FuNGI

C8VTR9

Protein Details

Accession

C8VTR9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
991-1020	PVHFFFCPYTRKRWKDRWRCIKDGPSKTID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 7.5, extr 7, cyto_mito 6.5, nucl 5, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MKILQANVGRGGAVHDLLLSFEADIILVQEPWTNTAKHLTKTHPRYQLFSPPTRWTARPRTLTYVRRDLPAHSLPEPISPDITTIYTAGLTIINVYRPPNDPQPDTESHAVTPGATGLLDWLDAHELELRLEPGTPTRGPNTLDLVFSNLPLRALVEDHLKTPSDHATIGIILEQEEPPPIYKLGSTNWEKARALASPPDPTLPIDLLAKQLVQTSQLAIQGVSRYNTRRLPRTLWWTPELTDILHQTRQQQNPDYKQLRKAIVRAKAEYWKQRIEQATAPIDVFKLAKWIQHPDQLAAPPLNIQGAQVTTPQGKADAFLNHLLEKGALLPNQTEEGPPNKPLGSLHLPTKEHCWAALCAPPPSAPGEDGLATTAWRELWPVLGDTITQLYYRCMEEGCFPLSLKSAKVIMLPKPGKRDYTQLNAWRPISLLSTLGKGLERLLAQQIAVRAIQADVLAPCHFGALPGRSAIDLVQVLVHRVEEAFQQGKDASLLLLDVKGAFDAVIHQQLLSHLRLQGWHKGLLQLLKDWLTGRSVSVHIKEGTATAPIKGGLPQGSPLSPILFLLYAARIVSTLEGSFCYADDMGILLTGNTLEESSQQLVEAYKQITALGTETGLPFSIEKTEIQHFSRKQQQHLPTVTLPGIGGITPSLYTRWLGVLLDTKLTFKAHINLVFSHGKRLAQHLKRLSNTQRGCPVAFMRAAVIQYVLPTALYGAEVFYTGKQQKGVVNSLLSLFRTAALAIIPAYKTTPTAALLREADLPDPEALLNSILRRAAVSKGHGPAGPRTEVYDAEIMGAVEGLRTALGQPCVGYSTQLVILLDNLAAASLLASYRPTPHRHGLSETFSQLAAQWMESPSILTMQWKPLQVRWIPGHSGIAGNELADKLAKLGSSIYSPDIPPSPAYLRQEAKQWLRTETYTAYANKAPETYKALNIRPHTKESRSREHKLPRWVLGRLVAARTGHGDFTAYHQRFDHTDYLESCTCGKAKTPVHFFFCPYTRKRWKDRWRCIKDGPSKTIDWLLSTAAGAEEFSRIVQESSFFKDICPNWARRSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.1
3	0.1
4	0.1
5	0.11
6	0.09
7	0.07
8	0.07
9	0.06
10	0.06
11	0.06
12	0.07
13	0.07
14	0.07
15	0.07
16	0.1
17	0.11
18	0.15
19	0.18
20	0.17
21	0.17
22	0.27
23	0.32
24	0.35
25	0.41
26	0.46
27	0.54
28	0.62
29	0.7
30	0.7
31	0.68
32	0.67
33	0.66
34	0.68
35	0.65
36	0.64
37	0.6
38	0.57
39	0.61
40	0.61
41	0.6
42	0.58
43	0.61
44	0.63
45	0.66
46	0.64
47	0.68
48	0.72
49	0.76
50	0.75
51	0.74
52	0.67
53	0.64
54	0.6
55	0.53
56	0.51
57	0.49
58	0.46
59	0.37
60	0.38
61	0.34
62	0.37
63	0.38
64	0.31
65	0.27
66	0.23
67	0.22
68	0.2
69	0.2
70	0.17
71	0.13
72	0.12
73	0.1
74	0.1
75	0.1
76	0.08
77	0.07
78	0.09
79	0.1
80	0.11
81	0.13
82	0.15
83	0.17
84	0.2
85	0.25
86	0.32
87	0.37
88	0.38
89	0.41
90	0.47
91	0.47
92	0.5
93	0.48
94	0.41
95	0.35
96	0.34
97	0.3
98	0.22
99	0.19
100	0.13
101	0.1
102	0.08
103	0.08
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.06
108	0.06
109	0.07
110	0.08
111	0.09
112	0.12
113	0.12
114	0.12
115	0.14
116	0.14
117	0.13
118	0.14
119	0.14
120	0.13
121	0.18
122	0.19
123	0.2
124	0.23
125	0.26
126	0.28
127	0.29
128	0.32
129	0.28
130	0.28
131	0.25
132	0.28
133	0.24
134	0.23
135	0.22
136	0.17
137	0.15
138	0.14
139	0.15
140	0.1
141	0.11
142	0.12
143	0.17
144	0.18
145	0.19
146	0.21
147	0.21
148	0.21
149	0.22
150	0.25
151	0.2
152	0.19
153	0.18
154	0.17
155	0.16
156	0.16
157	0.15
158	0.1
159	0.09
160	0.11
161	0.1
162	0.09
163	0.11
164	0.11
165	0.11
166	0.13
167	0.13
168	0.12
169	0.13
170	0.15
171	0.17
172	0.25
173	0.28
174	0.34
175	0.37
176	0.42
177	0.41
178	0.4
179	0.39
180	0.32
181	0.31
182	0.3
183	0.29
184	0.28
185	0.29
186	0.29
187	0.27
188	0.26
189	0.25
190	0.19
191	0.17
192	0.15
193	0.15
194	0.15
195	0.15
196	0.14
197	0.12
198	0.14
199	0.13
200	0.13
201	0.13
202	0.12
203	0.14
204	0.15
205	0.15
206	0.13
207	0.14
208	0.15
209	0.17
210	0.16
211	0.18
212	0.2
213	0.25
214	0.32
215	0.36
216	0.41
217	0.44
218	0.48
219	0.52
220	0.58
221	0.59
222	0.57
223	0.55
224	0.5
225	0.46
226	0.44
227	0.37
228	0.28
229	0.24
230	0.23
231	0.23
232	0.24
233	0.25
234	0.28
235	0.36
236	0.4
237	0.43
238	0.47
239	0.52
240	0.56
241	0.65
242	0.64
243	0.6
244	0.62
245	0.63
246	0.62
247	0.57
248	0.57
249	0.54
250	0.56
251	0.56
252	0.52
253	0.5
254	0.51
255	0.55
256	0.56
257	0.54
258	0.51
259	0.47
260	0.51
261	0.5
262	0.45
263	0.42
264	0.4
265	0.38
266	0.33
267	0.32
268	0.26
269	0.23
270	0.2
271	0.16
272	0.1
273	0.13
274	0.13
275	0.15
276	0.17
277	0.24
278	0.26
279	0.32
280	0.33
281	0.29
282	0.32
283	0.3
284	0.31
285	0.24
286	0.21
287	0.16
288	0.15
289	0.14
290	0.11
291	0.1
292	0.08
293	0.08
294	0.09
295	0.09
296	0.1
297	0.11
298	0.11
299	0.11
300	0.11
301	0.11
302	0.11
303	0.13
304	0.12
305	0.14
306	0.16
307	0.17
308	0.16
309	0.16
310	0.16
311	0.13
312	0.11
313	0.11
314	0.11
315	0.1
316	0.11
317	0.11
318	0.11
319	0.13
320	0.13
321	0.11
322	0.11
323	0.15
324	0.16
325	0.17
326	0.18
327	0.17
328	0.17
329	0.17
330	0.21
331	0.23
332	0.23
333	0.27
334	0.32
335	0.33
336	0.33
337	0.37
338	0.34
339	0.28
340	0.26
341	0.24
342	0.18
343	0.19
344	0.23
345	0.2
346	0.17
347	0.18
348	0.18
349	0.16
350	0.17
351	0.16
352	0.12
353	0.11
354	0.11
355	0.11
356	0.11
357	0.1
358	0.08
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.06
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.08
368	0.09
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.09
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.09
379	0.1
380	0.09
381	0.09
382	0.09
383	0.11
384	0.13
385	0.14
386	0.13
387	0.13
388	0.13
389	0.15
390	0.15
391	0.13
392	0.12
393	0.11
394	0.11
395	0.15
396	0.18
397	0.18
398	0.27
399	0.31
400	0.32
401	0.38
402	0.39
403	0.39
404	0.37
405	0.4
406	0.35
407	0.38
408	0.42
409	0.43
410	0.46
411	0.47
412	0.46
413	0.4
414	0.35
415	0.29
416	0.24
417	0.17
418	0.13
419	0.1
420	0.11
421	0.1
422	0.11
423	0.1
424	0.08
425	0.08
426	0.09
427	0.08
428	0.08
429	0.1
430	0.09
431	0.09
432	0.11
433	0.11
434	0.1
435	0.09
436	0.08
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.05
441	0.06
442	0.05
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.08
451	0.08
452	0.09
453	0.09
454	0.09
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.08
459	0.06
460	0.06
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.07
466	0.05
467	0.05
468	0.06
469	0.05
470	0.08
471	0.09
472	0.09
473	0.1
474	0.1
475	0.1
476	0.1
477	0.09
478	0.06
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.03
489	0.03
490	0.04
491	0.05
492	0.07
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.08
497	0.11
498	0.1
499	0.11
500	0.1
501	0.11
502	0.14
503	0.16
504	0.2
505	0.2
506	0.21
507	0.2
508	0.2
509	0.22
510	0.21
511	0.2
512	0.14
513	0.14
514	0.12
515	0.12
516	0.11
517	0.11
518	0.09
519	0.09
520	0.08
521	0.09
522	0.1
523	0.12
524	0.12
525	0.15
526	0.14
527	0.14
528	0.14
529	0.12
530	0.11
531	0.12
532	0.11
533	0.08
534	0.08
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.1
539	0.08
540	0.08
541	0.09
542	0.1
543	0.09
544	0.1
545	0.09
546	0.09
547	0.08
548	0.08
549	0.07
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.04
558	0.04
559	0.05
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.05
564	0.05
565	0.05
566	0.05
567	0.06
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.03
576	0.03
577	0.03
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.03
582	0.04
583	0.06
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.07
589	0.08
590	0.1
591	0.09
592	0.08
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.08
598	0.06
599	0.05
600	0.06
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.05
606	0.06
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.1
611	0.13
612	0.16
613	0.18
614	0.25
615	0.25
616	0.3
617	0.39
618	0.4
619	0.41
620	0.46
621	0.5
622	0.51
623	0.52
624	0.5
625	0.41
626	0.4
627	0.36
628	0.28
629	0.21
630	0.13
631	0.11
632	0.07
633	0.06
634	0.04
635	0.04
636	0.04
637	0.05
638	0.05
639	0.05
640	0.06
641	0.06
642	0.07
643	0.07
644	0.07
645	0.08
646	0.12
647	0.12
648	0.13
649	0.13
650	0.13
651	0.14
652	0.14
653	0.14
654	0.11
655	0.14
656	0.17
657	0.19
658	0.2
659	0.2
660	0.24
661	0.29
662	0.28
663	0.28
664	0.25
665	0.24
666	0.23
667	0.3
668	0.35
669	0.34
670	0.42
671	0.45
672	0.5
673	0.5
674	0.57
675	0.56
676	0.56
677	0.53
678	0.5
679	0.48
680	0.45
681	0.43
682	0.38
683	0.33
684	0.26
685	0.25
686	0.2
687	0.15
688	0.14
689	0.14
690	0.12
691	0.11
692	0.08
693	0.08
694	0.08
695	0.06
696	0.05
697	0.04
698	0.04
699	0.04
700	0.04
701	0.04
702	0.04
703	0.04
704	0.05
705	0.05
706	0.06
707	0.12
708	0.13
709	0.14
710	0.15
711	0.17
712	0.19
713	0.23
714	0.26
715	0.22
716	0.21
717	0.2
718	0.21
719	0.2
720	0.18
721	0.14
722	0.11
723	0.09
724	0.09
725	0.08
726	0.07
727	0.06
728	0.06
729	0.06
730	0.07
731	0.07
732	0.07
733	0.08
734	0.08
735	0.08
736	0.09
737	0.1
738	0.1
739	0.13
740	0.13
741	0.16
742	0.17
743	0.18
744	0.2
745	0.19
746	0.18
747	0.15
748	0.16
749	0.12
750	0.12
751	0.1
752	0.08
753	0.08
754	0.08
755	0.09
756	0.08
757	0.09
758	0.09
759	0.09
760	0.09
761	0.1
762	0.14
763	0.15
764	0.19
765	0.23
766	0.25
767	0.27
768	0.28
769	0.28
770	0.29
771	0.3
772	0.28
773	0.23
774	0.23
775	0.23
776	0.22
777	0.22
778	0.19
779	0.14
780	0.13
781	0.13
782	0.11
783	0.09
784	0.09
785	0.06
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.03
790	0.03
791	0.04
792	0.07
793	0.09
794	0.09
795	0.09
796	0.1
797	0.12
798	0.12
799	0.11
800	0.09
801	0.1
802	0.1
803	0.12
804	0.11
805	0.1
806	0.1
807	0.1
808	0.09
809	0.07
810	0.06
811	0.04
812	0.04
813	0.04
814	0.03
815	0.03
816	0.03
817	0.04
818	0.05
819	0.06
820	0.12
821	0.17
822	0.21
823	0.27
824	0.35
825	0.4
826	0.42
827	0.48
828	0.47
829	0.48
830	0.48
831	0.43
832	0.36
833	0.3
834	0.27
835	0.21
836	0.19
837	0.14
838	0.11
839	0.12
840	0.12
841	0.13
842	0.12
843	0.12
844	0.09
845	0.1
846	0.1
847	0.12
848	0.13
849	0.19
850	0.23
851	0.27
852	0.28
853	0.3
854	0.37
855	0.36
856	0.41
857	0.4
858	0.4
859	0.38
860	0.38
861	0.36
862	0.3
863	0.29
864	0.22
865	0.2
866	0.15
867	0.13
868	0.13
869	0.11
870	0.1
871	0.09
872	0.09
873	0.07
874	0.08
875	0.07
876	0.07
877	0.08
878	0.09
879	0.11
880	0.12
881	0.14
882	0.15
883	0.16
884	0.18
885	0.19
886	0.19
887	0.18
888	0.21
889	0.23
890	0.26
891	0.31
892	0.35
893	0.36
894	0.37
895	0.43
896	0.47
897	0.49
898	0.51
899	0.49
900	0.46
901	0.46
902	0.46
903	0.42
904	0.36
905	0.32
906	0.31
907	0.3
908	0.3
909	0.29
910	0.29
911	0.27
912	0.27
913	0.25
914	0.23
915	0.3
916	0.29
917	0.33
918	0.38
919	0.42
920	0.46
921	0.52
922	0.57
923	0.54
924	0.59
925	0.59
926	0.6
927	0.65
928	0.66
929	0.71
930	0.71
931	0.73
932	0.74
933	0.78
934	0.78
935	0.79
936	0.78
937	0.75
938	0.72
939	0.67
940	0.61
941	0.54
942	0.53
943	0.45
944	0.4
945	0.35
946	0.3
947	0.28
948	0.29
949	0.25
950	0.2
951	0.17
952	0.16
953	0.13
954	0.19
955	0.29
956	0.27
957	0.27
958	0.27
959	0.3
960	0.3
961	0.35
962	0.35
963	0.27
964	0.31
965	0.31
966	0.37
967	0.36
968	0.35
969	0.31
970	0.28
971	0.26
972	0.22
973	0.23
974	0.26
975	0.31
976	0.39
977	0.48
978	0.51
979	0.57
980	0.58
981	0.58
982	0.57
983	0.56
984	0.55
985	0.5
986	0.55
987	0.58
988	0.65
989	0.72
990	0.76
991	0.81
992	0.84
993	0.91
994	0.91
995	0.9
996	0.89
997	0.88
998	0.88
999	0.87
1000	0.85
1001	0.81
1002	0.75
1003	0.67
1004	0.62
1005	0.59
1006	0.49
1007	0.4
1008	0.32
1009	0.26
1010	0.22
1011	0.2
1012	0.17
1013	0.12
1014	0.11
1015	0.09
1016	0.08
1017	0.08
1018	0.08
1019	0.08
1020	0.09
1021	0.09
1022	0.1
1023	0.1
1024	0.13
1025	0.15
1026	0.22
1027	0.26
1028	0.25
1029	0.25
1030	0.32
1031	0.33
1032	0.39
1033	0.43
1034	0.41

C8VTR9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer