FuNGI

W9YDD3

Protein Details

Accession

W9YDD3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-123	GVAPRAKMNQQRARRFRAAR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
414-449	KRRKEMSDRRERNERRREQEKEAREAARNPKRRRSS

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto 9, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLTKKYPKIISPVIEEQPYEIDGVVYPVDTTKPNPNGEELHNLYLDFNGIVHPCSHPENKPPPANESEMMMEIFKYTDRVVNMVRPRRLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRAARDAKEADEKKAEFQTLLRQQTGNRDEEDDDDSTVEDVIKKTWDSNVITPGTPFMFILAQSIRYWVQWKLNTDPAWAELKVIISDASVPGEGEHKIMQFIRSQRSDPEYDPNTRHVMYGLDADLIMLGIATHEPHFRVLREDVFTRDAKAKTCKLCGQQGHYAENCRGNAKAKSGEFDEKGTTEELKPFVWLNVPILREYLGAEMLVPGQPFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIHEDGIDKLIAIWRDNLPLMGGYVTCDGNVDLARAQIILQGLAKQEDAIFKRRKEMSDRRERNERRREQEKEAREAARNPKRRRSSPDYSRGGGRADARVPTGPFETFEATNYPTLDYNSIVNRGAVDKTSASNKSAAAVLKEQMLAKRAGETPTKNGANGVNGSPSTDANTPASALGKRKAGLIEEEEVSETGTPGRNTPLEKAGAASDEPVDPDLDTVRLWEPGYADRYYEQKFHVSPNDIEFRHKVARAYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDLDKMTVKFDKGTPFRPYEQLMGVLPAASNHAIPPAFHPLMTDEDSSIVDFYPEDFDLDMNGKKQSWKAVVLLPFIDEKRLLAAMDTKYPLLSAEERARNEVGKDALIISDQNPLYDDLAMQFYSKKAKDGKDSVKLSMRKGKLAGTVSKNYDFFPHMDLVGPEEEIKLEPVVDDDRSLNVHFTMPPPTHVHKSMLFPGVVLPPPVLDKSDLAILRSKARNSGRDFGGAPLYDNTRRDPQDQHNRGGRINYAVNRPPMDTGGSAPGHGQDNPFAAFLDPRFAANMPPPGRGPPPPPPQSQRYGGQNGYGGYAGGGGGRGSQGAHYNYPNQGQGQGYYGNEAQNQYSAGRNGDQQQYGGRSVSDGHYQYPGQGQGQGQGQGQGRGYPPRDDRRGNYGGGYNQGGGGGGGYGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.62
3	0.66
4	0.68
5	0.65
6	0.63
7	0.62
8	0.59
9	0.52
10	0.47
11	0.4
12	0.35
13	0.31
14	0.23
15	0.16
16	0.12
17	0.1
18	0.12
19	0.1
20	0.08
21	0.08
22	0.09
23	0.11
24	0.12
25	0.15
26	0.23
27	0.29
28	0.33
29	0.35
30	0.37
31	0.4
32	0.42
33	0.47
34	0.42
35	0.39
36	0.36
37	0.34
38	0.31
39	0.27
40	0.24
41	0.14
42	0.1
43	0.1
44	0.1
45	0.11
46	0.12
47	0.13
48	0.15
49	0.21
50	0.27
51	0.28
52	0.37
53	0.46
54	0.54
55	0.6
56	0.59
57	0.6
58	0.59
59	0.6
60	0.51
61	0.44
62	0.38
63	0.32
64	0.3
65	0.24
66	0.19
67	0.14
68	0.14
69	0.11
70	0.1
71	0.1
72	0.13
73	0.14
74	0.18
75	0.2
76	0.28
77	0.37
78	0.44
79	0.47
80	0.46
81	0.47
82	0.46
83	0.45
84	0.39
85	0.31
86	0.29
87	0.26
88	0.24
89	0.23
90	0.19
91	0.19
92	0.18
93	0.16
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.37
99	0.45
100	0.54
101	0.65
102	0.73
103	0.78
104	0.81
105	0.79
106	0.76
107	0.77
108	0.77
109	0.72
110	0.73
111	0.68
112	0.61
113	0.66
114	0.61
115	0.54
116	0.52
117	0.47
118	0.42
119	0.42
120	0.4
121	0.3
122	0.3
123	0.36
124	0.37
125	0.4
126	0.38
127	0.35
128	0.36
129	0.46
130	0.49
131	0.41
132	0.34
133	0.33
134	0.32
135	0.33
136	0.35
137	0.26
138	0.22
139	0.19
140	0.18
141	0.15
142	0.14
143	0.12
144	0.1
145	0.1
146	0.1
147	0.13
148	0.13
149	0.14
150	0.17
151	0.22
152	0.24
153	0.27
154	0.32
155	0.32
156	0.32
157	0.31
158	0.3
159	0.25
160	0.21
161	0.17
162	0.12
163	0.1
164	0.1
165	0.13
166	0.12
167	0.13
168	0.13
169	0.16
170	0.15
171	0.15
172	0.18
173	0.18
174	0.25
175	0.28
176	0.33
177	0.35
178	0.42
179	0.41
180	0.41
181	0.38
182	0.33
183	0.32
184	0.28
185	0.23
186	0.17
187	0.17
188	0.16
189	0.15
190	0.12
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.08
195	0.07
196	0.07
197	0.07
198	0.09
199	0.09
200	0.1
201	0.11
202	0.1
203	0.13
204	0.14
205	0.15
206	0.18
207	0.24
208	0.3
209	0.31
210	0.33
211	0.35
212	0.39
213	0.41
214	0.38
215	0.42
216	0.39
217	0.41
218	0.42
219	0.41
220	0.4
221	0.37
222	0.35
223	0.26
224	0.23
225	0.18
226	0.18
227	0.15
228	0.11
229	0.11
230	0.1
231	0.09
232	0.08
233	0.06
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.05
240	0.07
241	0.08
242	0.11
243	0.13
244	0.14
245	0.18
246	0.2
247	0.23
248	0.25
249	0.26
250	0.26
251	0.29
252	0.28
253	0.27
254	0.3
255	0.28
256	0.29
257	0.34
258	0.38
259	0.38
260	0.43
261	0.47
262	0.46
263	0.52
264	0.53
265	0.52
266	0.52
267	0.52
268	0.51
269	0.47
270	0.45
271	0.4
272	0.4
273	0.34
274	0.28
275	0.26
276	0.26
277	0.27
278	0.28
279	0.31
280	0.27
281	0.29
282	0.32
283	0.36
284	0.33
285	0.32
286	0.3
287	0.23
288	0.24
289	0.23
290	0.2
291	0.16
292	0.17
293	0.17
294	0.15
295	0.16
296	0.15
297	0.15
298	0.15
299	0.14
300	0.15
301	0.17
302	0.18
303	0.17
304	0.17
305	0.17
306	0.14
307	0.14
308	0.12
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.08
315	0.07
316	0.06
317	0.06
318	0.07
319	0.07
320	0.1
321	0.11
322	0.11
323	0.13
324	0.17
325	0.18
326	0.19
327	0.21
328	0.18
329	0.16
330	0.16
331	0.14
332	0.1
333	0.08
334	0.08
335	0.05
336	0.05
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.07
347	0.07
348	0.11
349	0.12
350	0.13
351	0.12
352	0.12
353	0.12
354	0.12
355	0.12
356	0.08
357	0.06
358	0.05
359	0.08
360	0.08
361	0.09
362	0.11
363	0.11
364	0.13
365	0.13
366	0.12
367	0.1
368	0.1
369	0.09
370	0.07
371	0.06
372	0.06
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.07
388	0.06
389	0.07
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.09
394	0.07
395	0.08
396	0.12
397	0.15
398	0.22
399	0.27
400	0.26
401	0.34
402	0.36
403	0.38
404	0.43
405	0.51
406	0.53
407	0.59
408	0.66
409	0.64
410	0.72
411	0.76
412	0.77
413	0.78
414	0.76
415	0.72
416	0.75
417	0.75
418	0.73
419	0.75
420	0.7
421	0.65
422	0.62
423	0.57
424	0.5
425	0.5
426	0.51
427	0.52
428	0.57
429	0.56
430	0.6
431	0.65
432	0.68
433	0.71
434	0.7
435	0.71
436	0.71
437	0.76
438	0.71
439	0.64
440	0.61
441	0.53
442	0.45
443	0.37
444	0.28
445	0.21
446	0.18
447	0.17
448	0.16
449	0.17
450	0.16
451	0.15
452	0.15
453	0.12
454	0.12
455	0.12
456	0.13
457	0.12
458	0.12
459	0.12
460	0.12
461	0.13
462	0.13
463	0.12
464	0.1
465	0.11
466	0.11
467	0.1
468	0.11
469	0.11
470	0.12
471	0.11
472	0.11
473	0.1
474	0.11
475	0.11
476	0.09
477	0.09
478	0.08
479	0.09
480	0.13
481	0.14
482	0.14
483	0.15
484	0.14
485	0.14
486	0.16
487	0.15
488	0.12
489	0.12
490	0.12
491	0.12
492	0.13
493	0.13
494	0.11
495	0.13
496	0.12
497	0.1
498	0.13
499	0.13
500	0.15
501	0.18
502	0.18
503	0.21
504	0.27
505	0.27
506	0.24
507	0.24
508	0.22
509	0.2
510	0.2
511	0.16
512	0.11
513	0.1
514	0.11
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.09
519	0.1
520	0.1
521	0.1
522	0.1
523	0.09
524	0.11
525	0.1
526	0.11
527	0.12
528	0.13
529	0.13
530	0.14
531	0.15
532	0.14
533	0.14
534	0.14
535	0.14
536	0.13
537	0.13
538	0.12
539	0.11
540	0.1
541	0.09
542	0.06
543	0.05
544	0.07
545	0.07
546	0.08
547	0.1
548	0.11
549	0.12
550	0.14
551	0.16
552	0.15
553	0.15
554	0.15
555	0.13
556	0.12
557	0.11
558	0.1
559	0.08
560	0.07
561	0.07
562	0.07
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.05
569	0.07
570	0.07
571	0.08
572	0.08
573	0.08
574	0.09
575	0.11
576	0.15
577	0.13
578	0.13
579	0.13
580	0.17
581	0.18
582	0.19
583	0.18
584	0.18
585	0.18
586	0.21
587	0.24
588	0.24
589	0.24
590	0.26
591	0.31
592	0.28
593	0.3
594	0.28
595	0.27
596	0.27
597	0.27
598	0.24
599	0.2
600	0.22
601	0.21
602	0.24
603	0.2
604	0.17
605	0.16
606	0.15
607	0.13
608	0.1
609	0.08
610	0.04
611	0.04
612	0.05
613	0.06
614	0.06
615	0.07
616	0.08
617	0.08
618	0.09
619	0.13
620	0.16
621	0.15
622	0.19
623	0.2
624	0.25
625	0.28
626	0.3
627	0.27
628	0.23
629	0.23
630	0.2
631	0.19
632	0.15
633	0.12
634	0.09
635	0.07
636	0.08
637	0.09
638	0.09
639	0.08
640	0.09
641	0.09
642	0.11
643	0.12
644	0.11
645	0.11
646	0.14
647	0.22
648	0.23
649	0.28
650	0.32
651	0.35
652	0.37
653	0.38
654	0.37
655	0.31
656	0.29
657	0.25
658	0.2
659	0.17
660	0.15
661	0.12
662	0.1
663	0.07
664	0.08
665	0.07
666	0.06
667	0.05
668	0.08
669	0.08
670	0.08
671	0.11
672	0.17
673	0.17
674	0.17
675	0.17
676	0.17
677	0.2
678	0.22
679	0.2
680	0.12
681	0.13
682	0.14
683	0.13
684	0.12
685	0.08
686	0.06
687	0.05
688	0.06
689	0.07
690	0.07
691	0.08
692	0.07
693	0.08
694	0.09
695	0.11
696	0.11
697	0.1
698	0.11
699	0.12
700	0.13
701	0.15
702	0.19
703	0.2
704	0.21
705	0.22
706	0.26
707	0.29
708	0.28
709	0.27
710	0.22
711	0.22
712	0.2
713	0.19
714	0.14
715	0.11
716	0.11
717	0.11
718	0.1
719	0.08
720	0.13
721	0.14
722	0.17
723	0.18
724	0.17
725	0.16
726	0.16
727	0.16
728	0.13
729	0.13
730	0.15
731	0.22
732	0.27
733	0.28
734	0.31
735	0.31
736	0.29
737	0.28
738	0.27
739	0.2
740	0.14
741	0.14
742	0.12
743	0.11
744	0.1
745	0.1
746	0.08
747	0.13
748	0.13
749	0.13
750	0.13
751	0.14
752	0.14
753	0.14
754	0.13
755	0.08
756	0.1
757	0.1
758	0.09
759	0.09
760	0.1
761	0.17
762	0.17
763	0.21
764	0.25
765	0.3
766	0.37
767	0.46
768	0.52
769	0.55
770	0.57
771	0.57
772	0.59
773	0.58
774	0.55
775	0.55
776	0.49
777	0.42
778	0.41
779	0.4
780	0.37
781	0.39
782	0.41
783	0.38
784	0.42
785	0.42
786	0.44
787	0.42
788	0.37
789	0.35
790	0.29
791	0.24
792	0.22
793	0.19
794	0.16
795	0.17
796	0.16
797	0.16
798	0.15
799	0.14
800	0.11
801	0.1
802	0.1
803	0.09
804	0.1
805	0.08
806	0.07
807	0.06
808	0.08
809	0.1
810	0.1
811	0.11
812	0.1
813	0.11
814	0.13
815	0.14
816	0.13
817	0.12
818	0.13
819	0.13
820	0.14
821	0.19
822	0.18
823	0.21
824	0.26
825	0.31
826	0.34
827	0.36
828	0.38
829	0.34
830	0.38
831	0.4
832	0.38
833	0.33
834	0.28
835	0.28
836	0.28
837	0.25
838	0.21
839	0.15
840	0.12
841	0.14
842	0.15
843	0.14
844	0.12
845	0.11
846	0.12
847	0.18
848	0.18
849	0.18
850	0.22
851	0.23
852	0.29
853	0.33
854	0.33
855	0.35
856	0.4
857	0.46
858	0.48
859	0.53
860	0.47
861	0.46
862	0.46
863	0.4
864	0.39
865	0.32
866	0.27
867	0.22
868	0.25
869	0.26
870	0.26
871	0.28
872	0.31
873	0.34
874	0.36
875	0.41
876	0.47
877	0.54
878	0.58
879	0.62
880	0.62
881	0.61
882	0.6
883	0.55
884	0.47
885	0.41
886	0.41
887	0.38
888	0.38
889	0.4
890	0.43
891	0.41
892	0.41
893	0.37
894	0.32
895	0.3
896	0.23
897	0.2
898	0.22
899	0.21
900	0.2
901	0.19
902	0.2
903	0.2
904	0.2
905	0.19
906	0.15
907	0.17
908	0.18
909	0.17
910	0.15
911	0.14
912	0.15
913	0.14
914	0.17
915	0.15
916	0.14
917	0.16
918	0.16
919	0.18
920	0.2
921	0.29
922	0.26
923	0.29
924	0.3
925	0.32
926	0.36
927	0.38
928	0.39
929	0.4
930	0.48
931	0.52
932	0.59
933	0.61
934	0.63
935	0.65
936	0.64
937	0.61
938	0.59
939	0.59
940	0.52
941	0.49
942	0.45
943	0.39
944	0.35
945	0.29
946	0.2
947	0.13
948	0.12
949	0.09
950	0.07
951	0.06
952	0.05
953	0.05
954	0.05
955	0.06
956	0.06
957	0.08
958	0.13
959	0.16
960	0.2
961	0.23
962	0.27
963	0.3
964	0.33
965	0.34
966	0.29
967	0.29
968	0.27
969	0.25
970	0.24
971	0.23
972	0.21
973	0.22
974	0.23
975	0.21
976	0.22
977	0.23
978	0.21
979	0.19
980	0.2
981	0.18
982	0.2
983	0.2
984	0.2
985	0.21
986	0.24
987	0.29
988	0.34
989	0.34
990	0.31
991	0.34
992	0.35
993	0.35
994	0.32
995	0.26
996	0.2
997	0.21
998	0.23
999	0.25
1000	0.23
1001	0.22
1002	0.26
1003	0.26
1004	0.27
1005	0.29
1006	0.29
1007	0.23
1008	0.26
1009	0.24
1010	0.25
1011	0.29
1012	0.3
1013	0.26
1014	0.29
1015	0.3
1016	0.29
1017	0.29
1018	0.28
1019	0.27
1020	0.33
1021	0.35
1022	0.37
1023	0.44
1024	0.51
1025	0.58
1026	0.61
1027	0.63
1028	0.64
1029	0.65
1030	0.58
1031	0.53
1032	0.49
1033	0.44
1034	0.41
1035	0.39
1036	0.3
1037	0.26
1038	0.24
1039	0.2
1040	0.15
1041	0.12
1042	0.08

W9YDD3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer