FuNGI

W9Y2M0

Protein Details

Accession

W9Y2M0

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-32	QEATDRPTKKPQTSKAKVTYIT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
441-447	KKGKARK
460-467	KPKFAKLR
473-483	PKISAGRPSRR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 3, mito 2, cyto_pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MGEKKRKAGAQEATDRPTKKPQTSKAKVTYITGPDVAKPVVAFSPGFTLPPELKFNAFSKKTTTSSASPTSLLLQTSDHPTIDYVATESNTTEVGERHMKHYVAVFDPSSKSLRVTEAKKVTVRSSVRQVDQRDGSDGEENDTGATPTWATMPSSRAALTEAFGTKKSKKAVASVAENRLLARGGEKATDSPVSNAILWSIKDEDDPFLDTKNTSDATVLSRANKPLPPANLDTTEIEEVYGLSALVFPAPARTTLAQMPLAYWRERIGAKKDVVSRYRFVAHRVDRLTRLHLENPDDQTTLLKLQLLRYIQLLLELYTYITRLPARKPIPQPEQWPDHTTSDASLSTAFLSKLVAHFFPTSIPTAQAKTLLTTTILALTLHIPPPKWQPGVTMPVLVTEPSDISLDLALQPTEVSKLFRELGCKMESLADMELARWGWEKKGKARKIVDEDGKETTLPKPKFAKLRFPIEFPKISAGRPSRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.62
3	0.57
4	0.59
5	0.58
6	0.57
7	0.61
8	0.67
9	0.72
10	0.78
11	0.84
12	0.83
13	0.82
14	0.75
15	0.69
16	0.66
17	0.59
18	0.54
19	0.47
20	0.39
21	0.33
22	0.34
23	0.3
24	0.23
25	0.18
26	0.17
27	0.15
28	0.16
29	0.14
30	0.12
31	0.17
32	0.16
33	0.17
34	0.15
35	0.19
36	0.19
37	0.23
38	0.27
39	0.23
40	0.25
41	0.28
42	0.31
43	0.37
44	0.37
45	0.34
46	0.35
47	0.4
48	0.41
49	0.41
50	0.43
51	0.37
52	0.41
53	0.45
54	0.41
55	0.35
56	0.34
57	0.32
58	0.29
59	0.25
60	0.19
61	0.16
62	0.16
63	0.22
64	0.22
65	0.19
66	0.18
67	0.18
68	0.19
69	0.18
70	0.16
71	0.11
72	0.11
73	0.12
74	0.12
75	0.11
76	0.1
77	0.1
78	0.1
79	0.1
80	0.09
81	0.13
82	0.2
83	0.21
84	0.23
85	0.27
86	0.27
87	0.27
88	0.3
89	0.29
90	0.24
91	0.26
92	0.24
93	0.22
94	0.23
95	0.25
96	0.23
97	0.2
98	0.19
99	0.18
100	0.23
101	0.27
102	0.29
103	0.36
104	0.4
105	0.44
106	0.46
107	0.47
108	0.43
109	0.45
110	0.45
111	0.4
112	0.44
113	0.45
114	0.46
115	0.5
116	0.5
117	0.49
118	0.48
119	0.45
120	0.38
121	0.34
122	0.31
123	0.29
124	0.26
125	0.22
126	0.19
127	0.17
128	0.15
129	0.14
130	0.13
131	0.08
132	0.08
133	0.06
134	0.06
135	0.07
136	0.07
137	0.08
138	0.1
139	0.12
140	0.12
141	0.13
142	0.13
143	0.12
144	0.13
145	0.12
146	0.11
147	0.12
148	0.13
149	0.12
150	0.14
151	0.18
152	0.19
153	0.23
154	0.26
155	0.27
156	0.27
157	0.31
158	0.36
159	0.37
160	0.43
161	0.44
162	0.45
163	0.43
164	0.41
165	0.36
166	0.3
167	0.25
168	0.17
169	0.12
170	0.1
171	0.09
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.12
176	0.14
177	0.13
178	0.12
179	0.13
180	0.13
181	0.13
182	0.12
183	0.11
184	0.11
185	0.1
186	0.11
187	0.1
188	0.09
189	0.1
190	0.11
191	0.11
192	0.1
193	0.12
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.1
198	0.1
199	0.11
200	0.11
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.11
205	0.15
206	0.15
207	0.16
208	0.17
209	0.18
210	0.21
211	0.21
212	0.21
213	0.21
214	0.22
215	0.23
216	0.24
217	0.25
218	0.24
219	0.24
220	0.23
221	0.2
222	0.19
223	0.15
224	0.12
225	0.09
226	0.07
227	0.06
228	0.05
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.04
237	0.05
238	0.05
239	0.07
240	0.07
241	0.09
242	0.11
243	0.13
244	0.13
245	0.12
246	0.13
247	0.15
248	0.17
249	0.15
250	0.14
251	0.13
252	0.15
253	0.17
254	0.2
255	0.21
256	0.25
257	0.25
258	0.3
259	0.35
260	0.38
261	0.41
262	0.41
263	0.37
264	0.33
265	0.37
266	0.33
267	0.3
268	0.33
269	0.32
270	0.35
271	0.37
272	0.38
273	0.36
274	0.37
275	0.38
276	0.33
277	0.32
278	0.3
279	0.3
280	0.31
281	0.32
282	0.34
283	0.32
284	0.28
285	0.26
286	0.22
287	0.2
288	0.17
289	0.13
290	0.11
291	0.1
292	0.11
293	0.15
294	0.15
295	0.15
296	0.15
297	0.15
298	0.13
299	0.14
300	0.12
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.06
308	0.07
309	0.09
310	0.12
311	0.14
312	0.23
313	0.26
314	0.34
315	0.41
316	0.49
317	0.54
318	0.57
319	0.62
320	0.59
321	0.62
322	0.57
323	0.55
324	0.49
325	0.43
326	0.39
327	0.32
328	0.26
329	0.22
330	0.18
331	0.15
332	0.11
333	0.1
334	0.09
335	0.1
336	0.1
337	0.07
338	0.08
339	0.08
340	0.1
341	0.12
342	0.11
343	0.12
344	0.13
345	0.13
346	0.14
347	0.15
348	0.16
349	0.14
350	0.17
351	0.16
352	0.17
353	0.18
354	0.19
355	0.18
356	0.17
357	0.17
358	0.15
359	0.14
360	0.13
361	0.12
362	0.11
363	0.11
364	0.09
365	0.09
366	0.1
367	0.12
368	0.15
369	0.16
370	0.15
371	0.18
372	0.26
373	0.32
374	0.32
375	0.3
376	0.31
377	0.36
378	0.42
379	0.39
380	0.34
381	0.27
382	0.27
383	0.27
384	0.22
385	0.16
386	0.11
387	0.1
388	0.09
389	0.1
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.09
395	0.1
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.1
401	0.1
402	0.11
403	0.11
404	0.16
405	0.19
406	0.2
407	0.24
408	0.23
409	0.27
410	0.27
411	0.26
412	0.23
413	0.23
414	0.22
415	0.21
416	0.19
417	0.17
418	0.15
419	0.15
420	0.16
421	0.13
422	0.13
423	0.14
424	0.14
425	0.18
426	0.25
427	0.31
428	0.39
429	0.49
430	0.55
431	0.62
432	0.68
433	0.72
434	0.74
435	0.78
436	0.77
437	0.72
438	0.69
439	0.64
440	0.57
441	0.48
442	0.4
443	0.37
444	0.38
445	0.34
446	0.38
447	0.4
448	0.46
449	0.56
450	0.6
451	0.64
452	0.62
453	0.72
454	0.68
455	0.68
456	0.69
457	0.66
458	0.64
459	0.55
460	0.56
461	0.47
462	0.45
463	0.48

W9Y2M0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer