Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9YLW4

Protein Details
Accession W9YLW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-50NDTPSQKTAWPRWQKRGKEKSSLALHydrophilic
133-152ASSLGIKKKKPKVRFAEQAWHydrophilic
445-465LSNSSKSTMRSKPKHKPASFGHydrophilic
477-499TRSTSNGSRRKHKHESAHSSSVNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-144KKKKPK
Subcellular Location(s) plas 23, mito 1, cyto 1, E.R. 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016439  Lag1/Lac1-like  
IPR006634  TLC-dom  
IPR013599  TRAM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0050291  F:sphingosine N-acyltransferase activity  
GO:0046513  P:ceramide biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF08390  TRAM1  
PF03798  TRAM_LAG1_CLN8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50922  TLC  
Amino Acid Sequences MDGRNLADQEKLERISQPATNRRPHNDTPSQKTAWPRWQKRGKEKSSLALAGTWIVDHQISISLNLISMLFFIHTFFPPARHHTQKFFRISYYNPATGTFALGWDDIFFVFYWIVVFSGLRCAVMDYLLGPLASSLGIKKKKPKVRFAEQAWLLLYYSISWSVGMYTMYTSDYWLDVRALWRNWPIREMEGLAKWYYLVQFGFYLQQIVVVNIEERRKDYMQMFVHHIITCCLIFTSYGYHQYRVGTLILSLMDIVDVILPTAKILKYLHFNTACDVAFGVFMVTWFVTRHVLYTWVLYSIYAHIPQEIRYGCYQGSVLDLKGPSPTPNDWSHLIQPFRDPVGLVCWNNSIKWAFLLSLVALQVVLLIWFAAIIRVAYRVLTGQGADDVRSDDEDDEEEDISTERMHLAGPENKGSNYIDTVQLCVEPQSHHETEVLSTDANFSLSNSSKSTMRSKPKHKPASFGSAPERSAGSDITRSTSNGSRRKHKHESAHSSSVNLLAASSDRKELLGRIGCDKGTASE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.31
3 0.34
4 0.39
5 0.44
6 0.5
7 0.57
8 0.62
9 0.66
10 0.7
11 0.72
12 0.72
13 0.73
14 0.73
15 0.74
16 0.74
17 0.69
18 0.65
19 0.67
20 0.66
21 0.66
22 0.68
23 0.68
24 0.71
25 0.78
26 0.84
27 0.87
28 0.89
29 0.86
30 0.85
31 0.81
32 0.78
33 0.76
34 0.68
35 0.58
36 0.48
37 0.4
38 0.31
39 0.27
40 0.19
41 0.11
42 0.1
43 0.09
44 0.07
45 0.07
46 0.09
47 0.1
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.11
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.09
61 0.1
62 0.12
63 0.13
64 0.17
65 0.21
66 0.28
67 0.35
68 0.42
69 0.45
70 0.52
71 0.61
72 0.65
73 0.68
74 0.63
75 0.58
76 0.53
77 0.52
78 0.53
79 0.5
80 0.43
81 0.36
82 0.35
83 0.34
84 0.31
85 0.3
86 0.2
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.09
93 0.07
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.06
114 0.07
115 0.08
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.15
124 0.2
125 0.24
126 0.34
127 0.43
128 0.53
129 0.6
130 0.68
131 0.69
132 0.74
133 0.8
134 0.76
135 0.77
136 0.69
137 0.63
138 0.53
139 0.44
140 0.34
141 0.25
142 0.19
143 0.09
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.11
165 0.16
166 0.16
167 0.18
168 0.24
169 0.28
170 0.28
171 0.29
172 0.29
173 0.25
174 0.26
175 0.25
176 0.22
177 0.19
178 0.2
179 0.18
180 0.16
181 0.14
182 0.14
183 0.12
184 0.1
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.1
190 0.09
191 0.1
192 0.08
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.09
199 0.11
200 0.13
201 0.11
202 0.12
203 0.16
204 0.16
205 0.19
206 0.19
207 0.25
208 0.26
209 0.28
210 0.31
211 0.29
212 0.3
213 0.28
214 0.27
215 0.2
216 0.17
217 0.15
218 0.1
219 0.08
220 0.06
221 0.05
222 0.06
223 0.09
224 0.09
225 0.18
226 0.19
227 0.2
228 0.2
229 0.21
230 0.21
231 0.19
232 0.18
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.04
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.02
245 0.02
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.09
254 0.14
255 0.16
256 0.23
257 0.22
258 0.23
259 0.22
260 0.25
261 0.23
262 0.17
263 0.16
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.09
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.16
295 0.14
296 0.15
297 0.15
298 0.16
299 0.14
300 0.15
301 0.14
302 0.09
303 0.12
304 0.11
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.11
312 0.14
313 0.15
314 0.17
315 0.19
316 0.22
317 0.23
318 0.25
319 0.28
320 0.31
321 0.31
322 0.27
323 0.27
324 0.26
325 0.24
326 0.22
327 0.17
328 0.12
329 0.17
330 0.21
331 0.19
332 0.18
333 0.2
334 0.21
335 0.21
336 0.23
337 0.17
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.04
352 0.04
353 0.03
354 0.02
355 0.02
356 0.02
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.12
379 0.09
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.13
396 0.18
397 0.2
398 0.24
399 0.25
400 0.25
401 0.28
402 0.27
403 0.23
404 0.2
405 0.19
406 0.2
407 0.19
408 0.2
409 0.18
410 0.18
411 0.16
412 0.15
413 0.15
414 0.11
415 0.14
416 0.21
417 0.21
418 0.22
419 0.22
420 0.22
421 0.21
422 0.22
423 0.2
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.1
430 0.09
431 0.14
432 0.16
433 0.18
434 0.18
435 0.2
436 0.22
437 0.26
438 0.34
439 0.37
440 0.46
441 0.53
442 0.62
443 0.71
444 0.79
445 0.87
446 0.81
447 0.8
448 0.75
449 0.76
450 0.69
451 0.64
452 0.6
453 0.54
454 0.52
455 0.45
456 0.39
457 0.3
458 0.28
459 0.23
460 0.19
461 0.19
462 0.19
463 0.21
464 0.21
465 0.21
466 0.24
467 0.29
468 0.36
469 0.4
470 0.46
471 0.54
472 0.61
473 0.7
474 0.76
475 0.78
476 0.8
477 0.83
478 0.86
479 0.84
480 0.85
481 0.76
482 0.66
483 0.58
484 0.5
485 0.39
486 0.29
487 0.2
488 0.11
489 0.13
490 0.15
491 0.16
492 0.16
493 0.15
494 0.16
495 0.18
496 0.19
497 0.26
498 0.3
499 0.31
500 0.34
501 0.37
502 0.36
503 0.36