FuNGI

W9XR40

Protein Details

Accession

W9XR40

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MPPKAPPPRPRAGQHRRPAYRGRIE	Basic
194-215	CLYLACRRKHEQIRNERRPMYS	Hydrophilic
376-404	PPSYQRAHNPKGKKKRGRPRKHPLPETAA	Basic
645-664	AQARGKRKDGTKKPGRRGDV	Basic
791-815	ASVAAERRERKRKVERTSREKDADD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
5-19	APPPRPRAGQHRRPA
383-397	HNPKGKKKRGRPRKH
641-661	ALKQAQARGKRKDGTKKPGRR
787-806	LRSKASVAAERRERKRKVER

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011665 BRF1_TBP-bd_dom IPR013763 Cyclin-like_dom IPR036915 Cyclin-like_sf IPR000812 TFIIB IPR013150 TFIIB_cyclin
Gene Ontology	GO:0017025 F:TBP-class protein binding GO:0070897 P:transcription preinitiation complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF07741 BRF1 PF00382 TFIIB
CDD	cd20554 CYCLIN_TFIIIB90_rpt2

Amino Acid Sequences

MPPKAPPPRPRAGQHRRPAYRGRIEGLGSPAPSSLRATTPTFMRASTPVLTRKPGAKTMKCSNPTCPSPHIVESEQGLICDTCGAVAQEESGLVSEQGFGETESGRITALGVHVGESQTHQRTYAAGGALGNAGREPTINRDRSEAHARTIMLSYQSLLGVRLAEVEAGMQIFKLAWGNSFVQGRTIDSVAVVCLYLACRRKHEQIRNERRPMYSLMLIDFAEKLNIDVFALGKMYSDLIRRLYMQPDGSIQGDVSADLLAMGPEVLVSRFVDELEFDREHRDKIKMDAIRIVQRMKRDWMSTGRRPSGVCGAAVILAARMNNYRRTTREVVLTAKVTEITINKRLEEFHDTASSQLSIKQFRDNDILDALTPADPPSYQRAHNPKGKKKRGRPRKHPLPETAAEIEGDTSAPEPAGPEEADNDQPSAKRVRLDADGYKIPEIPVRKTPLDASSTLDSSEEPHSPADEESSDLSQEGRRAPEARNWKAPPVSAAELAIETEIEHDVLEALRDNPNIVTGQQHDRSSTSALISEPELSRDDDLAAIIPMTPPGKNKTPGPAVDTSDGNLGYVSLSPTIRPDEFDSDEDVSSCLLSEEESRIKERVWVSMNADWLRQDHVKRIKRELREAEMRAQGLDPAKEALKQAQARGKRKDGTKKPGRRGDVSYLNERDGERDRAGEGVEAGAESTAAERERSAAESVRKMFKTRGVYSRRVNYDVLDSIYGLTGGDSPSDGSRSRSQSVASMAPGLEQGAREGSVASTVASNAEDAGIGVGIFRGNGGRDGTRLRSKASVAAERRERKRKVERTSREKDADDAQGDRSMSRSRSPTTALPDTGAARGQSAGDSPDVRHGSEAAPEQHQLVTPESTQTQELPSVLSSSTAPVPSSTLHETAPEQSDGAGHDEGIGTVPGTTPRGNDDESISLSRPREPENEEYYDENDDDENEDDEDSDDDGEDEDEEGADVEAAFEGRYSGEGW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.86
3	0.83
4	0.81
5	0.82
6	0.81
7	0.79
8	0.73
9	0.67
10	0.6
11	0.56
12	0.53
13	0.5
14	0.43
15	0.34
16	0.3
17	0.27
18	0.23
19	0.23
20	0.22
21	0.19
22	0.18
23	0.22
24	0.25
25	0.27
26	0.29
27	0.32
28	0.3
29	0.28
30	0.28
31	0.26
32	0.27
33	0.28
34	0.31
35	0.34
36	0.36
37	0.4
38	0.41
39	0.45
40	0.46
41	0.51
42	0.55
43	0.55
44	0.6
45	0.66
46	0.72
47	0.73
48	0.71
49	0.71
50	0.69
51	0.67
52	0.64
53	0.59
54	0.53
55	0.51
56	0.51
57	0.48
58	0.41
59	0.39
60	0.35
61	0.36
62	0.31
63	0.26
64	0.24
65	0.18
66	0.17
67	0.14
68	0.12
69	0.07
70	0.08
71	0.08
72	0.08
73	0.08
74	0.08
75	0.08
76	0.08
77	0.08
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.07
83	0.07
84	0.08
85	0.08
86	0.07
87	0.09
88	0.09
89	0.09
90	0.09
91	0.09
92	0.09
93	0.08
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.1
98	0.09
99	0.1
100	0.12
101	0.12
102	0.13
103	0.14
104	0.21
105	0.22
106	0.23
107	0.22
108	0.21
109	0.21
110	0.24
111	0.25
112	0.19
113	0.16
114	0.15
115	0.15
116	0.17
117	0.16
118	0.13
119	0.09
120	0.08
121	0.07
122	0.08
123	0.09
124	0.16
125	0.25
126	0.29
127	0.3
128	0.33
129	0.36
130	0.41
131	0.5
132	0.43
133	0.38
134	0.38
135	0.37
136	0.36
137	0.35
138	0.3
139	0.22
140	0.2
141	0.17
142	0.14
143	0.14
144	0.13
145	0.12
146	0.11
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.08
151	0.07
152	0.07
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.04
158	0.04
159	0.04
160	0.05
161	0.07
162	0.07
163	0.08
164	0.11
165	0.13
166	0.17
167	0.2
168	0.19
169	0.2
170	0.2
171	0.21
172	0.2
173	0.19
174	0.15
175	0.13
176	0.13
177	0.1
178	0.1
179	0.08
180	0.05
181	0.05
182	0.07
183	0.12
184	0.19
185	0.2
186	0.26
187	0.31
188	0.41
189	0.51
190	0.59
191	0.64
192	0.69
193	0.79
194	0.83
195	0.86
196	0.81
197	0.72
198	0.66
199	0.59
200	0.52
201	0.45
202	0.35
203	0.28
204	0.26
205	0.24
206	0.22
207	0.18
208	0.13
209	0.1
210	0.09
211	0.08
212	0.07
213	0.07
214	0.06
215	0.06
216	0.07
217	0.06
218	0.07
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.07
223	0.09
224	0.1
225	0.12
226	0.14
227	0.15
228	0.18
229	0.2
230	0.22
231	0.24
232	0.23
233	0.21
234	0.22
235	0.22
236	0.2
237	0.18
238	0.15
239	0.12
240	0.11
241	0.1
242	0.08
243	0.06
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.05
255	0.05
256	0.06
257	0.06
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.1
262	0.14
263	0.14
264	0.14
265	0.19
266	0.21
267	0.22
268	0.25
269	0.26
270	0.23
271	0.26
272	0.34
273	0.31
274	0.31
275	0.35
276	0.36
277	0.39
278	0.4
279	0.4
280	0.35
281	0.36
282	0.38
283	0.37
284	0.37
285	0.32
286	0.33
287	0.38
288	0.45
289	0.48
290	0.53
291	0.51
292	0.49
293	0.48
294	0.47
295	0.44
296	0.36
297	0.28
298	0.2
299	0.18
300	0.16
301	0.15
302	0.13
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.09
308	0.11
309	0.17
310	0.21
311	0.24
312	0.26
313	0.34
314	0.38
315	0.37
316	0.4
317	0.37
318	0.37
319	0.36
320	0.34
321	0.27
322	0.23
323	0.21
324	0.15
325	0.14
326	0.14
327	0.16
328	0.21
329	0.22
330	0.22
331	0.22
332	0.23
333	0.25
334	0.28
335	0.25
336	0.21
337	0.22
338	0.22
339	0.22
340	0.22
341	0.19
342	0.13
343	0.15
344	0.15
345	0.17
346	0.18
347	0.23
348	0.23
349	0.26
350	0.3
351	0.27
352	0.25
353	0.22
354	0.21
355	0.15
356	0.15
357	0.13
358	0.08
359	0.08
360	0.07
361	0.06
362	0.06
363	0.08
364	0.13
365	0.14
366	0.15
367	0.23
368	0.31
369	0.38
370	0.45
371	0.53
372	0.58
373	0.67
374	0.76
375	0.79
376	0.81
377	0.85
378	0.89
379	0.91
380	0.92
381	0.92
382	0.92
383	0.92
384	0.88
385	0.83
386	0.78
387	0.69
388	0.62
389	0.52
390	0.41
391	0.31
392	0.25
393	0.19
394	0.12
395	0.1
396	0.06
397	0.05
398	0.04
399	0.04
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.09
408	0.11
409	0.11
410	0.11
411	0.1
412	0.11
413	0.12
414	0.14
415	0.13
416	0.13
417	0.14
418	0.16
419	0.18
420	0.22
421	0.22
422	0.24
423	0.25
424	0.24
425	0.24
426	0.21
427	0.19
428	0.18
429	0.17
430	0.16
431	0.19
432	0.23
433	0.22
434	0.23
435	0.24
436	0.25
437	0.25
438	0.23
439	0.21
440	0.18
441	0.18
442	0.17
443	0.15
444	0.12
445	0.12
446	0.14
447	0.11
448	0.1
449	0.1
450	0.1
451	0.11
452	0.11
453	0.1
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.08
458	0.08
459	0.07
460	0.08
461	0.08
462	0.09
463	0.1
464	0.1
465	0.11
466	0.13
467	0.14
468	0.2
469	0.28
470	0.3
471	0.37
472	0.37
473	0.38
474	0.37
475	0.36
476	0.31
477	0.26
478	0.24
479	0.16
480	0.15
481	0.13
482	0.12
483	0.11
484	0.1
485	0.05
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.04
491	0.03
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.05
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.07
501	0.08
502	0.08
503	0.08
504	0.08
505	0.1
506	0.15
507	0.18
508	0.18
509	0.18
510	0.18
511	0.2
512	0.19
513	0.17
514	0.12
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.1
519	0.11
520	0.09
521	0.1
522	0.11
523	0.1
524	0.11
525	0.1
526	0.1
527	0.08
528	0.08
529	0.07
530	0.05
531	0.05
532	0.04
533	0.04
534	0.05
535	0.06
536	0.06
537	0.08
538	0.12
539	0.17
540	0.19
541	0.21
542	0.26
543	0.29
544	0.3
545	0.33
546	0.32
547	0.3
548	0.29
549	0.28
550	0.23
551	0.19
552	0.18
553	0.13
554	0.1
555	0.07
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.06
561	0.06
562	0.08
563	0.11
564	0.11
565	0.12
566	0.14
567	0.17
568	0.2
569	0.2
570	0.22
571	0.21
572	0.2
573	0.19
574	0.16
575	0.12
576	0.09
577	0.08
578	0.05
579	0.04
580	0.04
581	0.05
582	0.08
583	0.11
584	0.13
585	0.15
586	0.15
587	0.15
588	0.2
589	0.2
590	0.22
591	0.22
592	0.23
593	0.25
594	0.27
595	0.32
596	0.27
597	0.27
598	0.22
599	0.19
600	0.21
601	0.21
602	0.2
603	0.23
604	0.33
605	0.4
606	0.43
607	0.52
608	0.56
609	0.57
610	0.65
611	0.62
612	0.59
613	0.6
614	0.59
615	0.54
616	0.5
617	0.45
618	0.37
619	0.31
620	0.26
621	0.21
622	0.18
623	0.13
624	0.11
625	0.12
626	0.12
627	0.13
628	0.13
629	0.19
630	0.2
631	0.24
632	0.29
633	0.37
634	0.44
635	0.49
636	0.53
637	0.51
638	0.57
639	0.64
640	0.67
641	0.69
642	0.72
643	0.76
644	0.79
645	0.82
646	0.79
647	0.73
648	0.69
649	0.66
650	0.64
651	0.59
652	0.56
653	0.5
654	0.46
655	0.43
656	0.37
657	0.33
658	0.28
659	0.28
660	0.21
661	0.2
662	0.2
663	0.19
664	0.19
665	0.16
666	0.12
667	0.07
668	0.07
669	0.06
670	0.05
671	0.04
672	0.04
673	0.03
674	0.04
675	0.05
676	0.05
677	0.06
678	0.06
679	0.08
680	0.09
681	0.11
682	0.12
683	0.15
684	0.19
685	0.24
686	0.28
687	0.34
688	0.34
689	0.34
690	0.35
691	0.37
692	0.41
693	0.41
694	0.47
695	0.47
696	0.53
697	0.58
698	0.64
699	0.62
700	0.56
701	0.51
702	0.43
703	0.4
704	0.35
705	0.3
706	0.21
707	0.17
708	0.14
709	0.14
710	0.12
711	0.08
712	0.06
713	0.06
714	0.05
715	0.05
716	0.05
717	0.06
718	0.07
719	0.1
720	0.1
721	0.14
722	0.2
723	0.25
724	0.27
725	0.27
726	0.27
727	0.28
728	0.31
729	0.28
730	0.22
731	0.19
732	0.17
733	0.17
734	0.16
735	0.13
736	0.1
737	0.08
738	0.08
739	0.08
740	0.08
741	0.08
742	0.08
743	0.07
744	0.07
745	0.07
746	0.07
747	0.06
748	0.06
749	0.07
750	0.07
751	0.07
752	0.06
753	0.06
754	0.05
755	0.05
756	0.05
757	0.04
758	0.04
759	0.04
760	0.04
761	0.04
762	0.04
763	0.04
764	0.05
765	0.05
766	0.08
767	0.1
768	0.11
769	0.13
770	0.17
771	0.23
772	0.3
773	0.3
774	0.31
775	0.31
776	0.32
777	0.36
778	0.38
779	0.41
780	0.38
781	0.45
782	0.52
783	0.58
784	0.66
785	0.7
786	0.69
787	0.7
788	0.76
789	0.78
790	0.79
791	0.81
792	0.83
793	0.83
794	0.87
795	0.86
796	0.8
797	0.71
798	0.63
799	0.57
800	0.53
801	0.45
802	0.38
803	0.31
804	0.29
805	0.28
806	0.25
807	0.23
808	0.22
809	0.21
810	0.25
811	0.28
812	0.27
813	0.3
814	0.35
815	0.37
816	0.4
817	0.43
818	0.39
819	0.35
820	0.35
821	0.33
822	0.3
823	0.27
824	0.19
825	0.15
826	0.14
827	0.13
828	0.11
829	0.11
830	0.11
831	0.12
832	0.13
833	0.13
834	0.21
835	0.22
836	0.22
837	0.21
838	0.21
839	0.2
840	0.23
841	0.27
842	0.22
843	0.23
844	0.23
845	0.24
846	0.23
847	0.24
848	0.22
849	0.2
850	0.19
851	0.17
852	0.2
853	0.2
854	0.21
855	0.2
856	0.19
857	0.18
858	0.17
859	0.17
860	0.15
861	0.15
862	0.15
863	0.13
864	0.13
865	0.12
866	0.12
867	0.15
868	0.15
869	0.15
870	0.14
871	0.15
872	0.15
873	0.2
874	0.22
875	0.2
876	0.2
877	0.21
878	0.23
879	0.26
880	0.28
881	0.24
882	0.2
883	0.18
884	0.19
885	0.18
886	0.2
887	0.16
888	0.12
889	0.12
890	0.12
891	0.12
892	0.12
893	0.1
894	0.06
895	0.06
896	0.08
897	0.09
898	0.12
899	0.13
900	0.12
901	0.17
902	0.2
903	0.22
904	0.23
905	0.24
906	0.25
907	0.28
908	0.3
909	0.28
910	0.29
911	0.29
912	0.33
913	0.32
914	0.33
915	0.35
916	0.37
917	0.44
918	0.46
919	0.49
920	0.47
921	0.47
922	0.44
923	0.42
924	0.36
925	0.29
926	0.23
927	0.18
928	0.18
929	0.17
930	0.16
931	0.13
932	0.13
933	0.12
934	0.13
935	0.13
936	0.11
937	0.1
938	0.09
939	0.08
940	0.09
941	0.09
942	0.08
943	0.08
944	0.07
945	0.07
946	0.07
947	0.07
948	0.07
949	0.06
950	0.06
951	0.05
952	0.06
953	0.06
954	0.06
955	0.05
956	0.06
957	0.06

W9XR40

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer