Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q1DME8

Protein Details
Accession Q1DME8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-99GIPKLRRSAKTKLKFKGKRHEFSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
78-94PKLRRSAKTKLKFKGKR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
GO:0008156  P:negative regulation of DNA replication  
GO:0031297  P:replication fork processing  
KEGG cim:CIMG_08515  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MAEDTAFDDLFNYDAGIEELLRDPEEEKNDRRASGTGTGSTENKNDDLIGLEEIKITRKRAPPVKLDENRLLSQAGIPKLRRSAKTKLKFKGKRHEFSDVARLLNFYQLWLDDLYPRAKFADGLSIIEKLGHTKRMQVMRKEWIDEGKPGRNLYDSNVTYLDPNSDNRGDKDTADPTIPSIFQRTLEQSAPAMEAHRNDQAESTHSPKRLSDSEIPIFGGGKAISLRNNADDDDDLFVPGNEGMDIDPPVQASQVPEEDDLDTFLAEQESTMQNTAHGLGILKPNAPPADEEDDLDALLAEAENTPARAPKTGHLEANRPAADDFDDELHILNEFGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.08
6 0.1
7 0.11
8 0.11
9 0.12
10 0.13
11 0.17
12 0.25
13 0.29
14 0.31
15 0.4
16 0.42
17 0.43
18 0.43
19 0.4
20 0.38
21 0.39
22 0.38
23 0.31
24 0.3
25 0.32
26 0.32
27 0.33
28 0.3
29 0.26
30 0.23
31 0.2
32 0.18
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.12
38 0.12
39 0.13
40 0.14
41 0.19
42 0.2
43 0.22
44 0.27
45 0.33
46 0.42
47 0.49
48 0.55
49 0.58
50 0.63
51 0.72
52 0.7
53 0.71
54 0.69
55 0.66
56 0.6
57 0.53
58 0.44
59 0.33
60 0.3
61 0.29
62 0.26
63 0.26
64 0.26
65 0.28
66 0.35
67 0.42
68 0.44
69 0.44
70 0.5
71 0.56
72 0.65
73 0.71
74 0.72
75 0.77
76 0.81
77 0.84
78 0.85
79 0.84
80 0.82
81 0.78
82 0.77
83 0.68
84 0.62
85 0.62
86 0.53
87 0.44
88 0.36
89 0.31
90 0.24
91 0.25
92 0.21
93 0.12
94 0.1
95 0.1
96 0.11
97 0.1
98 0.11
99 0.09
100 0.11
101 0.14
102 0.13
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.17
109 0.15
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.16
115 0.16
116 0.12
117 0.13
118 0.15
119 0.15
120 0.18
121 0.24
122 0.33
123 0.39
124 0.4
125 0.43
126 0.47
127 0.49
128 0.46
129 0.42
130 0.37
131 0.32
132 0.32
133 0.31
134 0.28
135 0.28
136 0.27
137 0.26
138 0.24
139 0.22
140 0.2
141 0.25
142 0.2
143 0.2
144 0.2
145 0.2
146 0.19
147 0.19
148 0.18
149 0.1
150 0.11
151 0.13
152 0.14
153 0.15
154 0.16
155 0.2
156 0.18
157 0.18
158 0.2
159 0.18
160 0.17
161 0.16
162 0.15
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.09
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.12
171 0.14
172 0.16
173 0.16
174 0.16
175 0.14
176 0.14
177 0.14
178 0.12
179 0.11
180 0.09
181 0.1
182 0.11
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.14
188 0.16
189 0.18
190 0.2
191 0.21
192 0.23
193 0.24
194 0.23
195 0.27
196 0.26
197 0.29
198 0.31
199 0.33
200 0.33
201 0.33
202 0.33
203 0.29
204 0.27
205 0.21
206 0.16
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.15
216 0.14
217 0.15
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.12
223 0.11
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.1
241 0.11
242 0.13
243 0.13
244 0.14
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.11
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.08
256 0.09
257 0.11
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.12
262 0.13
263 0.11
264 0.09
265 0.09
266 0.11
267 0.17
268 0.18
269 0.18
270 0.17
271 0.21
272 0.21
273 0.21
274 0.19
275 0.2
276 0.25
277 0.25
278 0.25
279 0.23
280 0.23
281 0.22
282 0.2
283 0.14
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.04
288 0.04
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.12
294 0.14
295 0.18
296 0.2
297 0.24
298 0.33
299 0.37
300 0.43
301 0.44
302 0.49
303 0.5
304 0.56
305 0.51
306 0.43
307 0.38
308 0.33
309 0.3
310 0.27
311 0.23
312 0.17
313 0.17
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.13