Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9YHV6

Protein Details
Accession W9YHV6    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-87SRRPEECECCGRKKRRGSFDAYPDNPSRPVLSRRPHPPHLRGCKLLHydrophilic
93-124HFACCVRSRRRYQLLTRYRYHKQKKPYSSISVHydrophilic
315-336SSTFAAKKVKKDKKGKVKGFDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
321-332KKVKKDKKGKVK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.666, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR044103  GAT_LSB5  
IPR038425  GAT_sf  
IPR045007  LSB5  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50179  VHS  
CDD cd14232  GAT_LSB5  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MSLFLLHTPACAPDAGFVDPPRQEQEIPATATTYELDSLLDSRRPEECECCGRKKRRGSFDAYPDNPSRPVLSRRPHPPHLRGCKLLVAALLHFACCVRSRRRYQLLTRYRYHKQKKPYSSISVHVEQLTSETYDEDDLAGVPDLLEVVKLQATGAQEVARALRKKLKYGNVHRQLRALTILDGLLQNGGSRVQRALLSDGPLLERLRIAAADPTSDPDVRSKCKVLFGQWVASSKDNPGLEGAKSLYNQLPKTHKPVQQRREQSRVLRETEEDVQREQEGEVARSRSDSFQRVGEPSSPTVLRKQSSPVALGQSSTFAAKKVKKDKKGKVKGFDLEREKPSILQSIAASSVASTGLTNALRLVNRESQRVSDNPEVLKRFETCKQLRRQILRYIQFVESEEFLGGLIHANEELVNALMAFEVLDKSVDDDSDSELEEAQHLSRQAARNEQAASRDAERMVAGLSISSPPKPPRPGPGHITLPSPRPTSNWRAKQVEMDSGSDSDVDDDDPDDPFGDKNAMNTPDPEALGKKGYTWREV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.2
4 0.2
5 0.25
6 0.26
7 0.29
8 0.3
9 0.3
10 0.28
11 0.28
12 0.34
13 0.34
14 0.35
15 0.33
16 0.3
17 0.27
18 0.27
19 0.25
20 0.18
21 0.13
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.11
26 0.14
27 0.17
28 0.16
29 0.18
30 0.22
31 0.26
32 0.28
33 0.31
34 0.34
35 0.41
36 0.46
37 0.54
38 0.61
39 0.66
40 0.72
41 0.78
42 0.82
43 0.82
44 0.83
45 0.81
46 0.8
47 0.81
48 0.83
49 0.74
50 0.71
51 0.63
52 0.59
53 0.52
54 0.43
55 0.36
56 0.31
57 0.37
58 0.39
59 0.45
60 0.5
61 0.6
62 0.67
63 0.73
64 0.77
65 0.78
66 0.8
67 0.82
68 0.81
69 0.74
70 0.67
71 0.63
72 0.54
73 0.46
74 0.37
75 0.28
76 0.21
77 0.22
78 0.2
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.13
83 0.16
84 0.22
85 0.26
86 0.35
87 0.43
88 0.53
89 0.62
90 0.69
91 0.73
92 0.78
93 0.8
94 0.78
95 0.78
96 0.75
97 0.74
98 0.76
99 0.77
100 0.73
101 0.74
102 0.76
103 0.79
104 0.82
105 0.81
106 0.79
107 0.73
108 0.71
109 0.67
110 0.59
111 0.51
112 0.43
113 0.35
114 0.26
115 0.24
116 0.19
117 0.13
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.13
147 0.16
148 0.17
149 0.19
150 0.26
151 0.28
152 0.33
153 0.4
154 0.47
155 0.51
156 0.6
157 0.68
158 0.71
159 0.76
160 0.71
161 0.66
162 0.58
163 0.49
164 0.42
165 0.31
166 0.21
167 0.15
168 0.14
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.09
182 0.11
183 0.14
184 0.14
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.16
190 0.15
191 0.12
192 0.1
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.15
206 0.19
207 0.21
208 0.23
209 0.24
210 0.23
211 0.28
212 0.29
213 0.27
214 0.32
215 0.3
216 0.31
217 0.3
218 0.32
219 0.29
220 0.28
221 0.26
222 0.18
223 0.21
224 0.17
225 0.16
226 0.14
227 0.14
228 0.13
229 0.14
230 0.14
231 0.11
232 0.11
233 0.13
234 0.14
235 0.16
236 0.17
237 0.2
238 0.25
239 0.26
240 0.33
241 0.4
242 0.43
243 0.49
244 0.59
245 0.61
246 0.64
247 0.72
248 0.7
249 0.69
250 0.68
251 0.63
252 0.62
253 0.59
254 0.52
255 0.44
256 0.38
257 0.34
258 0.35
259 0.33
260 0.25
261 0.21
262 0.19
263 0.18
264 0.18
265 0.15
266 0.12
267 0.1
268 0.1
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.14
275 0.16
276 0.18
277 0.17
278 0.18
279 0.2
280 0.2
281 0.2
282 0.2
283 0.19
284 0.17
285 0.18
286 0.17
287 0.16
288 0.2
289 0.22
290 0.2
291 0.19
292 0.22
293 0.23
294 0.24
295 0.25
296 0.22
297 0.22
298 0.21
299 0.2
300 0.17
301 0.14
302 0.13
303 0.12
304 0.1
305 0.08
306 0.14
307 0.18
308 0.26
309 0.36
310 0.44
311 0.53
312 0.63
313 0.72
314 0.77
315 0.84
316 0.84
317 0.81
318 0.79
319 0.76
320 0.71
321 0.69
322 0.65
323 0.6
324 0.54
325 0.49
326 0.43
327 0.37
328 0.33
329 0.29
330 0.22
331 0.18
332 0.16
333 0.14
334 0.14
335 0.13
336 0.12
337 0.07
338 0.08
339 0.06
340 0.06
341 0.04
342 0.04
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.1
348 0.11
349 0.12
350 0.16
351 0.21
352 0.23
353 0.26
354 0.26
355 0.26
356 0.29
357 0.3
358 0.32
359 0.29
360 0.31
361 0.3
362 0.35
363 0.34
364 0.32
365 0.33
366 0.28
367 0.27
368 0.29
369 0.37
370 0.38
371 0.45
372 0.53
373 0.59
374 0.65
375 0.68
376 0.69
377 0.68
378 0.71
379 0.67
380 0.61
381 0.57
382 0.5
383 0.43
384 0.39
385 0.32
386 0.23
387 0.19
388 0.16
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.07
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.11
419 0.12
420 0.13
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.11
425 0.11
426 0.09
427 0.11
428 0.11
429 0.12
430 0.17
431 0.22
432 0.24
433 0.31
434 0.33
435 0.34
436 0.36
437 0.37
438 0.34
439 0.31
440 0.32
441 0.26
442 0.26
443 0.23
444 0.21
445 0.19
446 0.16
447 0.15
448 0.12
449 0.09
450 0.07
451 0.08
452 0.1
453 0.12
454 0.13
455 0.18
456 0.23
457 0.31
458 0.37
459 0.4
460 0.47
461 0.53
462 0.58
463 0.59
464 0.62
465 0.61
466 0.56
467 0.59
468 0.52
469 0.51
470 0.49
471 0.46
472 0.39
473 0.36
474 0.41
475 0.46
476 0.53
477 0.56
478 0.59
479 0.61
480 0.62
481 0.66
482 0.63
483 0.61
484 0.53
485 0.46
486 0.4
487 0.35
488 0.34
489 0.26
490 0.22
491 0.14
492 0.12
493 0.1
494 0.09
495 0.09
496 0.1
497 0.1
498 0.11
499 0.1
500 0.11
501 0.1
502 0.11
503 0.14
504 0.14
505 0.16
506 0.23
507 0.26
508 0.27
509 0.28
510 0.31
511 0.3
512 0.31
513 0.31
514 0.26
515 0.25
516 0.28
517 0.26
518 0.26
519 0.31