Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9XQW3

Protein Details
Accession W9XQW3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRARRFRAARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
414-449KRRKEVSDRRERNERRREQEKEAREAARNPKRRRSS
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 7, cyto 7, cyto_mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLTKKYPKIISPVIEEQPYEIDGVVYPVDTTKPNPNGEEMHNLYLDFNGIVHPCSHPENKPPPANEAEMMMEIFKYTERVVNMVRPRRLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRAARDAKEADEQKAEFQTLLRQQQRDRDEDDDEASTVEEVIKKTWDSNVITPGTPFMFILAQSIRYWVQWKLNTDPAWAELKVIISDASVPGEGEHKIMQFIRSQRSDPEYDPNTRHVMYGLDADLIMLGIATHEPHFRVLREDVFLRDAKAKTCKLCGQQGHYAENCRGNAKAKSGEFDEKGTTEELKPFVWLNVPILREYLGAEMLVPGQPFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIHEDGIDKLIAIWRDNLPLMGGYVTCDGNVELARAQIILQGLAKQEDAIFKRRKEVSDRRERNERRREQEKEAREAARNPKRRRSSPDYNRGARADARAPTGPVETFEATDYPTLDYNAIVNRGTVDKAAASNKSAAAVLKEQMLAKRAAAAETPTKNGVNGVNGSPSGEGGTPASALGKRKAGLMEAEESSDAGTPGRHTPVAKPETNGQAGDPDLDTVRLWEPGYADRYYEQKFHVAPNDIEFRHKVARAYVEGLSWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIDKMTIKFDKGTPFRPYEQLMGVLPAASNHAIPPAFHPLMTDEDSEIVDFYPEDFELDANGKKQSWKAVVLLPFIDEKRLLSAMHTKYHLLNDDERARNEVGKDALIISDQNPLYDELAMQFYSKKAKNGKDSVKLSMRKGRLAGTVSKNADFLPHMDLVGPEEEIKLEPVVDDDRSLSVHFTMPPPTHVHKSMLFPGVVLPPAVLDKGDLALLRSKARNSGRDFGGAPLYDNTRRDPHDQQNRGGRINYAANRPPLDPGAPGTSNNNPFAAFLDPRFAANMPPPGRGPPPPQAQGYGGSNGYDRNQAPSNGYGGYGGGQGNHYNYQGQGQGQGQGQGQGYYGNQGQNQYYGRNGEQPQYGGRSVSDSSYQYAGQGQGYPPRNDRRGNHGGGYNQGGGGYGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.62
3 0.66
4 0.68
5 0.65
6 0.63
7 0.62
8 0.59
9 0.52
10 0.47
11 0.4
12 0.35
13 0.31
14 0.23
15 0.16
16 0.12
17 0.1
18 0.12
19 0.1
20 0.08
21 0.08
22 0.09
23 0.11
24 0.12
25 0.15
26 0.23
27 0.29
28 0.33
29 0.35
30 0.37
31 0.4
32 0.42
33 0.47
34 0.42
35 0.39
36 0.36
37 0.34
38 0.31
39 0.27
40 0.24
41 0.14
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.11
46 0.12
47 0.13
48 0.15
49 0.21
50 0.27
51 0.28
52 0.37
53 0.46
54 0.53
55 0.6
56 0.59
57 0.59
58 0.58
59 0.57
60 0.48
61 0.41
62 0.34
63 0.27
64 0.25
65 0.2
66 0.15
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.13
73 0.13
74 0.17
75 0.2
76 0.28
77 0.37
78 0.44
79 0.47
80 0.46
81 0.47
82 0.46
83 0.45
84 0.39
85 0.31
86 0.29
87 0.26
88 0.24
89 0.23
90 0.19
91 0.19
92 0.18
93 0.16
94 0.1
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.37
99 0.45
100 0.54
101 0.65
102 0.73
103 0.78
104 0.81
105 0.79
106 0.76
107 0.77
108 0.77
109 0.72
110 0.73
111 0.68
112 0.61
113 0.64
114 0.6
115 0.51
116 0.46
117 0.41
118 0.35
119 0.34
120 0.32
121 0.23
122 0.21
123 0.26
124 0.28
125 0.37
126 0.4
127 0.42
128 0.44
129 0.53
130 0.57
131 0.54
132 0.51
133 0.46
134 0.43
135 0.41
136 0.4
137 0.32
138 0.27
139 0.23
140 0.19
141 0.15
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.18
151 0.23
152 0.24
153 0.27
154 0.32
155 0.32
156 0.32
157 0.31
158 0.3
159 0.25
160 0.21
161 0.17
162 0.12
163 0.1
164 0.1
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.16
170 0.15
171 0.15
172 0.18
173 0.18
174 0.25
175 0.28
176 0.33
177 0.35
178 0.42
179 0.41
180 0.41
181 0.38
182 0.33
183 0.32
184 0.28
185 0.23
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.15
190 0.12
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.13
204 0.14
205 0.15
206 0.18
207 0.24
208 0.3
209 0.31
210 0.33
211 0.35
212 0.39
213 0.41
214 0.38
215 0.42
216 0.39
217 0.41
218 0.42
219 0.41
220 0.4
221 0.37
222 0.35
223 0.26
224 0.23
225 0.18
226 0.18
227 0.15
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.06
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.04
239 0.05
240 0.07
241 0.08
242 0.11
243 0.13
244 0.14
245 0.18
246 0.2
247 0.21
248 0.23
249 0.24
250 0.23
251 0.25
252 0.25
253 0.22
254 0.26
255 0.24
256 0.25
257 0.31
258 0.33
259 0.32
260 0.37
261 0.41
262 0.4
263 0.47
264 0.48
265 0.47
266 0.5
267 0.52
268 0.51
269 0.47
270 0.45
271 0.4
272 0.4
273 0.34
274 0.28
275 0.26
276 0.26
277 0.26
278 0.28
279 0.31
280 0.27
281 0.29
282 0.32
283 0.36
284 0.33
285 0.32
286 0.29
287 0.23
288 0.24
289 0.22
290 0.2
291 0.16
292 0.17
293 0.17
294 0.15
295 0.16
296 0.15
297 0.14
298 0.15
299 0.14
300 0.14
301 0.17
302 0.18
303 0.17
304 0.17
305 0.17
306 0.14
307 0.14
308 0.12
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.13
324 0.17
325 0.18
326 0.19
327 0.21
328 0.18
329 0.16
330 0.16
331 0.14
332 0.1
333 0.08
334 0.08
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.11
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.08
357 0.06
358 0.05
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.11
363 0.11
364 0.13
365 0.13
366 0.12
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.07
379 0.08
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.07
395 0.08
396 0.12
397 0.14
398 0.21
399 0.26
400 0.26
401 0.33
402 0.36
403 0.38
404 0.43
405 0.51
406 0.53
407 0.59
408 0.66
409 0.64
410 0.72
411 0.76
412 0.77
413 0.78
414 0.76
415 0.72
416 0.74
417 0.75
418 0.73
419 0.75
420 0.7
421 0.65
422 0.62
423 0.57
424 0.5
425 0.5
426 0.51
427 0.52
428 0.56
429 0.56
430 0.6
431 0.65
432 0.68
433 0.71
434 0.7
435 0.72
436 0.73
437 0.78
438 0.77
439 0.72
440 0.7
441 0.62
442 0.54
443 0.45
444 0.37
445 0.3
446 0.24
447 0.23
448 0.2
449 0.2
450 0.19
451 0.18
452 0.15
453 0.12
454 0.13
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.1
459 0.09
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.09
470 0.08
471 0.07
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.08
476 0.07
477 0.06
478 0.08
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.11
486 0.09
487 0.09
488 0.1
489 0.09
490 0.09
491 0.1
492 0.1
493 0.11
494 0.13
495 0.11
496 0.1
497 0.12
498 0.11
499 0.11
500 0.1
501 0.12
502 0.15
503 0.16
504 0.17
505 0.16
506 0.15
507 0.15
508 0.16
509 0.15
510 0.11
511 0.11
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.09
517 0.08
518 0.07
519 0.06
520 0.06
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.07
527 0.08
528 0.1
529 0.11
530 0.11
531 0.12
532 0.13
533 0.13
534 0.12
535 0.12
536 0.13
537 0.11
538 0.12
539 0.1
540 0.1
541 0.09
542 0.08
543 0.07
544 0.05
545 0.04
546 0.05
547 0.07
548 0.09
549 0.1
550 0.1
551 0.13
552 0.21
553 0.27
554 0.26
555 0.26
556 0.28
557 0.31
558 0.32
559 0.3
560 0.21
561 0.17
562 0.16
563 0.15
564 0.11
565 0.07
566 0.06
567 0.07
568 0.06
569 0.07
570 0.07
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.09
575 0.11
576 0.15
577 0.14
578 0.13
579 0.13
580 0.17
581 0.18
582 0.19
583 0.17
584 0.18
585 0.18
586 0.2
587 0.23
588 0.23
589 0.22
590 0.23
591 0.28
592 0.24
593 0.25
594 0.24
595 0.22
596 0.22
597 0.23
598 0.2
599 0.17
600 0.2
601 0.2
602 0.22
603 0.19
604 0.16
605 0.15
606 0.14
607 0.12
608 0.09
609 0.07
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.06
614 0.06
615 0.07
616 0.07
617 0.08
618 0.09
619 0.13
620 0.17
621 0.15
622 0.19
623 0.2
624 0.25
625 0.28
626 0.3
627 0.27
628 0.24
629 0.23
630 0.2
631 0.2
632 0.15
633 0.12
634 0.09
635 0.07
636 0.08
637 0.1
638 0.09
639 0.08
640 0.09
641 0.09
642 0.11
643 0.12
644 0.11
645 0.11
646 0.14
647 0.22
648 0.23
649 0.29
650 0.32
651 0.35
652 0.37
653 0.38
654 0.37
655 0.31
656 0.29
657 0.25
658 0.2
659 0.17
660 0.15
661 0.12
662 0.1
663 0.07
664 0.08
665 0.07
666 0.07
667 0.05
668 0.08
669 0.08
670 0.08
671 0.11
672 0.17
673 0.17
674 0.17
675 0.17
676 0.17
677 0.21
678 0.22
679 0.2
680 0.12
681 0.13
682 0.13
683 0.13
684 0.11
685 0.07
686 0.06
687 0.05
688 0.05
689 0.06
690 0.05
691 0.06
692 0.06
693 0.06
694 0.07
695 0.09
696 0.1
697 0.1
698 0.11
699 0.12
700 0.14
701 0.15
702 0.2
703 0.2
704 0.21
705 0.22
706 0.27
707 0.29
708 0.28
709 0.27
710 0.23
711 0.22
712 0.2
713 0.19
714 0.14
715 0.11
716 0.12
717 0.13
718 0.12
719 0.12
720 0.2
721 0.22
722 0.26
723 0.26
724 0.25
725 0.26
726 0.29
727 0.3
728 0.24
729 0.25
730 0.28
731 0.35
732 0.37
733 0.36
734 0.36
735 0.34
736 0.33
737 0.3
738 0.27
739 0.19
740 0.16
741 0.16
742 0.13
743 0.12
744 0.11
745 0.11
746 0.08
747 0.14
748 0.13
749 0.13
750 0.13
751 0.14
752 0.15
753 0.14
754 0.14
755 0.08
756 0.1
757 0.1
758 0.1
759 0.09
760 0.1
761 0.18
762 0.2
763 0.25
764 0.31
765 0.38
766 0.46
767 0.55
768 0.61
769 0.63
770 0.65
771 0.66
772 0.67
773 0.65
774 0.61
775 0.6
776 0.54
777 0.48
778 0.46
779 0.42
780 0.37
781 0.36
782 0.39
783 0.37
784 0.42
785 0.41
786 0.4
787 0.37
788 0.32
789 0.31
790 0.23
791 0.19
792 0.16
793 0.14
794 0.13
795 0.13
796 0.13
797 0.14
798 0.13
799 0.12
800 0.08
801 0.08
802 0.09
803 0.09
804 0.1
805 0.08
806 0.07
807 0.07
808 0.08
809 0.1
810 0.1
811 0.1
812 0.1
813 0.1
814 0.11
815 0.12
816 0.11
817 0.1
818 0.12
819 0.13
820 0.14
821 0.19
822 0.19
823 0.21
824 0.26
825 0.3
826 0.33
827 0.34
828 0.36
829 0.34
830 0.37
831 0.41
832 0.38
833 0.33
834 0.28
835 0.28
836 0.26
837 0.23
838 0.19
839 0.12
840 0.09
841 0.1
842 0.1
843 0.08
844 0.06
845 0.06
846 0.07
847 0.08
848 0.08
849 0.09
850 0.14
851 0.16
852 0.2
853 0.22
854 0.22
855 0.3
856 0.36
857 0.42
858 0.43
859 0.48
860 0.46
861 0.47
862 0.47
863 0.41
864 0.4
865 0.32
866 0.27
867 0.23
868 0.25
869 0.26
870 0.26
871 0.28
872 0.29
873 0.33
874 0.37
875 0.43
876 0.49
877 0.56
878 0.6
879 0.63
880 0.67
881 0.68
882 0.65
883 0.58
884 0.49
885 0.42
886 0.45
887 0.43
888 0.4
889 0.41
890 0.42
891 0.43
892 0.42
893 0.41
894 0.35
895 0.31
896 0.25
897 0.23
898 0.25
899 0.24
900 0.24
901 0.26
902 0.31
903 0.34
904 0.35
905 0.32
906 0.26
907 0.25
908 0.26
909 0.26
910 0.2
911 0.17
912 0.2
913 0.2
914 0.2
915 0.22
916 0.2
917 0.18
918 0.21
919 0.29
920 0.27
921 0.29
922 0.3
923 0.32
924 0.36
925 0.39
926 0.4
927 0.4
928 0.46
929 0.48
930 0.49
931 0.48
932 0.46
933 0.44
934 0.41
935 0.36
936 0.28
937 0.24
938 0.23
939 0.21
940 0.21
941 0.22
942 0.2
943 0.22
944 0.25
945 0.26
946 0.28
947 0.29
948 0.29
949 0.24
950 0.23
951 0.18
952 0.15
953 0.15
954 0.13
955 0.11
956 0.1
957 0.11
958 0.13
959 0.15
960 0.17
961 0.17
962 0.16
963 0.17
964 0.19
965 0.2
966 0.19
967 0.21
968 0.2
969 0.23
970 0.23
971 0.26
972 0.24
973 0.25
974 0.25
975 0.21
976 0.2
977 0.16
978 0.16
979 0.16
980 0.19
981 0.18
982 0.19
983 0.22
984 0.23
985 0.26
986 0.28
987 0.26
988 0.27
989 0.28
990 0.28
991 0.33
992 0.35
993 0.35
994 0.36
995 0.37
996 0.38
997 0.38
998 0.37
999 0.3
1000 0.28
1001 0.27
1002 0.24
1003 0.25
1004 0.24
1005 0.21
1006 0.23
1007 0.24
1008 0.23
1009 0.2
1010 0.22
1011 0.21
1012 0.19
1013 0.2
1014 0.2
1015 0.27
1016 0.33
1017 0.37
1018 0.42
1019 0.5
1020 0.54
1021 0.59
1022 0.6
1023 0.61
1024 0.64
1025 0.64
1026 0.62
1027 0.57
1028 0.54
1029 0.51
1030 0.51
1031 0.43
1032 0.33
1033 0.28
1034 0.24