Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9YBE9

Protein Details
Accession W9YBE9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
464-485VPKSQRQMKKEAKLKSRGQPQVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-98RGRKEAMNAKAKAKKRKA
465-478PKSQRQMKKEAKLK
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 11.5, cyto 6.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR014816  tRNA_MeTrfase_Gcd14  
Gene Ontology GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0016429  F:tRNA (adenine-N1-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08704  GCD14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51620  SAM_TRM61  
Amino Acid Sequences MVSSFLSRGCVAKEHDLASLHLRRDQSLPVVLSTEVTSADHEGYAEGVVTNTRFGSFPHSTMIGAAWGSQIRASKVDTGSRGRKEAMNAKAKAKKRKAEALEQSQSRSQSRSRTDTHAGDEDAVAAAAAEVEVEVASSGFVHILPPTPENWTISLPHRTQVVYTPDYSYILHRIRARPGSRLIEAGSGSGSFTHAAARAVFNAYSATSGVESVGKVFSFEFHAERHRRVKAEMVEHGLDTIVHTEHRDVYRDGFLVHEDEENRDRKTSPQANAIFLDLPAPWEAVPHLTREHQDGKPSALDPNSAVHLCTFSPCIEQAQKTVSSLRRHDWLEIEMVEMQQKRIEVRREYTGLSYDGMRGANAYAADVDEALVRLREVERRARDFHARTLSKRQQANGQRQQQQQQPDVGKLPFNGGKLVHRTEPELKTHTSYLVFAILPRAWTEEDEATARAKWSKHVKIAPSVPKSQRQMKKEAKLKSRGQPQVLNGRVDGEMGETTTEKTNAGTGESTPRAEAEAEAEPEAEAEAPGGLHV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.34
4 0.34
5 0.38
6 0.4
7 0.34
8 0.35
9 0.34
10 0.33
11 0.34
12 0.35
13 0.31
14 0.31
15 0.31
16 0.27
17 0.28
18 0.26
19 0.24
20 0.21
21 0.17
22 0.12
23 0.11
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.08
33 0.07
34 0.06
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.09
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.18
43 0.2
44 0.21
45 0.23
46 0.23
47 0.22
48 0.23
49 0.23
50 0.15
51 0.12
52 0.12
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.12
57 0.14
58 0.14
59 0.16
60 0.18
61 0.21
62 0.24
63 0.29
64 0.32
65 0.38
66 0.45
67 0.47
68 0.48
69 0.44
70 0.44
71 0.46
72 0.49
73 0.5
74 0.51
75 0.5
76 0.56
77 0.62
78 0.67
79 0.71
80 0.71
81 0.7
82 0.67
83 0.74
84 0.72
85 0.74
86 0.76
87 0.75
88 0.75
89 0.69
90 0.65
91 0.59
92 0.56
93 0.48
94 0.41
95 0.35
96 0.35
97 0.4
98 0.43
99 0.44
100 0.48
101 0.52
102 0.52
103 0.52
104 0.47
105 0.41
106 0.35
107 0.31
108 0.24
109 0.17
110 0.14
111 0.09
112 0.05
113 0.04
114 0.03
115 0.03
116 0.02
117 0.02
118 0.02
119 0.02
120 0.02
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.07
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.15
135 0.16
136 0.18
137 0.19
138 0.18
139 0.19
140 0.23
141 0.29
142 0.26
143 0.27
144 0.27
145 0.25
146 0.25
147 0.28
148 0.3
149 0.25
150 0.25
151 0.25
152 0.24
153 0.25
154 0.25
155 0.2
156 0.21
157 0.21
158 0.24
159 0.27
160 0.29
161 0.35
162 0.43
163 0.43
164 0.4
165 0.44
166 0.44
167 0.4
168 0.39
169 0.33
170 0.27
171 0.25
172 0.21
173 0.15
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.2
210 0.22
211 0.28
212 0.33
213 0.34
214 0.34
215 0.33
216 0.39
217 0.36
218 0.37
219 0.35
220 0.33
221 0.3
222 0.28
223 0.27
224 0.21
225 0.15
226 0.11
227 0.09
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.1
233 0.11
234 0.13
235 0.13
236 0.14
237 0.16
238 0.16
239 0.15
240 0.12
241 0.12
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.11
247 0.15
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.16
252 0.17
253 0.26
254 0.3
255 0.29
256 0.35
257 0.36
258 0.37
259 0.37
260 0.36
261 0.27
262 0.2
263 0.18
264 0.09
265 0.09
266 0.07
267 0.07
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.12
276 0.13
277 0.17
278 0.23
279 0.21
280 0.24
281 0.24
282 0.24
283 0.24
284 0.24
285 0.22
286 0.16
287 0.16
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.12
292 0.11
293 0.09
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.12
302 0.14
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.17
307 0.17
308 0.22
309 0.25
310 0.28
311 0.3
312 0.31
313 0.33
314 0.33
315 0.34
316 0.3
317 0.25
318 0.22
319 0.19
320 0.18
321 0.14
322 0.13
323 0.15
324 0.14
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.13
329 0.18
330 0.25
331 0.25
332 0.28
333 0.33
334 0.34
335 0.34
336 0.33
337 0.3
338 0.24
339 0.21
340 0.18
341 0.14
342 0.14
343 0.12
344 0.11
345 0.09
346 0.08
347 0.09
348 0.08
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.12
363 0.15
364 0.23
365 0.3
366 0.34
367 0.38
368 0.41
369 0.49
370 0.47
371 0.51
372 0.53
373 0.5
374 0.49
375 0.56
376 0.6
377 0.59
378 0.59
379 0.54
380 0.53
381 0.59
382 0.66
383 0.65
384 0.66
385 0.67
386 0.69
387 0.74
388 0.7
389 0.67
390 0.59
391 0.57
392 0.5
393 0.44
394 0.43
395 0.38
396 0.35
397 0.28
398 0.3
399 0.26
400 0.24
401 0.24
402 0.21
403 0.24
404 0.28
405 0.31
406 0.29
407 0.27
408 0.32
409 0.38
410 0.4
411 0.4
412 0.39
413 0.37
414 0.37
415 0.37
416 0.35
417 0.28
418 0.25
419 0.21
420 0.19
421 0.17
422 0.14
423 0.17
424 0.15
425 0.14
426 0.14
427 0.16
428 0.14
429 0.15
430 0.18
431 0.16
432 0.17
433 0.18
434 0.18
435 0.17
436 0.17
437 0.18
438 0.18
439 0.18
440 0.24
441 0.32
442 0.39
443 0.46
444 0.51
445 0.54
446 0.59
447 0.68
448 0.7
449 0.66
450 0.68
451 0.65
452 0.67
453 0.69
454 0.71
455 0.7
456 0.65
457 0.7
458 0.71
459 0.75
460 0.75
461 0.78
462 0.77
463 0.78
464 0.81
465 0.8
466 0.8
467 0.78
468 0.76
469 0.72
470 0.7
471 0.71
472 0.67
473 0.6
474 0.49
475 0.44
476 0.38
477 0.32
478 0.25
479 0.17
480 0.12
481 0.11
482 0.12
483 0.1
484 0.12
485 0.15
486 0.15
487 0.13
488 0.13
489 0.15
490 0.15
491 0.16
492 0.16
493 0.15
494 0.23
495 0.25
496 0.26
497 0.24
498 0.23
499 0.22
500 0.22
501 0.2
502 0.16
503 0.18
504 0.19
505 0.19
506 0.19
507 0.17
508 0.17
509 0.17
510 0.13
511 0.08
512 0.06
513 0.06