSATRITPAPPSQTEPEPEPEPEPEPAQPANPNEEILGYIPEAEPRAHPVPGDEDDYDEDEDEDEDEDDDDDRIEAAFAGNYYDEGSDGGYDDDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.6
3 0.6
4 0.6
5 0.61
6 0.56
7 0.5
8 0.45
9 0.44
10 0.42
11 0.4
12 0.39
13 0.38
14 0.41
15 0.39
16 0.42
17 0.49
18 0.51
19 0.52
20 0.57
21 0.6
22 0.65
23 0.7
24 0.77
25 0.79
26 0.8
27 0.79
28 0.79
29 0.81
30 0.76
31 0.75
32 0.7
33 0.66
34 0.65
35 0.65
36 0.65
37 0.61
38 0.6
39 0.61
40 0.6
41 0.58
42 0.53
43 0.49
44 0.42
45 0.4
46 0.4
47 0.34
48 0.34
49 0.31
50 0.32
51 0.28
52 0.25
53 0.22
54 0.18
55 0.16
56 0.13
57 0.13
58 0.09
59 0.12
60 0.14
61 0.15
62 0.17
63 0.18
64 0.17
65 0.16
66 0.17
67 0.13
68 0.1
69 0.09
70 0.07
71 0.06
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.05
89 0.06
90 0.05
91 0.07
92 0.09
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.14
98 0.16
99 0.23
100 0.25
101 0.28
102 0.29
103 0.29
104 0.31
105 0.3
106 0.31
107 0.24
108 0.22
109 0.18
110 0.18
111 0.19
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.23
116 0.23
117 0.27
118 0.31
119 0.3
120 0.29
121 0.3
122 0.3
123 0.24
124 0.24
125 0.23
126 0.19
127 0.2
128 0.22
129 0.22
130 0.21
131 0.2
132 0.19
133 0.17
134 0.19
135 0.18
136 0.16
137 0.15
138 0.16
139 0.19
140 0.2
141 0.18
142 0.18
143 0.17
144 0.16
145 0.17
146 0.16
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.15
152 0.15
153 0.19
154 0.22
155 0.27
156 0.27
157 0.29
158 0.27
159 0.29
160 0.34
161 0.34
162 0.32
163 0.28
164 0.25
165 0.25
166 0.25
167 0.24
168 0.23
169 0.19
170 0.2
171 0.2
172 0.21
173 0.26
174 0.27
175 0.26
176 0.25
177 0.25
178 0.23
179 0.23
180 0.21
181 0.14
182 0.11
183 0.08
184 0.06
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.07
194 0.09
195 0.11
196 0.15
197 0.18
198 0.19
199 0.23
200 0.26
201 0.24
202 0.25
203 0.25
204 0.21
205 0.19
206 0.17
207 0.13
208 0.11
209 0.11
210 0.08
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.11
221 0.11
222 0.14
223 0.15
224 0.14
225 0.16
226 0.18
227 0.17
228 0.16
229 0.17
230 0.18
231 0.19
232 0.18
233 0.17
234 0.16
235 0.15
236 0.14
237 0.12
238 0.08
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.08
247 0.1
248 0.13
249 0.16
250 0.21
251 0.21
252 0.21
253 0.22
254 0.26
255 0.31
256 0.3
257 0.31
258 0.28
259 0.3
260 0.29
261 0.29
262 0.27
263 0.2
264 0.16
265 0.13
266 0.11
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.08
275 0.11
276 0.14
277 0.17
278 0.18
279 0.22
280 0.27
281 0.31
282 0.3
283 0.32
284 0.3
285 0.3
286 0.32
287 0.29
288 0.23
289 0.19
290 0.17
291 0.12
292 0.13
293 0.11
294 0.13
295 0.16
296 0.17
297 0.17
298 0.2
299 0.22
300 0.23
301 0.25
302 0.21
303 0.18
304 0.21
305 0.21
306 0.19
307 0.18
308 0.15
309 0.12
310 0.12
311 0.13
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.09
318 0.08
319 0.09
320 0.07
321 0.1
322 0.12
323 0.15
324 0.17
325 0.16
326 0.16
327 0.15
328 0.21
329 0.21
330 0.21
331 0.26
332 0.32
333 0.4
334 0.48
335 0.55
336 0.57
337 0.62
338 0.69
339 0.71
340 0.74
341 0.77
342 0.8
343 0.82
344 0.82
345 0.82
346 0.82
347 0.8
348 0.76
349 0.69
350 0.65
351 0.59
352 0.51
353 0.43
354 0.34
355 0.27
356 0.21
357 0.17
358 0.1
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.06
364 0.07
365 0.08
366 0.17
367 0.26
368 0.29
369 0.38
370 0.46
371 0.53
372 0.57
373 0.61
374 0.57
375 0.5
376 0.52
377 0.43
378 0.36
379 0.28
380 0.23
381 0.18
382 0.13
383 0.1
384 0.05
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.04
390 0.04
391 0.03
392 0.03
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.05
412 0.04
413 0.04
414 0.03
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.05
420 0.09
421 0.15
422 0.2
423 0.22
424 0.29
425 0.34
426 0.44
427 0.53
428 0.59
429 0.6
430 0.63
431 0.69
432 0.69
433 0.68
434 0.66
435 0.6
436 0.53
437 0.47
438 0.39
439 0.31
440 0.23
441 0.19
442 0.11
443 0.07
444 0.05
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.04
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.07
471 0.08
472 0.09
473 0.11
474 0.12
475 0.14
476 0.14
477 0.15
478 0.16
479 0.22
480 0.24
481 0.3
482 0.39
483 0.44
484 0.45
485 0.53
486 0.55
487 0.56
488 0.58
489 0.55
490 0.53
491 0.52
492 0.52
493 0.45
494 0.46
495 0.39
496 0.34
497 0.28
498 0.22
499 0.18
500 0.14
501 0.13
502 0.11
503 0.11
504 0.11
505 0.12
506 0.12
507 0.1
508 0.11
509 0.11
510 0.11
511 0.1
512 0.09
513 0.09
514 0.11
515 0.14
516 0.13
517 0.15
518 0.13
519 0.13
520 0.16
521 0.16
522 0.15
523 0.18
524 0.22
525 0.25
526 0.29
527 0.31
528 0.29
529 0.35
530 0.34
531 0.3
532 0.35
533 0.34
534 0.29
535 0.33
536 0.39
537 0.38
538 0.42
539 0.43
540 0.36
541 0.32
542 0.34
543 0.3
544 0.25
545 0.22
546 0.18
547 0.15
548 0.15
549 0.14
550 0.13
551 0.11
552 0.09
553 0.11
554 0.18
555 0.26
556 0.31
557 0.4
558 0.5
559 0.61
560 0.71
561 0.79
562 0.81
563 0.84
564 0.89
565 0.9
566 0.86
567 0.81
568 0.73
569 0.64
570 0.53
571 0.42
572 0.32
573 0.2
574 0.14
575 0.09
576 0.07
577 0.06
578 0.05
579 0.05
580 0.06
581 0.07
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.12
586 0.14
587 0.14
588 0.17
589 0.2
590 0.21
591 0.21
592 0.21
593 0.19
594 0.21
595 0.21
596 0.23
597 0.21
598 0.22
599 0.26
600 0.31
601 0.3
602 0.3
603 0.39
604 0.4
605 0.45
606 0.47
607 0.45
608 0.44
609 0.48
610 0.48
611 0.4
612 0.34
613 0.29
614 0.25
615 0.23
616 0.19
617 0.14
618 0.14
619 0.13
620 0.17
621 0.18
622 0.17
623 0.19
624 0.19
625 0.2
626 0.2
627 0.27
628 0.3
629 0.36
630 0.39
631 0.41
632 0.45
633 0.45
634 0.44
635 0.42
636 0.38
637 0.37
638 0.39
639 0.44
640 0.5
641 0.55
642 0.56
643 0.54
644 0.52
645 0.48
646 0.46
647 0.37
648 0.3
649 0.28
650 0.3
651 0.27
652 0.28
653 0.25
654 0.23
655 0.22
656 0.18
657 0.14
658 0.12
659 0.12
660 0.14
661 0.15
662 0.15
663 0.21
664 0.24
665 0.3
666 0.37
667 0.43
668 0.48
669 0.57
670 0.65
671 0.69
672 0.76
673 0.73
674 0.69
675 0.61
676 0.56
677 0.46
678 0.43
679 0.33
680 0.24
681 0.19
682 0.14
683 0.17
684 0.16
685 0.19
686 0.2
687 0.24
688 0.29
689 0.34
690 0.39
691 0.39
692 0.42
693 0.41
694 0.42
695 0.46
696 0.47
697 0.48
698 0.47
699 0.45
700 0.43
701 0.42
702 0.36
703 0.33
704 0.3
705 0.3
706 0.28
707 0.34
708 0.35
709 0.38
710 0.4
711 0.39
712 0.41
713 0.38
714 0.37
715 0.35
716 0.33
717 0.32
718 0.31
719 0.3
720 0.26
721 0.27
722 0.26
723 0.27
724 0.29
725 0.29
726 0.33
727 0.31
728 0.3
729 0.26
730 0.25
731 0.23
732 0.18
733 0.17
734 0.11
735 0.11
736 0.11
737 0.13
738 0.14
739 0.14
740 0.14
741 0.19
742 0.22
743 0.21
744 0.21
745 0.22
746 0.26
747 0.28
748 0.32
749 0.25
750 0.25
751 0.26
752 0.29
753 0.27
754 0.22
755 0.19
756 0.15
757 0.15
758 0.13
759 0.11
760 0.09
761 0.09
762 0.09
763 0.09
764 0.09
765 0.09
766 0.09
767 0.08
768 0.08
769 0.07
770 0.07
771 0.07
772 0.07
773 0.08
774 0.07
775 0.09
776 0.09
777 0.09
778 0.1
779 0.1
780 0.09
781 0.08
782 0.09
783 0.08
784 0.08